MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015436	ACGG	2	8	196590	196597	25 %	0 %	50 %	25 %	330836150
3502	NC_015436	TGA	2	6	196598	196603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836150
3503	NC_015436	GAA	2	6	196630	196635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836150
3504	NC_015436	CAT	2	6	196760	196765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836150
3505	NC_015436	TGA	2	6	196766	196771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836150
3506	NC_015436	TGGC	2	8	196861	196868	0 %	25 %	50 %	25 %	330836150
3507	NC_015436	TGT	2	6	196883	196888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836150
3508	NC_015436	GCG	2	6	196924	196929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836150
3509	NC_015436	CGG	2	6	197072	197077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836150
3510	NC_015436	AGC	2	6	197138	197143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836151
3511	NC_015436	AAT	2	6	197249	197254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836151
3512	NC_015436	GAT	2	6	197291	197296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3513	NC_015436	GTAC	2	8	197334	197341	25 %	25 %	25 %	25 %	330836151
3514	NC_015436	TCCG	2	8	197349	197356	0 %	25 %	25 %	50 %	330836151
3515	NC_015436	CGT	2	6	197377	197382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836151
3516	NC_015436	GAGGAT	2	12	197384	197395	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330836151
3517	NC_015436	CCT	2	6	197445	197450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836151
3518	NC_015436	ATG	2	6	197505	197510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3519	NC_015436	GGC	2	6	197534	197539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836151
3520	NC_015436	TCT	2	6	197638	197643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836151
3521	NC_015436	GCA	2	6	197647	197652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836151
3522	NC_015436	CTGA	2	8	197691	197698	25 %	25 %	25 %	25 %	330836151
3523	NC_015436	GAA	2	6	197714	197719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836151
3524	NC_015436	GCG	2	6	197733	197738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836151
3525	NC_015436	TGG	2	6	197740	197745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836151
3526	NC_015436	GAT	2	6	197768	197773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3527	NC_015436	CGA	2	6	197776	197781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836151
3528	NC_015436	TGT	2	6	197836	197841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836151
3529	NC_015436	TTC	2	6	197950	197955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836151
3530	NC_015436	AAT	2	6	197984	197989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836151
3531	NC_015436	AATCA	2	10	198047	198056	60 %	20 %	0 %	20 %	330836151
3532	NC_015436	CAC	2	6	198125	198130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836151
3533	NC_015436	TTG	2	6	198198	198203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836151
3534	NC_015436	TGACCC	2	12	198253	198264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330836151
3535	NC_015436	GTG	2	6	198328	198333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836151
3536	NC_015436	GAT	2	6	198356	198361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3537	NC_015436	AGA	2	6	198387	198392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836151
3538	NC_015436	GAT	3	9	198440	198448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3539	NC_015436	ATC	2	6	198474	198479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836151
3540	NC_015436	CAT	2	6	198508	198513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836151
3541	NC_015436	AGG	2	6	198631	198636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836151
3542	NC_015436	ATG	2	6	198729	198734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3543	NC_015436	TTG	2	6	198741	198746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836151
3544	NC_015436	ATG	2	6	198759	198764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3545	NC_015436	ATG	2	6	198816	198821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836151
3546	NC_015436	CTT	2	6	198823	198828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836151
3547	NC_015436	TCA	2	6	198850	198855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836151
3548	NC_015436	GAA	2	6	199184	199189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836152
3549	NC_015436	ACTTTT	2	12	199191	199202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836152
3550	NC_015436	TTG	2	6	199215	199220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836152
3551	NC_015436	CTT	2	6	199221	199226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836152
3552	NC_015436	AGG	2	6	199247	199252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836152
3553	NC_015436	A	6	6	199260	199265	100 %	0 %	0 %	0 %	330836152
3554	NC_015436	AATT	2	8	199283	199290	50 %	50 %	0 %	0 %	330836152
3555	NC_015436	CA	3	6	199385	199390	50 %	0 %	0 %	50 %	330836152
3556	NC_015436	GCC	2	6	199431	199436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836152
3557	NC_015436	TA	3	6	199485	199490	50 %	50 %	0 %	0 %	330836152
3558	NC_015436	GCC	2	6	199524	199529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836152
3559	NC_015436	AAGTG	2	10	199544	199553	40 %	20 %	40 %	0 %	330836152
3560	NC_015436	ATG	2	6	199716	199721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836152
3561	NC_015436	A	6	6	199732	199737	100 %	0 %	0 %	0 %	330836152
3562	NC_015436	CAT	2	6	199757	199762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836152
3563	NC_015436	CCG	2	6	199766	199771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836152
3564	NC_015436	TGA	2	6	199850	199855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836152
3565	NC_015436	GCC	2	6	199959	199964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836152
3566	NC_015436	ACA	2	6	199984	199989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836152
3567	NC_015436	CAG	2	6	200022	200027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836152
3568	NC_015436	TTC	2	6	200055	200060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836152
3569	NC_015436	TAT	2	6	200130	200135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836152
3570	NC_015436	CGA	2	6	200260	200265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836152
3571	NC_015436	CTT	2	6	200271	200276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836152
3572	NC_015436	TCA	2	6	200317	200322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836152
3573	NC_015436	GAA	2	6	200355	200360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836152
3574	NC_015436	A	9	9	200556	200564	100 %	0 %	0 %	0 %	330836153
3575	NC_015436	AGAAA	2	10	200576	200585	80 %	0 %	20 %	0 %	330836153
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3577	NC_015436	T	7	7	200628	200634	0 %	100 %	0 %	0 %	330836153
3578	NC_015436	T	6	6	200678	200683	0 %	100 %	0 %	0 %	330836153
3579	NC_015436	AG	3	6	200689	200694	50 %	0 %	50 %	0 %	330836153
3580	NC_015436	CTTGG	2	10	200721	200730	0 %	40 %	40 %	20 %	330836153
3581	NC_015436	GTT	2	6	200744	200749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836153
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3583	NC_015436	ATC	2	6	200841	200846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836153
3584	NC_015436	CTT	2	6	200850	200855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836153
3585	NC_015436	TAT	2	6	200916	200921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836153
3586	NC_015436	CGG	2	6	200926	200931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836153
3587	NC_015436	TCT	2	6	200937	200942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836153
3588	NC_015436	CGC	2	6	200948	200953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836153
3589	NC_015436	GAT	2	6	200963	200968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836153
3590	NC_015436	CCA	2	6	201073	201078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836153
3591	NC_015436	GCTT	2	8	201134	201141	0 %	50 %	25 %	25 %	330836153
3592	NC_015436	CCTTGC	2	12	201214	201225	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330836153
3593	NC_015436	GTC	2	6	201237	201242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836153
3594	NC_015436	CAT	2	6	201251	201256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836153
3595	NC_015436	TTCTT	2	10	201409	201418	0 %	80 %	0 %	20 %	330836153
3596	NC_015436	TTC	2	6	201429	201434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836153
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3599	NC_015436	AT	3	6	201565	201570	50 %	50 %	0 %	0 %	330836154
3600	NC_015436	TTG	2	6	201610	201615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836154
3601	NC_015436	ATG	2	6	201634	201639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836154
3602	NC_015436	ATCA	2	8	201786	201793	50 %	25 %	0 %	25 %	330836154
3603	NC_015436	CATC	2	8	201809	201816	25 %	25 %	0 %	50 %	330836154
3604	NC_015436	AGGA	2	8	201849	201856	50 %	0 %	50 %	0 %	330836154
3605	NC_015436	CCA	2	6	201881	201886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836154
3606	NC_015436	TGA	2	6	201887	201892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836154
3607	NC_015436	CAT	2	6	201906	201911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836154
3608	NC_015436	CT	3	6	201917	201922	0 %	50 %	0 %	50 %	330836154
3609	NC_015436	ACG	2	6	202024	202029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836154
3610	NC_015436	CG	3	6	202053	202058	0 %	0 %	50 %	50 %	330836154
3611	NC_015436	TCT	2	6	202167	202172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836154
3612	NC_015436	A	6	6	202199	202204	100 %	0 %	0 %	0 %	330836154
3613	NC_015436	AAGA	2	8	202241	202248	75 %	0 %	25 %	0 %	330836154
3614	NC_015436	TGA	2	6	202254	202259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836154
3615	NC_015436	GCG	2	6	202276	202281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836154
3616	NC_015436	TCA	2	6	202304	202309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836154
3617	NC_015436	GGT	2	6	202339	202344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836154
3618	NC_015436	ATG	2	6	202384	202389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836155
3619	NC_015436	GTT	2	6	202413	202418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836155
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3621	NC_015436	TTC	2	6	202473	202478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836155
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3988	NC_015436	GAT	2	6	226803	226808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
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3991	NC_015436	GTC	2	6	226907	226912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836182
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