MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 29827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015594	CAT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342452
2	NC_015594	GCT	2	6	545	550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
3	NC_015594	GCC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342452
4	NC_015594	TTG	2	6	644	649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342452
5	NC_015594	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342452
6	NC_015594	CATCGC	2	12	685	696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334342452
7	NC_015594	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342452
8	NC_015594	GC	3	6	750	755	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
9	NC_015594	AT	3	6	769	774	50 %	50 %	0 %	0 %	334342452
10	NC_015594	TCGC	2	8	806	813	0 %	25 %	25 %	50 %	334342452
11	NC_015594	TCG	2	6	840	845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
12	NC_015594	CGTC	2	8	846	853	0 %	25 %	25 %	50 %	334342452
13	NC_015594	CGCTGG	2	12	867	878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334342452
14	NC_015594	GCT	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
15	NC_015594	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
16	NC_015594	CGA	2	6	990	995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342452
17	NC_015594	CGT	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
18	NC_015594	GGC	2	6	1115	1120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
19	NC_015594	TGC	4	12	1128	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
20	NC_015594	GGT	2	6	1141	1146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342452
21	NC_015594	GATGCT	2	12	1147	1158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334342452
22	NC_015594	CGC	2	6	1167	1172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342452
23	NC_015594	GCTG	2	8	1173	1180	0 %	25 %	50 %	25 %	334342452
24	NC_015594	GC	3	6	1181	1186	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
25	NC_015594	GCCGC	2	10	1191	1200	0 %	0 %	40 %	60 %	334342452
26	NC_015594	GC	3	6	1212	1217	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
27	NC_015594	GATC	2	8	1237	1244	25 %	25 %	25 %	25 %	334342452
28	NC_015594	CGC	2	6	1267	1272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342452
29	NC_015594	GC	3	6	1330	1335	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
30	NC_015594	TGA	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342452
31	NC_015594	CAC	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342452
32	NC_015594	GCG	3	9	1460	1468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
33	NC_015594	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342452
34	NC_015594	GCG	2	6	1528	1533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
35	NC_015594	CGG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
36	NC_015594	CGG	2	6	1560	1565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
37	NC_015594	GCT	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342452
38	NC_015594	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342452
39	NC_015594	TGG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342452
40	NC_015594	GC	3	6	1647	1652	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
41	NC_015594	CGG	2	6	1680	1685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
42	NC_015594	GC	3	6	1705	1710	0 %	0 %	50 %	50 %	334342452
43	NC_015594	GCGG	2	8	1741	1748	0 %	0 %	75 %	25 %	334342452
44	NC_015594	CGC	2	6	1761	1766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342452
45	NC_015594	GCG	2	6	1796	1801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
46	NC_015594	GCG	2	6	1844	1849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342452
47	NC_015594	CGGCG	2	10	1878	1887	0 %	0 %	60 %	40 %	334342452
48	NC_015594	TCG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342453
49	NC_015594	GCG	2	6	2075	2080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342453
50	NC_015594	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342453
51	NC_015594	CACG	2	8	2155	2162	25 %	0 %	25 %	50 %	334342453
52	NC_015594	CA	3	6	2190	2195	50 %	0 %	0 %	50 %	334342453
53	NC_015594	CGC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342453
54	NC_015594	CGG	2	6	2257	2262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342453
55	NC_015594	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342453
56	NC_015594	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342453
57	NC_015594	GGC	2	6	2340	2345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342453
58	NC_015594	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342453
59	NC_015594	CCA	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342453
60	NC_015594	GAGC	2	8	2582	2589	25 %	0 %	50 %	25 %	334342453
61	NC_015594	GC	3	6	2616	2621	0 %	0 %	50 %	50 %	334342453
62	NC_015594	TCC	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342453
63	NC_015594	GCCCG	2	10	2642	2651	0 %	0 %	40 %	60 %	334342453
64	NC_015594	CGTC	2	8	2677	2684	0 %	25 %	25 %	50 %	334342453
65	NC_015594	GGC	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342453
66	NC_015594	CGCC	2	8	2782	2789	0 %	0 %	25 %	75 %	334342453
67	NC_015594	CTC	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342453
68	NC_015594	GGCG	2	8	2852	2859	0 %	0 %	75 %	25 %	334342453
69	NC_015594	ATGC	2	8	2861	2868	25 %	25 %	25 %	25 %	334342453
70	NC_015594	GC	3	6	2878	2883	0 %	0 %	50 %	50 %	334342453
71	NC_015594	ATG	2	6	2889	2894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342453
72	NC_015594	CTT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342453
73	NC_015594	CGC	2	6	3001	3006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342454
74	NC_015594	AAGG	2	8	3036	3043	50 %	0 %	50 %	0 %	334342454
75	NC_015594	CAT	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342454
76	NC_015594	TTC	2	6	3143	3148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342454
77	NC_015594	GGC	2	6	3180	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342454
78	NC_015594	CCA	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342454
79	NC_015594	GCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342454
80	NC_015594	CTGG	2	8	3305	3312	0 %	25 %	50 %	25 %	334342454
81	NC_015594	CTG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342454
82	NC_015594	ACGGT	2	10	3382	3391	20 %	20 %	40 %	20 %	334342454
83	NC_015594	TCG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342454
84	NC_015594	GC	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	334342455
85	NC_015594	ATCGGG	2	12	3485	3496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342455
86	NC_015594	AGA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342455
87	NC_015594	CGG	2	6	3648	3653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342455
88	NC_015594	CCG	2	6	3657	3662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342455
89	NC_015594	CCG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342455
90	NC_015594	ACC	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342455
91	NC_015594	CGG	2	6	3805	3810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342455
92	NC_015594	CATG	2	8	3841	3848	25 %	25 %	25 %	25 %	334342455
93	NC_015594	CGTCG	2	10	3946	3955	0 %	20 %	40 %	40 %	334342455
94	NC_015594	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342455
95	NC_015594	GCC	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342455
96	NC_015594	GGCC	2	8	4145	4152	0 %	0 %	50 %	50 %	334342455
97	NC_015594	C	6	6	4186	4191	0 %	0 %	0 %	100 %	334342455
98	NC_015594	GCGT	2	8	4200	4207	0 %	25 %	50 %	25 %	334342455
99	NC_015594	CCG	2	6	4241	4246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342456
100	NC_015594	GC	3	6	4261	4266	0 %	0 %	50 %	50 %	334342456
101	NC_015594	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342456
102	NC_015594	GCC	3	9	4288	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342456
103	NC_015594	GCC	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342456
104	NC_015594	GCC	2	6	4391	4396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342456
105	NC_015594	GGC	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342456
106	NC_015594	AGATGG	2	12	4487	4498	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	334342456
107	NC_015594	CGG	4	12	4518	4529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342456
108	NC_015594	GC	3	6	4560	4565	0 %	0 %	50 %	50 %	334342456
109	NC_015594	GCG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342456
110	NC_015594	CGA	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342456
111	NC_015594	ACG	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342456
112	NC_015594	GAA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342456
113	NC_015594	GAT	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342456
114	NC_015594	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342456
115	NC_015594	GGCG	2	8	4842	4849	0 %	0 %	75 %	25 %	334342456
116	NC_015594	ACC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342456
117	NC_015594	GAT	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342456
118	NC_015594	TGT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342456
119	NC_015594	CGG	2	6	5012	5017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342456
120	NC_015594	CGG	2	6	5067	5072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342456
121	NC_015594	GC	3	6	5173	5178	0 %	0 %	50 %	50 %	334342457
122	NC_015594	TCC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342457
123	NC_015594	ATT	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342457
124	NC_015594	CGG	2	6	5210	5215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
125	NC_015594	CGCC	2	8	5285	5292	0 %	0 %	25 %	75 %	334342457
126	NC_015594	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342457
127	NC_015594	GCC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342457
128	NC_015594	GC	3	6	5389	5394	0 %	0 %	50 %	50 %	334342457
129	NC_015594	GCG	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
130	NC_015594	CATCG	2	10	5452	5461	20 %	20 %	20 %	40 %	334342457
131	NC_015594	GCG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
132	NC_015594	CTC	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342457
133	NC_015594	GC	3	6	5549	5554	0 %	0 %	50 %	50 %	334342457
134	NC_015594	CGG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
135	NC_015594	CCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342457
136	NC_015594	TCC	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342457
137	NC_015594	CGG	2	6	5711	5716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
138	NC_015594	ACC	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342457
139	NC_015594	GCC	3	9	5829	5837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342457
140	NC_015594	TCC	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342457
141	NC_015594	CGG	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
142	NC_015594	GGC	2	6	5959	5964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342457
143	NC_015594	CTT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342457
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145	NC_015594	CGCT	2	8	6041	6048	0 %	25 %	25 %	50 %	334342457
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149	NC_015594	GAT	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342458
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153	NC_015594	TGGG	2	8	6294	6301	0 %	25 %	75 %	0 %	334342458
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167	NC_015594	CGG	2	6	6751	6756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342458
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180	NC_015594	GAC	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342458
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202	NC_015594	CGG	2	6	7977	7982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342459
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239	NC_015594	GCTG	2	8	9661	9668	0 %	25 %	50 %	25 %	334342461
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245	NC_015594	GGCG	2	8	9836	9843	0 %	0 %	75 %	25 %	334342461
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249	NC_015594	ATCC	2	8	10005	10012	25 %	25 %	0 %	50 %	334342461
250	NC_015594	GC	3	6	10021	10026	0 %	0 %	50 %	50 %	334342461
251	NC_015594	TGC	2	6	10027	10032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342461
252	NC_015594	AGATC	2	10	10061	10070	40 %	20 %	20 %	20 %	334342461
253	NC_015594	TCG	2	6	10102	10107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342461
254	NC_015594	GCGG	2	8	10204	10211	0 %	0 %	75 %	25 %	334342461
255	NC_015594	CGA	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342461
256	NC_015594	GGACG	2	10	10292	10301	20 %	0 %	60 %	20 %	334342461
257	NC_015594	GCCCG	2	10	10304	10313	0 %	0 %	40 %	60 %	334342461
258	NC_015594	GAG	2	6	10374	10379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342461
259	NC_015594	CGG	2	6	10393	10398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342461
260	NC_015594	ACC	2	6	10410	10415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342461
261	NC_015594	CGC	2	6	10490	10495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342461
262	NC_015594	GAT	2	6	10515	10520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342461
263	NC_015594	TGACGG	2	12	10540	10551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342461
264	NC_015594	TGAC	2	8	10556	10563	25 %	25 %	25 %	25 %	334342461
265	NC_015594	TCGG	2	8	10603	10610	0 %	25 %	50 %	25 %	334342462
266	NC_015594	G	6	6	10609	10614	0 %	0 %	100 %	0 %	334342462
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393	NC_015594	TCGC	2	8	15439	15446	0 %	25 %	25 %	50 %	334342466
394	NC_015594	GTGCCG	2	12	15448	15459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334342466
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499	NC_015594	CGG	2	6	20529	20534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
500	NC_015594	ATCC	2	8	20545	20552	25 %	25 %	0 %	50 %	334342469

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