MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_015436	CAT	2	6	540313	540318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836426
9503	NC_015436	CAC	2	6	540406	540411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836426
9504	NC_015436	TG	3	6	540485	540490	0 %	50 %	50 %	0 %	330836426
9505	NC_015436	ATC	2	6	540494	540499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836426
9506	NC_015436	ACC	2	6	540560	540565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836426
9507	NC_015436	AAT	2	6	540665	540670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836426
9508	NC_015436	GGTA	2	8	540781	540788	25 %	25 %	50 %	0 %	330836426
9509	NC_015436	GTT	2	6	540820	540825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836426
9510	NC_015436	GCG	2	6	540830	540835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836426
9511	NC_015436	CAT	3	9	540937	540945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836426
9512	NC_015436	TTA	2	6	540972	540977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836426
9513	NC_015436	TGCC	2	8	541104	541111	0 %	25 %	25 %	50 %	330836426
9514	NC_015436	CTT	2	6	541115	541120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836426
9515	NC_015436	TCA	3	9	541140	541148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836426
9516	NC_015436	AGGCTC	2	12	541149	541160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330836426
9517	NC_015436	CAA	2	6	541386	541391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836427
9518	NC_015436	ATCG	2	8	541392	541399	25 %	25 %	25 %	25 %	330836427
9519	NC_015436	GGA	2	6	541462	541467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836427
9520	NC_015436	CAAT	2	8	541496	541503	50 %	25 %	0 %	25 %	330836427
9521	NC_015436	ATG	2	6	541508	541513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836427
9522	NC_015436	AACC	2	8	541537	541544	50 %	0 %	0 %	50 %	330836427
9523	NC_015436	TGG	2	6	541610	541615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836427
9524	NC_015436	TTTG	2	8	541669	541676	0 %	75 %	25 %	0 %	330836427
9525	NC_015436	ATC	2	6	541703	541708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836427
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9527	NC_015436	T	6	6	541942	541947	0 %	100 %	0 %	0 %	330836428
9528	NC_015436	CCA	2	6	542017	542022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836428
9529	NC_015436	TTGC	2	8	542045	542052	0 %	50 %	25 %	25 %	330836428
9530	NC_015436	TTCC	2	8	542189	542196	0 %	50 %	0 %	50 %	330836428
9531	NC_015436	GTAT	2	8	542221	542228	25 %	50 %	25 %	0 %	330836428
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9534	NC_015436	GAAG	2	8	542325	542332	50 %	0 %	50 %	0 %	330836428
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9536	NC_015436	GAT	2	6	542598	542603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836429
9537	NC_015436	TCG	2	6	542611	542616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836429
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9539	NC_015436	GTGA	2	8	542874	542881	25 %	25 %	50 %	0 %	330836429
9540	NC_015436	GCT	2	6	542910	542915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836429
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9543	NC_015436	TTGT	2	8	543078	543085	0 %	75 %	25 %	0 %	330836429
9544	NC_015436	GCAA	2	8	543090	543097	50 %	0 %	25 %	25 %	330836429
9545	NC_015436	TGT	2	6	543128	543133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836429
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9551	NC_015436	ACTG	2	8	543373	543380	25 %	25 %	25 %	25 %	330836430
9552	NC_015436	GT	3	6	543503	543508	0 %	50 %	50 %	0 %	330836430
9553	NC_015436	AAT	2	6	543544	543549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836430
9554	NC_015436	CATG	2	8	543577	543584	25 %	25 %	25 %	25 %	330836430
9555	NC_015436	A	6	6	543621	543626	100 %	0 %	0 %	0 %	330836430
9556	NC_015436	GAT	2	6	543912	543917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836431
9557	NC_015436	AAG	2	6	543923	543928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836431
9558	NC_015436	GCG	2	6	543955	543960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836431
9559	NC_015436	GCTT	2	8	543978	543985	0 %	50 %	25 %	25 %	330836431
9560	NC_015436	CTT	2	6	544163	544168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836431
9561	NC_015436	ATG	2	6	544208	544213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836431
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9564	NC_015436	GA	3	6	544327	544332	50 %	0 %	50 %	0 %	330836431
9565	NC_015436	TTCC	2	8	544359	544366	0 %	50 %	0 %	50 %	330836431
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9594	NC_015436	GCCA	2	8	546370	546377	25 %	0 %	25 %	50 %	330836434
9595	NC_015436	TAC	2	6	546449	546454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836434
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9609	NC_015436	ACGCT	2	10	547114	547123	20 %	20 %	20 %	40 %	330836434
9610	NC_015436	AAGA	2	8	547191	547198	75 %	0 %	25 %	0 %	330836434
9611	NC_015436	CCTGA	2	10	547271	547280	20 %	20 %	20 %	40 %	330836434
9612	NC_015436	AGC	2	6	547301	547306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836434
9613	NC_015436	TGGA	2	8	547322	547329	25 %	25 %	50 %	0 %	330836434
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9621	NC_015436	GAA	2	6	547729	547734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836434
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9989	NC_015436	CGA	2	6	566088	566093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836452
9990	NC_015436	TGCCTC	2	12	566120	566131	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330836452
9991	NC_015436	CTG	2	6	566294	566299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836452
9992	NC_015436	CTGT	2	8	566390	566397	0 %	50 %	25 %	25 %	330836452
9993	NC_015436	CAT	3	9	566442	566450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836452
9994	NC_015436	GTC	2	6	566506	566511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836452
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9996	NC_015436	GCC	2	6	566680	566685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836452
9997	NC_015436	GA	3	6	566711	566716	50 %	0 %	50 %	0 %	330836452
9998	NC_015436	GCA	2	6	566731	566736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836453
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