MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 59178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015757	TGG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626329
2	NC_015757	GGT	2	6	96	101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626329
3	NC_015757	CGAT	2	8	110	117	25 %	25 %	25 %	25 %	339626329
4	NC_015757	ACG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
5	NC_015757	CGA	2	6	266	271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
6	NC_015757	CGA	2	6	305	310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
7	NC_015757	TGG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626329
8	NC_015757	GCA	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
9	NC_015757	AC	3	6	490	495	50 %	0 %	0 %	50 %	339626329
10	NC_015757	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	339626329
11	NC_015757	CAT	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626329
12	NC_015757	A	6	6	525	530	100 %	0 %	0 %	0 %	339626329
13	NC_015757	GAC	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
14	NC_015757	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626329
15	NC_015757	C	6	6	766	771	0 %	0 %	0 %	100 %	339626329
16	NC_015757	GAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626329
17	NC_015757	TTA	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626329
18	NC_015757	A	6	6	877	882	100 %	0 %	0 %	0 %	339626329
19	NC_015757	AAG	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626329
20	NC_015757	CG	3	6	1200	1205	0 %	0 %	50 %	50 %	339626329
21	NC_015757	CGA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626329
22	NC_015757	TAC	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626329
23	NC_015757	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	339626329
24	NC_015757	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	339626329
25	NC_015757	CG	4	8	1293	1300	0 %	0 %	50 %	50 %	339626329
26	NC_015757	AAC	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626330
27	NC_015757	CGC	2	6	2015	2020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626330
28	NC_015757	CTC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626330
29	NC_015757	GGC	2	6	2132	2137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626330
30	NC_015757	TTCCGG	2	12	2170	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626330
31	NC_015757	CGG	3	9	2251	2259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626330
32	NC_015757	ATG	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626330
33	NC_015757	TCC	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626330
34	NC_015757	TGG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626330
35	NC_015757	G	6	6	2413	2418	0 %	0 %	100 %	0 %	339626330
36	NC_015757	CGC	2	6	2659	2664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626330
37	NC_015757	TGG	3	9	2818	2826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626331
38	NC_015757	ATC	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626331
39	NC_015757	TCG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626331
40	NC_015757	GGA	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339626331
41	NC_015757	GCG	3	9	3098	3106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626331
42	NC_015757	ATC	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626331
43	NC_015757	TGC	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626331
44	NC_015757	GATT	2	8	3220	3227	25 %	50 %	25 %	0 %	339626331
45	NC_015757	GAC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626331
46	NC_015757	GCC	2	6	3274	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626331
47	NC_015757	TTGGCG	2	12	3303	3314	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339626331
48	NC_015757	CAT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626331
49	NC_015757	G	7	7	3372	3378	0 %	0 %	100 %	0 %	339626331
50	NC_015757	GGCG	2	8	3392	3399	0 %	0 %	75 %	25 %	339626331
51	NC_015757	CGA	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626331
52	NC_015757	T	8	8	3492	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	339626331
53	NC_015757	GCC	2	6	3513	3518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626331
54	NC_015757	TTG	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626331
55	NC_015757	GAC	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626331
56	NC_015757	CAA	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626331
57	NC_015757	GGA	2	6	3814	3819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339626332
58	NC_015757	TGG	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626332
59	NC_015757	GCC	2	6	4070	4075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626332
60	NC_015757	CCG	2	6	4096	4101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626332
61	NC_015757	GACC	2	8	4107	4114	25 %	0 %	25 %	50 %	339626332
62	NC_015757	CGG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626332
63	NC_015757	TCA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626332
64	NC_015757	GC	3	6	4203	4208	0 %	0 %	50 %	50 %	339626332
65	NC_015757	ATC	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626332
66	NC_015757	GT	3	6	4280	4285	0 %	50 %	50 %	0 %	339626332
67	NC_015757	CGAC	2	8	4412	4419	25 %	0 %	25 %	50 %	339626333
68	NC_015757	ATC	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626333
69	NC_015757	AAC	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626333
70	NC_015757	GTAT	2	8	4762	4769	25 %	50 %	25 %	0 %	339626334
71	NC_015757	CGG	2	6	4988	4993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
72	NC_015757	CGG	3	9	5000	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
73	NC_015757	GGT	2	6	5051	5056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626334
74	NC_015757	CGA	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626334
75	NC_015757	CGG	2	6	5342	5347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
76	NC_015757	CGT	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626334
77	NC_015757	CTCAAT	2	12	5370	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626334
78	NC_015757	CGTGA	2	10	5382	5391	20 %	20 %	40 %	20 %	339626334
79	NC_015757	CCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626334
80	NC_015757	ACGGG	2	10	5423	5432	20 %	0 %	60 %	20 %	339626334
81	NC_015757	TCG	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626334
82	NC_015757	CG	3	6	5554	5559	0 %	0 %	50 %	50 %	339626334
83	NC_015757	ACA	2	6	5605	5610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626334
84	NC_015757	GAC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626334
85	NC_015757	GAT	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626334
86	NC_015757	AGACCA	2	12	5689	5700	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339626334
87	NC_015757	CGG	2	6	5815	5820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
88	NC_015757	AGC	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626334
89	NC_015757	TCG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626334
90	NC_015757	CGG	2	6	5929	5934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
91	NC_015757	CGGC	2	8	5965	5972	0 %	0 %	50 %	50 %	339626334
92	NC_015757	GAA	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626334
93	NC_015757	C	7	7	6276	6282	0 %	0 %	0 %	100 %	339626334
94	NC_015757	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	339626334
95	NC_015757	TGAA	2	8	6349	6356	50 %	25 %	25 %	0 %	339626334
96	NC_015757	AATG	2	8	6407	6414	50 %	25 %	25 %	0 %	339626334
97	NC_015757	CGG	3	9	6484	6492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626334
98	NC_015757	CAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626335
99	NC_015757	TTC	2	6	6628	6633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626335
100	NC_015757	AGG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339626335
101	NC_015757	A	6	6	6657	6662	100 %	0 %	0 %	0 %	339626335
102	NC_015757	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	339626335
103	NC_015757	CGG	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
104	NC_015757	GTCT	2	8	6982	6989	0 %	50 %	25 %	25 %	339626335
105	NC_015757	TGA	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626335
106	NC_015757	GAA	2	6	7065	7070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626335
107	NC_015757	GTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626335
108	NC_015757	C	7	7	7152	7158	0 %	0 %	0 %	100 %	339626335
109	NC_015757	GATC	2	8	7196	7203	25 %	25 %	25 %	25 %	339626335
110	NC_015757	TTG	2	6	7227	7232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626335
111	NC_015757	CGG	2	6	7262	7267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
112	NC_015757	GAA	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626335
113	NC_015757	GGGC	2	8	7365	7372	0 %	0 %	75 %	25 %	339626335
114	NC_015757	CGA	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626335
115	NC_015757	GCA	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626335
116	NC_015757	GTTG	2	8	7610	7617	0 %	50 %	50 %	0 %	339626335
117	NC_015757	CCG	2	6	7691	7696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626335
118	NC_015757	TAA	2	6	7712	7717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626335
119	NC_015757	CGG	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
120	NC_015757	A	6	6	7915	7920	100 %	0 %	0 %	0 %	339626335
121	NC_015757	TGA	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626335
122	NC_015757	CGG	2	6	8049	8054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
123	NC_015757	CGG	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
124	NC_015757	GAA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626335
125	NC_015757	TGG	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339626335
126	NC_015757	GT	3	6	8164	8169	0 %	50 %	50 %	0 %	339626335
127	NC_015757	GCG	2	6	8180	8185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
128	NC_015757	CGG	2	6	8186	8191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339626335
129	NC_015757	GAC	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626335
130	NC_015757	TCA	2	6	8230	8235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626335
131	NC_015757	TCG	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626335
132	NC_015757	GCCAA	2	10	8335	8344	40 %	0 %	20 %	40 %	339626335
133	NC_015757	CGC	2	6	8393	8398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626335
134	NC_015757	ATT	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626335
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