MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 29827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015594	CG	3	6	136207	136212	0 %	0 %	50 %	50 %	334342556
3002	NC_015594	GGC	2	6	136317	136322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3003	NC_015594	GGC	2	6	136384	136389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3004	NC_015594	CAG	2	6	136424	136429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3005	NC_015594	TTC	2	6	136472	136477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342556
3006	NC_015594	TGC	2	6	136522	136527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3007	NC_015594	TGC	2	6	136551	136556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3008	NC_015594	CAA	2	6	136606	136611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342556
3009	NC_015594	CGG	2	6	136648	136653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3010	NC_015594	GGC	2	6	136810	136815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3011	NC_015594	AGGC	2	8	136992	136999	25 %	0 %	50 %	25 %	334342556
3012	NC_015594	GGC	2	6	137005	137010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3013	NC_015594	GCG	2	6	137162	137167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3014	NC_015594	TCG	2	6	137217	137222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3015	NC_015594	AAGC	2	8	137255	137262	50 %	0 %	25 %	25 %	334342556
3016	NC_015594	TTGA	2	8	137345	137352	25 %	50 %	25 %	0 %	334342556
3017	NC_015594	TCA	2	6	137400	137405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342556
3018	NC_015594	CCAG	2	8	137416	137423	25 %	0 %	25 %	50 %	334342556
3019	NC_015594	AG	3	6	137422	137427	50 %	0 %	50 %	0 %	334342556
3020	NC_015594	AG	3	6	137485	137490	50 %	0 %	50 %	0 %	334342556
3021	NC_015594	GGA	2	6	137528	137533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342556
3022	NC_015594	GCT	2	6	137579	137584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3023	NC_015594	AAGA	2	8	137673	137680	75 %	0 %	25 %	0 %	334342556
3024	NC_015594	GAA	2	6	137710	137715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342556
3025	NC_015594	TTG	2	6	137799	137804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342556
3026	NC_015594	TA	3	6	137845	137850	50 %	50 %	0 %	0 %	334342556
3027	NC_015594	GCAC	2	8	137915	137922	25 %	0 %	25 %	50 %	334342556
3028	NC_015594	AGG	2	6	137943	137948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342556
3029	NC_015594	GTC	2	6	137981	137986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3030	NC_015594	AAG	2	6	137987	137992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342556
3031	NC_015594	GGCGAT	2	12	138013	138024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342556
3032	NC_015594	AAC	2	6	138084	138089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342556
3033	NC_015594	GCG	2	6	138100	138105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3034	NC_015594	GCAG	2	8	138181	138188	25 %	0 %	50 %	25 %	334342556
3035	NC_015594	GCGA	2	8	138203	138210	25 %	0 %	50 %	25 %	334342556
3036	NC_015594	GATC	3	12	138291	138302	25 %	25 %	25 %	25 %	334342556
3037	NC_015594	CTC	2	6	138320	138325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342556
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3039	NC_015594	CT	4	8	138378	138385	0 %	50 %	0 %	50 %	334342556
3040	NC_015594	CGG	2	6	138576	138581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3041	NC_015594	CATC	2	8	138600	138607	25 %	25 %	0 %	50 %	334342556
3042	NC_015594	GCA	2	6	138661	138666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342556
3043	NC_015594	T	6	6	138686	138691	0 %	100 %	0 %	0 %	334342556
3044	NC_015594	GGA	2	6	138733	138738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342556
3045	NC_015594	GAT	3	9	138803	138811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342556
3046	NC_015594	ATT	2	6	138827	138832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342556
3047	NC_015594	CG	3	6	138910	138915	0 %	0 %	50 %	50 %	334342556
3048	NC_015594	CGG	2	6	138918	138923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342556
3049	NC_015594	GA	3	6	139035	139040	50 %	0 %	50 %	0 %	334342557
3050	NC_015594	TGC	2	6	139066	139071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3051	NC_015594	CG	3	6	139098	139103	0 %	0 %	50 %	50 %	334342557
3052	NC_015594	CGCGAT	2	12	139145	139156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3053	NC_015594	TAG	2	6	139162	139167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342557
3054	NC_015594	CAT	2	6	139197	139202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342557
3055	NC_015594	GCG	2	6	139255	139260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342557
3056	NC_015594	GGTGAC	2	12	139264	139275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334342557
3057	NC_015594	TCG	2	6	139286	139291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3058	NC_015594	CTG	2	6	139297	139302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3059	NC_015594	TTG	2	6	139305	139310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342557
3060	NC_015594	CAG	2	6	139350	139355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3061	NC_015594	GCT	2	6	139383	139388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3062	NC_015594	GCC	2	6	139396	139401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342557
3063	NC_015594	CGC	2	6	139449	139454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342557
3064	NC_015594	GCT	2	6	139464	139469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342557
3065	NC_015594	CG	3	6	139486	139491	0 %	0 %	50 %	50 %	334342557
3066	NC_015594	TCT	2	6	139499	139504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342557
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3069	NC_015594	GAG	2	6	140493	140498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342558
3070	NC_015594	TCT	2	6	140675	140680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342558
3071	NC_015594	G	6	6	140698	140703	0 %	0 %	100 %	0 %	334342558
3072	NC_015594	AGG	2	6	140821	140826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342558
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3084	NC_015594	CAG	2	6	141336	141341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342559
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3089	NC_015594	GCT	2	6	141475	141480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342559
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3091	NC_015594	GTC	2	6	141544	141549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342559
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3093	NC_015594	CTC	2	6	141721	141726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342559
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3098	NC_015594	CGCA	2	8	141944	141951	25 %	0 %	25 %	50 %	334342560
3099	NC_015594	CGGA	2	8	142092	142099	25 %	0 %	50 %	25 %	334342560
3100	NC_015594	TGC	2	6	142102	142107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342560
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3102	NC_015594	CGA	2	6	142265	142270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342560
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3104	NC_015594	TCT	2	6	142310	142315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342560
3105	NC_015594	GC	3	6	142341	142346	0 %	0 %	50 %	50 %	334342560
3106	NC_015594	GGC	2	6	142355	142360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342560
3107	NC_015594	ATGG	2	8	142368	142375	25 %	25 %	50 %	0 %	334342560
3108	NC_015594	CAA	2	6	142391	142396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342560
3109	NC_015594	CCGA	2	8	142434	142441	25 %	0 %	25 %	50 %	334342560
3110	NC_015594	GTC	2	6	142452	142457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342560
3111	NC_015594	TCA	2	6	142551	142556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342561
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3119	NC_015594	TTG	2	6	142805	142810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334342561
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3121	NC_015594	CG	3	6	142890	142895	0 %	0 %	50 %	50 %	334342561
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3242	NC_015594	GC	3	6	149441	149446	0 %	0 %	50 %	50 %	334342568
3243	NC_015594	CGG	2	6	149464	149469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342568
3244	NC_015594	ACC	2	6	149523	149528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342568
3245	NC_015594	CGA	2	6	149578	149583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342568
3246	NC_015594	GGCGC	2	10	149629	149638	0 %	0 %	60 %	40 %	334342568
3247	NC_015594	CCGG	2	8	149642	149649	0 %	0 %	50 %	50 %	334342568
3248	NC_015594	GTG	2	6	149661	149666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342568
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3250	NC_015594	GCC	2	6	149750	149755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342568
3251	NC_015594	GCCCTC	2	12	149759	149770	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334342568
3252	NC_015594	TGG	2	6	149830	149835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342568
3253	NC_015594	GC	3	6	149863	149868	0 %	0 %	50 %	50 %	334342568
3254	NC_015594	GCC	2	6	149872	149877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342568
3255	NC_015594	ACGCCC	2	12	149907	149918	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	334342568
3256	NC_015594	ATG	2	6	149919	149924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342568
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3261	NC_015594	CGA	2	6	150160	150165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342568
3262	NC_015594	GAT	2	6	150224	150229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342568
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3266	NC_015594	GCAA	2	8	150664	150671	50 %	0 %	25 %	25 %	334342569
3267	NC_015594	CGG	2	6	150694	150699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342569
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3270	NC_015594	GATCG	2	10	150749	150758	20 %	20 %	40 %	20 %	334342569
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3272	NC_015594	GCC	2	6	150810	150815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342569
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3274	NC_015594	CAT	2	6	150933	150938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342569
3275	NC_015594	CAT	2	6	150962	150967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342569
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3279	NC_015594	GGA	2	6	151028	151033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342569
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3282	NC_015594	GC	3	6	151074	151079	0 %	0 %	50 %	50 %	334342569
3283	NC_015594	G	6	6	151084	151089	0 %	0 %	100 %	0 %	334342569
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3315	NC_015594	CAG	2	6	152732	152737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342571
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3361	NC_015594	ATGC	2	8	154680	154687	25 %	25 %	25 %	25 %	334342572
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3363	NC_015594	GCG	2	6	154722	154727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342572
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3483	NC_015594	CGT	2	6	163171	163176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342578
3484	NC_015594	GAT	2	6	163199	163204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342578
3485	NC_015594	CAG	2	6	163229	163234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342578
3486	NC_015594	CTT	2	6	163273	163278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342578
3487	NC_015594	CG	3	6	163324	163329	0 %	0 %	50 %	50 %	334342578
3488	NC_015594	GCT	2	6	163426	163431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342578
3489	NC_015594	TCCA	2	8	163500	163507	25 %	25 %	0 %	50 %	334342578
3490	NC_015594	AGGC	2	8	163925	163932	25 %	0 %	50 %	25 %	334342579
3491	NC_015594	ATG	2	6	163942	163947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342579
3492	NC_015594	TCA	2	6	163997	164002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342579
3493	NC_015594	GGC	4	12	164004	164015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342579
3494	NC_015594	CCA	2	6	164064	164069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342579
3495	NC_015594	GGCT	2	8	164098	164105	0 %	25 %	50 %	25 %	334342579
3496	NC_015594	CCT	2	6	164165	164170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342579
3497	NC_015594	TCAC	2	8	164227	164234	25 %	25 %	0 %	50 %	334342579
3498	NC_015594	CAT	2	6	164235	164240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342579
3499	NC_015594	TCT	2	6	164267	164272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342579
3500	NC_015594	GAA	2	6	164305	164310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342579

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