MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015436	TTC	2	6	622112	622117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836505
11002	NC_015436	AAAG	2	8	622123	622130	75 %	0 %	25 %	0 %	330836505
11003	NC_015436	A	6	6	622145	622150	100 %	0 %	0 %	0 %	330836505
11004	NC_015436	AG	3	6	622181	622186	50 %	0 %	50 %	0 %	330836505
11005	NC_015436	CCT	2	6	622223	622228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836505
11006	NC_015436	TTCC	2	8	622355	622362	0 %	50 %	0 %	50 %	330836505
11007	NC_015436	TCGC	2	8	622444	622451	0 %	25 %	25 %	50 %	330836505
11008	NC_015436	GCC	2	6	622504	622509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836505
11009	NC_015436	GAT	2	6	622525	622530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
11010	NC_015436	T	6	6	622559	622564	0 %	100 %	0 %	0 %	330836505
11011	NC_015436	GGA	2	6	622575	622580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836505
11012	NC_015436	GGA	2	6	622632	622637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836505
11013	NC_015436	ACA	2	6	622730	622735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
11014	NC_015436	CGCC	2	8	622752	622759	0 %	0 %	25 %	75 %	330836505
11015	NC_015436	GCTTAC	2	12	622761	622772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836505
11016	NC_015436	AGAA	2	8	622792	622799	75 %	0 %	25 %	0 %	330836505
11017	NC_015436	CGG	2	6	622890	622895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836505
11018	NC_015436	AAC	2	6	622934	622939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
11019	NC_015436	TGA	2	6	622943	622948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
11020	NC_015436	CAG	2	6	622975	622980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
11021	NC_015436	ACG	2	6	622991	622996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
11022	NC_015436	TG	3	6	623063	623068	0 %	50 %	50 %	0 %	330836505
11023	NC_015436	ATT	2	6	623151	623156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836505
11024	NC_015436	CTGC	2	8	623163	623170	0 %	25 %	25 %	50 %	330836505
11025	NC_015436	CAT	2	6	623220	623225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836505
11026	NC_015436	CGT	2	6	623256	623261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836505
11027	NC_015436	AAG	2	6	623266	623271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836505
11028	NC_015436	A	6	6	623336	623341	100 %	0 %	0 %	0 %	330836505
11029	NC_015436	GAA	2	6	623385	623390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836505
11030	NC_015436	ACA	2	6	623448	623453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836505
11031	NC_015436	TTCC	2	8	623504	623511	0 %	50 %	0 %	50 %	330836505
11032	NC_015436	TGA	2	6	623550	623555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836505
11033	NC_015436	GAC	2	6	623565	623570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836505
11034	NC_015436	CTTG	2	8	623637	623644	0 %	50 %	25 %	25 %	330836505
11035	NC_015436	GAA	2	6	623803	623808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
11036	NC_015436	AGA	2	6	623814	623819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
11037	NC_015436	ATTC	2	8	623964	623971	25 %	50 %	0 %	25 %	330836506
11038	NC_015436	GAA	2	6	623989	623994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836506
11039	NC_015436	GAT	2	6	624002	624007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
11040	NC_015436	GAT	2	6	624041	624046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
11041	NC_015436	GGC	2	6	624202	624207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836506
11042	NC_015436	GGCG	2	8	624352	624359	0 %	0 %	75 %	25 %	330836506
11043	NC_015436	CGA	2	6	624445	624450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836506
11044	NC_015436	GGA	2	6	624475	624480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836506
11045	NC_015436	GGT	2	6	624506	624511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836506
11046	NC_015436	GGA	2	6	624515	624520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836506
11047	NC_015436	CAGT	2	8	624601	624608	25 %	25 %	25 %	25 %	330836506
11048	NC_015436	TAT	2	6	624659	624664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836506
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11050	NC_015436	A	6	6	624706	624711	100 %	0 %	0 %	0 %	330836506
11051	NC_015436	ATGG	2	8	624815	624822	25 %	25 %	50 %	0 %	330836506
11052	NC_015436	GAT	2	6	624830	624835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836506
11053	NC_015436	TCC	2	6	624849	624854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836506
11054	NC_015436	AT	3	6	624918	624923	50 %	50 %	0 %	0 %	330836507
11055	NC_015436	TGCTCA	3	18	624926	624943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836507
11056	NC_015436	GGC	2	6	624961	624966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
11057	NC_015436	GGC	2	6	625029	625034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
11058	NC_015436	T	6	6	625064	625069	0 %	100 %	0 %	0 %	330836507
11059	NC_015436	TCT	2	6	625122	625127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836507
11060	NC_015436	ACA	2	6	625149	625154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836507
11061	NC_015436	AT	3	6	625188	625193	50 %	50 %	0 %	0 %	330836507
11062	NC_015436	GTT	2	6	625260	625265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836507
11063	NC_015436	GAGG	2	8	625270	625277	25 %	0 %	75 %	0 %	330836507
11064	NC_015436	CTG	2	6	625324	625329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11065	NC_015436	GTC	2	6	625330	625335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11066	NC_015436	GAA	2	6	625348	625353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836507
11067	NC_015436	CTT	2	6	625481	625486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836507
11068	NC_015436	GGT	2	6	625524	625529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836507
11069	NC_015436	CTG	2	6	625580	625585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11070	NC_015436	GGAC	2	8	625605	625612	25 %	0 %	50 %	25 %	330836507
11071	NC_015436	TGC	2	6	625728	625733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11072	NC_015436	TCAC	2	8	625789	625796	25 %	25 %	0 %	50 %	330836507
11073	NC_015436	CAAC	2	8	625831	625838	50 %	0 %	0 %	50 %	330836507
11074	NC_015436	T	7	7	625902	625908	0 %	100 %	0 %	0 %	330836507
11075	NC_015436	GAC	2	6	625923	625928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11076	NC_015436	ACAACC	2	12	625929	625940	50 %	0 %	0 %	50 %	330836507
11077	NC_015436	CTG	2	6	626029	626034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836507
11078	NC_015436	CATC	2	8	626036	626043	25 %	25 %	0 %	50 %	330836507
11079	NC_015436	ACAT	2	8	626047	626054	50 %	25 %	0 %	25 %	330836507
11080	NC_015436	TCA	2	6	626066	626071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836507
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11083	NC_015436	GGC	2	6	626114	626119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836507
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11086	NC_015436	ATG	2	6	626292	626297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836508
11087	NC_015436	T	7	7	626302	626308	0 %	100 %	0 %	0 %	330836508
11088	NC_015436	GAA	2	6	626309	626314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836508
11089	NC_015436	GAAA	2	8	626449	626456	75 %	0 %	25 %	0 %	330836508
11090	NC_015436	ACC	2	6	626537	626542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836508
11091	NC_015436	TCATTT	2	12	626560	626571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836508
11092	NC_015436	GCC	2	6	626597	626602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836508
11093	NC_015436	GCC	2	6	626618	626623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836508
11094	NC_015436	GGT	2	6	626701	626706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836508
11095	NC_015436	ATG	2	6	626709	626714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836508
11096	NC_015436	CAT	2	6	626746	626751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
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11098	NC_015436	ATC	2	6	626822	626827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
11099	NC_015436	AAG	2	6	626858	626863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836508
11100	NC_015436	TCA	2	6	626920	626925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836508
11101	NC_015436	TGC	2	6	626968	626973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836508
11102	NC_015436	CT	3	6	627083	627088	0 %	50 %	0 %	50 %	330836508
11103	NC_015436	GTAA	2	8	627103	627110	50 %	25 %	25 %	0 %	330836508
11104	NC_015436	TCC	2	6	627195	627200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836509
11105	NC_015436	GAT	2	6	627268	627273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11106	NC_015436	TGA	2	6	627280	627285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11107	NC_015436	GAC	2	6	627326	627331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836509
11108	NC_015436	AATG	2	8	627349	627356	50 %	25 %	25 %	0 %	330836509
11109	NC_015436	TGA	2	6	627453	627458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11110	NC_015436	TGA	2	6	627472	627477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11111	NC_015436	AGC	2	6	627579	627584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836509
11112	NC_015436	G	7	7	627601	627607	0 %	0 %	100 %	0 %	330836509
11113	NC_015436	GCC	2	6	627653	627658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836509
11114	NC_015436	TCC	2	6	627698	627703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836509
11115	NC_015436	AATTC	2	10	627714	627723	40 %	40 %	0 %	20 %	330836509
11116	NC_015436	GTCA	2	8	627724	627731	25 %	25 %	25 %	25 %	330836509
11117	NC_015436	TTGC	2	8	627752	627759	0 %	50 %	25 %	25 %	330836509
11118	NC_015436	CTT	2	6	627768	627773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836509
11119	NC_015436	TGA	2	6	627867	627872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11120	NC_015436	ATG	2	6	627908	627913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11121	NC_015436	ATG	2	6	627926	627931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836509
11122	NC_015436	CGGA	2	8	628045	628052	25 %	0 %	50 %	25 %	330836509
11123	NC_015436	TGC	2	6	628074	628079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836509
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11125	NC_015436	GCC	2	6	628307	628312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836509
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11130	NC_015436	CAAG	2	8	628612	628619	50 %	0 %	25 %	25 %	330836510
11131	NC_015436	CCT	2	6	628661	628666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836510
11132	NC_015436	GGC	2	6	628709	628714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836510
11133	NC_015436	GAAAG	2	10	628725	628734	60 %	0 %	40 %	0 %	330836510
11134	NC_015436	GA	3	6	628816	628821	50 %	0 %	50 %	0 %	330836510
11135	NC_015436	TGA	2	6	628849	628854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836510
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11152	NC_015436	ATTC	2	8	629899	629906	25 %	50 %	0 %	25 %	330836511
11153	NC_015436	GAT	2	6	629909	629914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836511
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11157	NC_015436	CGT	2	6	630206	630211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836511
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11227	NC_015436	GC	3	6	634368	634373	0 %	0 %	50 %	50 %	330836516
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11232	NC_015436	GTG	2	6	634553	634558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836516
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11234	NC_015436	TCCT	2	8	634962	634969	0 %	50 %	0 %	50 %	330836517
11235	NC_015436	TTC	2	6	634970	634975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836517
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11237	NC_015436	CTG	2	6	635065	635070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836517
11238	NC_015436	TGAC	2	8	635090	635097	25 %	25 %	25 %	25 %	330836517
11239	NC_015436	GAT	2	6	635146	635151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836517
11240	NC_015436	TCA	2	6	635177	635182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836517
11241	NC_015436	GGA	2	6	635221	635226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836517
11242	NC_015436	ATC	2	6	635240	635245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836517
11243	NC_015436	ATC	2	6	635349	635354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836517
11244	NC_015436	G	6	6	635387	635392	0 %	0 %	100 %	0 %	330836517
11245	NC_015436	ACA	2	6	635410	635415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836517
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11247	NC_015436	CATA	2	8	635703	635710	50 %	25 %	0 %	25 %	330836518
11248	NC_015436	TCT	2	6	635711	635716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836518
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11251	NC_015436	TGGA	2	8	635816	635823	25 %	25 %	50 %	0 %	330836518
11252	NC_015436	TCA	2	6	635845	635850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836518
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11260	NC_015436	TTC	2	6	636161	636166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836519
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11264	NC_015436	ATGG	2	8	636350	636357	25 %	25 %	50 %	0 %	330836519
11265	NC_015436	GAGG	2	8	636865	636872	25 %	0 %	75 %	0 %	330836520
11266	NC_015436	AAT	2	6	636894	636899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836520
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11269	NC_015436	TAG	2	6	636948	636953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836520
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11272	NC_015436	GAT	2	6	636978	636983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836520
11273	NC_015436	GAT	2	6	636990	636995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836520
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11278	NC_015436	AGG	2	6	637405	637410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836521
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11299	NC_015436	GA	3	6	638306	638311	50 %	0 %	50 %	0 %	330836522
11300	NC_015436	CTTG	2	8	638481	638488	0 %	50 %	25 %	25 %	330836522
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11330	NC_015436	TGCC	2	8	641414	641421	0 %	25 %	25 %	50 %	330836525
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11335	NC_015436	ACA	2	6	641771	641776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836525
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11337	NC_015436	CGTCA	2	10	641811	641820	20 %	20 %	20 %	40 %	330836525
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11342	NC_015436	TGA	2	6	642062	642067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836525
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11354	NC_015436	GGCA	2	8	642798	642805	25 %	0 %	50 %	25 %	330836526
11355	NC_015436	TG	3	6	643141	643146	0 %	50 %	50 %	0 %	330836526
11356	NC_015436	TTGAT	2	10	643359	643368	20 %	60 %	20 %	0 %	330836526
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11358	NC_015436	GAG	2	6	643475	643480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836526
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