MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_015436	TCT	2	6	1131036	1131041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836943
20003	NC_015436	CAT	2	6	1131059	1131064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836943
20004	NC_015436	TAC	2	6	1131073	1131078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836943
20005	NC_015436	TCC	2	6	1131128	1131133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836943
20006	NC_015436	GCT	2	6	1131148	1131153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836943
20007	NC_015436	ACA	2	6	1131207	1131212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836943
20008	NC_015436	TGA	2	6	1131228	1131233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836943
20009	NC_015436	GCT	2	6	1131253	1131258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836943
20010	NC_015436	TCA	2	6	1131270	1131275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836943
20011	NC_015436	GCT	2	6	1131277	1131282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836943
20012	NC_015436	CGT	2	6	1131308	1131313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836943
20013	NC_015436	GAAA	2	8	1131330	1131337	75 %	0 %	25 %	0 %	330836943
20014	NC_015436	CTC	2	6	1131411	1131416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836943
20015	NC_015436	CAG	2	6	1131434	1131439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836943
20016	NC_015436	GATT	2	8	1131520	1131527	25 %	50 %	25 %	0 %	330836943
20017	NC_015436	GAT	2	6	1131535	1131540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836943
20018	NC_015436	TTG	2	6	1131549	1131554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836943
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20020	NC_015436	GAA	2	6	1131710	1131715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836943
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20035	NC_015436	AACA	2	8	1132270	1132277	75 %	0 %	0 %	25 %	330836944
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20053	NC_015436	CAG	2	6	1133130	1133135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836944
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20116	NC_015436	CTG	2	6	1136629	1136634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836947
20117	NC_015436	AGG	2	6	1136648	1136653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836947
20118	NC_015436	CCAGT	2	10	1136701	1136710	20 %	20 %	20 %	40 %	330836947
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20231	NC_015436	TGA	2	6	1143175	1143180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20232	NC_015436	TGA	2	6	1143187	1143192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20233	NC_015436	GAT	2	6	1143227	1143232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20234	NC_015436	TGAT	2	8	1143237	1143244	25 %	50 %	25 %	0 %	330836953
20235	NC_015436	TGA	2	6	1143259	1143264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20236	NC_015436	GAA	2	6	1143281	1143286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836953
20237	NC_015436	TGA	3	9	1143292	1143300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20238	NC_015436	CGA	2	6	1143301	1143306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836953
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20240	NC_015436	GAT	2	6	1143320	1143325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20241	NC_015436	TGA	3	9	1143337	1143345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836953
20242	NC_015436	GAG	2	6	1143347	1143352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836953
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20345	NC_015436	GTA	2	6	1149313	1149318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836957
20346	NC_015436	GCA	2	6	1149322	1149327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836957
20347	NC_015436	GCC	2	6	1149343	1149348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836957
20348	NC_015436	CAG	2	6	1149357	1149362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836957
20349	NC_015436	AAC	2	6	1149422	1149427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836957
20350	NC_015436	ATC	2	6	1149469	1149474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836957
20351	NC_015436	GTA	2	6	1149499	1149504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836957
20352	NC_015436	AGC	2	6	1149513	1149518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836957
20353	NC_015436	GCC	2	6	1149592	1149597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836957
20354	NC_015436	ATC	2	6	1149604	1149609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836957
20355	NC_015436	CGGG	2	8	1149688	1149695	0 %	0 %	75 %	25 %	330836957
20356	NC_015436	GGATT	2	10	1149733	1149742	20 %	40 %	40 %	0 %	330836957
20357	NC_015436	GTC	2	6	1149796	1149801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836957
20358	NC_015436	ATC	2	6	1149808	1149813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836957
20359	NC_015436	CTG	2	6	1149928	1149933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836957
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20365	NC_015436	ACCATG	2	12	1150329	1150340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330836958
20366	NC_015436	CCT	2	6	1150415	1150420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836958
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20368	NC_015436	GCA	2	6	1150455	1150460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836958
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20370	NC_015436	GGCT	2	8	1150531	1150538	0 %	25 %	50 %	25 %	330836958
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20373	NC_015436	CGG	2	6	1150646	1150651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836958
20374	NC_015436	CAT	2	6	1150724	1150729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836958
20375	NC_015436	T	6	6	1150744	1150749	0 %	100 %	0 %	0 %	330836958
20376	NC_015436	TCAT	2	8	1150764	1150771	25 %	50 %	0 %	25 %	330836958
20377	NC_015436	GTC	2	6	1150782	1150787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836958
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20379	NC_015436	GCT	2	6	1150871	1150876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836958
20380	NC_015436	TCA	3	9	1150932	1150940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836958
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20385	NC_015436	GTT	2	6	1151157	1151162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836959
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20444	NC_015436	GGA	2	6	1154070	1154075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836962
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20446	NC_015436	TTCC	2	8	1154136	1154143	0 %	50 %	0 %	50 %	330836962
20447	NC_015436	ACGG	2	8	1154242	1154249	25 %	0 %	50 %	25 %	330836962
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20450	NC_015436	TCC	2	6	1154440	1154445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836963
20451	NC_015436	TTGT	2	8	1154452	1154459	0 %	75 %	25 %	0 %	330836963
20452	NC_015436	GCA	2	6	1154621	1154626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836963
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20455	NC_015436	GGC	2	6	1154742	1154747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836963
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20457	NC_015436	GTG	2	6	1154851	1154856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836963
20458	NC_015436	GGC	2	6	1154953	1154958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836964
20459	NC_015436	GGA	2	6	1154974	1154979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836964
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20461	NC_015436	AATCA	2	10	1155127	1155136	60 %	20 %	0 %	20 %	330836964
20462	NC_015436	CT	3	6	1155158	1155163	0 %	50 %	0 %	50 %	330836964
20463	NC_015436	ATCTT	2	10	1155173	1155182	20 %	60 %	0 %	20 %	330836964
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20465	NC_015436	ATC	2	6	1155271	1155276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836964
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