MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	GAAA	2	8	65	72	75 %	0 %	25 %	0 %	339498646
2	NC_015732	CAG	2	6	87	92	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
3	NC_015732	GAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
4	NC_015732	CATT	2	8	128	135	25 %	50 %	0 %	25 %	339498646
5	NC_015732	AGA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
6	NC_015732	ATT	3	9	159	167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498646
7	NC_015732	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
8	NC_015732	A	6	6	284	289	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
9	NC_015732	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
10	NC_015732	ACA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
11	NC_015732	ACA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
12	NC_015732	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498646
13	NC_015732	ATA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
14	NC_015732	A	6	6	506	511	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
15	NC_015732	TCCTT	2	10	530	539	0 %	60 %	0 %	40 %	339498646
16	NC_015732	AC	3	6	567	572	50 %	0 %	0 %	50 %	339498646
17	NC_015732	TACA	2	8	594	601	50 %	25 %	0 %	25 %	339498646
18	NC_015732	CTG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498646
19	NC_015732	AAAT	2	8	698	705	75 %	25 %	0 %	0 %	339498646
20	NC_015732	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
21	NC_015732	CAAAA	2	10	750	759	80 %	0 %	0 %	20 %	339498646
22	NC_015732	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498646
23	NC_015732	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
24	NC_015732	TCTG	2	8	860	867	0 %	50 %	25 %	25 %	339498646
25	NC_015732	CCA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498646
26	NC_015732	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
27	NC_015732	GTAA	2	8	1002	1009	50 %	25 %	25 %	0 %	339498646
28	NC_015732	AGC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
29	NC_015732	CAA	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
30	NC_015732	TCTT	2	8	1196	1203	0 %	75 %	0 %	25 %	339498646
31	NC_015732	A	7	7	1220	1226	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
32	NC_015732	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
33	NC_015732	CGG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498646
34	NC_015732	ATGC	3	12	1344	1355	25 %	25 %	25 %	25 %	339498646
35	NC_015732	GAA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
36	NC_015732	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	339498647
37	NC_015732	AGA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
38	NC_015732	AAAAT	2	10	1924	1933	80 %	20 %	0 %	0 %	339498647
39	NC_015732	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
40	NC_015732	A	7	7	1953	1959	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
41	NC_015732	TGA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
42	NC_015732	GAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498647
43	NC_015732	A	6	6	2190	2195	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
44	NC_015732	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
45	NC_015732	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
46	NC_015732	A	7	7	2308	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
47	NC_015732	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
48	NC_015732	ATC	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498647
49	NC_015732	CCG	2	6	2381	2386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498647
50	NC_015732	GTA	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
51	NC_015732	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
52	NC_015732	GAA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
53	NC_015732	T	6	6	2717	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	339498647
54	NC_015732	GTTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	339498648
55	NC_015732	T	6	6	2835	2840	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
56	NC_015732	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
57	NC_015732	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498648
58	NC_015732	ATC	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
59	NC_015732	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
60	NC_015732	CCT	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498648
61	NC_015732	TAT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498648
62	NC_015732	T	6	6	3097	3102	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
63	NC_015732	ACG	3	9	3140	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
64	NC_015732	T	6	6	3153	3158	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
65	NC_015732	TCTA	2	8	3183	3190	25 %	50 %	0 %	25 %	339498648
66	NC_015732	AAG	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
67	NC_015732	TCA	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
68	NC_015732	CGA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
69	NC_015732	GAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
70	NC_015732	A	6	6	3692	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	339498648
71	NC_015732	TGAACA	2	12	3716	3727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339498648
72	NC_015732	T	7	7	3731	3737	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
73	NC_015732	T	6	6	3740	3745	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
74	NC_015732	GAA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
75	NC_015732	GAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
76	NC_015732	TTCT	2	8	3840	3847	0 %	75 %	0 %	25 %	339498649
77	NC_015732	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	339498649
78	NC_015732	TAAG	2	8	3867	3874	50 %	25 %	25 %	0 %	339498649
79	NC_015732	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498649
80	NC_015732	TGGAAC	2	12	3954	3965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339498649
81	NC_015732	TCG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498649
82	NC_015732	TTCCT	2	10	4054	4063	0 %	60 %	0 %	40 %	339498649
83	NC_015732	TAAT	2	8	4071	4078	50 %	50 %	0 %	0 %	339498649
84	NC_015732	GTT	2	6	4184	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498649
85	NC_015732	CATA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	0 %	25 %	339498649
86	NC_015732	AGTAA	2	10	4384	4393	60 %	20 %	20 %	0 %	339498650
87	NC_015732	GGC	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498650
88	NC_015732	CGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498650
89	NC_015732	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498650
90	NC_015732	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	339498650
91	NC_015732	TTC	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498651
92	NC_015732	TTGT	2	8	4862	4869	0 %	75 %	25 %	0 %	339498651
93	NC_015732	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
94	NC_015732	TGT	2	6	5159	5164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
95	NC_015732	CCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498652
96	NC_015732	AAC	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
97	NC_015732	CAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
98	NC_015732	ATC	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
99	NC_015732	GAA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
100	NC_015732	ATAAGG	2	12	5452	5463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339498652
101	NC_015732	GTT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
102	NC_015732	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
103	NC_015732	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
104	NC_015732	CT	3	6	5709	5714	0 %	50 %	0 %	50 %	339498652
105	NC_015732	G	6	6	5727	5732	0 %	0 %	100 %	0 %	339498652
106	NC_015732	A	6	6	5866	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
107	NC_015732	A	6	6	5886	5891	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
108	NC_015732	TCA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
109	NC_015732	GTACCT	2	12	6000	6011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339498652
110	NC_015732	TA	3	6	6036	6041	50 %	50 %	0 %	0 %	339498652
111	NC_015732	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
112	NC_015732	TTC	2	6	6079	6084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
113	NC_015732	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
114	NC_015732	CTG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498652
115	NC_015732	ATT	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
116	NC_015732	T	6	6	6241	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	339498652
117	NC_015732	AAT	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
118	NC_015732	A	7	7	6323	6329	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
119	NC_015732	CAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
120	NC_015732	CAA	2	6	6406	6411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
121	NC_015732	A	6	6	6441	6446	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
122	NC_015732	TAA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
123	NC_015732	TGGA	2	8	6563	6570	25 %	25 %	50 %	0 %	339498652
124	NC_015732	TTTA	2	8	6660	6667	25 %	75 %	0 %	0 %	339498652
125	NC_015732	CAG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
126	NC_015732	AAT	2	6	6720	6725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
127	NC_015732	AGATGA	2	12	6730	6741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339498652
128	NC_015732	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
129	NC_015732	ATG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498652
130	NC_015732	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
131	NC_015732	ATT	2	6	6849	6854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
132	NC_015732	A	9	9	6920	6928	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
133	NC_015732	CGAT	2	8	7000	7007	25 %	25 %	25 %	25 %	339498653
134	NC_015732	AGA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
135	NC_015732	A	6	6	7086	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	339498653
136	NC_015732	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498653
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262	NC_015732	T	6	6	15194	15199	0 %	100 %	0 %	0 %	339498662
263	NC_015732	CAAAG	2	10	15356	15365	60 %	0 %	20 %	20 %	339498662
264	NC_015732	CCA	2	6	15490	15495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498662
265	NC_015732	GAC	3	9	15519	15527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498662
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