MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 29827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015594	CCG	2	6	541978	541983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342885
11002	NC_015594	GTG	2	6	541996	542001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342885
11003	NC_015594	AGG	3	9	542003	542011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342885
11004	NC_015594	CGA	2	6	542052	542057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342885
11005	NC_015594	GGTC	2	8	542099	542106	0 %	25 %	50 %	25 %	334342885
11006	NC_015594	TGC	2	6	542139	542144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342885
11007	NC_015594	AT	3	6	542184	542189	50 %	50 %	0 %	0 %	334342885
11008	NC_015594	CGG	2	6	542208	542213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342885
11009	NC_015594	TTCC	2	8	542286	542293	0 %	50 %	0 %	50 %	334342885
11010	NC_015594	GGC	3	9	542298	542306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342885
11011	NC_015594	ACGCTG	2	12	542426	542437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11012	NC_015594	GAT	2	6	542473	542478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342886
11013	NC_015594	GAT	2	6	542485	542490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342886
11014	NC_015594	GAC	2	6	542516	542521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11015	NC_015594	GTC	3	9	542534	542542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11016	NC_015594	GC	3	6	542554	542559	0 %	0 %	50 %	50 %	334342886
11017	NC_015594	G	6	6	542584	542589	0 %	0 %	100 %	0 %	334342886
11018	NC_015594	GGA	2	6	542617	542622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342886
11019	NC_015594	GC	3	6	542632	542637	0 %	0 %	50 %	50 %	334342886
11020	NC_015594	GC	3	6	542667	542672	0 %	0 %	50 %	50 %	334342886
11021	NC_015594	GCG	2	6	542679	542684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342886
11022	NC_015594	CGC	2	6	542728	542733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342886
11023	NC_015594	CGA	2	6	542763	542768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11024	NC_015594	GCGA	2	8	542795	542802	25 %	0 %	50 %	25 %	334342886
11025	NC_015594	CGCC	2	8	542827	542834	0 %	0 %	25 %	75 %	334342886
11026	NC_015594	TCC	2	6	542858	542863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342886
11027	NC_015594	TTC	2	6	542864	542869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342886
11028	NC_015594	TGG	2	6	542880	542885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342886
11029	NC_015594	CGG	3	9	542931	542939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342886
11030	NC_015594	AGG	2	6	542946	542951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342886
11031	NC_015594	TGC	2	6	542970	542975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11032	NC_015594	TGC	2	6	542988	542993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342886
11033	NC_015594	CCG	2	6	542994	542999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342886
11034	NC_015594	GAT	2	6	543064	543069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342886
11035	NC_015594	GCGGG	2	10	543075	543084	0 %	0 %	80 %	20 %	334342886
11036	NC_015594	GACC	2	8	543088	543095	25 %	0 %	25 %	50 %	334342886
11037	NC_015594	GCA	2	6	543144	543149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342886
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11039	NC_015594	CGG	2	6	543216	543221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342886
11040	NC_015594	ATT	2	6	543231	543236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334342886
11041	NC_015594	TGG	2	6	543242	543247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342886
11042	NC_015594	GCGAT	2	10	543271	543280	20 %	20 %	40 %	20 %	334342887
11043	NC_015594	GGCG	2	8	543326	543333	0 %	0 %	75 %	25 %	334342887
11044	NC_015594	CGG	3	9	543424	543432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
11045	NC_015594	CCA	2	6	543436	543441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342887
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11047	NC_015594	GCG	2	6	543495	543500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
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11049	NC_015594	GCG	2	6	543564	543569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
11050	NC_015594	GGT	2	6	543587	543592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342887
11051	NC_015594	ATCGAC	2	12	543624	543635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334342887
11052	NC_015594	CTG	2	6	543636	543641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342887
11053	NC_015594	TGC	2	6	543655	543660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342887
11054	NC_015594	GC	3	6	543659	543664	0 %	0 %	50 %	50 %	334342887
11055	NC_015594	ATC	2	6	543699	543704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342887
11056	NC_015594	CGG	2	6	543712	543717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
11057	NC_015594	GAT	2	6	543734	543739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342887
11058	NC_015594	GGC	2	6	543758	543763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
11059	NC_015594	CAA	2	6	543776	543781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342887
11060	NC_015594	CGA	2	6	543890	543895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342887
11061	NC_015594	GCG	2	6	543903	543908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342887
11062	NC_015594	AT	3	6	543995	544000	50 %	50 %	0 %	0 %	334342887
11063	NC_015594	ATC	2	6	544011	544016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342887
11064	NC_015594	G	6	6	544026	544031	0 %	0 %	100 %	0 %	334342887
11065	NC_015594	CCG	2	6	544051	544056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342887
11066	NC_015594	CGGGG	2	10	544072	544081	0 %	0 %	80 %	20 %	334342887
11067	NC_015594	CGG	3	9	544302	544310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342888
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11070	NC_015594	CGC	2	6	544441	544446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342888
11071	NC_015594	GC	3	6	544463	544468	0 %	0 %	50 %	50 %	334342888
11072	NC_015594	TCC	2	6	544481	544486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342888
11073	NC_015594	GCC	2	6	544654	544659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342888
11074	NC_015594	TTC	3	9	544661	544669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342888
11075	NC_015594	TGC	2	6	544719	544724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11076	NC_015594	CTG	2	6	544810	544815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11077	NC_015594	GAT	2	6	544834	544839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342888
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11079	NC_015594	ATG	2	6	544868	544873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342888
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11082	NC_015594	CTTC	2	8	544959	544966	0 %	50 %	0 %	50 %	334342888
11083	NC_015594	CGC	2	6	544977	544982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342888
11084	NC_015594	CAC	2	6	544984	544989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342888
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11086	NC_015594	GGCG	2	8	545011	545018	0 %	0 %	75 %	25 %	334342888
11087	NC_015594	AGA	2	6	545019	545024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342888
11088	NC_015594	ACC	2	6	545036	545041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342888
11089	NC_015594	TGG	2	6	545055	545060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342888
11090	NC_015594	CGG	2	6	545061	545066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342888
11091	NC_015594	AGGA	2	8	545084	545091	50 %	0 %	50 %	0 %	334342888
11092	NC_015594	CTT	2	6	545152	545157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342888
11093	NC_015594	GGC	2	6	545271	545276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342888
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11099	NC_015594	ATA	2	6	545503	545508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334342888
11100	NC_015594	CTG	2	6	545567	545572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11101	NC_015594	CGG	2	6	545601	545606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342888
11102	NC_015594	GC	3	6	545615	545620	0 %	0 %	50 %	50 %	334342888
11103	NC_015594	TCG	2	6	545628	545633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11104	NC_015594	CG	4	8	545653	545660	0 %	0 %	50 %	50 %	334342888
11105	NC_015594	TTC	3	9	545663	545671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342888
11106	NC_015594	TCG	2	6	545678	545683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11107	NC_015594	CGCGCA	2	12	545730	545741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334342888
11108	NC_015594	CGG	2	6	545768	545773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342888
11109	NC_015594	TCC	2	6	545789	545794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334342888
11110	NC_015594	GCC	2	6	545866	545871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342888
11111	NC_015594	TGA	2	6	545874	545879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342888
11112	NC_015594	CGA	2	6	545901	545906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342888
11113	NC_015594	CCCG	2	8	545926	545933	0 %	0 %	25 %	75 %	334342888
11114	NC_015594	GCGAT	2	10	545990	545999	20 %	20 %	40 %	20 %	334342888
11115	NC_015594	GCC	3	9	546025	546033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342888
11116	NC_015594	ACC	2	6	546059	546064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342888
11117	NC_015594	TGC	2	6	546069	546074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342888
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11119	NC_015594	GCGG	2	8	546120	546127	0 %	0 %	75 %	25 %	334342888
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11474	NC_015594	CAA	2	6	560467	560472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342895
11475	NC_015594	GCC	2	6	560531	560536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342895
11476	NC_015594	GAA	2	6	560566	560571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342895
11477	NC_015594	GCC	2	6	560594	560599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342895
11478	NC_015594	GCG	2	6	560631	560636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342895
11479	NC_015594	CCA	2	6	560734	560739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342895
11480	NC_015594	CAC	2	6	560833	560838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342895
11481	NC_015594	CGAC	2	8	560919	560926	25 %	0 %	25 %	50 %	334342895
11482	NC_015594	CAT	2	6	560953	560958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342895
11483	NC_015594	CGA	2	6	560973	560978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342895
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11485	NC_015594	AGC	2	6	561024	561029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342895
11486	NC_015594	CTG	2	6	561215	561220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
11487	NC_015594	GCG	2	6	561224	561229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342896
11488	NC_015594	GCT	2	6	561241	561246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
11489	NC_015594	GGC	2	6	561262	561267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342896
11490	NC_015594	CAT	2	6	561298	561303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342896
11491	NC_015594	TGC	2	6	561333	561338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
11492	NC_015594	GAAGGT	2	12	561355	561366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	334342896
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11498	NC_015594	G	6	6	561482	561487	0 %	0 %	100 %	0 %	334342896
11499	NC_015594	TGC	2	6	561513	561518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342896
11500	NC_015594	GGAAG	2	10	561553	561562	40 %	0 %	60 %	0 %	334342896

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