MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015732	TCA	3	9	2983184	2983192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501202
51502	NC_015732	AAG	2	6	2983256	2983261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501203
51503	NC_015732	CTA	2	6	2983384	2983389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501203
51504	NC_015732	GCC	2	6	2983463	2983468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501203
51505	NC_015732	CTC	2	6	2983619	2983624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501203
51506	NC_015732	CTT	2	6	2983636	2983641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501203
51507	NC_015732	CTT	2	6	2983729	2983734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501203
51508	NC_015732	TCC	2	6	2983836	2983841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501203
51509	NC_015732	T	7	7	2983891	2983897	0 %	100 %	0 %	0 %	339501203
51510	NC_015732	GAA	2	6	2984043	2984048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501203
51511	NC_015732	TTA	2	6	2984062	2984067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501203
51512	NC_015732	AAC	2	6	2984091	2984096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501203
51513	NC_015732	ATTCTA	2	12	2984109	2984120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339501203
51514	NC_015732	TGC	2	6	2984183	2984188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501203
51515	NC_015732	TAA	2	6	2984285	2984290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501203
51516	NC_015732	ATC	2	6	2984357	2984362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501203
51517	NC_015732	TTG	2	6	2984396	2984401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501203
51518	NC_015732	CTG	2	6	2984468	2984473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501203
51519	NC_015732	AAT	2	6	2984597	2984602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501203
51520	NC_015732	TAAT	2	8	2984638	2984645	50 %	50 %	0 %	0 %	339501203
51521	NC_015732	A	7	7	2984736	2984742	100 %	0 %	0 %	0 %	339501204
51522	NC_015732	ACA	2	6	2984751	2984756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501204
51523	NC_015732	A	6	6	2984756	2984761	100 %	0 %	0 %	0 %	339501204
51524	NC_015732	AC	3	6	2984846	2984851	50 %	0 %	0 %	50 %	339501204
51525	NC_015732	AGA	2	6	2984919	2984924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51526	NC_015732	CAG	2	6	2985059	2985064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501204
51527	NC_015732	AT	4	8	2985079	2985086	50 %	50 %	0 %	0 %	339501204
51528	NC_015732	A	7	7	2985117	2985123	100 %	0 %	0 %	0 %	339501204
51529	NC_015732	TTG	2	6	2985163	2985168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501204
51530	NC_015732	GAA	2	6	2985178	2985183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51531	NC_015732	TATC	2	8	2985197	2985204	25 %	50 %	0 %	25 %	339501204
51532	NC_015732	AGC	2	6	2985231	2985236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501204
51533	NC_015732	ATG	2	6	2985244	2985249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501204
51534	NC_015732	GAA	2	6	2985301	2985306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51535	NC_015732	TA	3	6	2985416	2985421	50 %	50 %	0 %	0 %	339501204
51536	NC_015732	AAT	2	6	2985475	2985480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501204
51537	NC_015732	AAG	2	6	2985614	2985619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51538	NC_015732	AAG	2	6	2985651	2985656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51539	NC_015732	TGA	2	6	2985702	2985707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501204
51540	NC_015732	TGA	2	6	2985722	2985727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501204
51541	NC_015732	TTGATA	2	12	2985728	2985739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339501204
51542	NC_015732	AT	3	6	2985747	2985752	50 %	50 %	0 %	0 %	339501204
51543	NC_015732	ATTT	2	8	2985770	2985777	25 %	75 %	0 %	0 %	339501204
51544	NC_015732	GAA	2	6	2985859	2985864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51545	NC_015732	TAC	2	6	2985875	2985880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501204
51546	NC_015732	AGC	2	6	2985897	2985902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501204
51547	NC_015732	TTG	2	6	2985908	2985913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501204
51548	NC_015732	AAG	2	6	2986010	2986015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501204
51549	NC_015732	AAAG	2	8	2986145	2986152	75 %	0 %	25 %	0 %	339501205
51550	NC_015732	T	6	6	2986161	2986166	0 %	100 %	0 %	0 %	339501205
51551	NC_015732	ACA	2	6	2986183	2986188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501205
51552	NC_015732	AAC	2	6	2986238	2986243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501205
51553	NC_015732	TTG	2	6	2986315	2986320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501205
51554	NC_015732	ACT	2	6	2986469	2986474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501205
51555	NC_015732	GAT	2	6	2986490	2986495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501205
51556	NC_015732	TCT	2	6	2986536	2986541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501205
51557	NC_015732	TCG	2	6	2986580	2986585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501205
51558	NC_015732	TC	3	6	2986589	2986594	0 %	50 %	0 %	50 %	339501205
51559	NC_015732	TAC	2	6	2986658	2986663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501205
51560	NC_015732	TA	4	8	2986745	2986752	50 %	50 %	0 %	0 %	339501205
51561	NC_015732	CT	3	6	2986913	2986918	0 %	50 %	0 %	50 %	339501205
51562	NC_015732	ATT	2	6	2986932	2986937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501205
51563	NC_015732	CAG	2	6	2986976	2986981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501205
51564	NC_015732	AGT	2	6	2987012	2987017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501205
51565	NC_015732	CTGT	2	8	2987151	2987158	0 %	50 %	25 %	25 %	339501206
51566	NC_015732	T	6	6	2987307	2987312	0 %	100 %	0 %	0 %	339501206
51567	NC_015732	T	6	6	2987418	2987423	0 %	100 %	0 %	0 %	339501206
51568	NC_015732	TCA	2	6	2987448	2987453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501206
51569	NC_015732	GTC	2	6	2987471	2987476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501206
51570	NC_015732	TTC	2	6	2987494	2987499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501206
51571	NC_015732	CCCG	2	8	2987516	2987523	0 %	0 %	25 %	75 %	339501206
51572	NC_015732	ATA	2	6	2987621	2987626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501206
51573	NC_015732	GCC	2	6	2987632	2987637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501206
51574	NC_015732	A	7	7	2987647	2987653	100 %	0 %	0 %	0 %	339501206
51575	NC_015732	GCA	2	6	2987683	2987688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501207
51576	NC_015732	TAG	2	6	2987767	2987772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501207
51577	NC_015732	T	7	7	2987895	2987901	0 %	100 %	0 %	0 %	339501207
51578	NC_015732	AT	3	6	2987902	2987907	50 %	50 %	0 %	0 %	339501207
51579	NC_015732	CAC	2	6	2987945	2987950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501207
51580	NC_015732	ACC	2	6	2987967	2987972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501207
51581	NC_015732	GGT	2	6	2988048	2988053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501207
51582	NC_015732	GTG	2	6	2988073	2988078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501207
51583	NC_015732	ACC	2	6	2988090	2988095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501207
51584	NC_015732	GAT	2	6	2988162	2988167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501207
51585	NC_015732	CTG	2	6	2988170	2988175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501207
51586	NC_015732	AGC	2	6	2988183	2988188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501207
51587	NC_015732	GAT	2	6	2988221	2988226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501207
51588	NC_015732	GGC	2	6	2988277	2988282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501207
51589	NC_015732	AATCAA	2	12	2988290	2988301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	339501207
51590	NC_015732	AAC	2	6	2988323	2988328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501207
51591	NC_015732	TTCAT	2	10	2988364	2988373	20 %	60 %	0 %	20 %	339501207
51592	NC_015732	TAA	2	6	2988386	2988391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501207
51593	NC_015732	T	6	6	2988471	2988476	0 %	100 %	0 %	0 %	339501207
51594	NC_015732	CAT	2	6	2988477	2988482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501207
51595	NC_015732	CTT	2	6	2988521	2988526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501208
51596	NC_015732	CGC	2	6	2988542	2988547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501208
51597	NC_015732	A	6	6	2988556	2988561	100 %	0 %	0 %	0 %	339501208
51598	NC_015732	TCT	2	6	2988598	2988603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501208
51599	NC_015732	T	6	6	2988643	2988648	0 %	100 %	0 %	0 %	339501208
51600	NC_015732	CAGC	2	8	2988653	2988660	25 %	0 %	25 %	50 %	339501208
51601	NC_015732	T	6	6	2988741	2988746	0 %	100 %	0 %	0 %	339501208
51602	NC_015732	CGTAC	2	10	2988818	2988827	20 %	20 %	20 %	40 %	339501208
51603	NC_015732	GAA	2	6	2988907	2988912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501208
51604	NC_015732	GCCG	2	8	2988922	2988929	0 %	0 %	50 %	50 %	339501208
51605	NC_015732	GCA	2	6	2988998	2989003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501208
51606	NC_015732	CAT	2	6	2989014	2989019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501208
51607	NC_015732	CCG	2	6	2989100	2989105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501208
51608	NC_015732	GTA	2	6	2989140	2989145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501208
51609	NC_015732	GCC	2	6	2989155	2989160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501208
51610	NC_015732	C	7	7	2989159	2989165	0 %	0 %	0 %	100 %	339501208
51611	NC_015732	CAG	2	6	2989334	2989339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501208
51612	NC_015732	ATA	2	6	2989467	2989472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501208
51613	NC_015732	GCC	2	6	2989495	2989500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501208
51614	NC_015732	TCA	2	6	2989523	2989528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501208
51615	NC_015732	TTC	2	6	2989536	2989541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501208
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51617	NC_015732	GGAT	2	8	2989646	2989653	25 %	25 %	50 %	0 %	339501209
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