MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015875	CAT	2	6	1220420	1220425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163933
21002	NC_015875	TGAC	2	8	1220511	1220518	25 %	25 %	25 %	25 %	342163933
21003	NC_015875	CTC	2	6	1220543	1220548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163933
21004	NC_015875	GCA	2	6	1220580	1220585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163933
21005	NC_015875	ATC	2	6	1220636	1220641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163933
21006	NC_015875	ATG	2	6	1220643	1220648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163933
21007	NC_015875	AACCA	2	10	1220819	1220828	60 %	0 %	0 %	40 %	342163933
21008	NC_015875	AACC	2	8	1220854	1220861	50 %	0 %	0 %	50 %	342163933
21009	NC_015875	CAA	2	6	1220869	1220874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163933
21010	NC_015875	CAA	2	6	1220900	1220905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163933
21011	NC_015875	TTGC	2	8	1220925	1220932	0 %	50 %	25 %	25 %	342163933
21012	NC_015875	ACA	2	6	1220944	1220949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163933
21013	NC_015875	CTG	2	6	1221020	1221025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163934
21014	NC_015875	ATA	2	6	1221049	1221054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163934
21015	NC_015875	ACA	2	6	1221094	1221099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163934
21016	NC_015875	ATTTT	2	10	1221127	1221136	20 %	80 %	0 %	0 %	342163934
21017	NC_015875	CTC	2	6	1221150	1221155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163934
21018	NC_015875	CTGCAA	2	12	1221203	1221214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	342163934
21019	NC_015875	CTG	2	6	1221263	1221268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163934
21020	NC_015875	GCC	2	6	1221280	1221285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	342163934
21021	NC_015875	TCAA	2	8	1221355	1221362	50 %	25 %	0 %	25 %	342163934
21022	NC_015875	CCT	2	6	1221416	1221421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163934
21023	NC_015875	AAT	2	6	1221498	1221503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163934
21024	NC_015875	CTTG	2	8	1221629	1221636	0 %	50 %	25 %	25 %	342163935
21025	NC_015875	A	8	8	1221667	1221674	100 %	0 %	0 %	0 %	342163935
21026	NC_015875	GAA	2	6	1221747	1221752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163935
21027	NC_015875	CGATT	2	10	1221773	1221782	20 %	40 %	20 %	20 %	342163935
21028	NC_015875	TTC	2	6	1221790	1221795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163935
21029	NC_015875	CTT	2	6	1221825	1221830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163935
21030	NC_015875	AGA	2	6	1221992	1221997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163935
21031	NC_015875	CCTTA	2	10	1222089	1222098	20 %	40 %	0 %	40 %	342163935
21032	NC_015875	GAG	2	6	1222143	1222148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163935
21033	NC_015875	TTA	2	6	1222149	1222154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163935
21034	NC_015875	CCT	2	6	1222175	1222180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163935
21035	NC_015875	GTG	2	6	1222245	1222250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163935
21036	NC_015875	GAAAA	2	10	1222251	1222260	80 %	0 %	20 %	0 %	342163935
21037	NC_015875	A	6	6	1222257	1222262	100 %	0 %	0 %	0 %	342163935
21038	NC_015875	AAAT	2	8	1222271	1222278	75 %	25 %	0 %	0 %	342163935
21039	NC_015875	CAA	2	6	1222301	1222306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163935
21040	NC_015875	TTC	2	6	1222796	1222801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163936
21041	NC_015875	GAG	2	6	1222846	1222851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163936
21042	NC_015875	AT	3	6	1222852	1222857	50 %	50 %	0 %	0 %	342163936
21043	NC_015875	CTG	2	6	1222858	1222863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163936
21044	NC_015875	TTG	2	6	1222903	1222908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163936
21045	NC_015875	CCA	2	6	1222956	1222961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342163936
21046	NC_015875	ATC	3	9	1222962	1222970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163936
21047	NC_015875	TTATCG	2	12	1222981	1222992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342163936
21048	NC_015875	GTT	2	6	1223070	1223075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163936
21049	NC_015875	TGC	2	6	1223087	1223092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163936
21050	NC_015875	GGT	2	6	1223154	1223159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163936
21051	NC_015875	CTTGG	2	10	1223178	1223187	0 %	40 %	40 %	20 %	342163936
21052	NC_015875	GGT	2	6	1223256	1223261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163936
21053	NC_015875	CTT	2	6	1223415	1223420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163936
21054	NC_015875	CCTT	2	8	1223449	1223456	0 %	50 %	0 %	50 %	342163936
21055	NC_015875	TGG	2	6	1223618	1223623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163936
21056	NC_015875	TCA	2	6	1223713	1223718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163936
21057	NC_015875	CTTGGA	2	12	1223739	1223750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	342163936
21058	NC_015875	ATC	2	6	1223814	1223819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163936
21059	NC_015875	CCT	2	6	1224329	1224334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163937
21060	NC_015875	TCT	2	6	1224567	1224572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163938
21061	NC_015875	ATTTT	2	10	1224582	1224591	20 %	80 %	0 %	0 %	342163938
21062	NC_015875	GT	3	6	1224694	1224699	0 %	50 %	50 %	0 %	342163938
21063	NC_015875	AGGA	2	8	1224700	1224707	50 %	0 %	50 %	0 %	342163938
21064	NC_015875	AT	3	6	1224816	1224821	50 %	50 %	0 %	0 %	342163938
21065	NC_015875	T	6	6	1225076	1225081	0 %	100 %	0 %	0 %	342163939
21066	NC_015875	TTTAG	2	10	1225084	1225093	20 %	60 %	20 %	0 %	342163939
21067	NC_015875	TCTT	2	8	1225114	1225121	0 %	75 %	0 %	25 %	342163939
21068	NC_015875	AG	3	6	1225133	1225138	50 %	0 %	50 %	0 %	342163939
21069	NC_015875	GTT	2	6	1225860	1225865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163940
21070	NC_015875	AGAT	2	8	1225937	1225944	50 %	25 %	25 %	0 %	342163940
21071	NC_015875	GA	3	6	1226029	1226034	50 %	0 %	50 %	0 %	342163940
21072	NC_015875	CAA	2	6	1226084	1226089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163940
21073	NC_015875	ATC	2	6	1226099	1226104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163940
21074	NC_015875	GAAT	2	8	1226123	1226130	50 %	25 %	25 %	0 %	342163940
21075	NC_015875	TTG	2	6	1226135	1226140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163940
21076	NC_015875	TAT	2	6	1226142	1226147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163940
21077	NC_015875	CTA	2	6	1226312	1226317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163941
21078	NC_015875	TCT	2	6	1226345	1226350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163941
21079	NC_015875	AACAG	2	10	1226412	1226421	60 %	0 %	20 %	20 %	342163941
21080	NC_015875	CTT	3	9	1226422	1226430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163941
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21082	NC_015875	TGC	3	9	1226582	1226590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163941
21083	NC_015875	AG	3	6	1226758	1226763	50 %	0 %	50 %	0 %	342163941
21084	NC_015875	ATA	2	6	1226816	1226821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163941
21085	NC_015875	TGTC	2	8	1226989	1226996	0 %	50 %	25 %	25 %	342163941
21086	NC_015875	GTA	2	6	1227014	1227019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163941
21087	NC_015875	AAC	2	6	1227057	1227062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163941
21088	NC_015875	AAT	2	6	1227074	1227079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163941
21089	NC_015875	TTG	2	6	1227133	1227138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163941
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21091	NC_015875	CCA	2	6	1227237	1227242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342163942
21092	NC_015875	CTGG	2	8	1227258	1227265	0 %	25 %	50 %	25 %	342163942
21093	NC_015875	TTG	2	6	1227360	1227365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163942
21094	NC_015875	GCT	2	6	1227390	1227395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163942
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21097	NC_015875	TGA	2	6	1227471	1227476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163942
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21099	NC_015875	CAA	2	6	1227631	1227636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163942
21100	NC_015875	TAA	2	6	1227716	1227721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163942
21101	NC_015875	AAGC	2	8	1227770	1227777	50 %	0 %	25 %	25 %	342163942
21102	NC_015875	CCT	2	6	1227825	1227830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163942
21103	NC_015875	CAT	2	6	1227850	1227855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163942
21104	NC_015875	CAT	2	6	1227928	1227933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163942
21105	NC_015875	CAT	2	6	1228027	1228032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163942
21106	NC_015875	TGG	2	6	1228033	1228038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163942
21107	NC_015875	TAAA	2	8	1228046	1228053	75 %	25 %	0 %	0 %	342163942
21108	NC_015875	AGAT	2	8	1228085	1228092	50 %	25 %	25 %	0 %	342163942
21109	NC_015875	CCA	2	6	1228102	1228107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342163942
21110	NC_015875	GAT	2	6	1228142	1228147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163942
21111	NC_015875	AGC	2	6	1228166	1228171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163942
21112	NC_015875	ATG	2	6	1228226	1228231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163942
21113	NC_015875	CTG	2	6	1228243	1228248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163942
21114	NC_015875	T	7	7	1228265	1228271	0 %	100 %	0 %	0 %	342163942
21115	NC_015875	CAT	2	6	1228280	1228285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163942
21116	NC_015875	TAT	2	6	1228389	1228394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163943
21117	NC_015875	AGA	2	6	1228504	1228509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163943
21118	NC_015875	CAT	2	6	1228767	1228772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163943
21119	NC_015875	TCT	2	6	1228775	1228780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163943
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21122	NC_015875	ATC	2	6	1228876	1228881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163943
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21467	NC_015875	CTG	2	6	1253614	1253619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163967
21468	NC_015875	TCC	2	6	1253642	1253647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163967
21469	NC_015875	CTT	2	6	1253686	1253691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163967
21470	NC_015875	T	6	6	1253937	1253942	0 %	100 %	0 %	0 %	342163968
21471	NC_015875	CTT	2	6	1253953	1253958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163968
21472	NC_015875	CATT	2	8	1254006	1254013	25 %	50 %	0 %	25 %	342163968
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21474	NC_015875	TGC	2	6	1254145	1254150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163968
21475	NC_015875	AGA	2	6	1254192	1254197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163968
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21477	NC_015875	AGA	2	6	1254233	1254238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163968
21478	NC_015875	CGA	2	6	1254363	1254368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163968
21479	NC_015875	TAT	2	6	1254369	1254374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163968
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21481	NC_015875	GTC	2	6	1254457	1254462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163968
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21486	NC_015875	ATA	2	6	1254725	1254730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163968
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21488	NC_015875	ATT	2	6	1254766	1254771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163968
21489	NC_015875	TAA	2	6	1254831	1254836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163968
21490	NC_015875	TCA	2	6	1254860	1254865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163968
21491	NC_015875	CAC	2	6	1254868	1254873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342163968
21492	NC_015875	TCAA	2	8	1254875	1254882	50 %	25 %	0 %	25 %	342163968
21493	NC_015875	GGT	2	6	1254885	1254890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163968
21494	NC_015875	GA	3	6	1254915	1254920	50 %	0 %	50 %	0 %	342163968
21495	NC_015875	CAG	2	6	1254972	1254977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163968
21496	NC_015875	TTC	2	6	1255009	1255014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163968
21497	NC_015875	GAG	2	6	1255101	1255106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163968
21498	NC_015875	GCT	2	6	1255169	1255174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163968
21499	NC_015875	GACAC	2	10	1255220	1255229	40 %	0 %	20 %	40 %	342163968
21500	NC_015875	TTC	2	6	1255815	1255820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163969

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