MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_015732	ACCG	2	8	2008826	2008833	25 %	0 %	25 %	50 %	339500437
35003	NC_015732	CCG	2	6	2008869	2008874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500437
35004	NC_015732	AAG	2	6	2008901	2008906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500437
35005	NC_015732	AGA	2	6	2008928	2008933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500437
35006	NC_015732	CCA	2	6	2008957	2008962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500437
35007	NC_015732	GCC	2	6	2009024	2009029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500437
35008	NC_015732	GCA	2	6	2009157	2009162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500437
35009	NC_015732	TCT	2	6	2009175	2009180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500437
35010	NC_015732	ATG	2	6	2009208	2009213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500437
35011	NC_015732	AGC	2	6	2009254	2009259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500437
35012	NC_015732	ACG	2	6	2009277	2009282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500437
35013	NC_015732	TGC	2	6	2009309	2009314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500437
35014	NC_015732	AT	3	6	2009343	2009348	50 %	50 %	0 %	0 %	339500437
35015	NC_015732	TCA	2	6	2009355	2009360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500437
35016	NC_015732	T	6	6	2009396	2009401	0 %	100 %	0 %	0 %	339500437
35017	NC_015732	TGG	2	6	2009476	2009481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500437
35018	NC_015732	CAA	2	6	2009491	2009496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500437
35019	NC_015732	ATC	2	6	2009504	2009509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500437
35020	NC_015732	CAA	2	6	2009761	2009766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339500438
35021	NC_015732	CATT	2	8	2009784	2009791	25 %	50 %	0 %	25 %	339500438
35022	NC_015732	GAA	2	6	2009813	2009818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500438
35023	NC_015732	GTT	2	6	2009837	2009842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339500438
35024	NC_015732	ATAG	2	8	2009864	2009871	50 %	25 %	25 %	0 %	339500438
35025	NC_015732	CTT	2	6	2009908	2009913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35026	NC_015732	AGGT	2	8	2009940	2009947	25 %	25 %	50 %	0 %	339500438
35027	NC_015732	CTT	2	6	2009957	2009962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35028	NC_015732	TTC	2	6	2009978	2009983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35029	NC_015732	CCA	2	6	2010019	2010024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500438
35030	NC_015732	GGGT	2	8	2010037	2010044	0 %	25 %	75 %	0 %	339500438
35031	NC_015732	AGC	2	6	2010107	2010112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500438
35032	NC_015732	GAT	2	6	2010128	2010133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500438
35033	NC_015732	ATTG	2	8	2010134	2010141	25 %	50 %	25 %	0 %	339500438
35034	NC_015732	CTT	2	6	2010167	2010172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35035	NC_015732	TGG	2	6	2010217	2010222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500438
35036	NC_015732	CTTC	2	8	2010250	2010257	0 %	50 %	0 %	50 %	339500438
35037	NC_015732	TGG	2	6	2010289	2010294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500438
35038	NC_015732	TCT	2	6	2010373	2010378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35039	NC_015732	TCA	2	6	2010384	2010389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500438
35040	NC_015732	GAT	2	6	2010410	2010415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500438
35041	NC_015732	CTT	2	6	2010419	2010424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35042	NC_015732	TTC	2	6	2010519	2010524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500438
35043	NC_015732	ATA	2	6	2010540	2010545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500438
35044	NC_015732	ATC	2	6	2010578	2010583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500438
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35048	NC_015732	CATA	2	8	2010800	2010807	50 %	25 %	0 %	25 %	339500438
35049	NC_015732	CAT	2	6	2010915	2010920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500439
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35051	NC_015732	CTT	2	6	2010997	2011002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500439
35052	NC_015732	TCG	2	6	2011032	2011037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500439
35053	NC_015732	GCC	2	6	2011161	2011166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500439
35054	NC_015732	TCA	2	6	2011173	2011178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500439
35055	NC_015732	AGC	2	6	2011239	2011244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500439
35056	NC_015732	AAG	2	6	2011301	2011306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500439
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35059	NC_015732	CCG	2	6	2011566	2011571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500440
35060	NC_015732	TAG	2	6	2011749	2011754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500440
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35063	NC_015732	ATTT	2	8	2011855	2011862	25 %	75 %	0 %	0 %	339500440
35064	NC_015732	TTTTC	2	10	2011884	2011893	0 %	80 %	0 %	20 %	339500440
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35069	NC_015732	TTC	2	6	2012056	2012061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500440
35070	NC_015732	AGCA	2	8	2012104	2012111	50 %	0 %	25 %	25 %	339500440
35071	NC_015732	AGG	2	6	2012117	2012122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500440
35072	NC_015732	TCA	2	6	2012150	2012155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500440
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35074	NC_015732	TCA	2	6	2012364	2012369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500440
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35083	NC_015732	CTT	2	6	2013174	2013179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500440
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35085	NC_015732	TGA	2	6	2013246	2013251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500440
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35087	NC_015732	GTAT	2	8	2013343	2013350	25 %	50 %	25 %	0 %	339500440
35088	NC_015732	CCA	2	6	2013390	2013395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339500440
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35098	NC_015732	GGGA	2	8	2014003	2014010	25 %	0 %	75 %	0 %	339500440
35099	NC_015732	AT	3	6	2014081	2014086	50 %	50 %	0 %	0 %	339500440
35100	NC_015732	T	6	6	2014100	2014105	0 %	100 %	0 %	0 %	339500440
35101	NC_015732	TAT	2	6	2014306	2014311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339500441
35102	NC_015732	CGG	2	6	2014332	2014337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500441
35103	NC_015732	TCT	2	6	2014388	2014393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500441
35104	NC_015732	CTC	2	6	2014417	2014422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500441
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35107	NC_015732	AG	3	6	2014506	2014511	50 %	0 %	50 %	0 %	339500441
35108	NC_015732	TGG	2	6	2014527	2014532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500441
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35114	NC_015732	TAA	2	6	2014872	2014877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339500441
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35352	NC_015732	GACC	2	8	2029712	2029719	25 %	0 %	25 %	50 %	339500454
35353	NC_015732	TTCCAG	2	12	2029740	2029751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339500454
35354	NC_015732	CGG	2	6	2029814	2029819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500454
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35468	NC_015732	AAG	2	6	2036302	2036307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339500457
35469	NC_015732	AGC	2	6	2036348	2036353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339500457
35470	NC_015732	CTT	2	6	2036397	2036402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500457
35471	NC_015732	GGC	2	6	2036431	2036436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500457
35472	NC_015732	GCT	2	6	2036638	2036643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339500457
35473	NC_015732	TGGG	2	8	2036651	2036658	0 %	25 %	75 %	0 %	339500457
35474	NC_015732	GGC	3	9	2036686	2036694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500457
35475	NC_015732	AAGG	2	8	2036722	2036729	50 %	0 %	50 %	0 %	339500457
35476	NC_015732	GGTG	2	8	2036752	2036759	0 %	25 %	75 %	0 %	339500457
35477	NC_015732	CGC	2	6	2036799	2036804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500457
35478	NC_015732	GAT	2	6	2036965	2036970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339500457
35479	NC_015732	G	6	6	2037003	2037008	0 %	0 %	100 %	0 %	339500457
35480	NC_015732	GCG	2	6	2037052	2037057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500457
35481	NC_015732	GGT	2	6	2037070	2037075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500457
35482	NC_015732	ACCG	2	8	2037147	2037154	25 %	0 %	25 %	50 %	339500458
35483	NC_015732	CAT	2	6	2037293	2037298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500458
35484	NC_015732	TCC	2	6	2037325	2037330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339500458
35485	NC_015732	ATCGT	2	10	2037379	2037388	20 %	40 %	20 %	20 %	339500458
35486	NC_015732	TCA	2	6	2037404	2037409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500458
35487	NC_015732	CGAGAT	2	12	2037455	2037466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339500458
35488	NC_015732	GCG	2	6	2037474	2037479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339500458
35489	NC_015732	GCCG	2	8	2037482	2037489	0 %	0 %	50 %	50 %	339500458
35490	NC_015732	CCGG	2	8	2037507	2037514	0 %	0 %	50 %	50 %	339500458
35491	NC_015732	CCCCT	2	10	2037540	2037549	0 %	20 %	0 %	80 %	339500458
35492	NC_015732	GCC	2	6	2037648	2037653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500458
35493	NC_015732	AGG	2	6	2037721	2037726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339500458
35494	NC_015732	AGGA	2	8	2037775	2037782	50 %	0 %	50 %	0 %	339500458
35495	NC_015732	CTT	2	6	2037845	2037850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339500458
35496	NC_015732	TCA	2	6	2037856	2037861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339500458
35497	NC_015732	TCTTT	2	10	2037863	2037872	0 %	80 %	0 %	20 %	339500458
35498	NC_015732	GGT	2	6	2037945	2037950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500458
35499	NC_015732	GGT	2	6	2038047	2038052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339500458
35500	NC_015732	GCC	2	6	2038221	2038226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339500458

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