MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_015732	GAA	2	6	3178759	3178764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501385
55003	NC_015732	TTC	2	6	3178770	3178775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501385
55004	NC_015732	TA	3	6	3179104	3179109	50 %	50 %	0 %	0 %	339501385
55005	NC_015732	GGC	2	6	3179188	3179193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501385
55006	NC_015732	ATC	2	6	3179208	3179213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501385
55007	NC_015732	GAA	2	6	3179221	3179226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501385
55008	NC_015732	ATC	2	6	3179227	3179232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501385
55009	NC_015732	CGG	2	6	3179262	3179267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501385
55010	NC_015732	GTA	2	6	3179371	3179376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501386
55011	NC_015732	ATC	2	6	3179440	3179445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501386
55012	NC_015732	TCT	2	6	3179483	3179488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501386
55013	NC_015732	CTG	2	6	3179493	3179498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501386
55014	NC_015732	C	6	6	3179526	3179531	0 %	0 %	0 %	100 %	339501386
55015	NC_015732	CCA	2	6	3179553	3179558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501386
55016	NC_015732	TTC	2	6	3179572	3179577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501386
55017	NC_015732	CTT	2	6	3179652	3179657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501386
55018	NC_015732	GGT	2	6	3179707	3179712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501386
55019	NC_015732	ACCG	2	8	3179726	3179733	25 %	0 %	25 %	50 %	339501386
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55022	NC_015732	TTG	2	6	3180135	3180140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501387
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55024	NC_015732	ATG	2	6	3180218	3180223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501387
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55026	NC_015732	GCA	2	6	3180252	3180257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501387
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55028	NC_015732	GATC	2	8	3180373	3180380	25 %	25 %	25 %	25 %	339501387
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55030	NC_015732	ATG	2	6	3180574	3180579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501387
55031	NC_015732	GTG	2	6	3180732	3180737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501387
55032	NC_015732	GCT	2	6	3180858	3180863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501387
55033	NC_015732	ATCT	2	8	3180884	3180891	25 %	50 %	0 %	25 %	339501387
55034	NC_015732	CTA	2	6	3180910	3180915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501387
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55036	NC_015732	GCCA	2	8	3180952	3180959	25 %	0 %	25 %	50 %	339501387
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55038	NC_015732	GTC	2	6	3181035	3181040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501387
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55040	NC_015732	GCA	2	6	3181062	3181067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501387
55041	NC_015732	CA	3	6	3181077	3181082	50 %	0 %	0 %	50 %	339501387
55042	NC_015732	ATGA	2	8	3181154	3181161	50 %	25 %	25 %	0 %	339501387
55043	NC_015732	GGTTCA	2	12	3181192	3181203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339501387
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55049	NC_015732	GT	3	6	3181767	3181772	0 %	50 %	50 %	0 %	339501388
55050	NC_015732	TTA	2	6	3181779	3181784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501388
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55052	NC_015732	CTA	2	6	3181841	3181846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501388
55053	NC_015732	T	6	6	3182008	3182013	0 %	100 %	0 %	0 %	339501388
55054	NC_015732	TTA	2	6	3182025	3182030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501388
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55058	NC_015732	A	6	6	3182255	3182260	100 %	0 %	0 %	0 %	339501389
55059	NC_015732	AG	3	6	3182298	3182303	50 %	0 %	50 %	0 %	339501389
55060	NC_015732	AT	3	6	3182387	3182392	50 %	50 %	0 %	0 %	339501389
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55067	NC_015732	CCAT	2	8	3182611	3182618	25 %	25 %	0 %	50 %	339501389
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55071	NC_015732	CAA	2	6	3182866	3182871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501389
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55083	NC_015732	ATTT	2	8	3183446	3183453	25 %	75 %	0 %	0 %	339501389
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55088	NC_015732	AGA	2	6	3183991	3183996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501390
55089	NC_015732	CGC	2	6	3184007	3184012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501390
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55093	NC_015732	TA	3	6	3184367	3184372	50 %	50 %	0 %	0 %	339501390
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55100	NC_015732	TTA	2	6	3184634	3184639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501390
55101	NC_015732	TGA	2	6	3184927	3184932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501391
55102	NC_015732	TGGC	2	8	3184934	3184941	0 %	25 %	50 %	25 %	339501391
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55104	NC_015732	T	6	6	3185001	3185006	0 %	100 %	0 %	0 %	339501391
55105	NC_015732	TTCC	2	8	3185073	3185080	0 %	50 %	0 %	50 %	339501391
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55107	NC_015732	TTGG	2	8	3185517	3185524	0 %	50 %	50 %	0 %	339501392
55108	NC_015732	CTT	2	6	3185547	3185552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501392
55109	NC_015732	CCGG	2	8	3185553	3185560	0 %	0 %	50 %	50 %	339501392
55110	NC_015732	TGA	2	6	3185607	3185612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501392
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55113	NC_015732	CGCAG	2	10	3185685	3185694	20 %	0 %	40 %	40 %	339501392
55114	NC_015732	TAC	2	6	3185698	3185703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501392
55115	NC_015732	TC	3	6	3185842	3185847	0 %	50 %	0 %	50 %	339501393
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55117	NC_015732	CGG	2	6	3185884	3185889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501393
55118	NC_015732	ACCAT	2	10	3185937	3185946	40 %	20 %	0 %	40 %	339501393
55119	NC_015732	GAAC	2	8	3186096	3186103	50 %	0 %	25 %	25 %	339501393
55120	NC_015732	CGG	2	6	3186186	3186191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501393
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55134	NC_015732	CGG	2	6	3186949	3186954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501394
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55232	NC_015732	CAGA	2	8	3192055	3192062	50 %	0 %	25 %	25 %	339501397
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55343	NC_015732	GGTG	2	8	3200458	3200465	0 %	25 %	75 %	0 %	339501402
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55346	NC_015732	TCA	2	6	3200598	3200603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501402
55347	NC_015732	T	6	6	3200636	3200641	0 %	100 %	0 %	0 %	339501402
55348	NC_015732	CGG	2	6	3200671	3200676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501402
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55352	NC_015732	CTG	2	6	3200794	3200799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501403
55353	NC_015732	TCT	2	6	3200822	3200827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501403
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55461	NC_015732	CTCCA	2	10	3206374	3206383	20 %	20 %	0 %	60 %	339501406
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55469	NC_015732	CAG	2	6	3206829	3206834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501406
55470	NC_015732	A	6	6	3206847	3206852	100 %	0 %	0 %	0 %	339501406
55471	NC_015732	AGGGGT	2	12	3206891	3206902	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	339501406
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55473	NC_015732	GCT	2	6	3207062	3207067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501407
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55499	NC_015732	CAC	2	6	3208565	3208570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501408
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