MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015875	ATT	2	6	59163	59168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162754
1002	NC_015875	TGAT	2	8	59186	59193	25 %	50 %	25 %	0 %	342162754
1003	NC_015875	TAAG	2	8	59219	59226	50 %	25 %	25 %	0 %	342162754
1004	NC_015875	CTC	2	6	59228	59233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162754
1005	NC_015875	TGG	2	6	59262	59267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162754
1006	NC_015875	T	6	6	59268	59273	0 %	100 %	0 %	0 %	342162754
1007	NC_015875	CGGTCT	2	12	59373	59384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1008	NC_015875	GGT	2	6	59431	59436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162754
1009	NC_015875	GAAGC	2	10	59456	59465	40 %	0 %	40 %	20 %	342162754
1010	NC_015875	GCT	2	6	59491	59496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1011	NC_015875	TCTAGT	2	12	59500	59511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	342162754
1012	NC_015875	TGG	2	6	59558	59563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162754
1013	NC_015875	GTG	2	6	59564	59569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162754
1014	NC_015875	GGA	2	6	59584	59589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162754
1015	NC_015875	TCTA	2	8	59594	59601	25 %	50 %	0 %	25 %	342162754
1016	NC_015875	AAGA	2	8	59608	59615	75 %	0 %	25 %	0 %	342162754
1017	NC_015875	GGA	2	6	59634	59639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162754
1018	NC_015875	GAT	2	6	59701	59706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1019	NC_015875	CAG	2	6	59714	59719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1020	NC_015875	AGC	2	6	59793	59798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1021	NC_015875	GAA	2	6	59827	59832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1022	NC_015875	GAA	2	6	59860	59865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1023	NC_015875	A	6	6	59883	59888	100 %	0 %	0 %	0 %	342162754
1024	NC_015875	GTT	2	6	59896	59901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162754
1025	NC_015875	AAG	2	6	59978	59983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1026	NC_015875	AAC	2	6	60001	60006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162754
1027	NC_015875	AG	3	6	60010	60015	50 %	0 %	50 %	0 %	342162754
1028	NC_015875	ATG	2	6	60037	60042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1029	NC_015875	AAC	2	6	60056	60061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162754
1030	NC_015875	GA	3	6	60089	60094	50 %	0 %	50 %	0 %	342162754
1031	NC_015875	CA	3	6	60124	60129	50 %	0 %	0 %	50 %	342162754
1032	NC_015875	GAA	2	6	60141	60146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1033	NC_015875	GAA	2	6	60157	60162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1034	NC_015875	AAC	2	6	60197	60202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162754
1035	NC_015875	A	7	7	60241	60247	100 %	0 %	0 %	0 %	342162754
1036	NC_015875	AAAC	2	8	60260	60267	75 %	0 %	0 %	25 %	342162754
1037	NC_015875	ACT	2	6	60362	60367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162754
1038	NC_015875	GAA	2	6	60370	60375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1039	NC_015875	GAA	2	6	60391	60396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1040	NC_015875	GCA	2	6	60430	60435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1041	NC_015875	A	6	6	60446	60451	100 %	0 %	0 %	0 %	342162754
1042	NC_015875	GA	3	6	60507	60512	50 %	0 %	50 %	0 %	342162754
1043	NC_015875	ATG	2	6	60518	60523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1044	NC_015875	TCG	2	6	60536	60541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1045	NC_015875	TGA	2	6	60549	60554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1046	NC_015875	ACA	2	6	60557	60562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162754
1047	NC_015875	AAG	2	6	60587	60592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1048	NC_015875	CTG	2	6	60614	60619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1049	NC_015875	GCAATT	2	12	60630	60641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	342162754
1050	NC_015875	GAA	2	6	60733	60738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
1051	NC_015875	CTG	2	6	60821	60826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1052	NC_015875	TGA	2	6	60860	60865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1053	NC_015875	GAG	2	6	60874	60879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162754
1054	NC_015875	ATG	2	6	60902	60907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162754
1055	NC_015875	AAC	2	6	61051	61056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162754
1056	NC_015875	ATCT	2	8	61091	61098	25 %	50 %	0 %	25 %	342162754
1057	NC_015875	CGT	2	6	61332	61337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1058	NC_015875	TGG	2	6	61491	61496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162754
1059	NC_015875	GAGGG	2	10	61576	61585	20 %	0 %	80 %	0 %	342162754
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1061	NC_015875	GCGG	2	8	61623	61630	0 %	0 %	75 %	25 %	342162754
1062	NC_015875	TGC	2	6	61674	61679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162754
1063	NC_015875	GAA	2	6	61723	61728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162754
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1066	NC_015875	AGGG	2	8	61927	61934	25 %	0 %	75 %	0 %	342162754
1067	NC_015875	AATGT	2	10	61935	61944	40 %	40 %	20 %	0 %	342162754
1068	NC_015875	GTG	2	6	61992	61997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162755
1069	NC_015875	GCT	2	6	62019	62024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162755
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1071	NC_015875	ATGC	2	8	62259	62266	25 %	25 %	25 %	25 %	342162755
1072	NC_015875	CTC	2	6	62323	62328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162755
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1076	NC_015875	ATTG	2	8	62469	62476	25 %	50 %	25 %	0 %	342162755
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1083	NC_015875	AAT	2	6	62885	62890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162756
1084	NC_015875	GTA	2	6	62955	62960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162756
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1096	NC_015875	ATCA	2	8	63818	63825	50 %	25 %	0 %	25 %	342162756
1097	NC_015875	ATG	2	6	63843	63848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162756
1098	NC_015875	CT	3	6	63910	63915	0 %	50 %	0 %	50 %	342162756
1099	NC_015875	CT	3	6	63971	63976	0 %	50 %	0 %	50 %	342162756
1100	NC_015875	A	6	6	64173	64178	100 %	0 %	0 %	0 %	342162757
1101	NC_015875	GAA	2	6	64214	64219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162757
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1106	NC_015875	GTT	3	9	64642	64650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162758
1107	NC_015875	TGA	2	6	64668	64673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162758
1108	NC_015875	GGT	2	6	64735	64740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162758
1109	NC_015875	TGAT	2	8	64763	64770	25 %	50 %	25 %	0 %	342162758
1110	NC_015875	AAG	2	6	64774	64779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162758
1111	NC_015875	TTC	2	6	64810	64815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162758
1112	NC_015875	A	6	6	64820	64825	100 %	0 %	0 %	0 %	342162758
1113	NC_015875	ATGGT	2	10	64841	64850	20 %	40 %	40 %	0 %	342162758
1114	NC_015875	CG	3	6	64933	64938	0 %	0 %	50 %	50 %	342162758
1115	NC_015875	AAG	3	9	64979	64987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162758
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1117	NC_015875	GAT	2	6	65179	65184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162758
1118	NC_015875	GAA	2	6	65191	65196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162758
1119	NC_015875	CAA	2	6	65212	65217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162758
1120	NC_015875	GACA	2	8	65232	65239	50 %	0 %	25 %	25 %	342162758
1121	NC_015875	CGTC	2	8	65240	65247	0 %	25 %	25 %	50 %	342162758
1122	NC_015875	ATG	2	6	65255	65260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162758
1123	NC_015875	CTT	2	6	65345	65350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162758
1124	NC_015875	TGG	2	6	65364	65369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162758
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