MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 38129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_015760	CTG	2	6	1445717	1445722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399113
25003	NC_015760	ATTT	2	8	1445842	1445849	25 %	75 %	0 %	0 %	340399114
25004	NC_015760	T	6	6	1445855	1445860	0 %	100 %	0 %	0 %	340399114
25005	NC_015760	TCT	2	6	1445902	1445907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399114
25006	NC_015760	TTTG	2	8	1445920	1445927	0 %	75 %	25 %	0 %	340399114
25007	NC_015760	TTC	2	6	1445968	1445973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399114
25008	NC_015760	TCT	2	6	1445989	1445994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399115
25009	NC_015760	ATG	2	6	1446034	1446039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399115
25010	NC_015760	CGT	2	6	1446061	1446066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399115
25011	NC_015760	CCTTGT	2	12	1446146	1446157	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340399115
25012	NC_015760	GCATAG	2	12	1446307	1446318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340399115
25013	NC_015760	CCG	2	6	1446323	1446328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340399115
25014	NC_015760	TGA	2	6	1446341	1446346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399115
25015	NC_015760	GGC	2	6	1446360	1446365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340399115
25016	NC_015760	CAT	2	6	1446396	1446401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399115
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25019	NC_015760	CTT	2	6	1446620	1446625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399115
25020	NC_015760	TAA	2	6	1446731	1446736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399115
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25022	NC_015760	CTT	2	6	1446811	1446816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399116
25023	NC_015760	CTTT	2	8	1446912	1446919	0 %	75 %	0 %	25 %	340399116
25024	NC_015760	ATC	2	6	1446988	1446993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399116
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25028	NC_015760	TCA	2	6	1447326	1447331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399116
25029	NC_015760	AAG	2	6	1447345	1447350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340399116
25030	NC_015760	CTTC	2	8	1447536	1447543	0 %	50 %	0 %	50 %	340399116
25031	NC_015760	ATC	2	6	1447558	1447563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399116
25032	NC_015760	CTG	2	6	1447582	1447587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399116
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25034	NC_015760	CCTTC	2	10	1447764	1447773	0 %	40 %	0 %	60 %	340399116
25035	NC_015760	CAT	2	6	1447939	1447944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399116
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25109	NC_015760	GGT	2	6	1452854	1452859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340399124
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25115	NC_015760	TAA	2	6	1453100	1453105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399124
25116	NC_015760	T	7	7	1453120	1453126	0 %	100 %	0 %	0 %	340399124
25117	NC_015760	TCA	2	6	1453156	1453161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399124
25118	NC_015760	TCA	2	6	1453222	1453227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399124
25119	NC_015760	CGTCAA	2	12	1453439	1453450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340399124
25120	NC_015760	ATC	2	6	1453465	1453470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399124
25121	NC_015760	T	6	6	1453812	1453817	0 %	100 %	0 %	0 %	340399125
25122	NC_015760	ACC	2	6	1453834	1453839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340399125
25123	NC_015760	TTG	2	6	1453898	1453903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399125
25124	NC_015760	T	6	6	1453933	1453938	0 %	100 %	0 %	0 %	340399125
25125	NC_015760	TGT	2	6	1453951	1453956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399125
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25129	NC_015760	ATT	2	6	1454107	1454112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340399125
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25132	NC_015760	TAA	2	6	1454244	1454249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399125
25133	NC_015760	CT	3	6	1454278	1454283	0 %	50 %	0 %	50 %	340399126
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25135	NC_015760	TGA	3	9	1454348	1454356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
25136	NC_015760	TGA	2	6	1454369	1454374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
25137	NC_015760	GAT	2	6	1454388	1454393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
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25140	NC_015760	CTT	2	6	1454660	1454665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399126
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25143	NC_015760	TTG	2	6	1454738	1454743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399126
25144	NC_015760	CAT	2	6	1454785	1454790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399126
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25148	NC_015760	TGA	2	6	1454870	1454875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
25149	NC_015760	TGA	2	6	1454891	1454896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
25150	NC_015760	TGA	3	9	1454912	1454920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399126
25151	NC_015760	GTT	2	6	1454963	1454968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399126
25152	NC_015760	TTGT	2	8	1454970	1454977	0 %	75 %	25 %	0 %	340399126
25153	NC_015760	TCA	2	6	1455048	1455053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399126
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25222	NC_015760	GTCAC	2	10	1458431	1458440	20 %	20 %	20 %	40 %	340399129
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25232	NC_015760	ATT	2	6	1459060	1459065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340399129
25233	NC_015760	ATA	2	6	1459310	1459315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399130
25234	NC_015760	ATC	2	6	1459413	1459418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399130
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25264	NC_015760	A	6	6	1461124	1461129	100 %	0 %	0 %	0 %	340399131
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25335	NC_015760	CTC	2	6	1464925	1464930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340399134
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25338	NC_015760	CT	3	6	1465052	1465057	0 %	50 %	0 %	50 %	340399134
25339	NC_015760	TCC	2	6	1465136	1465141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340399134
25340	NC_015760	CTA	2	6	1465192	1465197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399134
25341	NC_015760	TTGCC	2	10	1465283	1465292	0 %	40 %	20 %	40 %	340399134
25342	NC_015760	TAC	2	6	1465315	1465320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399134
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25344	NC_015760	TCTCAA	2	12	1465407	1465418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399134
25345	NC_015760	TTC	2	6	1465510	1465515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399135
25346	NC_015760	TTC	2	6	1465660	1465665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399135
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25348	NC_015760	TTA	2	6	1465905	1465910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340399136
25349	NC_015760	AGA	2	6	1465965	1465970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340399136
25350	NC_015760	AAGAT	2	10	1466028	1466037	60 %	20 %	20 %	0 %	340399136
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25352	NC_015760	ATC	2	6	1466266	1466271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399137
25353	NC_015760	TTG	2	6	1466321	1466326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399137
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25355	NC_015760	TGC	2	6	1466358	1466363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399137
25356	NC_015760	CTT	2	6	1466433	1466438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399137
25357	NC_015760	TTG	2	6	1466458	1466463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399137
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25364	NC_015760	CTC	2	6	1466866	1466871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340399138
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25444	NC_015760	AGAT	2	8	1471999	1472006	50 %	25 %	25 %	0 %	340399145
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25449	NC_015760	GTC	2	6	1472163	1472168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399145
25450	NC_015760	GTTC	2	8	1472290	1472297	0 %	50 %	25 %	25 %	340399145
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25454	NC_015760	AAT	2	6	1472552	1472557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399145
25455	NC_015760	GA	3	6	1472591	1472596	50 %	0 %	50 %	0 %	340399145
25456	NC_015760	CAG	2	6	1472600	1472605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340399145
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25458	NC_015760	TTAC	2	8	1472817	1472824	25 %	50 %	0 %	25 %	340399146
25459	NC_015760	TCT	2	6	1472900	1472905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399146
25460	NC_015760	AAGG	2	8	1472910	1472917	50 %	0 %	50 %	0 %	340399146
25461	NC_015760	AAT	2	6	1472971	1472976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340399146
25462	NC_015760	CAA	2	6	1473030	1473035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340399146
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25464	NC_015760	T	6	6	1473053	1473058	0 %	100 %	0 %	0 %	340399146
25465	NC_015760	GTA	2	6	1473264	1473269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399147
25466	NC_015760	TCC	2	6	1473274	1473279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340399147
25467	NC_015760	CCCTT	2	10	1473361	1473370	0 %	40 %	0 %	60 %	340399147
25468	NC_015760	TCT	2	6	1473550	1473555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399147
25469	NC_015760	GA	3	6	1473605	1473610	50 %	0 %	50 %	0 %	340399148
25470	NC_015760	GGT	2	6	1473687	1473692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340399148
25471	NC_015760	TAT	2	6	1474062	1474067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340399148
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25473	NC_015760	T	6	6	1474144	1474149	0 %	100 %	0 %	0 %	340399148
25474	NC_015760	CGA	2	6	1474194	1474199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340399148
25475	NC_015760	TTG	2	6	1474217	1474222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399148
25476	NC_015760	TAC	2	6	1474248	1474253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399148
25477	NC_015760	CGA	3	9	1474296	1474304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340399148
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25480	NC_015760	CAT	2	6	1474338	1474343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340399148
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25482	NC_015760	GAC	2	6	1474410	1474415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340399148
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25485	NC_015760	GATA	2	8	1474689	1474696	50 %	25 %	25 %	0 %	340399148
25486	NC_015760	CGT	2	6	1474702	1474707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399148
25487	NC_015760	GTG	2	6	1474794	1474799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340399148
25488	NC_015760	GA	3	6	1474827	1474832	50 %	0 %	50 %	0 %	340399148
25489	NC_015760	CTG	2	6	1474854	1474859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340399148
25490	NC_015760	ACG	2	6	1474882	1474887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340399148
25491	NC_015760	TCT	2	6	1474908	1474913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399148
25492	NC_015760	GA	3	6	1474915	1474920	50 %	0 %	50 %	0 %	340399148
25493	NC_015760	T	7	7	1474949	1474955	0 %	100 %	0 %	0 %	340399148
25494	NC_015760	TAG	2	6	1475096	1475101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340399148
25495	NC_015760	TGAT	2	8	1475128	1475135	25 %	50 %	25 %	0 %	340399148
25496	NC_015760	TGT	2	6	1475160	1475165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340399148
25497	NC_015760	TTCAGC	2	12	1475287	1475298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340399148
25498	NC_015760	GCG	2	6	1475377	1475382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340399148
25499	NC_015760	AAGG	2	8	1475394	1475401	50 %	0 %	50 %	0 %	340399148
25500	NC_015760	TTC	2	6	1475407	1475412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340399148

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