MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_015732	CTT	2	6	1265863	1265868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499738
21503	NC_015732	ATC	2	6	1265879	1265884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499738
21504	NC_015732	CTT	2	6	1266095	1266100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499738
21505	NC_015732	TCG	2	6	1266117	1266122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499738
21506	NC_015732	TTGTTT	2	12	1266208	1266219	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	339499738
21507	NC_015732	GCT	2	6	1266264	1266269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499738
21508	NC_015732	A	8	8	1266317	1266324	100 %	0 %	0 %	0 %	339499738
21509	NC_015732	TAA	2	6	1266403	1266408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499738
21510	NC_015732	TCT	2	6	1266552	1266557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499738
21511	NC_015732	ATTC	2	8	1266575	1266582	25 %	50 %	0 %	25 %	339499738
21512	NC_015732	TGA	2	6	1266631	1266636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499739
21513	NC_015732	CTTC	2	8	1266650	1266657	0 %	50 %	0 %	50 %	339499739
21514	NC_015732	TCTGG	2	10	1266732	1266741	0 %	40 %	40 %	20 %	339499739
21515	NC_015732	GTTG	2	8	1266756	1266763	0 %	50 %	50 %	0 %	339499739
21516	NC_015732	TAGTGG	2	12	1266811	1266822	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	339499739
21517	NC_015732	T	9	9	1266923	1266931	0 %	100 %	0 %	0 %	339499739
21518	NC_015732	CCAT	2	8	1266970	1266977	25 %	25 %	0 %	50 %	339499739
21519	NC_015732	AAAGCC	2	12	1267022	1267033	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339499739
21520	NC_015732	TGTT	2	8	1267115	1267122	0 %	75 %	25 %	0 %	339499739
21521	NC_015732	GT	3	6	1267143	1267148	0 %	50 %	50 %	0 %	339499739
21522	NC_015732	AG	3	6	1267277	1267282	50 %	0 %	50 %	0 %	339499740
21523	NC_015732	AGA	2	6	1267366	1267371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499740
21524	NC_015732	TTCG	2	8	1267379	1267386	0 %	50 %	25 %	25 %	339499740
21525	NC_015732	ATCCC	2	10	1267405	1267414	20 %	20 %	0 %	60 %	339499740
21526	NC_015732	AT	3	6	1267416	1267421	50 %	50 %	0 %	0 %	339499740
21527	NC_015732	TCT	2	6	1267450	1267455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499740
21528	NC_015732	TA	3	6	1267495	1267500	50 %	50 %	0 %	0 %	339499740
21529	NC_015732	TAGG	2	8	1267525	1267532	25 %	25 %	50 %	0 %	339499740
21530	NC_015732	GTT	2	6	1267585	1267590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499740
21531	NC_015732	AGCA	2	8	1267617	1267624	50 %	0 %	25 %	25 %	339499740
21532	NC_015732	CAGGG	2	10	1267704	1267713	20 %	0 %	60 %	20 %	339499741
21533	NC_015732	GA	3	6	1267793	1267798	50 %	0 %	50 %	0 %	339499741
21534	NC_015732	A	6	6	1267897	1267902	100 %	0 %	0 %	0 %	339499741
21535	NC_015732	ATA	2	6	1267910	1267915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499741
21536	NC_015732	CTA	2	6	1267951	1267956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499741
21537	NC_015732	GGTCAT	2	12	1268141	1268152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339499742
21538	NC_015732	AGG	2	6	1268181	1268186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339499742
21539	NC_015732	GCC	2	6	1268214	1268219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339499742
21540	NC_015732	CTT	2	6	1268248	1268253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499742
21541	NC_015732	ATC	2	6	1268256	1268261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499742
21542	NC_015732	T	7	7	1268272	1268278	0 %	100 %	0 %	0 %	339499742
21543	NC_015732	AAAGA	2	10	1268317	1268326	80 %	0 %	20 %	0 %	339499742
21544	NC_015732	GTTT	2	8	1268341	1268348	0 %	75 %	25 %	0 %	339499742
21545	NC_015732	T	6	6	1268381	1268386	0 %	100 %	0 %	0 %	339499742
21546	NC_015732	TTC	2	6	1268559	1268564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499742
21547	NC_015732	CTA	2	6	1268647	1268652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499742
21548	NC_015732	GTTTCT	2	12	1268737	1268748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	339499742
21549	NC_015732	ATTT	2	8	1268865	1268872	25 %	75 %	0 %	0 %	339499742
21550	NC_015732	TCT	2	6	1268928	1268933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499742
21551	NC_015732	ATTCC	2	10	1268968	1268977	20 %	40 %	0 %	40 %	339499742
21552	NC_015732	TCA	2	6	1268996	1269001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499742
21553	NC_015732	ACA	2	6	1269013	1269018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339499742
21554	NC_015732	ATA	2	6	1269019	1269024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499742
21555	NC_015732	GAT	2	6	1269033	1269038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499742
21556	NC_015732	CAA	2	6	1269078	1269083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339499742
21557	NC_015732	ATA	2	6	1269091	1269096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499742
21558	NC_015732	G	6	6	1269157	1269162	0 %	0 %	100 %	0 %	339499743
21559	NC_015732	GCA	2	6	1269216	1269221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339499743
21560	NC_015732	GAG	2	6	1269254	1269259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339499743
21561	NC_015732	ATA	2	6	1269327	1269332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499743
21562	NC_015732	TCA	2	6	1269420	1269425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499743
21563	NC_015732	GCC	2	6	1269447	1269452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339499743
21564	NC_015732	TCT	2	6	1269462	1269467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499743
21565	NC_015732	ATA	2	6	1269489	1269494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499743
21566	NC_015732	GCAT	2	8	1269530	1269537	25 %	25 %	25 %	25 %	339499743
21567	NC_015732	ATA	2	6	1269573	1269578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499743
21568	NC_015732	TGC	2	6	1269651	1269656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499743
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21570	NC_015732	TGA	2	6	1269684	1269689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499743
21571	NC_015732	GTT	2	6	1269724	1269729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499743
21572	NC_015732	GTT	2	6	1269757	1269762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499743
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21575	NC_015732	CTA	2	6	1269880	1269885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499743
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21577	NC_015732	GAT	2	6	1269965	1269970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499744
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21583	NC_015732	ATT	2	6	1270523	1270528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339499744
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21585	NC_015732	ATG	2	6	1270595	1270600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499744
21586	NC_015732	ATC	2	6	1270693	1270698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499744
21587	NC_015732	TCCA	2	8	1270729	1270736	25 %	25 %	0 %	50 %	339499744
21588	NC_015732	GCATC	2	10	1270743	1270752	20 %	20 %	20 %	40 %	339499744
21589	NC_015732	TGA	2	6	1270854	1270859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499744
21590	NC_015732	TGGGG	2	10	1271015	1271024	0 %	20 %	80 %	0 %	339499744
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21592	NC_015732	GTTG	2	8	1271158	1271165	0 %	50 %	50 %	0 %	339499744
21593	NC_015732	CTG	2	6	1271273	1271278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499744
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21596	NC_015732	CTG	2	6	1271622	1271627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499744
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21600	NC_015732	T	6	6	1271769	1271774	0 %	100 %	0 %	0 %	339499744
21601	NC_015732	T	7	7	1271795	1271801	0 %	100 %	0 %	0 %	339499744
21602	NC_015732	TCA	2	6	1271832	1271837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499744
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21604	NC_015732	AAG	2	6	1271946	1271951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499745
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21607	NC_015732	AAGGC	2	10	1272097	1272106	40 %	0 %	40 %	20 %	339499745
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21609	NC_015732	TCA	2	6	1272121	1272126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499745
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21611	NC_015732	TGC	2	6	1272197	1272202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499745
21612	NC_015732	AAG	2	6	1272476	1272481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499746
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