MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_015732	ACTGC	2	10	1121289	1121298	20 %	20 %	20 %	40 %	339499638
19003	NC_015732	TGA	2	6	1121364	1121369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499638
19004	NC_015732	TCC	2	6	1121438	1121443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339499638
19005	NC_015732	T	6	6	1121498	1121503	0 %	100 %	0 %	0 %	339499638
19006	NC_015732	CAA	2	6	1121619	1121624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339499638
19007	NC_015732	CCG	2	6	1121640	1121645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339499638
19008	NC_015732	AT	3	6	1122312	1122317	50 %	50 %	0 %	0 %	339499639
19009	NC_015732	GGA	2	6	1122408	1122413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339499639
19010	NC_015732	ACTT	2	8	1122449	1122456	25 %	50 %	0 %	25 %	339499639
19011	NC_015732	TCAC	2	8	1122541	1122548	25 %	25 %	0 %	50 %	339499639
19012	NC_015732	TTA	2	6	1122652	1122657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339499639
19013	NC_015732	CA	4	8	1122661	1122668	50 %	0 %	0 %	50 %	339499639
19014	NC_015732	AGA	2	6	1122726	1122731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499639
19015	NC_015732	A	7	7	1122773	1122779	100 %	0 %	0 %	0 %	339499639
19016	NC_015732	GTTCA	2	10	1122833	1122842	20 %	40 %	20 %	20 %	339499639
19017	NC_015732	CT	3	6	1122863	1122868	0 %	50 %	0 %	50 %	339499639
19018	NC_015732	TCC	2	6	1122888	1122893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339499639
19019	NC_015732	TGGA	2	8	1122908	1122915	25 %	25 %	50 %	0 %	339499639
19020	NC_015732	TCT	2	6	1122916	1122921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499639
19021	NC_015732	GAT	2	6	1122949	1122954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499639
19022	NC_015732	GAA	2	6	1122991	1122996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499639
19023	NC_015732	GCT	2	6	1123003	1123008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499639
19024	NC_015732	CT	3	6	1123030	1123035	0 %	50 %	0 %	50 %	339499639
19025	NC_015732	GAA	2	6	1123039	1123044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499639
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19028	NC_015732	CGG	2	6	1123201	1123206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339499639
19029	NC_015732	GAA	2	6	1123261	1123266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499639
19030	NC_015732	AT	3	6	1123276	1123281	50 %	50 %	0 %	0 %	339499639
19031	NC_015732	TCC	2	6	1123355	1123360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339499640
19032	NC_015732	AGT	2	6	1123403	1123408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499640
19033	NC_015732	TGTT	2	8	1123458	1123465	0 %	75 %	25 %	0 %	339499640
19034	NC_015732	GAT	2	6	1123544	1123549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499640
19035	NC_015732	AT	3	6	1123554	1123559	50 %	50 %	0 %	0 %	339499640
19036	NC_015732	AGC	2	6	1123688	1123693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339499640
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19038	NC_015732	TTC	2	6	1123732	1123737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499640
19039	NC_015732	GATC	2	8	1123748	1123755	25 %	25 %	25 %	25 %	339499640
19040	NC_015732	GTC	2	6	1123774	1123779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499640
19041	NC_015732	CTG	2	6	1123822	1123827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499640
19042	NC_015732	T	7	7	1123861	1123867	0 %	100 %	0 %	0 %	339499641
19043	NC_015732	TCA	2	6	1123883	1123888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499641
19044	NC_015732	CTG	2	6	1123981	1123986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499641
19045	NC_015732	TCTGA	2	10	1124064	1124073	20 %	40 %	20 %	20 %	339499641
19046	NC_015732	TCA	2	6	1124213	1124218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499641
19047	NC_015732	GTG	2	6	1124255	1124260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339499641
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19049	NC_015732	GCA	2	6	1124432	1124437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339499641
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19051	NC_015732	TTTG	2	8	1124480	1124487	0 %	75 %	25 %	0 %	339499641
19052	NC_015732	AATT	2	8	1124503	1124510	50 %	50 %	0 %	0 %	339499641
19053	NC_015732	ATT	2	6	1124513	1124518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339499641
19054	NC_015732	TTGA	2	8	1124568	1124575	25 %	50 %	25 %	0 %	339499641
19055	NC_015732	AAT	2	6	1124610	1124615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499641
19056	NC_015732	TGAT	2	8	1124663	1124670	25 %	50 %	25 %	0 %	339499641
19057	NC_015732	AAC	2	6	1124800	1124805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339499641
19058	NC_015732	TATT	2	8	1124835	1124842	25 %	75 %	0 %	0 %	339499641
19059	NC_015732	GGC	2	6	1124851	1124856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339499641
19060	NC_015732	CTT	2	6	1124886	1124891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499641
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19062	NC_015732	GTA	2	6	1125014	1125019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499641
19063	NC_015732	GA	3	6	1125046	1125051	50 %	0 %	50 %	0 %	339499641
19064	NC_015732	GCG	2	6	1125082	1125087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339499641
19065	NC_015732	TA	3	6	1125104	1125109	50 %	50 %	0 %	0 %	339499641
19066	NC_015732	T	6	6	1125195	1125200	0 %	100 %	0 %	0 %	339499641
19067	NC_015732	GTTT	2	8	1125204	1125211	0 %	75 %	25 %	0 %	339499641
19068	NC_015732	ATA	2	6	1125277	1125282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499641
19069	NC_015732	CAT	2	6	1125342	1125347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499641
19070	NC_015732	ATG	2	6	1125362	1125367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499641
19071	NC_015732	T	6	6	1125493	1125498	0 %	100 %	0 %	0 %	339499641
19072	NC_015732	CTT	2	6	1125567	1125572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339499641
19073	NC_015732	GTT	2	6	1125593	1125598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499641
19074	NC_015732	CTA	2	6	1125615	1125620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499641
19075	NC_015732	TAAAT	2	10	1125638	1125647	60 %	40 %	0 %	0 %	339499641
19076	NC_015732	GTAA	2	8	1125669	1125676	50 %	25 %	25 %	0 %	339499641
19077	NC_015732	TAC	2	6	1125712	1125717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499641
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19079	NC_015732	CAT	2	6	1125884	1125889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499642
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19083	NC_015732	T	8	8	1126088	1126095	0 %	100 %	0 %	0 %	339499642
19084	NC_015732	GTT	2	6	1126167	1126172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499642
19085	NC_015732	GTTT	2	8	1126385	1126392	0 %	75 %	25 %	0 %	339499643
19086	NC_015732	A	6	6	1126407	1126412	100 %	0 %	0 %	0 %	339499643
19087	NC_015732	TCA	2	6	1126572	1126577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499643
19088	NC_015732	GAT	2	6	1126592	1126597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499643
19089	NC_015732	TTTGG	2	10	1126603	1126612	0 %	60 %	40 %	0 %	339499643
19090	NC_015732	AG	3	6	1126615	1126620	50 %	0 %	50 %	0 %	339499643
19091	NC_015732	ATA	2	6	1126665	1126670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339499643
19092	NC_015732	AGA	2	6	1126687	1126692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339499643
19093	NC_015732	GAACA	2	10	1126713	1126722	60 %	0 %	20 %	20 %	339499643
19094	NC_015732	CAAC	2	8	1126781	1126788	50 %	0 %	0 %	50 %	339499643
19095	NC_015732	ATT	2	6	1126877	1126882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339499643
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19098	NC_015732	TGA	2	6	1127005	1127010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499643
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19100	NC_015732	GGT	2	6	1127038	1127043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339499643
19101	NC_015732	ATC	2	6	1127084	1127089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499643
19102	NC_015732	CCTG	2	8	1127104	1127111	0 %	25 %	25 %	50 %	339499643
19103	NC_015732	ATG	2	6	1127139	1127144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499643
19104	NC_015732	GTT	2	6	1127159	1127164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499643
19105	NC_015732	GCA	2	6	1127210	1127215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339499643
19106	NC_015732	GAT	2	6	1127222	1127227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499643
19107	NC_015732	ATC	2	6	1127394	1127399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499644
19108	NC_015732	ACT	2	6	1127487	1127492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499644
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19110	NC_015732	GTC	2	6	1127643	1127648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339499644
19111	NC_015732	ACTG	2	8	1127669	1127676	25 %	25 %	25 %	25 %	339499644
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19113	NC_015732	ATC	2	6	1127763	1127768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339499644
19114	NC_015732	TTG	2	6	1127860	1127865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339499644
19115	NC_015732	CAA	2	6	1127941	1127946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339499644
19116	NC_015732	ATCA	2	8	1127975	1127982	50 %	25 %	0 %	25 %	339499644
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19118	NC_015732	T	6	6	1128051	1128056	0 %	100 %	0 %	0 %	339499644
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19232	NC_015732	CAG	2	6	1133563	1133568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339499651
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19236	NC_015732	ATG	2	6	1133800	1133805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339499651
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