MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015875	GCG	2	6	819258	819263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	342163515
14002	NC_015875	TAT	2	6	819302	819307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163515
14003	NC_015875	CTT	2	6	819308	819313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163515
14004	NC_015875	A	6	6	819354	819359	100 %	0 %	0 %	0 %	342163515
14005	NC_015875	AGG	2	6	819368	819373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163515
14006	NC_015875	TCT	2	6	819416	819421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163516
14007	NC_015875	TGG	2	6	819460	819465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163516
14008	NC_015875	GTG	3	9	819480	819488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163516
14009	NC_015875	TTATGG	2	12	819513	819524	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	342163516
14010	NC_015875	AGC	2	6	819574	819579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163516
14011	NC_015875	CTTG	2	8	819595	819602	0 %	50 %	25 %	25 %	342163516
14012	NC_015875	ATC	2	6	819632	819637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163516
14013	NC_015875	GCA	3	9	819641	819649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163516
14014	NC_015875	TGT	2	6	819673	819678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163516
14015	NC_015875	GCCT	2	8	819706	819713	0 %	25 %	25 %	50 %	342163516
14016	NC_015875	TCT	2	6	819828	819833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163516
14017	NC_015875	TCT	2	6	819847	819852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163516
14018	NC_015875	CTTG	2	8	819881	819888	0 %	50 %	25 %	25 %	342163516
14019	NC_015875	TTA	2	6	819999	820004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163516
14020	NC_015875	TCAA	2	8	820045	820052	50 %	25 %	0 %	25 %	342163516
14021	NC_015875	TTG	2	6	820080	820085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163516
14022	NC_015875	TGC	2	6	820105	820110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163516
14023	NC_015875	GAT	2	6	820111	820116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163516
14024	NC_015875	TCT	2	6	820158	820163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163516
14025	NC_015875	CTTT	2	8	820278	820285	0 %	75 %	0 %	25 %	342163516
14026	NC_015875	ATCAA	2	10	820325	820334	60 %	20 %	0 %	20 %	342163516
14027	NC_015875	T	6	6	820380	820385	0 %	100 %	0 %	0 %	342163517
14028	NC_015875	TGG	2	6	820393	820398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163517
14029	NC_015875	ATA	2	6	820498	820503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163517
14030	NC_015875	AG	3	6	820511	820516	50 %	0 %	50 %	0 %	342163517
14031	NC_015875	TAC	2	6	820610	820615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163517
14032	NC_015875	AGA	2	6	820658	820663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163517
14033	NC_015875	GAA	2	6	820808	820813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163517
14034	NC_015875	GTT	2	6	820894	820899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163517
14035	NC_015875	GATT	2	8	820928	820935	25 %	50 %	25 %	0 %	342163517
14036	NC_015875	TAA	2	6	820998	821003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163517
14037	NC_015875	A	6	6	821159	821164	100 %	0 %	0 %	0 %	342163518
14038	NC_015875	ATG	3	9	821188	821196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163518
14039	NC_015875	CCA	2	6	821276	821281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342163518
14040	NC_015875	TCG	2	6	821296	821301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163518
14041	NC_015875	GGA	2	6	821466	821471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163518
14042	NC_015875	GGT	2	6	821484	821489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163518
14043	NC_015875	TGG	2	6	821501	821506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163518
14044	NC_015875	TTC	2	6	821522	821527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163518
14045	NC_015875	TGG	2	6	821606	821611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163518
14046	NC_015875	GAA	2	6	821630	821635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163518
14047	NC_015875	AAGTAG	2	12	821920	821931	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342163518
14048	NC_015875	ATG	2	6	821944	821949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163518
14049	NC_015875	CGG	2	6	821999	822004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	342163518
14050	NC_015875	ATGA	2	8	822045	822052	50 %	25 %	25 %	0 %	342163518
14051	NC_015875	AGC	2	6	822125	822130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163518
14052	NC_015875	TTCT	2	8	822133	822140	0 %	75 %	0 %	25 %	342163518
14053	NC_015875	GAA	2	6	822153	822158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163518
14054	NC_015875	CTT	2	6	822248	822253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163518
14055	NC_015875	AGC	2	6	822323	822328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163518
14056	NC_015875	TGA	2	6	822341	822346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163518
14057	NC_015875	GAA	2	6	822359	822364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163518
14058	NC_015875	AAGA	2	8	822369	822376	75 %	0 %	25 %	0 %	342163518
14059	NC_015875	CCCAG	2	10	822404	822413	20 %	0 %	20 %	60 %	342163518
14060	NC_015875	CAAAGG	2	12	822791	822802	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	342163518
14061	NC_015875	AAGA	2	8	822804	822811	75 %	0 %	25 %	0 %	342163518
14062	NC_015875	GGAC	2	8	822829	822836	25 %	0 %	50 %	25 %	342163518
14063	NC_015875	AGA	2	6	822845	822850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163518
14064	NC_015875	AAC	2	6	822932	822937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163518
14065	NC_015875	GAA	2	6	823077	823082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163518
14066	NC_015875	GAAA	2	8	823099	823106	75 %	0 %	25 %	0 %	342163519
14067	NC_015875	ATA	2	6	823107	823112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163519
14068	NC_015875	A	6	6	823184	823189	100 %	0 %	0 %	0 %	342163519
14069	NC_015875	GAA	2	6	823205	823210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163519
14070	NC_015875	ACAA	2	8	823308	823315	75 %	0 %	0 %	25 %	342163519
14071	NC_015875	TTGA	2	8	823325	823332	25 %	50 %	25 %	0 %	342163519
14072	NC_015875	AAAC	2	8	823333	823340	75 %	0 %	0 %	25 %	342163519
14073	NC_015875	CAAA	2	8	823364	823371	75 %	0 %	0 %	25 %	342163519
14074	NC_015875	TGA	2	6	823387	823392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163519
14075	NC_015875	GAA	2	6	823502	823507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163519
14076	NC_015875	TAT	2	6	823526	823531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163519
14077	NC_015875	T	6	6	823588	823593	0 %	100 %	0 %	0 %	342163519
14078	NC_015875	GAA	3	9	823643	823651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163519
14079	NC_015875	TGAT	2	8	823665	823672	25 %	50 %	25 %	0 %	342163519
14080	NC_015875	ATA	2	6	823728	823733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163519
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14083	NC_015875	TGA	2	6	823816	823821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163519
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14085	NC_015875	ATCAA	2	10	823890	823899	60 %	20 %	0 %	20 %	342163519
14086	NC_015875	CTT	2	6	823953	823958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163519
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14088	NC_015875	CCT	2	6	824198	824203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163519
14089	NC_015875	ATG	2	6	824216	824221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163519
14090	NC_015875	TGA	2	6	824306	824311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163520
14091	NC_015875	GAG	2	6	824359	824364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163520
14092	NC_015875	AAGA	2	8	824377	824384	75 %	0 %	25 %	0 %	342163520
14093	NC_015875	TTC	2	6	824444	824449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163520
14094	NC_015875	ATC	2	6	824492	824497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163520
14095	NC_015875	GAA	2	6	824560	824565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163520
14096	NC_015875	GTG	2	6	824609	824614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342163520
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14098	NC_015875	TCTA	2	8	824758	824765	25 %	50 %	0 %	25 %	342163520
14099	NC_015875	AG	3	6	824921	824926	50 %	0 %	50 %	0 %	342163520
14100	NC_015875	GAT	2	6	825046	825051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163520
14101	NC_015875	ACT	2	6	825071	825076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163520
14102	NC_015875	AAC	2	6	825092	825097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342163520
14103	NC_015875	A	7	7	825126	825132	100 %	0 %	0 %	0 %	342163520
14104	NC_015875	GA	3	6	825191	825196	50 %	0 %	50 %	0 %	342163521
14105	NC_015875	ATTT	2	8	825211	825218	25 %	75 %	0 %	0 %	342163521
14106	NC_015875	CAGAT	2	10	825253	825262	40 %	20 %	20 %	20 %	342163521
14107	NC_015875	A	6	6	825347	825352	100 %	0 %	0 %	0 %	342163521
14108	NC_015875	T	6	6	825382	825387	0 %	100 %	0 %	0 %	342163521
14109	NC_015875	GAT	2	6	825414	825419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163521
14110	NC_015875	TTCAA	2	10	825479	825488	40 %	40 %	0 %	20 %	342163521
14111	NC_015875	CCT	2	6	825548	825553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163521
14112	NC_015875	ATC	2	6	825679	825684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163521
14113	NC_015875	A	6	6	825689	825694	100 %	0 %	0 %	0 %	342163521
14114	NC_015875	TGA	2	6	825695	825700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342163521
14115	NC_015875	GGA	2	6	825829	825834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163522
14116	NC_015875	AG	3	6	825891	825896	50 %	0 %	50 %	0 %	342163522
14117	NC_015875	GAA	2	6	825898	825903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163522
14118	NC_015875	AAG	2	6	826010	826015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163522
14119	NC_015875	TTTA	2	8	826040	826047	25 %	75 %	0 %	0 %	342163522
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14121	NC_015875	AAT	2	6	826147	826152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342163522
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14361	NC_015875	GCA	2	6	840100	840105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163536
14362	NC_015875	GGA	2	6	840138	840143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342163536
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14364	NC_015875	TCT	2	6	840184	840189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163536
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14477	NC_015875	T	6	6	846719	846724	0 %	100 %	0 %	0 %	342163543
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14479	NC_015875	TCA	2	6	846774	846779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163543
14480	NC_015875	TTA	2	6	846783	846788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342163543
14481	NC_015875	GTT	2	6	846821	846826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342163543
14482	NC_015875	CGA	2	6	846895	846900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163543
14483	NC_015875	GCG	2	6	846942	846947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	342163543
14484	NC_015875	GTC	2	6	847038	847043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163543
14485	NC_015875	GCA	2	6	847227	847232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342163543
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14487	NC_015875	CCT	2	6	847266	847271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342163543
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14493	NC_015875	ATC	2	6	847469	847474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342163544
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14498	NC_015875	TG	3	6	847647	847652	0 %	50 %	50 %	0 %	342163544
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14500	NC_015875	TTC	2	6	847851	847856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342163544

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