MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015436	GAC	2	6	1103861	1103866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836918
19502	NC_015436	GGC	2	6	1103885	1103890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836918
19503	NC_015436	TCA	2	6	1103971	1103976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836918
19504	NC_015436	CTC	3	9	1104062	1104070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836918
19505	NC_015436	TCA	2	6	1104132	1104137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836918
19506	NC_015436	ACA	2	6	1104145	1104150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836918
19507	NC_015436	TCA	2	6	1104189	1104194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836918
19508	NC_015436	AAG	2	6	1104229	1104234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836918
19509	NC_015436	TTC	2	6	1104336	1104341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836918
19510	NC_015436	AC	3	6	1104432	1104437	50 %	0 %	0 %	50 %	330836918
19511	NC_015436	ATA	2	6	1104452	1104457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836918
19512	NC_015436	GAAA	2	8	1104469	1104476	75 %	0 %	25 %	0 %	330836918
19513	NC_015436	AGG	2	6	1104527	1104532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836918
19514	NC_015436	CTT	2	6	1104540	1104545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836918
19515	NC_015436	AAG	2	6	1104560	1104565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836918
19516	NC_015436	T	8	8	1104566	1104573	0 %	100 %	0 %	0 %	330836918
19517	NC_015436	TCA	2	6	1104592	1104597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836918
19518	NC_015436	TCA	2	6	1104660	1104665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836919
19519	NC_015436	GGAC	2	8	1104912	1104919	25 %	0 %	50 %	25 %	330836919
19520	NC_015436	GCT	2	6	1104973	1104978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19521	NC_015436	AAC	2	6	1105016	1105021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836919
19522	NC_015436	AGG	2	6	1105022	1105027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836919
19523	NC_015436	GCT	2	6	1105069	1105074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19524	NC_015436	GT	3	6	1105076	1105081	0 %	50 %	50 %	0 %	330836919
19525	NC_015436	GC	3	6	1105124	1105129	0 %	0 %	50 %	50 %	330836919
19526	NC_015436	CGA	2	6	1105162	1105167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19527	NC_015436	TTC	2	6	1105187	1105192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836919
19528	NC_015436	TGG	2	6	1105233	1105238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836919
19529	NC_015436	CGGG	2	8	1105249	1105256	0 %	0 %	75 %	25 %	330836919
19530	NC_015436	CTG	2	6	1105265	1105270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19531	NC_015436	TAC	2	6	1105271	1105276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836919
19532	NC_015436	CGG	2	6	1105325	1105330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836919
19533	NC_015436	G	6	6	1105329	1105334	0 %	0 %	100 %	0 %	330836919
19534	NC_015436	ACC	2	6	1105430	1105435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836919
19535	NC_015436	GCA	2	6	1105459	1105464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19536	NC_015436	ATG	2	6	1105499	1105504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836919
19537	NC_015436	CTG	2	6	1105529	1105534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19538	NC_015436	TCA	2	6	1105551	1105556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836919
19539	NC_015436	TCG	2	6	1105559	1105564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19540	NC_015436	AGG	2	6	1105608	1105613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836919
19541	NC_015436	GCC	2	6	1105628	1105633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836919
19542	NC_015436	GCC	2	6	1105656	1105661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836919
19543	NC_015436	GGT	2	6	1105735	1105740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836919
19544	NC_015436	TTC	2	6	1105742	1105747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836919
19545	NC_015436	CAG	2	6	1105760	1105765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19546	NC_015436	CAG	2	6	1105805	1105810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19547	NC_015436	GCG	2	6	1105811	1105816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836919
19548	NC_015436	G	6	6	1105820	1105825	0 %	0 %	100 %	0 %	330836919
19549	NC_015436	AAC	2	6	1105841	1105846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836919
19550	NC_015436	GAA	2	6	1105867	1105872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836919
19551	NC_015436	GCT	2	6	1105942	1105947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19552	NC_015436	GAG	2	6	1105955	1105960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836919
19553	NC_015436	GAG	2	6	1106006	1106011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836919
19554	NC_015436	C	6	6	1106018	1106023	0 %	0 %	0 %	100 %	330836919
19555	NC_015436	GGGC	2	8	1106030	1106037	0 %	0 %	75 %	25 %	330836919
19556	NC_015436	GAC	2	6	1106081	1106086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19557	NC_015436	CAT	2	6	1106092	1106097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836919
19558	NC_015436	CTG	2	6	1106228	1106233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19559	NC_015436	G	6	6	1106260	1106265	0 %	0 %	100 %	0 %	330836919
19560	NC_015436	TGG	2	6	1106286	1106291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836919
19561	NC_015436	CTG	2	6	1106309	1106314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836919
19562	NC_015436	GAA	2	6	1106449	1106454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836919
19563	NC_015436	TCGG	3	12	1106863	1106874	0 %	25 %	50 %	25 %	330836920
19564	NC_015436	CTT	2	6	1106901	1106906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836920
19565	NC_015436	AAC	2	6	1106947	1106952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836920
19566	NC_015436	A	6	6	1106979	1106984	100 %	0 %	0 %	0 %	330836920
19567	NC_015436	GTC	2	6	1107054	1107059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836920
19568	NC_015436	CGC	2	6	1107100	1107105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836920
19569	NC_015436	TCCG	2	8	1107106	1107113	0 %	25 %	25 %	50 %	330836920
19570	NC_015436	GCAA	2	8	1107114	1107121	50 %	0 %	25 %	25 %	330836920
19571	NC_015436	GAT	2	6	1107165	1107170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836920
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19574	NC_015436	CTG	2	6	1107192	1107197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836920
19575	NC_015436	AGG	2	6	1107235	1107240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836920
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19577	NC_015436	GGATA	2	10	1107319	1107328	40 %	20 %	40 %	0 %	330836921
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19580	NC_015436	ACT	2	6	1107465	1107470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836921
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19582	NC_015436	GCCA	2	8	1107528	1107535	25 %	0 %	25 %	50 %	330836921
19583	NC_015436	GGT	2	6	1107591	1107596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836921
19584	NC_015436	CATA	2	8	1107697	1107704	50 %	25 %	0 %	25 %	330836921
19585	NC_015436	ATC	2	6	1107795	1107800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836921
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19587	NC_015436	GAA	2	6	1107873	1107878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836921
19588	NC_015436	GAAA	2	8	1107908	1107915	75 %	0 %	25 %	0 %	330836921
19589	NC_015436	TGA	2	6	1107968	1107973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836921
19590	NC_015436	TTCA	2	8	1107984	1107991	25 %	50 %	0 %	25 %	330836921
19591	NC_015436	TCC	2	6	1108051	1108056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836921
19592	NC_015436	AAGATG	2	12	1108146	1108157	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	330836921
19593	NC_015436	CGG	2	6	1108178	1108183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836921
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19596	NC_015436	TTC	2	6	1108268	1108273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836921
19597	NC_015436	GAA	2	6	1108277	1108282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836921
19598	NC_015436	TGA	2	6	1108310	1108315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836921
19599	NC_015436	GA	3	6	1108339	1108344	50 %	0 %	50 %	0 %	330836921
19600	NC_015436	TGG	2	6	1108464	1108469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836921
19601	NC_015436	CAT	2	6	1108568	1108573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836921
19602	NC_015436	GGC	2	6	1108622	1108627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836922
19603	NC_015436	AT	3	6	1108633	1108638	50 %	50 %	0 %	0 %	330836922
19604	NC_015436	CA	3	6	1108642	1108647	50 %	0 %	0 %	50 %	330836922
19605	NC_015436	CGT	2	6	1108807	1108812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836922
19606	NC_015436	GCC	2	6	1108820	1108825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836922
19607	NC_015436	AT	3	6	1108862	1108867	50 %	50 %	0 %	0 %	330836922
19608	NC_015436	CAA	2	6	1108869	1108874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836922
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19611	NC_015436	CGA	2	6	1109010	1109015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836922
19612	NC_015436	TCG	2	6	1109088	1109093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836922
19613	NC_015436	TCT	2	6	1109212	1109217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836922
19614	NC_015436	TTG	2	6	1109319	1109324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836922
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19616	NC_015436	GGGA	2	8	1109411	1109418	25 %	0 %	75 %	0 %	330836922
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19619	NC_015436	CAT	3	9	1109472	1109480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836922
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19731	NC_015436	TTC	2	6	1115967	1115972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836929
19732	NC_015436	AGC	2	6	1116008	1116013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836929
19733	NC_015436	AGC	2	6	1116065	1116070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836929
19734	NC_015436	AGC	2	6	1116074	1116079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836929
19735	NC_015436	GGGAGC	2	12	1116080	1116091	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330836929
19736	NC_015436	TGC	2	6	1116107	1116112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836929
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19740	NC_015436	GAT	2	6	1116479	1116484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836929
19741	NC_015436	CGA	2	6	1116535	1116540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836929
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19744	NC_015436	CTG	3	9	1116721	1116729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836929
19745	NC_015436	CAT	2	6	1116790	1116795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836929
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19749	NC_015436	GGCG	2	8	1116934	1116941	0 %	0 %	75 %	25 %	330836929
19750	NC_015436	GCC	2	6	1116950	1116955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836929
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19757	NC_015436	TCCT	2	8	1118029	1118036	0 %	50 %	0 %	50 %	330836931
19758	NC_015436	ATC	2	6	1118075	1118080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836931
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