MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015732	GTG	2	6	259178	259183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498868
4502	NC_015732	CCA	2	6	259214	259219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498868
4503	NC_015732	CGC	2	6	259245	259250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498868
4504	NC_015732	CTTA	2	8	259306	259313	25 %	50 %	0 %	25 %	339498869
4505	NC_015732	AAG	2	6	259318	259323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498869
4506	NC_015732	ATGA	2	8	259336	259343	50 %	25 %	25 %	0 %	339498869
4507	NC_015732	GAA	2	6	259398	259403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498869
4508	NC_015732	AGT	2	6	259417	259422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498869
4509	NC_015732	AAT	2	6	259423	259428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498869
4510	NC_015732	TAAGAA	2	12	259444	259455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339498869
4511	NC_015732	AG	3	6	259467	259472	50 %	0 %	50 %	0 %	339498869
4512	NC_015732	A	6	6	259487	259492	100 %	0 %	0 %	0 %	339498869
4513	NC_015732	AGA	2	6	259499	259504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498869
4514	NC_015732	TAC	2	6	259570	259575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498869
4515	NC_015732	ATG	2	6	259611	259616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498869
4516	NC_015732	TAA	2	6	259647	259652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498869
4517	NC_015732	GTG	2	6	259715	259720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498869
4518	NC_015732	CTT	2	6	259728	259733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498869
4519	NC_015732	TGT	2	6	259736	259741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498869
4520	NC_015732	TG	3	6	259789	259794	0 %	50 %	50 %	0 %	339498869
4521	NC_015732	TGG	2	6	259798	259803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498869
4522	NC_015732	AAT	2	6	259813	259818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498869
4523	NC_015732	T	6	6	259901	259906	0 %	100 %	0 %	0 %	339498869
4524	NC_015732	AAT	2	6	259927	259932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498869
4525	NC_015732	AGT	2	6	259982	259987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498869
4526	NC_015732	AATC	2	8	260483	260490	50 %	25 %	0 %	25 %	339498870
4527	NC_015732	AT	3	6	260505	260510	50 %	50 %	0 %	0 %	339498870
4528	NC_015732	TCTGA	2	10	260534	260543	20 %	40 %	20 %	20 %	339498870
4529	NC_015732	ATC	2	6	260575	260580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498870
4530	NC_015732	TAA	2	6	260630	260635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498870
4531	NC_015732	TCA	3	9	260692	260700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498870
4532	NC_015732	CAG	2	6	260717	260722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498870
4533	NC_015732	AACA	2	8	260784	260791	75 %	0 %	0 %	25 %	339498870
4534	NC_015732	AAAG	2	8	260861	260868	75 %	0 %	25 %	0 %	339498870
4535	NC_015732	TGA	2	6	261120	261125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498871
4536	NC_015732	T	6	6	261146	261151	0 %	100 %	0 %	0 %	339498871
4537	NC_015732	TCC	2	6	261241	261246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498871
4538	NC_015732	GCTTCG	2	12	261265	261276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498871
4539	NC_015732	TTA	2	6	261325	261330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498871
4540	NC_015732	T	6	6	261359	261364	0 %	100 %	0 %	0 %	339498871
4541	NC_015732	TTTC	2	8	261405	261412	0 %	75 %	0 %	25 %	339498871
4542	NC_015732	CTT	2	6	261419	261424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498871
4543	NC_015732	T	6	6	261495	261500	0 %	100 %	0 %	0 %	339498871
4544	NC_015732	ATT	2	6	261513	261518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498871
4545	NC_015732	CTT	2	6	261545	261550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498871
4546	NC_015732	ATC	2	6	261558	261563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498871
4547	NC_015732	T	8	8	261645	261652	0 %	100 %	0 %	0 %	339498871
4548	NC_015732	TCAT	2	8	261700	261707	25 %	50 %	0 %	25 %	339498871
4549	NC_015732	ATG	2	6	261712	261717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498871
4550	NC_015732	T	6	6	261731	261736	0 %	100 %	0 %	0 %	339498871
4551	NC_015732	ATCAT	2	10	261757	261766	40 %	40 %	0 %	20 %	339498871
4552	NC_015732	GAT	2	6	261775	261780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498871
4553	NC_015732	TCC	2	6	261821	261826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498872
4554	NC_015732	AGAA	2	8	261850	261857	75 %	0 %	25 %	0 %	339498872
4555	NC_015732	TCAA	2	8	261944	261951	50 %	25 %	0 %	25 %	339498872
4556	NC_015732	ATA	2	6	261953	261958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498872
4557	NC_015732	ATT	2	6	261961	261966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498872
4558	NC_015732	TGCA	2	8	262051	262058	25 %	25 %	25 %	25 %	339498872
4559	NC_015732	ATA	2	6	262073	262078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498872
4560	NC_015732	CGGAA	2	10	262407	262416	40 %	0 %	40 %	20 %	339498873
4561	NC_015732	TGA	2	6	262579	262584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498873
4562	NC_015732	AGCC	2	8	262626	262633	25 %	0 %	25 %	50 %	339498873
4563	NC_015732	AGT	2	6	262662	262667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498873
4564	NC_015732	AT	3	6	262685	262690	50 %	50 %	0 %	0 %	339498873
4565	NC_015732	CATC	2	8	262712	262719	25 %	25 %	0 %	50 %	339498873
4566	NC_015732	TCA	3	9	262766	262774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498873
4567	NC_015732	TTA	2	6	262793	262798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498873
4568	NC_015732	CAATG	2	10	263002	263011	40 %	20 %	20 %	20 %	339498874
4569	NC_015732	TGA	2	6	263024	263029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498874
4570	NC_015732	TCA	2	6	263126	263131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498874
4571	NC_015732	TCGGTC	2	12	263138	263149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498874
4572	NC_015732	GCC	2	6	263188	263193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498874
4573	NC_015732	TGG	3	9	263253	263261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498874
4574	NC_015732	TGCT	2	8	263317	263324	0 %	50 %	25 %	25 %	339498874
4575	NC_015732	CGG	2	6	263403	263408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498874
4576	NC_015732	T	6	6	263425	263430	0 %	100 %	0 %	0 %	339498874
4577	NC_015732	GATGC	2	10	263527	263536	20 %	20 %	40 %	20 %	339498874
4578	NC_015732	TGC	2	6	263540	263545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498874
4579	NC_015732	CCT	2	6	263583	263588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498874
4580	NC_015732	ATGA	2	8	263735	263742	50 %	25 %	25 %	0 %	339498874
4581	NC_015732	CTA	2	6	263752	263757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498875
4582	NC_015732	ATT	2	6	263772	263777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498875
4583	NC_015732	GTC	2	6	263788	263793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498875
4584	NC_015732	TTG	2	6	263863	263868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498875
4585	NC_015732	GAA	2	6	263889	263894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498875
4586	NC_015732	CGG	2	6	264006	264011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498875
4587	NC_015732	A	6	6	264015	264020	100 %	0 %	0 %	0 %	339498875
4588	NC_015732	A	6	6	264023	264028	100 %	0 %	0 %	0 %	339498875
4589	NC_015732	CCCGG	2	10	264070	264079	0 %	0 %	40 %	60 %	339498875
4590	NC_015732	CAG	2	6	264082	264087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498875
4591	NC_015732	TGA	2	6	264167	264172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498875
4592	NC_015732	T	7	7	264380	264386	0 %	100 %	0 %	0 %	339498875
4593	NC_015732	GAA	2	6	264420	264425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498875
4594	NC_015732	GTG	2	6	264509	264514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498875
4595	NC_015732	T	6	6	264581	264586	0 %	100 %	0 %	0 %	339498876
4596	NC_015732	TG	3	6	264590	264595	0 %	50 %	50 %	0 %	339498876
4597	NC_015732	GAT	2	6	264719	264724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
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4599	NC_015732	TTG	2	6	264807	264812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498876
4600	NC_015732	TGA	2	6	264844	264849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
4601	NC_015732	ATG	2	6	264993	264998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
4602	NC_015732	GTA	2	6	265016	265021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
4603	NC_015732	TCT	2	6	265236	265241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498877
4604	NC_015732	TC	4	8	265244	265251	0 %	50 %	0 %	50 %	339498877
4605	NC_015732	GTG	2	6	265255	265260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498877
4606	NC_015732	TAG	2	6	265345	265350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498877
4607	NC_015732	ATGG	2	8	265376	265383	25 %	25 %	50 %	0 %	339498877
4608	NC_015732	AT	3	6	265404	265409	50 %	50 %	0 %	0 %	339498877
4609	NC_015732	TGC	2	6	265433	265438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498877
4610	NC_015732	GCTT	2	8	265451	265458	0 %	50 %	25 %	25 %	339498877
4611	NC_015732	TCA	2	6	265467	265472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
4612	NC_015732	CAGC	2	8	265506	265513	25 %	0 %	25 %	50 %	339498877
4613	NC_015732	TCA	2	6	265542	265547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
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4615	NC_015732	TGG	2	6	265577	265582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498877
4616	NC_015732	TTG	2	6	265617	265622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498877
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4618	NC_015732	TGA	2	6	265785	265790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498877
4619	NC_015732	TTA	2	6	265819	265824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498877
4620	NC_015732	GAAA	2	8	265869	265876	75 %	0 %	25 %	0 %	339498877
4621	NC_015732	TG	3	6	265922	265927	0 %	50 %	50 %	0 %	339498877
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4623	NC_015732	ATTT	2	8	265994	266001	25 %	75 %	0 %	0 %	339498877
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4853	NC_015732	TCTA	2	8	281104	281111	25 %	50 %	0 %	25 %	339498888
4854	NC_015732	CACC	2	8	281130	281137	25 %	0 %	0 %	75 %	339498888
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4989	NC_015732	CT	3	6	290428	290433	0 %	50 %	0 %	50 %	339498897
4990	NC_015732	T	6	6	290444	290449	0 %	100 %	0 %	0 %	339498897
4991	NC_015732	CCA	2	6	290451	290456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498897
4992	NC_015732	T	6	6	290488	290493	0 %	100 %	0 %	0 %	339498897
4993	NC_015732	CT	3	6	290496	290501	0 %	50 %	0 %	50 %	339498897
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