MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_015947	CGTCGC	2	12	4252082	4252093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344209246
101002	NC_015947	CGCAG	2	10	4252118	4252127	20 %	0 %	40 %	40 %	344209246
101003	NC_015947	GC	3	6	4252144	4252149	0 %	0 %	50 %	50 %	344209246
101004	NC_015947	TCCT	2	8	4252320	4252327	0 %	50 %	0 %	50 %	344209246
101005	NC_015947	CCG	2	6	4252336	4252341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209246
101006	NC_015947	GCC	2	6	4252371	4252376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209246
101007	NC_015947	GCA	2	6	4252384	4252389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209246
101008	NC_015947	GC	3	6	4252415	4252420	0 %	0 %	50 %	50 %	344209246
101009	NC_015947	CGAG	2	8	4252435	4252442	25 %	0 %	50 %	25 %	344209246
101010	NC_015947	CCG	2	6	4252445	4252450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209246
101011	NC_015947	GATGC	2	10	4252549	4252558	20 %	20 %	40 %	20 %	344209247
101012	NC_015947	GAT	2	6	4252569	4252574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209247
101013	NC_015947	CTG	2	6	4252582	4252587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101014	NC_015947	GCG	2	6	4252627	4252632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101015	NC_015947	GGCCCG	2	12	4252641	4252652	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101016	NC_015947	GGC	2	6	4252663	4252668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101017	NC_015947	CGG	2	6	4252719	4252724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101018	NC_015947	GC	3	6	4252758	4252763	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101019	NC_015947	GGC	2	6	4252835	4252840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101020	NC_015947	CGG	2	6	4252848	4252853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101021	NC_015947	CTG	2	6	4252864	4252869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101022	NC_015947	CGC	2	6	4252885	4252890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209247
101023	NC_015947	TGGC	2	8	4252909	4252916	0 %	25 %	50 %	25 %	344209247
101024	NC_015947	ACG	2	6	4252982	4252987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101025	NC_015947	CGA	2	6	4253009	4253014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101026	NC_015947	GGT	2	6	4253076	4253081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209247
101027	NC_015947	CG	3	6	4253091	4253096	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101028	NC_015947	CACC	2	8	4253099	4253106	25 %	0 %	0 %	75 %	344209247
101029	NC_015947	CCA	2	6	4253108	4253113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209247
101030	NC_015947	CTG	3	9	4253143	4253151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101031	NC_015947	CAT	2	6	4253160	4253165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209247
101032	NC_015947	GTGCAG	2	12	4253218	4253229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344209247
101033	NC_015947	CAC	2	6	4253270	4253275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209247
101034	NC_015947	CGA	2	6	4253286	4253291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101035	NC_015947	CAC	2	6	4253316	4253321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209247
101036	NC_015947	CAA	2	6	4253343	4253348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209247
101037	NC_015947	GC	3	6	4253386	4253391	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101038	NC_015947	TGG	2	6	4253396	4253401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209247
101039	NC_015947	CTG	2	6	4253419	4253424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101040	NC_015947	CGC	2	6	4253433	4253438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209247
101041	NC_015947	GCC	2	6	4253465	4253470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209247
101042	NC_015947	GC	3	6	4253543	4253548	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101043	NC_015947	CAT	2	6	4253571	4253576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209247
101044	NC_015947	CAG	2	6	4253587	4253592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101045	NC_015947	CAC	2	6	4253655	4253660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209247
101046	NC_015947	GCC	2	6	4253712	4253717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209247
101047	NC_015947	GGT	2	6	4253727	4253732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209247
101048	NC_015947	GAC	2	6	4253749	4253754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101049	NC_015947	CTGAGC	2	12	4253830	4253841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101050	NC_015947	GAG	2	6	4253890	4253895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209247
101051	NC_015947	CG	4	8	4253929	4253936	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101052	NC_015947	CCGGC	2	10	4253938	4253947	0 %	0 %	40 %	60 %	344209247
101053	NC_015947	TGC	2	6	4253954	4253959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101054	NC_015947	GCA	2	6	4253966	4253971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101055	NC_015947	GCGCTG	2	12	4254019	4254030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344209247
101056	NC_015947	GCG	2	6	4254066	4254071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209247
101057	NC_015947	GC	4	8	4254226	4254233	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101058	NC_015947	GAT	2	6	4254247	4254252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209247
101059	NC_015947	CG	3	6	4254338	4254343	0 %	0 %	50 %	50 %	344209247
101060	NC_015947	CAG	2	6	4254370	4254375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209247
101061	NC_015947	ACG	2	6	4255150	4255155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209248
101062	NC_015947	CTG	2	6	4255262	4255267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209248
101063	NC_015947	GCC	2	6	4255333	4255338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209248
101064	NC_015947	CCAC	2	8	4255405	4255412	25 %	0 %	0 %	75 %	344209248
101065	NC_015947	CT	3	6	4255474	4255479	0 %	50 %	0 %	50 %	344209248
101066	NC_015947	CGG	2	6	4255505	4255510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209248
101067	NC_015947	GTG	2	6	4255518	4255523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209248
101068	NC_015947	GTT	2	6	4255609	4255614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209249
101069	NC_015947	CGG	2	6	4255619	4255624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209249
101070	NC_015947	GCG	2	6	4255628	4255633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209249
101071	NC_015947	GCG	2	6	4255662	4255667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209249
101072	NC_015947	AGC	2	6	4255670	4255675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209249
101073	NC_015947	ACG	2	6	4255676	4255681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209249
101074	NC_015947	TCA	2	6	4255683	4255688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209249
101075	NC_015947	AGC	2	6	4255715	4255720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209249
101076	NC_015947	CAC	2	6	4255762	4255767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209249
101077	NC_015947	AGCC	2	8	4255800	4255807	25 %	0 %	25 %	50 %	344209249
101078	NC_015947	GCC	2	6	4255818	4255823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209249
101079	NC_015947	GCG	2	6	4255841	4255846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209249
101080	NC_015947	AGA	2	6	4255896	4255901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209249
101081	NC_015947	GAA	2	6	4255998	4256003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209249
101082	NC_015947	CTT	2	6	4256587	4256592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209250
101083	NC_015947	C	6	6	4256603	4256608	0 %	0 %	0 %	100 %	344209250
101084	NC_015947	AGGC	2	8	4256622	4256629	25 %	0 %	50 %	25 %	344209250
101085	NC_015947	GAT	2	6	4256641	4256646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209250
101086	NC_015947	CTG	2	6	4256660	4256665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209250
101087	NC_015947	AGT	2	6	4256692	4256697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209250
101088	NC_015947	GCC	2	6	4256779	4256784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209251
101089	NC_015947	TC	3	6	4256813	4256818	0 %	50 %	0 %	50 %	344209251
101090	NC_015947	ACC	2	6	4256833	4256838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209251
101091	NC_015947	ATG	2	6	4256878	4256883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209251
101092	NC_015947	GCT	2	6	4257070	4257075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209251
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101094	NC_015947	C	6	6	4257208	4257213	0 %	0 %	0 %	100 %	344209251
101095	NC_015947	AGC	2	6	4257226	4257231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209251
101096	NC_015947	CTTG	2	8	4257277	4257284	0 %	50 %	25 %	25 %	344209251
101097	NC_015947	CAC	2	6	4257313	4257318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209251
101098	NC_015947	TGG	2	6	4257338	4257343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209251
101099	NC_015947	CCCAT	2	10	4257349	4257358	20 %	20 %	0 %	60 %	344209251
101100	NC_015947	ACT	2	6	4257363	4257368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209251
101101	NC_015947	TCT	2	6	4257418	4257423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209251
101102	NC_015947	GCCA	2	8	4257450	4257457	25 %	0 %	25 %	50 %	344209251
101103	NC_015947	CG	3	6	4257531	4257536	0 %	0 %	50 %	50 %	344209252
101104	NC_015947	CCG	2	6	4257563	4257568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209252
101105	NC_015947	GAA	2	6	4257603	4257608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209252
101106	NC_015947	CGTA	2	8	4257614	4257621	25 %	25 %	25 %	25 %	344209252
101107	NC_015947	ACC	2	6	4257664	4257669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209252
101108	NC_015947	T	6	6	4258096	4258101	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
101109	NC_015947	GCCCT	2	10	4258120	4258129	0 %	20 %	20 %	60 %	344209253
101110	NC_015947	T	6	6	4258232	4258237	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
101111	NC_015947	CCT	2	6	4258244	4258249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209253
101112	NC_015947	T	6	6	4258260	4258265	0 %	100 %	0 %	0 %	344209253
101113	NC_015947	C	6	6	4258320	4258325	0 %	0 %	0 %	100 %	344209253
101114	NC_015947	GGC	2	6	4258340	4258345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209253
101115	NC_015947	ACG	2	6	4258349	4258354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209253
101116	NC_015947	ATC	2	6	4258399	4258404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209253
101117	NC_015947	CAC	2	6	4258449	4258454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209253
101118	NC_015947	ATGG	2	8	4258490	4258497	25 %	25 %	50 %	0 %	344209253
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101120	NC_015947	CTG	2	6	4258546	4258551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209253
101121	NC_015947	AGCGC	2	10	4258560	4258569	20 %	0 %	40 %	40 %	344209253
101122	NC_015947	ACACC	2	10	4258578	4258587	40 %	0 %	0 %	60 %	344209253
101123	NC_015947	TTG	2	6	4258637	4258642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209253
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101126	NC_015947	GAT	2	6	4258701	4258706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209253
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101132	NC_015947	GCA	2	6	4258884	4258889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209253
101133	NC_015947	CGC	2	6	4258896	4258901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209253
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101138	NC_015947	TCA	2	6	4259613	4259618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209254
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101143	NC_015947	TG	3	6	4259807	4259812	0 %	50 %	50 %	0 %	344209254
101144	NC_015947	CCCT	2	8	4259957	4259964	0 %	25 %	0 %	75 %	344209254
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101221	NC_015947	CATATG	2	12	4263142	4263153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344209255
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101337	NC_015947	TGCT	2	8	4268765	4268772	0 %	50 %	25 %	25 %	344209257
101338	NC_015947	GCG	2	6	4268809	4268814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209257
101339	NC_015947	CGAC	2	8	4268892	4268899	25 %	0 %	25 %	50 %	344209257
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