MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015436	GAA	2	6	1021052	1021057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836847
18002	NC_015436	ACGA	2	8	1021068	1021075	50 %	0 %	25 %	25 %	330836847
18003	NC_015436	AGGAC	2	10	1021096	1021105	40 %	0 %	40 %	20 %	330836847
18004	NC_015436	TGG	2	6	1021139	1021144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836848
18005	NC_015436	ACT	2	6	1021253	1021258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836848
18006	NC_015436	GAC	2	6	1021310	1021315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836848
18007	NC_015436	AAC	2	6	1021318	1021323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836848
18008	NC_015436	AC	3	6	1021411	1021416	50 %	0 %	0 %	50 %	330836848
18009	NC_015436	ATG	2	6	1021426	1021431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836848
18010	NC_015436	AAC	2	6	1021522	1021527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836848
18011	NC_015436	TCT	2	6	1021557	1021562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836848
18012	NC_015436	GATG	2	8	1021577	1021584	25 %	25 %	50 %	0 %	330836848
18013	NC_015436	ATC	2	6	1021623	1021628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836848
18014	NC_015436	CAT	2	6	1021631	1021636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836848
18015	NC_015436	GTT	2	6	1021667	1021672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836848
18016	NC_015436	CGC	2	6	1021691	1021696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836848
18017	NC_015436	ACT	2	6	1021766	1021771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836848
18018	NC_015436	CAT	2	6	1021784	1021789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836848
18019	NC_015436	CTT	2	6	1021922	1021927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836849
18020	NC_015436	CATCTG	2	12	1022108	1022119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836849
18021	NC_015436	TTCC	2	8	1022167	1022174	0 %	50 %	0 %	50 %	330836849
18022	NC_015436	CGC	2	6	1022248	1022253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836849
18023	NC_015436	ATC	2	6	1022265	1022270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836849
18024	NC_015436	GTA	2	6	1022384	1022389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836849
18025	NC_015436	GAA	2	6	1022587	1022592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836849
18026	NC_015436	GAA	2	6	1022633	1022638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836849
18027	NC_015436	TCA	2	6	1022662	1022667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836849
18028	NC_015436	TGC	2	6	1022671	1022676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836849
18029	NC_015436	CTT	2	6	1022737	1022742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836849
18030	NC_015436	GAC	2	6	1022756	1022761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836849
18031	NC_015436	ACATG	2	10	1022803	1022812	40 %	20 %	20 %	20 %	330836849
18032	NC_015436	TTTC	2	8	1022821	1022828	0 %	75 %	0 %	25 %	330836849
18033	NC_015436	AGGC	2	8	1022830	1022837	25 %	0 %	50 %	25 %	330836849
18034	NC_015436	GGC	2	6	1022849	1022854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836849
18035	NC_015436	GGAT	2	8	1022944	1022951	25 %	25 %	50 %	0 %	330836849
18036	NC_015436	TGA	2	6	1022977	1022982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836849
18037	NC_015436	TCA	2	6	1023108	1023113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836849
18038	NC_015436	GAT	2	6	1023149	1023154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836849
18039	NC_015436	TCTT	2	8	1023183	1023190	0 %	75 %	0 %	25 %	330836849
18040	NC_015436	GGCA	2	8	1023276	1023283	25 %	0 %	50 %	25 %	330836849
18041	NC_015436	CAT	2	6	1023541	1023546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836849
18042	NC_015436	GAC	2	6	1023571	1023576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836849
18043	NC_015436	CCA	2	6	1023601	1023606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836849
18044	NC_015436	T	7	7	1023634	1023640	0 %	100 %	0 %	0 %	330836849
18045	NC_015436	CAT	2	6	1023655	1023660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836849
18046	NC_015436	TA	3	6	1023759	1023764	50 %	50 %	0 %	0 %	330836850
18047	NC_015436	TGT	2	6	1023843	1023848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836850
18048	NC_015436	CAC	2	6	1023850	1023855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836850
18049	NC_015436	TC	3	6	1023880	1023885	0 %	50 %	0 %	50 %	330836850
18050	NC_015436	G	6	6	1023888	1023893	0 %	0 %	100 %	0 %	330836850
18051	NC_015436	ATT	2	6	1023898	1023903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836850
18052	NC_015436	CGT	2	6	1023907	1023912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836850
18053	NC_015436	T	6	6	1023987	1023992	0 %	100 %	0 %	0 %	330836850
18054	NC_015436	TCA	2	6	1024031	1024036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836850
18055	NC_015436	CGG	2	6	1024062	1024067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836850
18056	NC_015436	CTT	2	6	1024074	1024079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836850
18057	NC_015436	ATCC	2	8	1024151	1024158	25 %	25 %	0 %	50 %	330836850
18058	NC_015436	GTC	2	6	1024181	1024186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836850
18059	NC_015436	GAC	2	6	1024279	1024284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836850
18060	NC_015436	ACC	2	6	1024313	1024318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836850
18061	NC_015436	CATG	2	8	1024358	1024365	25 %	25 %	25 %	25 %	330836850
18062	NC_015436	GT	3	6	1024378	1024383	0 %	50 %	50 %	0 %	330836850
18063	NC_015436	T	6	6	1024435	1024440	0 %	100 %	0 %	0 %	330836850
18064	NC_015436	GA	3	6	1024450	1024455	50 %	0 %	50 %	0 %	330836850
18065	NC_015436	GAA	2	6	1024514	1024519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836850
18066	NC_015436	TCA	2	6	1024542	1024547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836850
18067	NC_015436	TAG	2	6	1024562	1024567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836850
18068	NC_015436	TGC	2	6	1024631	1024636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836850
18069	NC_015436	AC	3	6	1024985	1024990	50 %	0 %	0 %	50 %	330836851
18070	NC_015436	A	6	6	1025008	1025013	100 %	0 %	0 %	0 %	330836851
18071	NC_015436	AG	3	6	1025060	1025065	50 %	0 %	50 %	0 %	330836851
18072	NC_015436	ATG	2	6	1025096	1025101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836851
18073	NC_015436	GAT	2	6	1025152	1025157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836851
18074	NC_015436	CAG	2	6	1025230	1025235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836851
18075	NC_015436	GGA	2	6	1025250	1025255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836851
18076	NC_015436	A	6	6	1025302	1025307	100 %	0 %	0 %	0 %	330836851
18077	NC_015436	AACC	2	8	1025355	1025362	50 %	0 %	0 %	50 %	330836851
18078	NC_015436	CGG	2	6	1025534	1025539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836851
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18080	NC_015436	GAA	2	6	1025634	1025639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836851
18081	NC_015436	CG	3	6	1025665	1025670	0 %	0 %	50 %	50 %	330836851
18082	NC_015436	ACC	2	6	1025683	1025688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836851
18083	NC_015436	GAT	2	6	1025709	1025714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836851
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18085	NC_015436	TTG	2	6	1025837	1025842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836851
18086	NC_015436	AAC	3	9	1025932	1025940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836851
18087	NC_015436	GAC	2	6	1026079	1026084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836851
18088	NC_015436	TGG	2	6	1026138	1026143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836851
18089	NC_015436	GAG	2	6	1026175	1026180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836851
18090	NC_015436	ACT	2	6	1026212	1026217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836851
18091	NC_015436	GGT	2	6	1026218	1026223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836851
18092	NC_015436	CCGTG	2	10	1026339	1026348	0 %	20 %	40 %	40 %	330836851
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18095	NC_015436	GAATG	2	10	1026560	1026569	40 %	20 %	40 %	0 %	330836852
18096	NC_015436	TGA	2	6	1026624	1026629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836852
18097	NC_015436	CTG	2	6	1026703	1026708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836852
18098	NC_015436	CAT	2	6	1026732	1026737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836852
18099	NC_015436	AAG	2	6	1027079	1027084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836853
18100	NC_015436	GT	3	6	1027112	1027117	0 %	50 %	50 %	0 %	330836853
18101	NC_015436	CCG	2	6	1027145	1027150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836853
18102	NC_015436	GTCA	2	8	1027197	1027204	25 %	25 %	25 %	25 %	330836853
18103	NC_015436	TCA	2	6	1027264	1027269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836853
18104	NC_015436	AT	3	6	1027357	1027362	50 %	50 %	0 %	0 %	330836853
18105	NC_015436	ACA	2	6	1027390	1027395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836853
18106	NC_015436	ATC	2	6	1027396	1027401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836853
18107	NC_015436	TCC	2	6	1027453	1027458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836853
18108	NC_015436	GGAA	2	8	1027644	1027651	50 %	0 %	50 %	0 %	330836853
18109	NC_015436	TC	3	6	1027899	1027904	0 %	50 %	0 %	50 %	330836854
18110	NC_015436	CCTGT	2	10	1027925	1027934	0 %	40 %	20 %	40 %	330836854
18111	NC_015436	GCCGAT	2	12	1027936	1027947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330836854
18112	NC_015436	TTTC	2	8	1027991	1027998	0 %	75 %	0 %	25 %	330836854
18113	NC_015436	CGG	2	6	1028055	1028060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836854
18114	NC_015436	GGA	2	6	1028071	1028076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836854
18115	NC_015436	TCA	2	6	1028084	1028089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836854
18116	NC_015436	CAA	2	6	1028118	1028123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836854
18117	NC_015436	ACA	2	6	1028126	1028131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836854
18118	NC_015436	CGG	2	6	1028223	1028228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836854
18119	NC_015436	CAT	2	6	1028235	1028240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836854
18120	NC_015436	TCA	2	6	1028327	1028332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836854
18121	NC_015436	TGA	2	6	1028340	1028345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836854
18122	NC_015436	TCA	2	6	1028381	1028386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836854
18123	NC_015436	GAA	2	6	1028388	1028393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836854
18124	NC_015436	GAA	2	6	1028442	1028447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836854
18125	NC_015436	AAG	2	6	1028539	1028544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836854
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18128	NC_015436	GAA	2	6	1028647	1028652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836854
18129	NC_015436	CT	3	6	1028665	1028670	0 %	50 %	0 %	50 %	330836854
18130	NC_015436	CCG	2	6	1028693	1028698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836854
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18132	NC_015436	CAA	2	6	1028721	1028726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836854
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18135	NC_015436	T	6	6	1028910	1028915	0 %	100 %	0 %	0 %	330836854
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18138	NC_015436	GAA	2	6	1029036	1029041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836854
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18143	NC_015436	CCG	2	6	1029221	1029226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836854
18144	NC_015436	AGGC	2	8	1029236	1029243	25 %	0 %	50 %	25 %	330836854
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18224	NC_015436	GTGG	2	8	1034488	1034495	0 %	25 %	75 %	0 %	330836857
18225	NC_015436	GCG	2	6	1034514	1034519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836857
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18230	NC_015436	GGC	2	6	1034728	1034733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836857
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18348	NC_015436	TCA	2	6	1040825	1040830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836862
18349	NC_015436	GAA	2	6	1040901	1040906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836862
18350	NC_015436	GA	3	6	1040923	1040928	50 %	0 %	50 %	0 %	330836862
18351	NC_015436	ACGGA	2	10	1041044	1041053	40 %	0 %	40 %	20 %	330836862
18352	NC_015436	GTC	2	6	1041079	1041084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836862
18353	NC_015436	GCGA	2	8	1041118	1041125	25 %	0 %	50 %	25 %	330836862
18354	NC_015436	TCA	2	6	1041140	1041145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836862
18355	NC_015436	ACG	2	6	1041154	1041159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836862
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18358	NC_015436	C	6	6	1041257	1041262	0 %	0 %	0 %	100 %	330836862
18359	NC_015436	TGG	2	6	1041297	1041302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836862
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18364	NC_015436	ATG	2	6	1041593	1041598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836863
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18367	NC_015436	GGT	2	6	1041747	1041752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836863
18368	NC_015436	TAC	2	6	1041775	1041780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836863
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18393	NC_015436	TG	3	6	1042951	1042956	0 %	50 %	50 %	0 %	330836864
18394	NC_015436	ATG	2	6	1043040	1043045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836864
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18463	NC_015436	TCC	2	6	1047647	1047652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836868
18464	NC_015436	A	6	6	1047700	1047705	100 %	0 %	0 %	0 %	330836868
18465	NC_015436	CGG	2	6	1047767	1047772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836868
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18467	NC_015436	TCC	2	6	1047832	1047837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836868
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