MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_015732	CAG	2	6	3236494	3236499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501433
56002	NC_015732	GAA	2	6	3236517	3236522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501433
56003	NC_015732	TCA	2	6	3236543	3236548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501433
56004	NC_015732	T	6	6	3236575	3236580	0 %	100 %	0 %	0 %	339501433
56005	NC_015732	GAT	2	6	3236760	3236765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501433
56006	NC_015732	TTG	2	6	3236805	3236810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501433
56007	NC_015732	GCC	2	6	3236853	3236858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501433
56008	NC_015732	TCT	2	6	3236951	3236956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501433
56009	NC_015732	TAT	2	6	3236968	3236973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501433
56010	NC_015732	AATA	2	8	3237160	3237167	75 %	25 %	0 %	0 %	339501434
56011	NC_015732	CCG	2	6	3237169	3237174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501434
56012	NC_015732	CAT	2	6	3237228	3237233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501434
56013	NC_015732	CCG	2	6	3237256	3237261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501434
56014	NC_015732	TCG	2	6	3237273	3237278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501434
56015	NC_015732	CAT	2	6	3237384	3237389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501434
56016	NC_015732	AGA	2	6	3237399	3237404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501434
56017	NC_015732	CTT	2	6	3237406	3237411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501434
56018	NC_015732	AGG	2	6	3237433	3237438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501434
56019	NC_015732	A	7	7	3237489	3237495	100 %	0 %	0 %	0 %	339501434
56020	NC_015732	AT	3	6	3237576	3237581	50 %	50 %	0 %	0 %	339501434
56021	NC_015732	C	6	6	3237739	3237744	0 %	0 %	0 %	100 %	339501434
56022	NC_015732	GCG	2	6	3237847	3237852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501434
56023	NC_015732	TGCC	2	8	3237865	3237872	0 %	25 %	25 %	50 %	339501434
56024	NC_015732	TGC	2	6	3237892	3237897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501434
56025	NC_015732	T	6	6	3237906	3237911	0 %	100 %	0 %	0 %	339501434
56026	NC_015732	AAT	2	6	3237950	3237955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501434
56027	NC_015732	CAT	2	6	3238086	3238091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501434
56028	NC_015732	T	8	8	3238113	3238120	0 %	100 %	0 %	0 %	339501434
56029	NC_015732	T	6	6	3238133	3238138	0 %	100 %	0 %	0 %	339501434
56030	NC_015732	ACC	2	6	3238192	3238197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501434
56031	NC_015732	ATT	2	6	3238232	3238237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501434
56032	NC_015732	GGA	2	6	3238320	3238325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501434
56033	NC_015732	ACC	2	6	3238361	3238366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501434
56034	NC_015732	CCT	2	6	3238367	3238372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501434
56035	NC_015732	TAGT	2	8	3238401	3238408	25 %	50 %	25 %	0 %	339501434
56036	NC_015732	TTTA	2	8	3238438	3238445	25 %	75 %	0 %	0 %	339501434
56037	NC_015732	GA	3	6	3238472	3238477	50 %	0 %	50 %	0 %	339501434
56038	NC_015732	GTT	2	6	3238496	3238501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501434
56039	NC_015732	TTA	2	6	3238547	3238552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501434
56040	NC_015732	TTC	2	6	3238576	3238581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501434
56041	NC_015732	ACA	2	6	3238664	3238669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501434
56042	NC_015732	ACC	2	6	3238726	3238731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501434
56043	NC_015732	TCT	2	6	3238814	3238819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501434
56044	NC_015732	T	7	7	3238835	3238841	0 %	100 %	0 %	0 %	339501434

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.