MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_015875	GTTTG	2	10	1399767	1399776	0 %	60 %	40 %	0 %	342164113
24004	NC_015875	CTG	2	6	1399892	1399897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164113
24005	NC_015875	TGT	2	6	1399980	1399985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164113
24006	NC_015875	TTA	2	6	1400017	1400022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164113
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24008	NC_015875	GCTA	2	8	1400064	1400071	25 %	25 %	25 %	25 %	342164113
24009	NC_015875	TGT	2	6	1400076	1400081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164113
24010	NC_015875	TCA	2	6	1400083	1400088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164113
24011	NC_015875	CTTT	2	8	1400128	1400135	0 %	75 %	0 %	25 %	342164113
24012	NC_015875	TCT	2	6	1400140	1400145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164113
24013	NC_015875	ACT	2	6	1400164	1400169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164113
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24016	NC_015875	TTA	2	6	1400402	1400407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164114
24017	NC_015875	GCTA	2	8	1400449	1400456	25 %	25 %	25 %	25 %	342164114
24018	NC_015875	GTT	2	6	1400462	1400467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164114
24019	NC_015875	TCT	2	6	1400525	1400530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164114
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24038	NC_015875	CTTT	2	8	1401317	1401324	0 %	75 %	0 %	25 %	342164114
24039	NC_015875	TCA	2	6	1401371	1401376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164114
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24051	NC_015875	TTCG	2	8	1401767	1401774	0 %	50 %	25 %	25 %	342164114
24052	NC_015875	TTA	2	6	1401848	1401853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164114
24053	NC_015875	TGTATT	2	12	1401868	1401879	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342164114
24054	NC_015875	TC	4	8	1401881	1401888	0 %	50 %	0 %	50 %	342164114
24055	NC_015875	TAC	2	6	1401966	1401971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164114
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24059	NC_015875	TA	3	6	1402080	1402085	50 %	50 %	0 %	0 %	342164114
24060	NC_015875	TCA	2	6	1402091	1402096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164114
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24085	NC_015875	TAC	2	6	1403199	1403204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164114
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24088	NC_015875	T	6	6	1403246	1403251	0 %	100 %	0 %	0 %	342164114
24089	NC_015875	ATC	2	6	1403320	1403325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164114
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24091	NC_015875	CTG	2	6	1403424	1403429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164114
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24100	NC_015875	ACT	2	6	1404633	1404638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164115
24101	NC_015875	TTGA	2	8	1404708	1404715	25 %	50 %	25 %	0 %	342164115
24102	NC_015875	AAG	2	6	1404751	1404756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164115
24103	NC_015875	TTGA	2	8	1404783	1404790	25 %	50 %	25 %	0 %	342164115
24104	NC_015875	AC	3	6	1404820	1404825	50 %	0 %	0 %	50 %	342164115
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24111	NC_015875	GTGTTG	2	12	1405042	1405053	0 %	50 %	50 %	0 %	342164115
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24113	NC_015875	ATCG	2	8	1405181	1405188	25 %	25 %	25 %	25 %	342164115
24114	NC_015875	A	6	6	1405273	1405278	100 %	0 %	0 %	0 %	342164115
24115	NC_015875	GAA	2	6	1405290	1405295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164115
24116	NC_015875	CA	3	6	1405305	1405310	50 %	0 %	0 %	50 %	342164115
24117	NC_015875	ATG	2	6	1405314	1405319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164115
24118	NC_015875	GAA	2	6	1405326	1405331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164115
24119	NC_015875	TGC	2	6	1405406	1405411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164115
24120	NC_015875	CTA	2	6	1405412	1405417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164115
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24147	NC_015875	CAAT	2	8	1407153	1407160	50 %	25 %	0 %	25 %	342164117
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24218	NC_015875	AGGG	2	8	1411564	1411571	25 %	0 %	75 %	0 %	342164122
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24220	NC_015875	CGT	2	6	1411610	1411615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164122
24221	NC_015875	TGA	2	6	1411649	1411654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164122
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24223	NC_015875	C	6	6	1411789	1411794	0 %	0 %	0 %	100 %	342164122
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24226	NC_015875	GCT	2	6	1412094	1412099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164122
24227	NC_015875	TC	3	6	1412105	1412110	0 %	50 %	0 %	50 %	342164122
24228	NC_015875	TA	3	6	1412164	1412169	50 %	50 %	0 %	0 %	342164122
24229	NC_015875	TTA	2	6	1412196	1412201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164122
24230	NC_015875	TGATTT	2	12	1412234	1412245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342164122
24231	NC_015875	CCA	2	6	1412276	1412281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164122
24232	NC_015875	GTC	2	6	1412326	1412331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164122
24233	NC_015875	ACG	2	6	1412784	1412789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164124
24234	NC_015875	TCAA	2	8	1412797	1412804	50 %	25 %	0 %	25 %	342164124
24235	NC_015875	CTT	2	6	1412819	1412824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164124
24236	NC_015875	GATATC	2	12	1412868	1412879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	342164124
24237	NC_015875	CGA	2	6	1412903	1412908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164124
24238	NC_015875	ATCAT	2	10	1412914	1412923	40 %	40 %	0 %	20 %	342164124
24239	NC_015875	CCG	2	6	1412941	1412946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	342164124
24240	NC_015875	TCA	3	9	1412974	1412982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164124
24241	NC_015875	TCA	2	6	1413001	1413006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164124
24242	NC_015875	T	6	6	1413168	1413173	0 %	100 %	0 %	0 %	342164125
24243	NC_015875	TCT	2	6	1413221	1413226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164125
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24246	NC_015875	TCA	2	6	1413389	1413394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164125
24247	NC_015875	GAA	2	6	1413450	1413455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164125
24248	NC_015875	CAG	2	6	1413468	1413473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164125
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24250	NC_015875	ATAG	2	8	1413652	1413659	50 %	25 %	25 %	0 %	342164125
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24252	NC_015875	GTTG	2	8	1413734	1413741	0 %	50 %	50 %	0 %	342164125
24253	NC_015875	TGG	2	6	1413907	1413912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342164125
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24262	NC_015875	TCA	2	6	1414193	1414198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164125
24263	NC_015875	T	6	6	1414210	1414215	0 %	100 %	0 %	0 %	342164125
24264	NC_015875	TCT	2	6	1414238	1414243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164125
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24268	NC_015875	TTTC	2	8	1414445	1414452	0 %	75 %	0 %	25 %	342164125
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24302	NC_015875	CGA	2	6	1416213	1416218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164127
24303	NC_015875	ATC	2	6	1416263	1416268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164127
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24335	NC_015875	CTT	2	6	1417931	1417936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164129
24336	NC_015875	T	6	6	1417961	1417966	0 %	100 %	0 %	0 %	342164129
24337	NC_015875	TTC	2	6	1417974	1417979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164129
24338	NC_015875	T	6	6	1418010	1418015	0 %	100 %	0 %	0 %	342164129
24339	NC_015875	TAAAA	2	10	1418052	1418061	80 %	20 %	0 %	0 %	342164129
24340	NC_015875	CAAT	2	8	1418066	1418073	50 %	25 %	0 %	25 %	342164129
24341	NC_015875	AATA	2	8	1418241	1418248	75 %	25 %	0 %	0 %	342164130
24342	NC_015875	TGG	2	6	1418252	1418257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342164130
24343	NC_015875	AGA	2	6	1418261	1418266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164130
24344	NC_015875	AAG	2	6	1418330	1418335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164130
24345	NC_015875	TTC	2	6	1418344	1418349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164130
24346	NC_015875	T	7	7	1418400	1418406	0 %	100 %	0 %	0 %	342164130
24347	NC_015875	ACG	3	9	1418413	1418421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164130
24348	NC_015875	CAA	2	6	1418440	1418445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164130
24349	NC_015875	CCA	2	6	1418500	1418505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164130
24350	NC_015875	ATCG	2	8	1418515	1418522	25 %	25 %	25 %	25 %	342164130
24351	NC_015875	AATA	2	8	1418715	1418722	75 %	25 %	0 %	0 %	342164130
24352	NC_015875	CAA	2	6	1418746	1418751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164130
24353	NC_015875	GAT	2	6	1418797	1418802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164130
24354	NC_015875	TTC	2	6	1418815	1418820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164130
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24467	NC_015875	T	7	7	1426265	1426271	0 %	100 %	0 %	0 %	342164140
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24472	NC_015875	T	6	6	1426659	1426664	0 %	100 %	0 %	0 %	342164141
24473	NC_015875	TTC	2	6	1426708	1426713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164141
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24499	NC_015875	AGAC	2	8	1428348	1428355	50 %	0 %	25 %	25 %	342164141
24500	NC_015875	TTCT	2	8	1428426	1428433	0 %	75 %	0 %	25 %	342164141

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