MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 2493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	GCA	2	6	5	10	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731759
2	NC_015710	CTG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731759
3	NC_015710	TGC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731759
4	NC_015710	ACA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
5	NC_015710	CAA	2	6	72	77	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
6	NC_015710	GCAACA	2	12	80	91	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731759
7	NC_015710	ACA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
8	NC_015710	GAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
9	NC_015710	T	6	6	139	144	0 %	100 %	0 %	0 %	338731759
10	NC_015710	TCT	2	6	147	152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
11	NC_015710	GAT	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
12	NC_015710	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
13	NC_015710	TCT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
14	NC_015710	TCT	3	9	302	310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
15	NC_015710	TCT	3	9	317	325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
16	NC_015710	ATTC	2	8	330	337	25 %	50 %	0 %	25 %	338731759
17	NC_015710	CTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
18	NC_015710	TCT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
19	NC_015710	ATC	2	6	433	438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731759
20	NC_015710	TCA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731759
21	NC_015710	TTC	2	6	481	486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
22	NC_015710	AAT	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731759
23	NC_015710	AGG	2	6	578	583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731759
24	NC_015710	CTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731760
25	NC_015710	GGT	2	6	898	903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731760
26	NC_015710	GAT	2	6	904	909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731760
27	NC_015710	GA	3	6	940	945	50 %	0 %	50 %	0 %	338731760
28	NC_015710	CAT	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731760
29	NC_015710	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
30	NC_015710	CT	3	6	1118	1123	0 %	50 %	0 %	50 %	338731761
31	NC_015710	GA	3	6	1179	1184	50 %	0 %	50 %	0 %	338731761
32	NC_015710	GTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731761
33	NC_015710	TGTT	2	8	1322	1329	0 %	75 %	25 %	0 %	338731761
34	NC_015710	CTTTT	2	10	1344	1353	0 %	80 %	0 %	20 %	338731761
35	NC_015710	T	6	6	1373	1378	0 %	100 %	0 %	0 %	338731761
36	NC_015710	TCT	2	6	1496	1501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
37	NC_015710	CTT	3	9	1520	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
38	NC_015710	TTGT	2	8	1545	1552	0 %	75 %	25 %	0 %	338731761
39	NC_015710	G	6	6	1557	1562	0 %	0 %	100 %	0 %	338731761
40	NC_015710	TGA	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731761
41	NC_015710	T	6	6	1589	1594	0 %	100 %	0 %	0 %	338731761
42	NC_015710	T	6	6	1604	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	338731761
43	NC_015710	TTG	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731761
44	NC_015710	ATG	3	9	1687	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731761
45	NC_015710	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731761
46	NC_015710	GAC	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731761
47	NC_015710	ATA	2	6	1960	1965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731761
48	NC_015710	T	6	6	1994	1999	0 %	100 %	0 %	0 %	338731761
49	NC_015710	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731761
50	NC_015710	CTT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
51	NC_015710	TTC	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
52	NC_015710	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731762
53	NC_015710	ATC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731762
54	NC_015710	AG	3	6	2522	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	338731762
55	NC_015710	T	6	6	2640	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	338731762
56	NC_015710	TCA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731762
57	NC_015710	TTC	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731762
58	NC_015710	T	7	7	2778	2784	0 %	100 %	0 %	0 %	338731762
59	NC_015710	GA	3	6	2798	2803	50 %	0 %	50 %	0 %	338731762
60	NC_015710	AAT	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731762
61	NC_015710	GTTCCA	2	12	2825	2836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731762
62	NC_015710	T	7	7	2842	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	338731762
63	NC_015710	TGT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731762
64	NC_015710	GAC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731762
65	NC_015710	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	338731762
66	NC_015710	TGA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731762
67	NC_015710	A	6	6	3049	3054	100 %	0 %	0 %	0 %	338731763
68	NC_015710	TC	3	6	3135	3140	0 %	50 %	0 %	50 %	338731763
69	NC_015710	TGC	2	6	3183	3188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731763
70	NC_015710	AAT	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731763
71	NC_015710	TGC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731763
72	NC_015710	GTT	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731763
73	NC_015710	GTG	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731763
74	NC_015710	GCA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731763
75	NC_015710	T	7	7	3429	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	338731763
76	NC_015710	GA	3	6	3459	3464	50 %	0 %	50 %	0 %	338731763
77	NC_015710	AGTC	2	8	3484	3491	25 %	25 %	25 %	25 %	338731763
78	NC_015710	ATT	3	9	3548	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731763
79	NC_015710	GGA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731763
80	NC_015710	TA	3	6	3613	3618	50 %	50 %	0 %	0 %	338731763
81	NC_015710	TC	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	338731763
82	NC_015710	TTC	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731763
83	NC_015710	AAG	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731763
84	NC_015710	T	8	8	3750	3757	0 %	100 %	0 %	0 %	338731763
85	NC_015710	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731763
86	NC_015710	CTT	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731763
87	NC_015710	AT	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	338731763
88	NC_015710	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	338731763
89	NC_015710	ACA	2	6	3992	3997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731763
90	NC_015710	TAT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731763
91	NC_015710	TTG	2	6	4136	4141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731763
92	NC_015710	T	6	6	4150	4155	0 %	100 %	0 %	0 %	338731763
93	NC_015710	GATG	2	8	4167	4174	25 %	25 %	50 %	0 %	338731763
94	NC_015710	T	6	6	4195	4200	0 %	100 %	0 %	0 %	338731763
95	NC_015710	TCTT	2	8	4218	4225	0 %	75 %	0 %	25 %	338731763
96	NC_015710	CTT	2	6	4260	4265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731764
97	NC_015710	GAG	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731764
98	NC_015710	CTAT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	0 %	25 %	338731764
99	NC_015710	TCT	2	6	4465	4470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
100	NC_015710	TTCC	2	8	4551	4558	0 %	50 %	0 %	50 %	338731765
101	NC_015710	ACC	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731765
102	NC_015710	GA	3	6	4596	4601	50 %	0 %	50 %	0 %	338731765
103	NC_015710	ATTC	2	8	4606	4613	25 %	50 %	0 %	25 %	338731765
104	NC_015710	AATC	2	8	4633	4640	50 %	25 %	0 %	25 %	338731765
105	NC_015710	TCT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
106	NC_015710	AACG	2	8	4723	4730	50 %	0 %	25 %	25 %	338731765
107	NC_015710	TGA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
108	NC_015710	GAA	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
109	NC_015710	ATC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731765
110	NC_015710	A	8	8	4988	4995	100 %	0 %	0 %	0 %	338731765
111	NC_015710	AGG	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731765
112	NC_015710	GCA	4	12	5135	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
113	NC_015710	GAA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
114	NC_015710	AT	3	6	5245	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	338731765
115	NC_015710	CAA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731765
116	NC_015710	TGA	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
117	NC_015710	GTTTG	2	10	5407	5416	0 %	60 %	40 %	0 %	338731765
118	NC_015710	GAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
119	NC_015710	AGA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
120	NC_015710	TGA	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
121	NC_015710	CAT	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731765
122	NC_015710	AGA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
123	NC_015710	CAAG	2	8	5581	5588	50 %	0 %	25 %	25 %	338731765
124	NC_015710	AGC	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
125	NC_015710	CGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
126	NC_015710	TCT	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
127	NC_015710	GGT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731765
128	NC_015710	ATA	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
129	NC_015710	AAC	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731765
130	NC_015710	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
131	NC_015710	TAA	2	6	5898	5903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
132	NC_015710	TAA	2	6	5986	5991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
133	NC_015710	CAC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731765
134	NC_015710	TGG	2	6	6046	6051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731765
135	NC_015710	A	7	7	6139	6145	100 %	0 %	0 %	0 %	338731766
136	NC_015710	GAT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731766
137	NC_015710	A	7	7	6202	6208	100 %	0 %	0 %	0 %	338731766
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267	NC_015710	A	7	7	12640	12646	100 %	0 %	0 %	0 %	338731776
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500	NC_015710	A	7	7	26762	26768	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790

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