MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015732	TCA	2	6	53804	53809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498694
1002	NC_015732	TAA	2	6	53863	53868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498694
1003	NC_015732	AGTT	2	8	53908	53915	25 %	50 %	25 %	0 %	339498694
1004	NC_015732	T	7	7	53980	53986	0 %	100 %	0 %	0 %	339498694
1005	NC_015732	AT	3	6	54056	54061	50 %	50 %	0 %	0 %	339498694
1006	NC_015732	TGT	2	6	54224	54229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498694
1007	NC_015732	CTT	2	6	54243	54248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498694
1008	NC_015732	ATA	2	6	54526	54531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498695
1009	NC_015732	CTT	2	6	54535	54540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498695
1010	NC_015732	ATG	2	6	54561	54566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498695
1011	NC_015732	ATT	2	6	54581	54586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498695
1012	NC_015732	TTC	2	6	54599	54604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498695
1013	NC_015732	TAA	2	6	54608	54613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498695
1014	NC_015732	TA	3	6	54636	54641	50 %	50 %	0 %	0 %	339498695
1015	NC_015732	TAT	2	6	54652	54657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498695
1016	NC_015732	T	6	6	54703	54708	0 %	100 %	0 %	0 %	339498695
1017	NC_015732	CAC	2	6	54808	54813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498695
1018	NC_015732	ATC	2	6	54830	54835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498695
1019	NC_015732	TCGA	2	8	54917	54924	25 %	25 %	25 %	25 %	339498695
1020	NC_015732	TA	3	6	54935	54940	50 %	50 %	0 %	0 %	339498695
1021	NC_015732	ATA	2	6	54953	54958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498695
1022	NC_015732	TCA	2	6	55023	55028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498695
1023	NC_015732	AAG	2	6	55046	55051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498695
1024	NC_015732	T	7	7	55061	55067	0 %	100 %	0 %	0 %	339498695
1025	NC_015732	GATT	2	8	55138	55145	25 %	50 %	25 %	0 %	339498695
1026	NC_015732	TCCATA	2	12	55178	55189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498695
1027	NC_015732	TAA	2	6	55200	55205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498695
1028	NC_015732	T	6	6	55300	55305	0 %	100 %	0 %	0 %	339498695
1029	NC_015732	CAAA	2	8	55312	55319	75 %	0 %	0 %	25 %	339498695
1030	NC_015732	GTA	2	6	55320	55325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498695
1031	NC_015732	TTG	2	6	55332	55337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498695
1032	NC_015732	TAG	2	6	55354	55359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498695
1033	NC_015732	ATA	2	6	55640	55645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498696
1034	NC_015732	GT	3	6	55650	55655	0 %	50 %	50 %	0 %	339498696
1035	NC_015732	GGT	2	6	55658	55663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498696
1036	NC_015732	GT	3	6	55678	55683	0 %	50 %	50 %	0 %	339498696
1037	NC_015732	CAC	2	6	55686	55691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498696
1038	NC_015732	TCT	2	6	55700	55705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498696
1039	NC_015732	AGG	2	6	55876	55881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498696
1040	NC_015732	CAA	2	6	55917	55922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498696
1041	NC_015732	T	7	7	56004	56010	0 %	100 %	0 %	0 %	339498696
1042	NC_015732	ATCC	2	8	56034	56041	25 %	25 %	0 %	50 %	339498696
1043	NC_015732	ACA	3	9	56105	56113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498696
1044	NC_015732	TTAT	2	8	56183	56190	25 %	75 %	0 %	0 %	339498696
1045	NC_015732	GAA	2	6	56222	56227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498697
1046	NC_015732	GTT	2	6	56248	56253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498697
1047	NC_015732	AAT	2	6	56295	56300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498697
1048	NC_015732	ATA	2	6	56302	56307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498697
1049	NC_015732	TAC	2	6	56324	56329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498697
1050	NC_015732	AGG	2	6	56348	56353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498697
1051	NC_015732	CTA	2	6	56356	56361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498697
1052	NC_015732	ACA	2	6	56415	56420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498697
1053	NC_015732	CAA	2	6	56452	56457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498697
1054	NC_015732	AGG	2	6	56531	56536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498697
1055	NC_015732	GAT	2	6	56556	56561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498697
1056	NC_015732	A	6	6	56600	56605	100 %	0 %	0 %	0 %	339498697
1057	NC_015732	ACC	2	6	56736	56741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498697
1058	NC_015732	TGAA	2	8	56905	56912	50 %	25 %	25 %	0 %	339498698
1059	NC_015732	TTA	2	6	56945	56950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1060	NC_015732	TAT	2	6	56961	56966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1061	NC_015732	ATA	2	6	56996	57001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498698
1062	NC_015732	TAT	2	6	57147	57152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1063	NC_015732	TA	3	6	57156	57161	50 %	50 %	0 %	0 %	339498698
1064	NC_015732	TGA	3	9	57168	57176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
1065	NC_015732	TGA	2	6	57248	57253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
1066	NC_015732	TGA	2	6	57297	57302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
1067	NC_015732	ATT	2	6	57343	57348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1068	NC_015732	A	6	6	57357	57362	100 %	0 %	0 %	0 %	339498698
1069	NC_015732	ATA	2	6	57370	57375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498698
1070	NC_015732	ATA	2	6	57380	57385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498698
1071	NC_015732	A	6	6	57555	57560	100 %	0 %	0 %	0 %	339498698
1072	NC_015732	TAA	2	6	57603	57608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498698
1073	NC_015732	GAA	2	6	57649	57654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498698
1074	NC_015732	T	7	7	57659	57665	0 %	100 %	0 %	0 %	339498698
1075	NC_015732	AAAT	2	8	57669	57676	75 %	25 %	0 %	0 %	339498698
1076	NC_015732	GAT	2	6	57697	57702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
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1081	NC_015732	TAA	2	6	58110	58115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498698
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1083	NC_015732	TTA	2	6	58263	58268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1084	NC_015732	TTA	2	6	58283	58288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1085	NC_015732	GATA	2	8	58296	58303	50 %	25 %	25 %	0 %	339498698
1086	NC_015732	TTA	2	6	58327	58332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498698
1087	NC_015732	GGT	2	6	58341	58346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498698
1088	NC_015732	AGT	2	6	58366	58371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
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1090	NC_015732	GA	3	6	58386	58391	50 %	0 %	50 %	0 %	339498698
1091	NC_015732	TTC	2	6	58407	58412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498698
1092	NC_015732	TAC	2	6	58452	58457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498698
1093	NC_015732	TGA	2	6	58518	58523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
1094	NC_015732	TAG	2	6	58602	58607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498698
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1097	NC_015732	CTT	2	6	58772	58777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498699
1098	NC_015732	TAG	2	6	58890	58895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498699
1099	NC_015732	TGG	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498699
1100	NC_015732	GGA	2	6	58972	58977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498699
1101	NC_015732	CTTC	2	8	59083	59090	0 %	50 %	0 %	50 %	339498699
1102	NC_015732	TCT	2	6	59155	59160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498699
1103	NC_015732	AAGTA	2	10	59220	59229	60 %	20 %	20 %	0 %	339498699
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1105	NC_015732	TAA	2	6	59283	59288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498699
1106	NC_015732	TAC	2	6	59325	59330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498699
1107	NC_015732	AAT	2	6	59331	59336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498699
1108	NC_015732	TTA	2	6	59378	59383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498699
1109	NC_015732	TTA	2	6	59399	59404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498699
1110	NC_015732	ATG	2	6	59459	59464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498699
1111	NC_015732	ATG	2	6	59480	59485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498699
1112	NC_015732	AGA	2	6	59535	59540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498699
1113	NC_015732	ATG	2	6	59615	59620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498699
1114	NC_015732	TG	3	6	59624	59629	0 %	50 %	50 %	0 %	339498699
1115	NC_015732	GT	3	6	59667	59672	0 %	50 %	50 %	0 %	339498699
1116	NC_015732	AGT	2	6	59707	59712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498699
1117	NC_015732	CAT	2	6	59755	59760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498699
1118	NC_015732	ATT	2	6	59762	59767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498699
1119	NC_015732	T	6	6	59766	59771	0 %	100 %	0 %	0 %	339498699
1120	NC_015732	AT	4	8	59816	59823	50 %	50 %	0 %	0 %	339498699
1121	NC_015732	AAT	2	6	59824	59829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498699
1122	NC_015732	GCTAT	2	10	59867	59876	20 %	40 %	20 %	20 %	339498699
1123	NC_015732	TTG	2	6	59900	59905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498699
1124	NC_015732	ATT	2	6	59915	59920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498699
1125	NC_015732	ATA	2	6	59978	59983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498699
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1127	NC_015732	TAA	2	6	60075	60080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498699
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1246	NC_015732	TATTGG	2	12	67421	67432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339498706
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1248	NC_015732	TTTTC	2	10	67531	67540	0 %	80 %	0 %	20 %	339498706
1249	NC_015732	AAT	2	6	67583	67588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498706
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1252	NC_015732	TGGGGA	2	12	68011	68022	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	339498707
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