MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015436	TCC	2	6	734394	734399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836603
13002	NC_015436	GTA	2	6	734475	734480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836603
13003	NC_015436	CAC	2	6	734512	734517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836603
13004	NC_015436	TGA	2	6	734527	734532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836603
13005	NC_015436	ACA	2	6	734541	734546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836603
13006	NC_015436	AGA	2	6	734567	734572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836603
13007	NC_015436	CAC	2	6	734654	734659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836603
13008	NC_015436	CCA	2	6	734665	734670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836603
13009	NC_015436	TCA	2	6	734752	734757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836603
13010	NC_015436	TCA	2	6	734763	734768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836603
13011	NC_015436	AG	4	8	734769	734776	50 %	0 %	50 %	0 %	330836603
13012	NC_015436	TGT	2	6	734817	734822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836603
13013	NC_015436	TCA	2	6	734823	734828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836603
13014	NC_015436	CGAT	2	8	734946	734953	25 %	25 %	25 %	25 %	330836603
13015	NC_015436	TTC	3	9	734954	734962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836603
13016	NC_015436	TCT	2	6	734991	734996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836603
13017	NC_015436	CCTTT	2	10	735006	735015	0 %	60 %	0 %	40 %	330836603
13018	NC_015436	CAA	2	6	735029	735034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836603
13019	NC_015436	GCC	2	6	735090	735095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836603
13020	NC_015436	GTC	2	6	735099	735104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836603
13021	NC_015436	ACG	2	6	735125	735130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836603
13022	NC_015436	GTCG	2	8	735164	735171	0 %	25 %	50 %	25 %	330836603
13023	NC_015436	TCA	2	6	735207	735212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836603
13024	NC_015436	CAT	2	6	735358	735363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836603
13025	NC_015436	GAA	2	6	735447	735452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836603
13026	NC_015436	GAT	2	6	735461	735466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836603
13027	NC_015436	CCA	2	6	735514	735519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836603
13028	NC_015436	ACGA	2	8	735533	735540	50 %	0 %	25 %	25 %	330836603
13029	NC_015436	AGG	2	6	735631	735636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836604
13030	NC_015436	CTC	2	6	735637	735642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836604
13031	NC_015436	CGG	2	6	735686	735691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836604
13032	NC_015436	TTC	2	6	735750	735755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836604
13033	NC_015436	A	6	6	735769	735774	100 %	0 %	0 %	0 %	330836604
13034	NC_015436	TCT	2	6	735793	735798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836604
13035	NC_015436	CAT	2	6	735852	735857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836604
13036	NC_015436	T	8	8	735896	735903	0 %	100 %	0 %	0 %	330836604
13037	NC_015436	CAT	2	6	735905	735910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836604
13038	NC_015436	ATG	2	6	735982	735987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836604
13039	NC_015436	CAT	2	6	736056	736061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836604
13040	NC_015436	AGG	2	6	736104	736109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836604
13041	NC_015436	ATG	2	6	736171	736176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836604
13042	NC_015436	ATA	2	6	736177	736182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836604
13043	NC_015436	CAC	2	6	736213	736218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836604
13044	NC_015436	GAA	2	6	736258	736263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836604
13045	NC_015436	GAT	2	6	736264	736269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836604
13046	NC_015436	GAA	2	6	736345	736350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836604
13047	NC_015436	TCA	2	6	736354	736359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836604
13048	NC_015436	CTT	2	6	736382	736387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836604
13049	NC_015436	TTC	2	6	736396	736401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836604
13050	NC_015436	CTG	2	6	736406	736411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836604
13051	NC_015436	CGC	2	6	736413	736418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836604
13052	NC_015436	GCG	2	6	736519	736524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836604
13053	NC_015436	ATGACA	2	12	736555	736566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330836604
13054	NC_015436	C	7	7	736586	736592	0 %	0 %	0 %	100 %	330836604
13055	NC_015436	TTA	2	6	736615	736620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836604
13056	NC_015436	A	6	6	736685	736690	100 %	0 %	0 %	0 %	330836604
13057	NC_015436	CAT	2	6	736820	736825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836605
13058	NC_015436	T	8	8	736828	736835	0 %	100 %	0 %	0 %	330836605
13059	NC_015436	A	6	6	736972	736977	100 %	0 %	0 %	0 %	330836606
13060	NC_015436	AAGGAC	2	12	737072	737083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330836606
13061	NC_015436	ATG	2	6	737091	737096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836606
13062	NC_015436	CGA	3	9	737110	737118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836606
13063	NC_015436	AAG	2	6	737123	737128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836606
13064	NC_015436	CCGA	2	8	737148	737155	25 %	0 %	25 %	50 %	330836606
13065	NC_015436	TCC	2	6	737369	737374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836606
13066	NC_015436	A	6	6	737395	737400	100 %	0 %	0 %	0 %	330836606
13067	NC_015436	GCAT	2	8	737530	737537	25 %	25 %	25 %	25 %	330836607
13068	NC_015436	AGA	2	6	737593	737598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836607
13069	NC_015436	A	6	6	737598	737603	100 %	0 %	0 %	0 %	330836607
13070	NC_015436	CGG	2	6	737661	737666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836607
13071	NC_015436	CTT	2	6	737684	737689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836607
13072	NC_015436	CGC	2	6	737706	737711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836607
13073	NC_015436	TTC	2	6	737722	737727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836607
13074	NC_015436	ACTC	2	8	737766	737773	25 %	25 %	0 %	50 %	330836607
13075	NC_015436	TGCTCC	2	12	737776	737787	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330836607
13076	NC_015436	CAGC	2	8	737814	737821	25 %	0 %	25 %	50 %	330836607
13077	NC_015436	AT	3	6	737858	737863	50 %	50 %	0 %	0 %	330836607
13078	NC_015436	ATCA	2	8	737950	737957	50 %	25 %	0 %	25 %	330836607
13079	NC_015436	TAT	2	6	737958	737963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836607
13080	NC_015436	TCC	2	6	737986	737991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836607
13081	NC_015436	ATG	2	6	737993	737998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836607
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13083	NC_015436	TGCCC	2	10	738034	738043	0 %	20 %	20 %	60 %	330836607
13084	NC_015436	CGC	2	6	738130	738135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836607
13085	NC_015436	AT	3	6	738155	738160	50 %	50 %	0 %	0 %	330836607
13086	NC_015436	CGC	2	6	738163	738168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836607
13087	NC_015436	GGC	2	6	738244	738249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836607
13088	NC_015436	GCG	2	6	738255	738260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836607
13089	NC_015436	TCC	2	6	738274	738279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836607
13090	NC_015436	A	6	6	738285	738290	100 %	0 %	0 %	0 %	330836607
13091	NC_015436	CGG	2	6	738308	738313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836607
13092	NC_015436	GAA	2	6	738331	738336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836607
13093	NC_015436	TC	3	6	738445	738450	0 %	50 %	0 %	50 %	330836607
13094	NC_015436	TTC	2	6	738508	738513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836607
13095	NC_015436	TCC	2	6	738550	738555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836607
13096	NC_015436	A	7	7	738742	738748	100 %	0 %	0 %	0 %	330836608
13097	NC_015436	GAT	2	6	738768	738773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836608
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13099	NC_015436	GAA	2	6	738931	738936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836608
13100	NC_015436	GCC	2	6	738970	738975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836608
13101	NC_015436	CGC	2	6	738976	738981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836608
13102	NC_015436	GAT	2	6	739011	739016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836608
13103	NC_015436	CGT	2	6	739023	739028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836608
13104	NC_015436	TGAAA	2	10	739050	739059	60 %	20 %	20 %	0 %	330836608
13105	NC_015436	GGAA	2	8	739113	739120	50 %	0 %	50 %	0 %	330836608
13106	NC_015436	ATC	2	6	739132	739137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836608
13107	NC_015436	ATGG	2	8	739173	739180	25 %	25 %	50 %	0 %	330836608
13108	NC_015436	GCG	2	6	739245	739250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836608
13109	NC_015436	AAT	2	6	739285	739290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836608
13110	NC_015436	ACA	2	6	739316	739321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836608
13111	NC_015436	CAT	2	6	739357	739362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836608
13112	NC_015436	CAT	2	6	739368	739373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836608
13113	NC_015436	TGA	2	6	739374	739379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836608
13114	NC_015436	TGAT	2	8	739394	739401	25 %	50 %	25 %	0 %	330836608
13115	NC_015436	ATC	2	6	739420	739425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836608
13116	NC_015436	GGA	2	6	739437	739442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836608
13117	NC_015436	TGA	2	6	739515	739520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836608
13118	NC_015436	GAA	2	6	739528	739533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836608
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13120	NC_015436	GAA	2	6	739662	739667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836608
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13239	NC_015436	CAT	2	6	745960	745965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836612
13240	NC_015436	ACC	2	6	745974	745979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836612
13241	NC_015436	TGA	2	6	746017	746022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836612
13242	NC_015436	ATC	2	6	746057	746062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836612
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13244	NC_015436	CGT	2	6	746174	746179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836612
13245	NC_015436	TCG	2	6	746197	746202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836612
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13250	NC_015436	CT	3	6	746416	746421	0 %	50 %	0 %	50 %	330836612
13251	NC_015436	GTT	2	6	746453	746458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836612
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13344	NC_015436	AATCAA	2	12	751373	751384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330836617
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13351	NC_015436	AAGG	2	8	751684	751691	50 %	0 %	50 %	0 %	330836617
13352	NC_015436	CGG	2	6	751832	751837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836617
13353	NC_015436	A	6	6	751934	751939	100 %	0 %	0 %	0 %	330836618
13354	NC_015436	GAA	2	6	751947	751952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836618
13355	NC_015436	GGA	2	6	752010	752015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836618
13356	NC_015436	ACTGT	2	10	752071	752080	20 %	40 %	20 %	20 %	330836618
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13358	NC_015436	GAT	2	6	752355	752360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836618
13359	NC_015436	ACA	2	6	752394	752399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836618
13360	NC_015436	TCC	2	6	752478	752483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836618
13361	NC_015436	ACC	2	6	752544	752549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836618
13362	NC_015436	TTC	2	6	752583	752588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836618
13363	NC_015436	CAC	2	6	752703	752708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836618
13364	NC_015436	CGTC	2	8	752767	752774	0 %	25 %	25 %	50 %	330836618
13365	NC_015436	GGA	2	6	752801	752806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836618
13366	NC_015436	CTGG	2	8	752910	752917	0 %	25 %	50 %	25 %	330836618
13367	NC_015436	TGCTT	2	10	752959	752968	0 %	60 %	20 %	20 %	330836618
13368	NC_015436	CGCA	2	8	753126	753133	25 %	0 %	25 %	50 %	330836618
13369	NC_015436	CTT	2	6	753213	753218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836619
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13371	NC_015436	ATC	2	6	753278	753283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836619
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13390	NC_015436	GAAA	2	8	754385	754392	75 %	0 %	25 %	0 %	330836620
13391	NC_015436	AGA	2	6	754393	754398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836620
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13396	NC_015436	AAAAG	2	10	754661	754670	80 %	0 %	20 %	0 %	330836620
13397	NC_015436	GACA	2	8	754708	754715	50 %	0 %	25 %	25 %	330836620
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13403	NC_015436	CGT	2	6	754930	754935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836620
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13410	NC_015436	GTC	2	6	755369	755374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836620
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13414	NC_015436	ATG	2	6	755536	755541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836621
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13422	NC_015436	GCT	2	6	755836	755841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836621
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13425	NC_015436	GCC	2	6	755909	755914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836621
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13429	NC_015436	TCT	2	6	756111	756116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836621
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13435	NC_015436	CTG	2	6	756371	756376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836621
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13441	NC_015436	GATG	2	8	756590	756597	25 %	25 %	50 %	0 %	330836622
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13447	NC_015436	TAG	2	6	756883	756888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836622
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13450	NC_015436	AAG	2	6	757089	757094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836622
13451	NC_015436	CGGCT	2	10	757183	757192	0 %	20 %	40 %	40 %	330836622
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13455	NC_015436	ATG	2	6	757392	757397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836622
13456	NC_015436	TTG	2	6	757541	757546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836622
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13460	NC_015436	GCA	2	6	757947	757952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836623
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13462	NC_015436	TGCC	2	8	757992	757999	0 %	25 %	25 %	50 %	330836623
13463	NC_015436	ATC	2	6	758043	758048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836623
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13465	NC_015436	CA	3	6	758223	758228	50 %	0 %	0 %	50 %	330836623
13466	NC_015436	CAT	2	6	758261	758266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836623
13467	NC_015436	TC	3	6	758281	758286	0 %	50 %	0 %	50 %	330836623
13468	NC_015436	ATG	2	6	758321	758326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836623
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13470	NC_015436	TGA	2	6	758435	758440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836624
13471	NC_015436	TCT	2	6	758468	758473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836624
13472	NC_015436	TCC	2	6	758485	758490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836624
13473	NC_015436	GCT	2	6	758500	758505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836624
13474	NC_015436	TGA	2	6	758552	758557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836624
13475	NC_015436	TCCT	2	8	758564	758571	0 %	50 %	0 %	50 %	330836624
13476	NC_015436	TAT	2	6	758580	758585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836624
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13478	NC_015436	CGG	2	6	758705	758710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836624
13479	NC_015436	TTC	2	6	758751	758756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836624
13480	NC_015436	TTC	2	6	758802	758807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836624
13481	NC_015436	TCTT	2	8	758838	758845	0 %	75 %	0 %	25 %	330836624
13482	NC_015436	GTC	2	6	759010	759015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836624
13483	NC_015436	T	6	6	759084	759089	0 %	100 %	0 %	0 %	330836624
13484	NC_015436	CAT	2	6	759147	759152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836624
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13487	NC_015436	TTCC	2	8	759272	759279	0 %	50 %	0 %	50 %	330836624
13488	NC_015436	CTG	2	6	759393	759398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836625
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13490	NC_015436	CAGT	2	8	759427	759434	25 %	25 %	25 %	25 %	330836625
13491	NC_015436	CT	4	8	759441	759448	0 %	50 %	0 %	50 %	330836625
13492	NC_015436	TCCT	2	8	759469	759476	0 %	50 %	0 %	50 %	330836625
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