MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015732	ATA	2	6	2541194	2541199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500848
44002	NC_015732	TTG	2	6	2541207	2541212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500848
44003	NC_015732	GGC	2	6	2541370	2541375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500848
44004	NC_015732	ACT	2	6	2541388	2541393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500848
44005	NC_015732	TCAT	2	8	2541401	2541408	25 %	50 %	0 %	25 %	339500848
44006	NC_015732	AG	3	6	2541477	2541482	50 %	0 %	50 %	0 %	339500849
44007	NC_015732	ATC	2	6	2541537	2541542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500849
44008	NC_015732	GTA	2	6	2541549	2541554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500849
44009	NC_015732	TGA	2	6	2541613	2541618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500849
44010	NC_015732	GACT	2	8	2541628	2541635	25 %	25 %	25 %	25 %	339500849
44011	NC_015732	TGC	2	6	2541648	2541653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500849
44012	NC_015732	AAC	2	6	2541733	2541738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500849
44013	NC_015732	TCT	2	6	2541784	2541789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500849
44014	NC_015732	GGTACA	2	12	2541813	2541824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339500849
44015	NC_015732	TTG	2	6	2541834	2541839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500849
44016	NC_015732	TCA	2	6	2542127	2542132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500850
44017	NC_015732	TAA	2	6	2542212	2542217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500850
44018	NC_015732	CTT	3	9	2542341	2542349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500850
44019	NC_015732	TA	3	6	2542413	2542418	50 %	50 %	0 %	0 %	339500850
44020	NC_015732	T	6	6	2542419	2542424	0 %	100 %	0 %	0 %	339500850
44021	NC_015732	CTGATC	2	12	2542699	2542710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339500851
44022	NC_015732	C	6	6	2542751	2542756	0 %	0 %	0 %	100 %	339500851
44023	NC_015732	TCA	2	6	2542777	2542782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500851
44024	NC_015732	A	7	7	2542853	2542859	100 %	0 %	0 %	0 %	339500851
44025	NC_015732	T	6	6	2542968	2542973	0 %	100 %	0 %	0 %	339500851
44026	NC_015732	GGA	2	6	2543063	2543068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500851
44027	NC_015732	GCA	2	6	2543093	2543098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500851
44028	NC_015732	ATA	2	6	2543139	2543144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500851
44029	NC_015732	A	6	6	2543156	2543161	100 %	0 %	0 %	0 %	339500851
44030	NC_015732	CCG	2	6	2543187	2543192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500851
44031	NC_015732	TCCCG	2	10	2543200	2543209	0 %	20 %	20 %	60 %	339500851
44032	NC_015732	GGCC	2	8	2543322	2543329	0 %	0 %	50 %	50 %	339500851
44033	NC_015732	TTC	2	6	2543343	2543348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500851
44034	NC_015732	T	7	7	2543447	2543453	0 %	100 %	0 %	0 %	339500851
44035	NC_015732	GAAT	2	8	2543551	2543558	50 %	25 %	25 %	0 %	339500851
44036	NC_015732	TCC	2	6	2543572	2543577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500851
44037	NC_015732	GA	3	6	2543610	2543615	50 %	0 %	50 %	0 %	339500851
44038	NC_015732	CCA	2	6	2543747	2543752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500851
44039	NC_015732	AAC	2	6	2543764	2543769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500851
44040	NC_015732	TCC	2	6	2543775	2543780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500851
44041	NC_015732	TA	3	6	2543830	2543835	50 %	50 %	0 %	0 %	339500851
44042	NC_015732	ATG	2	6	2543919	2543924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500851
44043	NC_015732	GAAAC	2	10	2543991	2544000	60 %	0 %	20 %	20 %	339500851
44044	NC_015732	A	6	6	2544012	2544017	100 %	0 %	0 %	0 %	339500851
44045	NC_015732	T	8	8	2544107	2544114	0 %	100 %	0 %	0 %	339500851
44046	NC_015732	A	6	6	2544154	2544159	100 %	0 %	0 %	0 %	339500851
44047	NC_015732	T	6	6	2544198	2544203	0 %	100 %	0 %	0 %	339500851
44048	NC_015732	ACC	2	6	2544310	2544315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500851
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44050	NC_015732	GA	3	6	2544485	2544490	50 %	0 %	50 %	0 %	339500852
44051	NC_015732	CGG	2	6	2544616	2544621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500852
44052	NC_015732	TTC	2	6	2544670	2544675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500852
44053	NC_015732	CAGT	2	8	2544680	2544687	25 %	25 %	25 %	25 %	339500852
44054	NC_015732	ACC	2	6	2544691	2544696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500852
44055	NC_015732	GGA	3	9	2544773	2544781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500852
44056	NC_015732	TGT	2	6	2544866	2544871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500852
44057	NC_015732	TAT	2	6	2544929	2544934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500852
44058	NC_015732	TGA	2	6	2544944	2544949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500852
44059	NC_015732	ACT	2	6	2544950	2544955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500852
44060	NC_015732	ATC	2	6	2544969	2544974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500852
44061	NC_015732	AAT	2	6	2545160	2545165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500853
44062	NC_015732	GAAAT	2	10	2545209	2545218	60 %	20 %	20 %	0 %	339500853
44063	NC_015732	TCA	2	6	2545259	2545264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500853
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44065	NC_015732	TAA	2	6	2545413	2545418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500853
44066	NC_015732	TAA	2	6	2545474	2545479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500853
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44078	NC_015732	T	6	6	2546011	2546016	0 %	100 %	0 %	0 %	339500854
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44084	NC_015732	A	7	7	2546415	2546421	100 %	0 %	0 %	0 %	339500854
44085	NC_015732	ATAC	2	8	2546454	2546461	50 %	25 %	0 %	25 %	339500854
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44089	NC_015732	ACC	2	6	2546898	2546903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500854
44090	NC_015732	AT	3	6	2547015	2547020	50 %	50 %	0 %	0 %	339500854
44091	NC_015732	TTTTTA	2	12	2547142	2547153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339500854
44092	NC_015732	ATG	2	6	2547664	2547669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500855
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44100	NC_015732	TCA	2	6	2548308	2548313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500856
44101	NC_015732	CGG	2	6	2548321	2548326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500856
44102	NC_015732	CGG	2	6	2548342	2548347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500856
44103	NC_015732	ATT	2	6	2548370	2548375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500856
44104	NC_015732	CGA	2	6	2548419	2548424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500856
44105	NC_015732	TCA	2	6	2548476	2548481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500856
44106	NC_015732	GCT	2	6	2548528	2548533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500856
44107	NC_015732	T	6	6	2548536	2548541	0 %	100 %	0 %	0 %	339500856
44108	NC_015732	CAG	2	6	2548544	2548549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500856
44109	NC_015732	T	6	6	2548595	2548600	0 %	100 %	0 %	0 %	339500856
44110	NC_015732	ATC	2	6	2548679	2548684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500856
44111	NC_015732	AGT	2	6	2548723	2548728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500856
44112	NC_015732	CAC	2	6	2548741	2548746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500856
44113	NC_015732	TGG	2	6	2548974	2548979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500856
44114	NC_015732	CAA	2	6	2549052	2549057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500856
44115	NC_015732	TGGTA	2	10	2549089	2549098	20 %	40 %	40 %	0 %	339500856
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44117	NC_015732	CGG	2	6	2549172	2549177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500856
44118	NC_015732	TGG	2	6	2549184	2549189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500856
44119	NC_015732	CTC	2	6	2549264	2549269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500856
44120	NC_015732	CGT	2	6	2549287	2549292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500856
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44128	NC_015732	T	9	9	2549855	2549863	0 %	100 %	0 %	0 %	339500857
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44137	NC_015732	TA	3	6	2550195	2550200	50 %	50 %	0 %	0 %	339500857
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44218	NC_015732	T	6	6	2556569	2556574	0 %	100 %	0 %	0 %	339500864
44219	NC_015732	CCT	2	6	2556636	2556641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500864
44220	NC_015732	AG	4	8	2556673	2556680	50 %	0 %	50 %	0 %	339500864
44221	NC_015732	GCC	2	6	2556698	2556703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500864
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44223	NC_015732	TGT	2	6	2556746	2556751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500864
44224	NC_015732	TGTTT	2	10	2556797	2556806	0 %	80 %	20 %	0 %	339500864
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44227	NC_015732	T	6	6	2556960	2556965	0 %	100 %	0 %	0 %	339500864
44228	NC_015732	AGAA	2	8	2557002	2557009	75 %	0 %	25 %	0 %	339500864
44229	NC_015732	TGA	2	6	2557036	2557041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500865
44230	NC_015732	CTG	2	6	2557079	2557084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500865
44231	NC_015732	TGA	2	6	2557093	2557098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500865
44232	NC_015732	T	6	6	2557204	2557209	0 %	100 %	0 %	0 %	339500865
44233	NC_015732	AGG	2	6	2557312	2557317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500865
44234	NC_015732	CAAC	2	8	2557334	2557341	50 %	0 %	0 %	50 %	339500866
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44333	NC_015732	TCT	2	6	2563036	2563041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500872
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44335	NC_015732	CTT	2	6	2563157	2563162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500872
44336	NC_015732	ATG	2	6	2563173	2563178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500872
44337	NC_015732	GAT	2	6	2563214	2563219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500872
44338	NC_015732	TGTT	2	8	2563294	2563301	0 %	75 %	25 %	0 %	339500872
44339	NC_015732	AGC	2	6	2563343	2563348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500872
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44341	NC_015732	TCT	2	6	2563400	2563405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500872
44342	NC_015732	CAA	2	6	2563484	2563489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500872
44343	NC_015732	ACTG	2	8	2563545	2563552	25 %	25 %	25 %	25 %	339500872
44344	NC_015732	GCTG	2	8	2563577	2563584	0 %	25 %	50 %	25 %	339500872
44345	NC_015732	TGT	2	6	2563600	2563605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500872
44346	NC_015732	TTA	2	6	2563627	2563632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500872
44347	NC_015732	CCG	2	6	2563642	2563647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500872
44348	NC_015732	AG	3	6	2563794	2563799	50 %	0 %	50 %	0 %	339500873
44349	NC_015732	GAA	2	6	2563836	2563841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500873
44350	NC_015732	CAG	2	6	2563960	2563965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500873
44351	NC_015732	CGG	2	6	2564120	2564125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500873
44352	NC_015732	GCG	2	6	2564283	2564288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500874
44353	NC_015732	CAA	2	6	2564319	2564324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500874
44354	NC_015732	CTG	2	6	2564466	2564471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500874
44355	NC_015732	CA	3	6	2564544	2564549	50 %	0 %	0 %	50 %	339500874
44356	NC_015732	AGCA	2	8	2564566	2564573	50 %	0 %	25 %	25 %	339500874
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44358	NC_015732	CAGG	2	8	2564621	2564628	25 %	0 %	50 %	25 %	339500874
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44362	NC_015732	AT	3	6	2564869	2564874	50 %	50 %	0 %	0 %	339500875
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44382	NC_015732	A	7	7	2565834	2565840	100 %	0 %	0 %	0 %	339500877
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44389	NC_015732	ATAA	3	12	2566062	2566073	75 %	25 %	0 %	0 %	339500877
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44461	NC_015732	ATAA	2	8	2570712	2570719	75 %	25 %	0 %	0 %	339500882
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44465	NC_015732	CAT	2	6	2570913	2570918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500882
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44499	NC_015732	A	6	6	2572541	2572546	100 %	0 %	0 %	0 %	339500884
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