MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 29827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015594	CACGG	2	10	20561	20570	20 %	0 %	40 %	40 %	334342469
502	NC_015594	CGG	2	6	20595	20600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
503	NC_015594	GGCG	2	8	20629	20636	0 %	0 %	75 %	25 %	334342469
504	NC_015594	CGT	3	9	20638	20646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342469
505	NC_015594	GGGC	2	8	20668	20675	0 %	0 %	75 %	25 %	334342469
506	NC_015594	CCA	2	6	20700	20705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342469
507	NC_015594	GC	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	334342469
508	NC_015594	GGC	2	6	20768	20773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
509	NC_015594	GCG	2	6	20810	20815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
510	NC_015594	CGATC	2	10	20848	20857	20 %	20 %	20 %	40 %	334342469
511	NC_015594	TCA	2	6	20880	20885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342469
512	NC_015594	CTGGAC	2	12	20888	20899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342469
513	NC_015594	GC	3	6	20995	21000	0 %	0 %	50 %	50 %	334342469
514	NC_015594	GCG	2	6	21005	21010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
515	NC_015594	GAC	2	6	21013	21018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342469
516	NC_015594	GCG	2	6	21023	21028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342469
517	NC_015594	CGCGG	2	10	21029	21038	0 %	0 %	60 %	40 %	334342469
518	NC_015594	AAC	2	6	21103	21108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342470
519	NC_015594	ATG	2	6	21177	21182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342470
520	NC_015594	TGCAG	2	10	21301	21310	20 %	20 %	40 %	20 %	334342471
521	NC_015594	GCC	2	6	21343	21348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342471
522	NC_015594	CCGG	2	8	21406	21413	0 %	0 %	50 %	50 %	334342471
523	NC_015594	CCG	2	6	21435	21440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342471
524	NC_015594	CG	4	8	21546	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	334342471
525	NC_015594	CAG	2	6	21582	21587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342471
526	NC_015594	TGA	2	6	21653	21658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342471
527	NC_015594	CAG	2	6	21675	21680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342471
528	NC_015594	TCG	2	6	21685	21690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342471
529	NC_015594	GA	3	6	21691	21696	50 %	0 %	50 %	0 %	334342471
530	NC_015594	CCG	2	6	21813	21818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
531	NC_015594	CAA	2	6	21850	21855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334342472
532	NC_015594	GCT	3	9	21874	21882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342472
533	NC_015594	GGC	2	6	21883	21888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342472
534	NC_015594	ACG	2	6	21963	21968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342472
535	NC_015594	GGA	2	6	22036	22041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342472
536	NC_015594	GGC	2	6	22105	22110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342472
537	NC_015594	GGCCAG	2	12	22135	22146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334342472
538	NC_015594	CGC	2	6	22147	22152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
539	NC_015594	GCC	2	6	22160	22165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
540	NC_015594	GC	3	6	22180	22185	0 %	0 %	50 %	50 %	334342472
541	NC_015594	CGC	2	6	22216	22221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
542	NC_015594	CAACGC	2	12	22222	22233	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334342472
543	NC_015594	CGC	2	6	22240	22245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
544	NC_015594	GCC	2	6	22274	22279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
545	NC_015594	GCG	2	6	22281	22286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342472
546	NC_015594	GCC	3	9	22346	22354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
547	NC_015594	GC	3	6	22374	22379	0 %	0 %	50 %	50 %	334342472
548	NC_015594	CAGG	2	8	22411	22418	25 %	0 %	50 %	25 %	334342472
549	NC_015594	CGCAGG	2	12	22419	22430	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334342472
550	NC_015594	GCC	2	6	22436	22441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
551	NC_015594	CCG	2	6	22455	22460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
552	NC_015594	GC	3	6	22489	22494	0 %	0 %	50 %	50 %	334342472
553	NC_015594	GACG	2	8	22502	22509	25 %	0 %	50 %	25 %	334342472
554	NC_015594	GGC	2	6	22549	22554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342472
555	NC_015594	TGA	2	6	22563	22568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342472
556	NC_015594	GC	3	6	22722	22727	0 %	0 %	50 %	50 %	334342472
557	NC_015594	GCC	2	6	22741	22746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
558	NC_015594	CGC	3	9	22888	22896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
559	NC_015594	CCG	2	6	22903	22908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342472
560	NC_015594	CG	3	6	22927	22932	0 %	0 %	50 %	50 %	334342472
561	NC_015594	GCC	3	9	22948	22956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
562	NC_015594	C	6	6	22969	22974	0 %	0 %	0 %	100 %	334342473
563	NC_015594	CGC	3	9	22992	23000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
564	NC_015594	TGGC	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	334342473
565	NC_015594	GGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
566	NC_015594	GAT	2	6	23034	23039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342473
567	NC_015594	CCA	2	6	23078	23083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334342473
568	NC_015594	TGG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342473
569	NC_015594	ATC	2	6	23152	23157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342473
570	NC_015594	GGC	2	6	23169	23174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
571	NC_015594	CTGG	2	8	23175	23182	0 %	25 %	50 %	25 %	334342473
572	NC_015594	GCT	2	6	23187	23192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
573	NC_015594	GCC	3	9	23215	23223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
574	NC_015594	CGA	2	6	23262	23267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342473
575	NC_015594	GAC	2	6	23271	23276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342473
576	NC_015594	ATC	2	6	23281	23286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342473
577	NC_015594	CGG	2	6	23310	23315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
578	NC_015594	ATC	2	6	23341	23346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342473
579	NC_015594	CGG	2	6	23436	23441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
580	NC_015594	CTT	2	6	23475	23480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334342473
581	NC_015594	GCT	3	9	23514	23522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
582	NC_015594	CTGG	2	8	23574	23581	0 %	25 %	50 %	25 %	334342473
583	NC_015594	GCTGGG	2	12	23598	23609	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	334342473
584	NC_015594	GGA	2	6	23628	23633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342473
585	NC_015594	ATC	2	6	23683	23688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342473
586	NC_015594	CTG	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
587	NC_015594	ATG	2	6	23812	23817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342473
588	NC_015594	GCC	2	6	23854	23859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
589	NC_015594	ACG	2	6	23870	23875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342473
590	NC_015594	CTG	2	6	23899	23904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
591	NC_015594	CTGATG	2	12	23920	23931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334342473
592	NC_015594	CGC	2	6	23939	23944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
593	NC_015594	TCGCG	2	10	23967	23976	0 %	20 %	40 %	40 %	334342473
594	NC_015594	TGA	2	6	23990	23995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334342473
595	NC_015594	CTG	2	6	24070	24075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
596	NC_015594	GGCACG	2	12	24079	24090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334342473
597	NC_015594	CTTCCT	2	12	24099	24110	0 %	50 %	0 %	50 %	334342473
598	NC_015594	GGC	2	6	24117	24122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
599	NC_015594	GGA	2	6	24141	24146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334342473
600	NC_015594	CGC	2	6	24156	24161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
601	NC_015594	CGCTGG	2	12	24197	24208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334342473
602	NC_015594	GCTG	2	8	24239	24246	0 %	25 %	50 %	25 %	334342473
603	NC_015594	GAA	2	6	24262	24267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334342473
604	NC_015594	CGG	2	6	24306	24311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
605	NC_015594	GGC	2	6	24328	24333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342473
606	NC_015594	GCC	2	6	24340	24345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342473
607	NC_015594	CAT	2	6	24426	24431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334342473
608	NC_015594	TGC	2	6	24437	24442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342473
609	NC_015594	GCC	2	6	24548	24553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
610	NC_015594	GC	3	6	24609	24614	0 %	0 %	50 %	50 %	334342474
611	NC_015594	CG	3	6	24619	24624	0 %	0 %	50 %	50 %	334342474
612	NC_015594	CGC	4	12	24655	24666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
613	NC_015594	TGG	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334342474
614	NC_015594	CG	3	6	24713	24718	0 %	0 %	50 %	50 %	334342474
615	NC_015594	GCC	2	6	24722	24727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
616	NC_015594	GGC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342474
617	NC_015594	AGGC	2	8	24761	24768	25 %	0 %	50 %	25 %	334342474
618	NC_015594	CGG	3	9	24889	24897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342474
619	NC_015594	GCG	2	6	24967	24972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342474
620	NC_015594	G	6	6	24972	24977	0 %	0 %	100 %	0 %	334342474
621	NC_015594	GGC	2	6	24982	24987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342474
622	NC_015594	CCG	2	6	25044	25049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
623	NC_015594	GCA	2	6	25084	25089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342474
624	NC_015594	CGCC	2	8	25117	25124	0 %	0 %	25 %	75 %	334342474
625	NC_015594	TGC	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342474
626	NC_015594	CGC	2	6	25222	25227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
627	NC_015594	CGC	2	6	25240	25245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342474
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754	NC_015594	CGG	2	6	31076	31081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334342479
755	NC_015594	GC	3	6	31106	31111	0 %	0 %	50 %	50 %	334342479
756	NC_015594	CATGGC	2	12	31147	31158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334342479
757	NC_015594	GCA	2	6	31170	31175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334342479
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759	NC_015594	CCG	2	6	31304	31309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334342479
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763	NC_015594	CG	3	6	31450	31455	0 %	0 %	50 %	50 %	334342479
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769	NC_015594	CTG	2	6	31675	31680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334342479
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783	NC_015594	GC	3	6	32177	32182	0 %	0 %	50 %	50 %	334342480
784	NC_015594	GCCA	2	8	32210	32217	25 %	0 %	25 %	50 %	334342480
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