MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Serratia sp. AS12 chromosome

Total Repeats: 104911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015566	CCG	2	6	116	121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924896
2	NC_015566	GCA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924896
3	NC_015566	ACA	2	6	224	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924896
4	NC_015566	CTG	2	6	304	309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924896
5	NC_015566	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924896
6	NC_015566	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924896
7	NC_015566	ATC	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924896
8	NC_015566	GC	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	333924896
9	NC_015566	GGT	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924896
10	NC_015566	GC	3	6	429	434	0 %	0 %	50 %	50 %	333924896
11	NC_015566	TTG	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333924896
12	NC_015566	CCAA	2	8	545	552	50 %	0 %	0 %	50 %	333924896
13	NC_015566	GC	4	8	556	563	0 %	0 %	50 %	50 %	333924896
14	NC_015566	GGC	2	6	564	569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924896
15	NC_015566	GTT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333924896
16	NC_015566	CAT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924896
17	NC_015566	GC	3	6	679	684	0 %	0 %	50 %	50 %	333924896
18	NC_015566	AAC	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924896
19	NC_015566	GAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924896
20	NC_015566	TAC	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924896
21	NC_015566	T	6	6	823	828	0 %	100 %	0 %	0 %	333924896
22	NC_015566	CAA	2	6	831	836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924896
23	NC_015566	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924896
24	NC_015566	CAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924896
25	NC_015566	GCC	2	6	993	998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924896
26	NC_015566	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333924896
27	NC_015566	CGA	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924896
28	NC_015566	CGTG	2	8	1104	1111	0 %	25 %	50 %	25 %	333924896
29	NC_015566	CTG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924896
30	NC_015566	ATA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333924896
31	NC_015566	TAAAAT	2	12	1269	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333924896
32	NC_015566	GCG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924896
33	NC_015566	GCCC	2	8	1318	1325	0 %	0 %	25 %	75 %	333924896
34	NC_015566	GATGGC	2	12	1332	1343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333924896
35	NC_015566	ACCA	2	8	1360	1367	50 %	0 %	0 %	50 %	333924896
36	NC_015566	TGG	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924896
37	NC_015566	AGC	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924896
38	NC_015566	AGA	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924896
39	NC_015566	AGC	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924897
40	NC_015566	GCC	2	6	1584	1589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924897
41	NC_015566	TGC	3	9	1614	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924897
42	NC_015566	CTGC	2	8	1636	1643	0 %	25 %	25 %	50 %	333924897
43	NC_015566	TGGAGA	2	12	1662	1673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333924897
44	NC_015566	TGG	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924897
45	NC_015566	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	333924897
46	NC_015566	CG	3	6	1729	1734	0 %	0 %	50 %	50 %	333924897
47	NC_015566	CGG	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924897
48	NC_015566	GAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924897
49	NC_015566	CTA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924897
50	NC_015566	GAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924897
51	NC_015566	CGAC	2	8	2028	2035	25 %	0 %	25 %	50 %	333924897
52	NC_015566	CAG	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924897
53	NC_015566	CTG	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924897
54	NC_015566	CGC	2	6	2151	2156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924897
55	NC_015566	GCA	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924897
56	NC_015566	CGC	2	6	2249	2254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924897
57	NC_015566	GAA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924897
58	NC_015566	CGAA	2	8	2337	2344	50 %	0 %	25 %	25 %	333924897
59	NC_015566	CAA	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924897
60	NC_015566	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924897
61	NC_015566	ACG	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924897
62	NC_015566	CTG	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924897
63	NC_015566	GGC	3	9	2581	2589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924897
64	NC_015566	CGT	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924897
65	NC_015566	GCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924898
66	NC_015566	GCG	2	6	2818	2823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924898
67	NC_015566	GC	3	6	2919	2924	0 %	0 %	50 %	50 %	333924898
68	NC_015566	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924898
69	NC_015566	GC	3	6	3168	3173	0 %	0 %	50 %	50 %	333924898
70	NC_015566	GTT	2	6	3188	3193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333924898
71	NC_015566	T	6	6	3210	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	333924898
72	NC_015566	AGC	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924898
73	NC_015566	GC	3	6	3392	3397	0 %	0 %	50 %	50 %	333924898
74	NC_015566	AG	3	6	3450	3455	50 %	0 %	50 %	0 %	333924898
75	NC_015566	GCT	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924898
76	NC_015566	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333924898
77	NC_015566	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	333924898
78	NC_015566	GCT	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924898
79	NC_015566	GCGG	2	8	3650	3657	0 %	0 %	75 %	25 %	333924898
80	NC_015566	TGAT	2	8	3671	3678	25 %	50 %	25 %	0 %	333924898
81	NC_015566	CCCAGG	2	12	3740	3751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333924898
82	NC_015566	CTC	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333924899
83	NC_015566	GAT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333924899
84	NC_015566	CAC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333924899
85	NC_015566	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
86	NC_015566	GGT	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924899
87	NC_015566	GCG	2	6	4144	4149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
88	NC_015566	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924899
89	NC_015566	TGC	2	6	4166	4171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
90	NC_015566	CGG	2	6	4176	4181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
91	NC_015566	GAC	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
92	NC_015566	CGG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
93	NC_015566	GTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333924899
94	NC_015566	AACTGG	2	12	4262	4273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333924899
95	NC_015566	CAC	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333924899
96	NC_015566	CAA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924899
97	NC_015566	AGA	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924899
98	NC_015566	GGC	2	6	4534	4539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
99	NC_015566	TTG	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333924899
100	NC_015566	AACAAA	2	12	4564	4575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333924899
101	NC_015566	ATCC	2	8	4582	4589	25 %	25 %	0 %	50 %	333924899
102	NC_015566	GAC	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
103	NC_015566	ACG	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
104	NC_015566	CAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924899
105	NC_015566	AAG	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333924899
106	NC_015566	GAT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333924899
107	NC_015566	TTCTC	2	10	4870	4879	0 %	60 %	0 %	40 %	333924899
108	NC_015566	TTC	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924899
109	NC_015566	TGA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333924899
110	NC_015566	TCG	3	9	4985	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
111	NC_015566	ATC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924899
112	NC_015566	GCG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
113	NC_015566	GCG	2	6	5026	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
114	NC_015566	CGT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
115	NC_015566	GGCC	2	8	5076	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	333924899
116	NC_015566	TGG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924899
117	NC_015566	GCGG	2	8	5158	5165	0 %	0 %	75 %	25 %	333924899
118	NC_015566	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	333924899
119	NC_015566	CAT	4	12	5352	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333924899
120	NC_015566	GCT	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
121	NC_015566	CTT	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924899
122	NC_015566	GCC	2	6	5469	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924899
123	NC_015566	A	6	6	5488	5493	100 %	0 %	0 %	0 %	333924899
124	NC_015566	GC	3	6	5588	5593	0 %	0 %	50 %	50 %	333924899
125	NC_015566	TGG	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924899
126	NC_015566	CGC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333924899
127	NC_015566	CG	4	8	5681	5688	0 %	0 %	50 %	50 %	333924899
128	NC_015566	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
129	NC_015566	AAC	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333924899
130	NC_015566	TGAA	2	8	5720	5727	50 %	25 %	25 %	0 %	333924899
131	NC_015566	CTG	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
132	NC_015566	AGC	2	6	5798	5803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
133	NC_015566	GCA	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
134	NC_015566	TGC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924899
135	NC_015566	TTC	2	6	5917	5922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924899
136	NC_015566	CGG	2	6	5925	5930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924899
137	NC_015566	CTGC	2	8	5946	5953	0 %	25 %	25 %	50 %	333924899
138	NC_015566	AGC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924899
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152	NC_015566	TGA	3	9	6876	6884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333924900
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154	NC_015566	GCT	2	6	6898	6903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924900
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257	NC_015566	TGC	2	6	12798	12803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333924907
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259	NC_015566	TCT	2	6	12870	12875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924907
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261	NC_015566	GTG	2	6	12941	12946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333924907
262	NC_015566	GCG	3	9	12947	12955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924907
263	NC_015566	TGCCG	2	10	12970	12979	0 %	20 %	40 %	40 %	333924907
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373	NC_015566	GGGCC	2	10	18361	18370	0 %	0 %	60 %	40 %	333924911
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382	NC_015566	CGGC	2	8	18818	18825	0 %	0 %	50 %	50 %	333924912
383	NC_015566	TTC	2	6	18889	18894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333924912
384	NC_015566	GCG	2	6	18955	18960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924912
385	NC_015566	CGG	2	6	18995	19000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924912
386	NC_015566	GCCGAA	2	12	19021	19032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333924912
387	NC_015566	GCGCCA	2	12	19044	19055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333924912
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498	NC_015566	GC	3	6	23916	23921	0 %	0 %	50 %	50 %	333924916
499	NC_015566	CGG	2	6	24111	24116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333924917
500	NC_015566	GCCTT	2	10	24123	24132	0 %	40 %	20 %	40 %	333924917

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