MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015875	TCT	2	6	1428536	1428541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164141
24503	NC_015875	A	7	7	1428619	1428625	100 %	0 %	0 %	0 %	342164141
24504	NC_015875	AAG	2	6	1428633	1428638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164141
24505	NC_015875	ACT	2	6	1428655	1428660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164141
24506	NC_015875	TTTC	2	8	1428676	1428683	0 %	75 %	0 %	25 %	342164141
24507	NC_015875	CT	4	8	1428806	1428813	0 %	50 %	0 %	50 %	342164141
24508	NC_015875	AAT	2	6	1428828	1428833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164141
24509	NC_015875	GCAT	2	8	1428875	1428882	25 %	25 %	25 %	25 %	342164141
24510	NC_015875	TCA	2	6	1428945	1428950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164141
24511	NC_015875	A	6	6	1428970	1428975	100 %	0 %	0 %	0 %	342164141
24512	NC_015875	TCCT	2	8	1429033	1429040	0 %	50 %	0 %	50 %	342164141
24513	NC_015875	TGGC	2	8	1429073	1429080	0 %	25 %	50 %	25 %	342164141
24514	NC_015875	TCA	2	6	1429082	1429087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164141
24515	NC_015875	AAGA	2	8	1429098	1429105	75 %	0 %	25 %	0 %	342164141
24516	NC_015875	CTC	2	6	1429108	1429113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164141
24517	NC_015875	TTC	2	6	1429357	1429362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164141
24518	NC_015875	CTT	2	6	1429368	1429373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164141
24519	NC_015875	TCA	2	6	1429403	1429408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164141
24520	NC_015875	CA	3	6	1429441	1429446	50 %	0 %	0 %	50 %	342164141
24521	NC_015875	A	7	7	1429462	1429468	100 %	0 %	0 %	0 %	342164141
24522	NC_015875	A	6	6	1429479	1429484	100 %	0 %	0 %	0 %	342164141
24523	NC_015875	ATC	2	6	1429489	1429494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164141
24524	NC_015875	TTC	3	9	1429513	1429521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164141
24525	NC_015875	TGA	2	6	1429557	1429562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164141
24526	NC_015875	CTT	2	6	1429763	1429768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164142
24527	NC_015875	CTTC	2	8	1429813	1429820	0 %	50 %	0 %	50 %	342164142
24528	NC_015875	CAA	2	6	1429869	1429874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164142
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24531	NC_015875	CTTG	2	8	1430012	1430019	0 %	50 %	25 %	25 %	342164142
24532	NC_015875	ATT	2	6	1430097	1430102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164142
24533	NC_015875	T	6	6	1430164	1430169	0 %	100 %	0 %	0 %	342164142
24534	NC_015875	TCT	2	6	1430339	1430344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164142
24535	NC_015875	CTT	2	6	1430351	1430356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164142
24536	NC_015875	CCA	2	6	1430371	1430376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164142
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24539	NC_015875	AATC	2	8	1430490	1430497	50 %	25 %	0 %	25 %	342164142
24540	NC_015875	GGGT	2	8	1430529	1430536	0 %	25 %	75 %	0 %	342164142
24541	NC_015875	TTAA	2	8	1430548	1430555	50 %	50 %	0 %	0 %	342164142
24542	NC_015875	CGCCT	2	10	1430559	1430568	0 %	20 %	20 %	60 %	342164142
24543	NC_015875	TTAA	2	8	1430686	1430693	50 %	50 %	0 %	0 %	342164142
24544	NC_015875	GTTTCT	2	12	1430818	1430829	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	342164142
24545	NC_015875	CTG	2	6	1431006	1431011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164143
24546	NC_015875	TAA	2	6	1431045	1431050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164143
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24551	NC_015875	CAT	2	6	1431381	1431386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164143
24552	NC_015875	CCA	3	9	1431480	1431488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164143
24553	NC_015875	TTGG	2	8	1431554	1431561	0 %	50 %	50 %	0 %	342164143
24554	NC_015875	ACATCC	2	12	1431578	1431589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	342164143
24555	NC_015875	CTT	2	6	1431612	1431617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164143
24556	NC_015875	ACC	2	6	1431682	1431687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164143
24557	NC_015875	CTG	2	6	1431786	1431791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164143
24558	NC_015875	GCC	2	6	1431800	1431805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	342164143
24559	NC_015875	TAC	2	6	1431822	1431827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164143
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24561	NC_015875	GAAA	2	8	1432365	1432372	75 %	0 %	25 %	0 %	342164144
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24563	NC_015875	TAG	2	6	1432655	1432660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164144
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24566	NC_015875	GA	3	6	1432757	1432762	50 %	0 %	50 %	0 %	342164144
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24570	NC_015875	TTC	2	6	1433168	1433173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164145
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24572	NC_015875	TGT	2	6	1433216	1433221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164145
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24591	NC_015875	TCTA	2	8	1434152	1434159	25 %	50 %	0 %	25 %	342164145
24592	NC_015875	TAA	2	6	1434174	1434179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164145
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24602	NC_015875	TTC	2	6	1434752	1434757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164145
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24605	NC_015875	AAG	2	6	1435417	1435422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164146
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24613	NC_015875	TTA	2	6	1436023	1436028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164146
24614	NC_015875	TATCT	2	10	1436208	1436217	20 %	60 %	0 %	20 %	342164146
24615	NC_015875	CTT	2	6	1436246	1436251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164146
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24617	NC_015875	CTA	2	6	1436327	1436332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164146
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24732	NC_015875	AGGTG	2	10	1442634	1442643	20 %	20 %	60 %	0 %	342164155
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24850	NC_015875	T	8	8	1449320	1449327	0 %	100 %	0 %	0 %	342164163
24851	NC_015875	T	7	7	1449331	1449337	0 %	100 %	0 %	0 %	342164163
24852	NC_015875	CAT	2	6	1449594	1449599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164164
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24955	NC_015875	TCA	2	6	1456598	1456603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164170
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24960	NC_015875	CTG	2	6	1456839	1456844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164170
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24962	NC_015875	CTT	2	6	1456974	1456979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164170
24963	NC_015875	CTT	2	6	1456989	1456994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164170
24964	NC_015875	CCA	2	6	1457063	1457068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164170
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24966	NC_015875	GAT	2	6	1457104	1457109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164170
24967	NC_015875	ATC	2	6	1457111	1457116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164170
24968	NC_015875	CTT	2	6	1457166	1457171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164170
24969	NC_015875	TGA	2	6	1457218	1457223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164170
24970	NC_015875	GTTCTT	2	12	1457292	1457303	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	342164170
24971	NC_015875	TGAA	2	8	1457615	1457622	50 %	25 %	25 %	0 %	342164171
24972	NC_015875	ATCT	2	8	1457626	1457633	25 %	50 %	0 %	25 %	342164171
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24975	NC_015875	TCT	2	6	1457719	1457724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164171
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24986	NC_015875	CTAG	2	8	1458128	1458135	25 %	25 %	25 %	25 %	342164171
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24989	NC_015875	GAC	2	6	1458251	1458256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164171
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24993	NC_015875	ATTG	2	8	1458541	1458548	25 %	50 %	25 %	0 %	342164171
24994	NC_015875	GAA	2	6	1458566	1458571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164171
24995	NC_015875	TGA	2	6	1458580	1458585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164171
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24998	NC_015875	TCA	2	6	1458778	1458783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164171
24999	NC_015875	A	7	7	1458790	1458796	100 %	0 %	0 %	0 %	342164171
25000	NC_015875	TTC	2	6	1458835	1458840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164172

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