MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Serratia plymuthica AS9 chromosome

Total Repeats: 104898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015567	CCG	2	6	116	121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929849
2	NC_015567	GCA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929849
3	NC_015567	ACA	2	6	224	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929849
4	NC_015567	CTG	2	6	304	309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929849
5	NC_015567	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929849
6	NC_015567	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929849
7	NC_015567	ATC	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929849
8	NC_015567	GC	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	333929849
9	NC_015567	GGT	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929849
10	NC_015567	GC	3	6	429	434	0 %	0 %	50 %	50 %	333929849
11	NC_015567	TTG	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929849
12	NC_015567	CCAA	2	8	545	552	50 %	0 %	0 %	50 %	333929849
13	NC_015567	GC	4	8	556	563	0 %	0 %	50 %	50 %	333929849
14	NC_015567	GGC	2	6	564	569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929849
15	NC_015567	GTT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929849
16	NC_015567	CAT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929849
17	NC_015567	GC	3	6	679	684	0 %	0 %	50 %	50 %	333929849
18	NC_015567	AAC	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929849
19	NC_015567	GAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929849
20	NC_015567	TAC	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929849
21	NC_015567	T	6	6	823	828	0 %	100 %	0 %	0 %	333929849
22	NC_015567	CAA	2	6	831	836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929849
23	NC_015567	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929849
24	NC_015567	CAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929849
25	NC_015567	GCC	2	6	993	998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929849
26	NC_015567	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929849
27	NC_015567	CGA	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929849
28	NC_015567	CGTG	2	8	1104	1111	0 %	25 %	50 %	25 %	333929849
29	NC_015567	CTG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929849
30	NC_015567	ATA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333929849
31	NC_015567	TAAAAT	2	12	1269	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333929849
32	NC_015567	GCG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929849
33	NC_015567	GCCC	2	8	1318	1325	0 %	0 %	25 %	75 %	333929849
34	NC_015567	GATGGC	2	12	1332	1343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333929849
35	NC_015567	ACCA	2	8	1360	1367	50 %	0 %	0 %	50 %	333929849
36	NC_015567	TGG	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929849
37	NC_015567	AGC	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929849
38	NC_015567	AGA	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929849
39	NC_015567	AGC	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929850
40	NC_015567	GCC	2	6	1584	1589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929850
41	NC_015567	TGC	3	9	1614	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929850
42	NC_015567	CTGC	2	8	1636	1643	0 %	25 %	25 %	50 %	333929850
43	NC_015567	TGGAGA	2	12	1662	1673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333929850
44	NC_015567	TGG	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929850
45	NC_015567	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	333929850
46	NC_015567	CG	3	6	1729	1734	0 %	0 %	50 %	50 %	333929850
47	NC_015567	CGG	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929850
48	NC_015567	GAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929850
49	NC_015567	CTA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929850
50	NC_015567	GAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929850
51	NC_015567	CGAC	2	8	2028	2035	25 %	0 %	25 %	50 %	333929850
52	NC_015567	CAG	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929850
53	NC_015567	CTG	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929850
54	NC_015567	CGC	2	6	2151	2156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929850
55	NC_015567	GCA	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929850
56	NC_015567	CGC	2	6	2249	2254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929850
57	NC_015567	GAA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929850
58	NC_015567	CGAA	2	8	2337	2344	50 %	0 %	25 %	25 %	333929850
59	NC_015567	CAA	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929850
60	NC_015567	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929850
61	NC_015567	ACG	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929850
62	NC_015567	CTG	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929850
63	NC_015567	GGC	3	9	2581	2589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929850
64	NC_015567	CGT	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929850
65	NC_015567	GCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929851
66	NC_015567	GCG	2	6	2818	2823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929851
67	NC_015567	GC	3	6	2919	2924	0 %	0 %	50 %	50 %	333929851
68	NC_015567	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929851
69	NC_015567	GC	3	6	3168	3173	0 %	0 %	50 %	50 %	333929851
70	NC_015567	GTT	2	6	3188	3193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929851
71	NC_015567	T	6	6	3210	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	333929851
72	NC_015567	AGC	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929851
73	NC_015567	GC	3	6	3392	3397	0 %	0 %	50 %	50 %	333929851
74	NC_015567	AG	3	6	3450	3455	50 %	0 %	50 %	0 %	333929851
75	NC_015567	GCT	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929851
76	NC_015567	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333929851
77	NC_015567	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	333929851
78	NC_015567	GCT	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929851
79	NC_015567	GCGG	2	8	3650	3657	0 %	0 %	75 %	25 %	333929851
80	NC_015567	TGAT	2	8	3671	3678	25 %	50 %	25 %	0 %	333929851
81	NC_015567	CCCAGG	2	12	3740	3751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333929851
82	NC_015567	CTC	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333929852
83	NC_015567	GAT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929852
84	NC_015567	CAC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929852
85	NC_015567	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
86	NC_015567	GGT	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929852
87	NC_015567	GCG	2	6	4144	4149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
88	NC_015567	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929852
89	NC_015567	TGC	2	6	4166	4171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
90	NC_015567	CGG	2	6	4176	4181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
91	NC_015567	GAC	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
92	NC_015567	CGG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
93	NC_015567	GTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929852
94	NC_015567	AACTGG	2	12	4262	4273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333929852
95	NC_015567	CAC	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929852
96	NC_015567	CAA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929852
97	NC_015567	AGA	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929852
98	NC_015567	GGC	2	6	4534	4539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
99	NC_015567	TTG	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929852
100	NC_015567	AACAAA	2	12	4564	4575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333929852
101	NC_015567	ATCC	2	8	4582	4589	25 %	25 %	0 %	50 %	333929852
102	NC_015567	GAC	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
103	NC_015567	ACG	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
104	NC_015567	CAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929852
105	NC_015567	AAG	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929852
106	NC_015567	GAT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929852
107	NC_015567	TTCTC	2	10	4870	4879	0 %	60 %	0 %	40 %	333929852
108	NC_015567	TTC	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929852
109	NC_015567	TGA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929852
110	NC_015567	TCG	3	9	4985	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
111	NC_015567	ATC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929852
112	NC_015567	GCG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
113	NC_015567	GCG	2	6	5026	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
114	NC_015567	CGT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
115	NC_015567	GGCC	2	8	5076	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	333929852
116	NC_015567	TGG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929852
117	NC_015567	GCGG	2	8	5158	5165	0 %	0 %	75 %	25 %	333929852
118	NC_015567	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	333929852
119	NC_015567	CAT	4	12	5352	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929852
120	NC_015567	GCT	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
121	NC_015567	CTT	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929852
122	NC_015567	GCC	2	6	5469	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929852
123	NC_015567	A	6	6	5488	5493	100 %	0 %	0 %	0 %	333929852
124	NC_015567	GC	3	6	5588	5593	0 %	0 %	50 %	50 %	333929852
125	NC_015567	TGG	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929852
126	NC_015567	CGC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929852
127	NC_015567	CG	4	8	5681	5688	0 %	0 %	50 %	50 %	333929852
128	NC_015567	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
129	NC_015567	AAC	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929852
130	NC_015567	TGAA	2	8	5720	5727	50 %	25 %	25 %	0 %	333929852
131	NC_015567	CTG	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
132	NC_015567	AGC	2	6	5798	5803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
133	NC_015567	GCA	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
134	NC_015567	TGC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
135	NC_015567	TTC	2	6	5917	5922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929852
136	NC_015567	CGG	2	6	5925	5930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929852
137	NC_015567	CTGC	2	8	5946	5953	0 %	25 %	25 %	50 %	333929852
138	NC_015567	AGC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929852
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141	NC_015567	TGC	2	6	6161	6166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929852
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149	NC_015567	GC	3	6	6713	6718	0 %	0 %	50 %	50 %	333929853
150	NC_015567	CCAT	2	8	6792	6799	25 %	25 %	0 %	50 %	333929853
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152	NC_015567	TGA	3	9	6876	6884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929853
153	NC_015567	TGA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929853
154	NC_015567	GCT	2	6	6898	6903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929853
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159	NC_015567	TGT	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929854
160	NC_015567	GCT	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929854
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166	NC_015567	GCT	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929854
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172	NC_015567	CGG	2	6	8007	8012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929854
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259	NC_015567	TCT	2	6	12870	12875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929860
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261	NC_015567	GTG	2	6	12941	12946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929860
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382	NC_015567	CGGC	2	8	18818	18825	0 %	0 %	50 %	50 %	333929865
383	NC_015567	TTC	2	6	18889	18894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929865
384	NC_015567	GCG	2	6	18955	18960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929865
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499	NC_015567	CGG	2	6	24111	24116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929870
500	NC_015567	GCCTT	2	10	24123	24132	0 %	40 %	20 %	40 %	333929870

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