MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_015732	TCG	2	6	2893845	2893850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501131
50002	NC_015732	CTG	2	6	2893887	2893892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501131
50003	NC_015732	AAAAAC	2	12	2893934	2893945	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	339501131
50004	NC_015732	TTA	2	6	2893995	2894000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501131
50005	NC_015732	CGC	2	6	2894041	2894046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501131
50006	NC_015732	TAT	2	6	2894122	2894127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501131
50007	NC_015732	GGT	2	6	2894149	2894154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501131
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50009	NC_015732	TCC	2	6	2894226	2894231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501131
50010	NC_015732	CTT	2	6	2894255	2894260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501131
50011	NC_015732	GAT	2	6	2894290	2894295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501131
50012	NC_015732	TTGG	2	8	2894351	2894358	0 %	50 %	50 %	0 %	339501131
50013	NC_015732	AGG	2	6	2894371	2894376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501131
50014	NC_015732	CT	3	6	2894377	2894382	0 %	50 %	0 %	50 %	339501131
50015	NC_015732	G	6	6	2894386	2894391	0 %	0 %	100 %	0 %	339501131
50016	NC_015732	GCT	2	6	2894411	2894416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501131
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50018	NC_015732	GTA	2	6	2894472	2894477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501131
50019	NC_015732	ATC	2	6	2894690	2894695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501131
50020	NC_015732	GCC	2	6	2894735	2894740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501131
50021	NC_015732	CGAC	2	8	2894854	2894861	25 %	0 %	25 %	50 %	339501131
50022	NC_015732	CGG	2	6	2894947	2894952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501131
50023	NC_015732	GCAGTG	2	12	2894963	2894974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339501131
50024	NC_015732	GCA	2	6	2895029	2895034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501131
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50026	NC_015732	TCA	2	6	2895217	2895222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501131
50027	NC_015732	CAAC	2	8	2895243	2895250	50 %	0 %	0 %	50 %	339501131
50028	NC_015732	CAGGA	2	10	2895345	2895354	40 %	0 %	40 %	20 %	339501131
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50031	NC_015732	T	6	6	2895581	2895586	0 %	100 %	0 %	0 %	339501131
50032	NC_015732	CAC	2	6	2896428	2896433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501132
50033	NC_015732	TGA	2	6	2896444	2896449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501132
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50035	NC_015732	AGT	2	6	2896643	2896648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501132
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50040	NC_015732	GCCA	2	8	2896790	2896797	25 %	0 %	25 %	50 %	339501132
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50043	NC_015732	CCGA	2	8	2897014	2897021	25 %	0 %	25 %	50 %	339501132
50044	NC_015732	AGG	2	6	2897043	2897048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501132
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50049	NC_015732	CCGG	2	8	2897323	2897330	0 %	0 %	50 %	50 %	339501132
50050	NC_015732	CCCGA	2	10	2897364	2897373	20 %	0 %	20 %	60 %	339501132
50051	NC_015732	GGCGA	2	10	2897429	2897438	20 %	0 %	60 %	20 %	339501132
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50054	NC_015732	GCA	2	6	2897614	2897619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501132
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50056	NC_015732	CCTG	2	8	2897632	2897639	0 %	25 %	25 %	50 %	339501132
50057	NC_015732	TTCA	2	8	2897645	2897652	25 %	50 %	0 %	25 %	339501132
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50067	NC_015732	TCCCCG	2	12	2898529	2898540	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	339501134
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50101	NC_015732	T	7	7	2900146	2900152	0 %	100 %	0 %	0 %	339501135
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50107	NC_015732	TTCC	2	8	2900327	2900334	0 %	50 %	0 %	50 %	339501135
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50114	NC_015732	CAA	2	6	2900723	2900728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501135
50115	NC_015732	T	6	6	2900764	2900769	0 %	100 %	0 %	0 %	339501135
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50117	NC_015732	CAT	2	6	2900964	2900969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501135
50118	NC_015732	CTTCAG	2	12	2901041	2901052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339501135
50119	NC_015732	AGAA	2	8	2901054	2901061	75 %	0 %	25 %	0 %	339501135
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50223	NC_015732	ATACAG	2	12	2906694	2906705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339501139
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50230	NC_015732	CAT	2	6	2907023	2907028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501139
50231	NC_015732	ATT	2	6	2907057	2907062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501139
50232	NC_015732	TGA	2	6	2907094	2907099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501139
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50352	NC_015732	CTA	2	6	2914824	2914829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501147
50353	NC_015732	CTG	2	6	2914852	2914857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501147
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50452	NC_015732	CCTGC	2	10	2920492	2920501	0 %	20 %	20 %	60 %	339501153
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50466	NC_015732	TCG	2	6	2921391	2921396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501153
50467	NC_015732	ATCA	2	8	2921401	2921408	50 %	25 %	0 %	25 %	339501153
50468	NC_015732	TAA	2	6	2921423	2921428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501153
50469	NC_015732	TAT	2	6	2921460	2921465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501153
50470	NC_015732	A	7	7	2921488	2921494	100 %	0 %	0 %	0 %	339501153
50471	NC_015732	GAA	2	6	2921548	2921553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501153
50472	NC_015732	ATCG	2	8	2921555	2921562	25 %	25 %	25 %	25 %	339501153
50473	NC_015732	TAC	2	6	2921583	2921588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501153
50474	NC_015732	CAC	2	6	2921685	2921690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501153
50475	NC_015732	GAT	2	6	2921767	2921772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501154
50476	NC_015732	GATG	2	8	2921808	2921815	25 %	25 %	50 %	0 %	339501154
50477	NC_015732	AAC	2	6	2921870	2921875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501154
50478	NC_015732	GGC	2	6	2921920	2921925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501154
50479	NC_015732	A	6	6	2921939	2921944	100 %	0 %	0 %	0 %	339501154
50480	NC_015732	A	6	6	2922142	2922147	100 %	0 %	0 %	0 %	339501154
50481	NC_015732	GAA	2	6	2922157	2922162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501154
50482	NC_015732	ATT	2	6	2922163	2922168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501154
50483	NC_015732	GTC	2	6	2922274	2922279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501154
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50486	NC_015732	AGA	2	6	2922627	2922632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501154
50487	NC_015732	T	7	7	2922635	2922641	0 %	100 %	0 %	0 %	339501154
50488	NC_015732	ACC	2	6	2922669	2922674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501154
50489	NC_015732	CTG	2	6	2922706	2922711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501154
50490	NC_015732	ACAT	2	8	2922743	2922750	50 %	25 %	0 %	25 %	339501154
50491	NC_015732	CTA	2	6	2922902	2922907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501154
50492	NC_015732	GCT	2	6	2922931	2922936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501154
50493	NC_015732	TATAT	2	10	2923054	2923063	40 %	60 %	0 %	0 %	339501154
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50495	NC_015732	GTAT	2	8	2923085	2923092	25 %	50 %	25 %	0 %	339501154
50496	NC_015732	TCA	2	6	2923183	2923188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501155
50497	NC_015732	ATC	2	6	2923273	2923278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501155
50498	NC_015732	AACAG	2	10	2923370	2923379	60 %	0 %	20 %	20 %	339501155
50499	NC_015732	GGAA	2	8	2923445	2923452	50 %	0 %	50 %	0 %	339501155
50500	NC_015732	TCC	2	6	2923463	2923468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501155

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