MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_015732	TTTAC	2	10	3122149	3122158	20 %	60 %	0 %	20 %	339501330
54002	NC_015732	CA	3	6	3122185	3122190	50 %	0 %	0 %	50 %	339501330
54003	NC_015732	A	6	6	3122257	3122262	100 %	0 %	0 %	0 %	339501330
54004	NC_015732	ACT	2	6	3122275	3122280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501330
54005	NC_015732	T	8	8	3122325	3122332	0 %	100 %	0 %	0 %	339501330
54006	NC_015732	T	8	8	3122376	3122383	0 %	100 %	0 %	0 %	339501330
54007	NC_015732	CTA	2	6	3122393	3122398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501330
54008	NC_015732	CAA	2	6	3122499	3122504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501330
54009	NC_015732	TGA	2	6	3122622	3122627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501330
54010	NC_015732	TCC	2	6	3122649	3122654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501331
54011	NC_015732	T	6	6	3122718	3122723	0 %	100 %	0 %	0 %	339501331
54012	NC_015732	TAC	2	6	3122734	3122739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501331
54013	NC_015732	AAG	2	6	3122753	3122758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501331
54014	NC_015732	TAA	2	6	3122780	3122785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501331
54015	NC_015732	T	7	7	3122786	3122792	0 %	100 %	0 %	0 %	339501331
54016	NC_015732	AG	3	6	3122828	3122833	50 %	0 %	50 %	0 %	339501331
54017	NC_015732	AT	4	8	3122847	3122854	50 %	50 %	0 %	0 %	339501331
54018	NC_015732	CCT	2	6	3122862	3122867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501331
54019	NC_015732	CAG	2	6	3122911	3122916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501331
54020	NC_015732	CTGC	2	8	3123016	3123023	0 %	25 %	25 %	50 %	339501331
54021	NC_015732	GAAA	2	8	3123135	3123142	75 %	0 %	25 %	0 %	339501331
54022	NC_015732	CAAT	2	8	3123157	3123164	50 %	25 %	0 %	25 %	339501331
54023	NC_015732	GTATT	2	10	3123211	3123220	20 %	60 %	20 %	0 %	339501331
54024	NC_015732	TTG	2	6	3123262	3123267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501332
54025	NC_015732	GCA	3	9	3123269	3123277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501332
54026	NC_015732	TGGA	2	8	3123328	3123335	25 %	25 %	50 %	0 %	339501332
54027	NC_015732	GACACC	2	12	3123340	3123351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501332
54028	NC_015732	AC	3	6	3123374	3123379	50 %	0 %	0 %	50 %	339501332
54029	NC_015732	CCG	2	6	3123407	3123412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501332
54030	NC_015732	CCGATG	2	12	3123466	3123477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501332
54031	NC_015732	GGC	2	6	3123505	3123510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501332
54032	NC_015732	TTC	2	6	3123592	3123597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501332
54033	NC_015732	CAGCC	2	10	3123654	3123663	20 %	0 %	20 %	60 %	339501332
54034	NC_015732	AGC	2	6	3123751	3123756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501332
54035	NC_015732	TACCA	2	10	3123760	3123769	40 %	20 %	0 %	40 %	339501332
54036	NC_015732	ACC	2	6	3123820	3123825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501332
54037	NC_015732	TCTGG	2	10	3123846	3123855	0 %	40 %	40 %	20 %	339501332
54038	NC_015732	GAA	2	6	3123878	3123883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501332
54039	NC_015732	AT	3	6	3123974	3123979	50 %	50 %	0 %	0 %	339501332
54040	NC_015732	CAT	2	6	3124030	3124035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54041	NC_015732	CAT	2	6	3124152	3124157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54042	NC_015732	TCA	2	6	3124220	3124225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54043	NC_015732	CAT	2	6	3124584	3124589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54044	NC_015732	TGT	2	6	3124600	3124605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501332
54045	NC_015732	CAT	2	6	3124680	3124685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54046	NC_015732	TA	3	6	3124741	3124746	50 %	50 %	0 %	0 %	339501332
54047	NC_015732	ATC	2	6	3124760	3124765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501332
54048	NC_015732	AAG	2	6	3124789	3124794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501332
54049	NC_015732	AGA	2	6	3124804	3124809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501332
54050	NC_015732	A	7	7	3124928	3124934	100 %	0 %	0 %	0 %	339501333
54051	NC_015732	TTG	2	6	3124944	3124949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501333
54052	NC_015732	GAT	2	6	3125105	3125110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501333
54053	NC_015732	A	8	8	3125115	3125122	100 %	0 %	0 %	0 %	339501333
54054	NC_015732	TGTT	2	8	3125200	3125207	0 %	75 %	25 %	0 %	339501333
54055	NC_015732	CAT	2	6	3125225	3125230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501333
54056	NC_015732	ATC	2	6	3125233	3125238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501333
54057	NC_015732	ATG	2	6	3125269	3125274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501333
54058	NC_015732	AGCT	2	8	3125279	3125286	25 %	25 %	25 %	25 %	339501333
54059	NC_015732	TCA	2	6	3125326	3125331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501333
54060	NC_015732	TAA	2	6	3125337	3125342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501333
54061	NC_015732	TCA	2	6	3125365	3125370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501333
54062	NC_015732	TCA	2	6	3125408	3125413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501333
54063	NC_015732	CAAC	2	8	3125559	3125566	50 %	0 %	0 %	50 %	339501334
54064	NC_015732	TAA	2	6	3125608	3125613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501334
54065	NC_015732	ATT	2	6	3125631	3125636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501334
54066	NC_015732	AGA	2	6	3125659	3125664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501334
54067	NC_015732	CAC	2	6	3125689	3125694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501334
54068	NC_015732	A	6	6	3125774	3125779	100 %	0 %	0 %	0 %	339501334
54069	NC_015732	GTT	2	6	3125817	3125822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501334
54070	NC_015732	GAA	2	6	3125831	3125836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501334
54071	NC_015732	TGA	2	6	3125856	3125861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501334
54072	NC_015732	AAG	2	6	3125862	3125867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501334
54073	NC_015732	GGTA	2	8	3125929	3125936	25 %	25 %	50 %	0 %	339501334
54074	NC_015732	AGG	2	6	3125937	3125942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501334
54075	NC_015732	A	7	7	3125989	3125995	100 %	0 %	0 %	0 %	339501334
54076	NC_015732	ATG	2	6	3126030	3126035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501334
54077	NC_015732	CGATT	2	10	3126053	3126062	20 %	40 %	20 %	20 %	339501334
54078	NC_015732	A	6	6	3126073	3126078	100 %	0 %	0 %	0 %	339501334
54079	NC_015732	TGA	2	6	3126136	3126141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501334
54080	NC_015732	TTAT	2	8	3126200	3126207	25 %	75 %	0 %	0 %	339501334
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54083	NC_015732	CGG	2	6	3126528	3126533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501335
54084	NC_015732	ATT	2	6	3126552	3126557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501335
54085	NC_015732	TTC	2	6	3126560	3126565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501335
54086	NC_015732	TAT	2	6	3126626	3126631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501335
54087	NC_015732	ATG	2	6	3126652	3126657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501335
54088	NC_015732	GCAA	2	8	3126706	3126713	50 %	0 %	25 %	25 %	339501335
54089	NC_015732	AAT	2	6	3126848	3126853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501335
54090	NC_015732	TGG	2	6	3126937	3126942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501335
54091	NC_015732	GAA	2	6	3126969	3126974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501335
54092	NC_015732	AGG	2	6	3127015	3127020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501335
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54094	NC_015732	TCA	2	6	3127213	3127218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501335
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54096	NC_015732	TGAAA	2	10	3127425	3127434	60 %	20 %	20 %	0 %	339501335
54097	NC_015732	TGA	2	6	3127449	3127454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501336
54098	NC_015732	A	6	6	3127511	3127516	100 %	0 %	0 %	0 %	339501336
54099	NC_015732	GAAA	2	8	3127518	3127525	75 %	0 %	25 %	0 %	339501336
54100	NC_015732	CTAA	2	8	3127617	3127624	50 %	25 %	0 %	25 %	339501336
54101	NC_015732	AGAA	2	8	3127724	3127731	75 %	0 %	25 %	0 %	339501337
54102	NC_015732	AGT	2	6	3127744	3127749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501337
54103	NC_015732	TATC	2	8	3127773	3127780	25 %	50 %	0 %	25 %	339501337
54104	NC_015732	A	9	9	3127812	3127820	100 %	0 %	0 %	0 %	339501337
54105	NC_015732	TCA	2	6	3127823	3127828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501337
54106	NC_015732	TTA	2	6	3127842	3127847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501337
54107	NC_015732	TTA	2	6	3127851	3127856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501337
54108	NC_015732	T	7	7	3127920	3127926	0 %	100 %	0 %	0 %	339501337
54109	NC_015732	AT	3	6	3127933	3127938	50 %	50 %	0 %	0 %	339501337
54110	NC_015732	TGT	2	6	3127962	3127967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501337
54111	NC_015732	CAC	2	6	3128001	3128006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501337
54112	NC_015732	CAT	2	6	3128084	3128089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501337
54113	NC_015732	GCA	2	6	3128102	3128107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501337
54114	NC_015732	A	6	6	3128110	3128115	100 %	0 %	0 %	0 %	339501337
54115	NC_015732	CACCAT	2	12	3128164	3128175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339501337
54116	NC_015732	TA	3	6	3128216	3128221	50 %	50 %	0 %	0 %	339501337
54117	NC_015732	ATT	2	6	3128240	3128245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501337
54118	NC_015732	A	6	6	3128273	3128278	100 %	0 %	0 %	0 %	339501337
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54220	NC_015732	TGA	2	6	3134578	3134583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501343
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54224	NC_015732	AAT	2	6	3134720	3134725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501343
54225	NC_015732	TTCTGC	2	12	3134858	3134869	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339501343
54226	NC_015732	TTG	2	6	3134898	3134903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501343
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54229	NC_015732	CAG	2	6	3135015	3135020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501344
54230	NC_015732	AAC	2	6	3135108	3135113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501344
54231	NC_015732	GGTT	2	8	3135120	3135127	0 %	50 %	50 %	0 %	339501344
54232	NC_015732	CCA	2	6	3135176	3135181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501344
54233	NC_015732	CGA	2	6	3135260	3135265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501344
54234	NC_015732	TTCC	2	8	3135281	3135288	0 %	50 %	0 %	50 %	339501344
54235	NC_015732	T	8	8	3135310	3135317	0 %	100 %	0 %	0 %	339501344
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54337	NC_015732	GTA	2	6	3141734	3141739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501352
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54340	NC_015732	TACC	2	8	3141794	3141801	25 %	25 %	0 %	50 %	339501352
54341	NC_015732	TATT	2	8	3141844	3141851	25 %	75 %	0 %	0 %	339501352
54342	NC_015732	AAAG	2	8	3141868	3141875	75 %	0 %	25 %	0 %	339501352
54343	NC_015732	ATC	2	6	3141882	3141887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501352
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54349	NC_015732	TCA	2	6	3142334	3142339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501353
54350	NC_015732	AGG	2	6	3142429	3142434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501353
54351	NC_015732	AAC	2	6	3142540	3142545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501353
54352	NC_015732	T	6	6	3142548	3142553	0 %	100 %	0 %	0 %	339501353
54353	NC_015732	ATTC	2	8	3142635	3142642	25 %	50 %	0 %	25 %	339501353
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54355	NC_015732	TCA	2	6	3142667	3142672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501353
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54376	NC_015732	AAT	2	6	3143330	3143335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501354
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54378	NC_015732	T	8	8	3143504	3143511	0 %	100 %	0 %	0 %	339501355
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54452	NC_015732	TTCGG	2	10	3147867	3147876	0 %	40 %	40 %	20 %	339501361
54453	NC_015732	CCG	2	6	3147887	3147892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501361
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54458	NC_015732	CCAC	2	8	3148201	3148208	25 %	0 %	0 %	75 %	339501361
54459	NC_015732	AAT	2	6	3148275	3148280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501361
54460	NC_015732	GCA	2	6	3148289	3148294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501361
54461	NC_015732	GACC	2	8	3148308	3148315	25 %	0 %	25 %	50 %	339501361
54462	NC_015732	CTT	2	6	3148355	3148360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501361
54463	NC_015732	GATGGC	2	12	3148374	3148385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339501361
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54465	NC_015732	CAT	2	6	3148482	3148487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501361
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