MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015875	TCTT	2	8	1340875	1340882	0 %	75 %	0 %	25 %	342164051
23002	NC_015875	TCA	2	6	1340890	1340895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164051
23003	NC_015875	ATTGT	2	10	1340896	1340905	20 %	60 %	20 %	0 %	342164051
23004	NC_015875	ATG	2	6	1340956	1340961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164051
23005	NC_015875	TA	3	6	1340978	1340983	50 %	50 %	0 %	0 %	342164051
23006	NC_015875	AAC	2	6	1341159	1341164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164051
23007	NC_015875	CAA	2	6	1341209	1341214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164051
23008	NC_015875	T	7	7	1341245	1341251	0 %	100 %	0 %	0 %	342164051
23009	NC_015875	T	7	7	1341330	1341336	0 %	100 %	0 %	0 %	342164051
23010	NC_015875	ATT	2	6	1341342	1341347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23011	NC_015875	CTG	2	6	1341391	1341396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164051
23012	NC_015875	TCC	2	6	1341447	1341452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164051
23013	NC_015875	ATA	2	6	1341511	1341516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164051
23014	NC_015875	TTG	2	6	1341534	1341539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164051
23015	NC_015875	TTC	2	6	1341700	1341705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164051
23016	NC_015875	TCA	3	9	1341734	1341742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164051
23017	NC_015875	TA	3	6	1341779	1341784	50 %	50 %	0 %	0 %	342164051
23018	NC_015875	ACTCTG	2	12	1341785	1341796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342164051
23019	NC_015875	ATC	2	6	1341837	1341842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164051
23020	NC_015875	AAT	2	6	1341927	1341932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164051
23021	NC_015875	TCT	2	6	1341949	1341954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164051
23022	NC_015875	TAT	2	6	1341968	1341973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23023	NC_015875	TTC	2	6	1342014	1342019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164051
23024	NC_015875	ATC	3	9	1342035	1342043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164051
23025	NC_015875	ACTTA	2	10	1342059	1342068	40 %	40 %	0 %	20 %	342164051
23026	NC_015875	TTA	2	6	1342096	1342101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23027	NC_015875	TCA	2	6	1342144	1342149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164051
23028	NC_015875	TGC	2	6	1342185	1342190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164051
23029	NC_015875	TAT	2	6	1342250	1342255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23030	NC_015875	AGA	2	6	1342329	1342334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164051
23031	NC_015875	ATT	2	6	1342338	1342343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23032	NC_015875	CTT	2	6	1342367	1342372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164051
23033	NC_015875	AGA	2	6	1342386	1342391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164051
23034	NC_015875	TCGAA	2	10	1342482	1342491	40 %	20 %	20 %	20 %	342164051
23035	NC_015875	TTA	2	6	1342504	1342509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164051
23036	NC_015875	T	6	6	1342887	1342892	0 %	100 %	0 %	0 %	342164052
23037	NC_015875	CTT	2	6	1342893	1342898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164052
23038	NC_015875	ATCA	2	8	1342903	1342910	50 %	25 %	0 %	25 %	342164052
23039	NC_015875	TCT	2	6	1342916	1342921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164052
23040	NC_015875	TCA	2	6	1342925	1342930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164052
23041	NC_015875	ATT	2	6	1342966	1342971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164052
23042	NC_015875	TC	3	6	1343153	1343158	0 %	50 %	0 %	50 %	342164052
23043	NC_015875	ATC	2	6	1343161	1343166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164052
23044	NC_015875	T	6	6	1343289	1343294	0 %	100 %	0 %	0 %	342164053
23045	NC_015875	T	7	7	1343296	1343302	0 %	100 %	0 %	0 %	342164053
23046	NC_015875	TGA	2	6	1343368	1343373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164053
23047	NC_015875	ATC	2	6	1343482	1343487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164053
23048	NC_015875	ATG	2	6	1343524	1343529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164053
23049	NC_015875	CACATC	2	12	1343536	1343547	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	342164053
23050	NC_015875	TCT	2	6	1343568	1343573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164053
23051	NC_015875	CAA	2	6	1343649	1343654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164053
23052	NC_015875	AT	3	6	1343657	1343662	50 %	50 %	0 %	0 %	342164053
23053	NC_015875	TCC	2	6	1343684	1343689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164054
23054	NC_015875	CTT	2	6	1343710	1343715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164054
23055	NC_015875	AAAG	2	8	1343952	1343959	75 %	0 %	25 %	0 %	342164054
23056	NC_015875	CTG	2	6	1344033	1344038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164054
23057	NC_015875	CTT	2	6	1344048	1344053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164054
23058	NC_015875	ACC	2	6	1344187	1344192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164054
23059	NC_015875	ACC	2	6	1344205	1344210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164054
23060	NC_015875	TC	3	6	1344228	1344233	0 %	50 %	0 %	50 %	342164054
23061	NC_015875	TAA	2	6	1344248	1344253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164054
23062	NC_015875	TAG	2	6	1344272	1344277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164054
23063	NC_015875	TCT	2	6	1344345	1344350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164054
23064	NC_015875	CTT	2	6	1344360	1344365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164054
23065	NC_015875	TTC	2	6	1344503	1344508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164055
23066	NC_015875	GAA	2	6	1344723	1344728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164055
23067	NC_015875	TCA	2	6	1344864	1344869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164055
23068	NC_015875	CCCAT	2	10	1344951	1344960	20 %	20 %	0 %	60 %	342164055
23069	NC_015875	GCT	2	6	1345089	1345094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164055
23070	NC_015875	ACC	2	6	1345113	1345118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164055
23071	NC_015875	CAA	2	6	1345129	1345134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164055
23072	NC_015875	T	7	7	1345162	1345168	0 %	100 %	0 %	0 %	342164055
23073	NC_015875	GTA	2	6	1345253	1345258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164055
23074	NC_015875	CTG	2	6	1345300	1345305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164055
23075	NC_015875	GTCTA	2	10	1345349	1345358	20 %	40 %	20 %	20 %	342164055
23076	NC_015875	CTT	2	6	1345372	1345377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164055
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23080	NC_015875	GCT	2	6	1345743	1345748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164057
23081	NC_015875	TTTACG	2	12	1345754	1345765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342164057
23082	NC_015875	ACG	2	6	1345844	1345849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164057
23083	NC_015875	CGT	2	6	1345855	1345860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164057
23084	NC_015875	ATTC	2	8	1345867	1345874	25 %	50 %	0 %	25 %	342164057
23085	NC_015875	TAC	2	6	1345880	1345885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164057
23086	NC_015875	T	7	7	1345897	1345903	0 %	100 %	0 %	0 %	342164057
23087	NC_015875	AAT	2	6	1346072	1346077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164058
23088	NC_015875	TTGGG	2	10	1346234	1346243	0 %	40 %	60 %	0 %	342164058
23089	NC_015875	TAG	2	6	1346284	1346289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164058
23090	NC_015875	CTTCAG	2	12	1346428	1346439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342164058
23091	NC_015875	CTTT	2	8	1346469	1346476	0 %	75 %	0 %	25 %	342164058
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23099	NC_015875	AGG	2	6	1347118	1347123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164059
23100	NC_015875	CTG	2	6	1347153	1347158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164059
23101	NC_015875	AGA	2	6	1347253	1347258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164059
23102	NC_015875	GGA	2	6	1347269	1347274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164059
23103	NC_015875	CTG	2	6	1347414	1347419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164059
23104	NC_015875	CTG	2	6	1347429	1347434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164059
23105	NC_015875	CTTCA	2	10	1347437	1347446	20 %	40 %	0 %	40 %	342164059
23106	NC_015875	CTG	2	6	1347455	1347460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164059
23107	NC_015875	GAG	2	6	1347590	1347595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164059
23108	NC_015875	TGG	2	6	1347628	1347633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342164059
23109	NC_015875	CTGG	2	8	1347717	1347724	0 %	25 %	50 %	25 %	342164059
23110	NC_015875	CAAC	2	8	1347777	1347784	50 %	0 %	0 %	50 %	342164059
23111	NC_015875	ACC	2	6	1347858	1347863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164059
23112	NC_015875	CTT	2	6	1347886	1347891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164059
23113	NC_015875	TTTA	2	8	1347911	1347918	25 %	75 %	0 %	0 %	342164059
23114	NC_015875	ATA	2	6	1348512	1348517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164060
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23116	NC_015875	GTA	2	6	1348575	1348580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164060
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23221	NC_015875	ATCTT	2	10	1354419	1354428	20 %	60 %	0 %	20 %	342164064
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23223	NC_015875	AG	3	6	1354588	1354593	50 %	0 %	50 %	0 %	342164064
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23228	NC_015875	TTGAGG	2	12	1354926	1354937	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	342164064
23229	NC_015875	AGCC	2	8	1354987	1354994	25 %	0 %	25 %	50 %	342164064
23230	NC_015875	GT	3	6	1355125	1355130	0 %	50 %	50 %	0 %	342164064
23231	NC_015875	AAGA	2	8	1355144	1355151	75 %	0 %	25 %	0 %	342164064
23232	NC_015875	GCA	2	6	1355169	1355174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342164064
23233	NC_015875	GGCATG	2	12	1355219	1355230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	342164064
23234	NC_015875	GCAC	2	8	1355265	1355272	25 %	0 %	25 %	50 %	342164064
23235	NC_015875	CAC	2	6	1355290	1355295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164064
23236	NC_015875	CATC	2	8	1355329	1355336	25 %	25 %	0 %	50 %	342164064
23237	NC_015875	CGAA	2	8	1355387	1355394	50 %	0 %	25 %	25 %	342164064
23238	NC_015875	CCA	2	6	1355413	1355418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164064
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23240	NC_015875	GAAC	2	8	1355535	1355542	50 %	0 %	25 %	25 %	342164064
23241	NC_015875	CCAACT	2	12	1355545	1355556	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	342164064
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23245	NC_015875	ATAC	2	8	1355819	1355826	50 %	25 %	0 %	25 %	342164064
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23248	NC_015875	AAGG	2	8	1356035	1356042	50 %	0 %	50 %	0 %	342164065
23249	NC_015875	ACAG	2	8	1356067	1356074	50 %	0 %	25 %	25 %	342164065
23250	NC_015875	A	7	7	1356165	1356171	100 %	0 %	0 %	0 %	342164065
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23345	NC_015875	ACC	2	6	1361033	1361038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164071
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23348	NC_015875	CAA	2	6	1361140	1361145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342164071
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23351	NC_015875	TCA	2	6	1361446	1361451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164071
23352	NC_015875	TCA	2	6	1361463	1361468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164071
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23469	NC_015875	AAT	2	6	1368636	1368641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164080
23470	NC_015875	CCA	2	6	1368654	1368659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164080
23471	NC_015875	TGCA	2	8	1368679	1368686	25 %	25 %	25 %	25 %	342164080
23472	NC_015875	GAA	2	6	1368802	1368807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164080
23473	NC_015875	ATC	2	6	1368879	1368884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164080
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23492	NC_015875	TGA	2	6	1369824	1369829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164082
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23500	NC_015875	GAAA	2	8	1370248	1370255	75 %	0 %	25 %	0 %	342164082

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