MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 39616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015436	GTC	2	6	319665	319670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836256
5502	NC_015436	TCA	2	6	319673	319678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836256
5503	NC_015436	GAT	2	6	319743	319748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836256
5504	NC_015436	CATG	2	8	319760	319767	25 %	25 %	25 %	25 %	330836256
5505	NC_015436	TGA	2	6	319787	319792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836256
5506	NC_015436	CAG	2	6	319878	319883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836256
5507	NC_015436	CACTT	2	10	319890	319899	20 %	40 %	0 %	40 %	330836256
5508	NC_015436	ATC	2	6	319930	319935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836256
5509	NC_015436	TTG	2	6	320038	320043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836256
5510	NC_015436	TCC	2	6	320092	320097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836256
5511	NC_015436	TGAA	2	8	320156	320163	50 %	25 %	25 %	0 %	330836256
5512	NC_015436	TTCAG	2	10	320182	320191	20 %	40 %	20 %	20 %	330836256
5513	NC_015436	CGA	2	6	320381	320386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836256
5514	NC_015436	GAA	2	6	320403	320408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836256
5515	NC_015436	AGCA	2	8	320430	320437	50 %	0 %	25 %	25 %	330836256
5516	NC_015436	TCC	2	6	320532	320537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836257
5517	NC_015436	GTT	2	6	320549	320554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836257
5518	NC_015436	TGA	2	6	320596	320601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836257
5519	NC_015436	GGA	2	6	320662	320667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836257
5520	NC_015436	GAT	2	6	320671	320676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836257
5521	NC_015436	CGTTC	2	10	320685	320694	0 %	40 %	20 %	40 %	330836257
5522	NC_015436	TC	3	6	320711	320716	0 %	50 %	0 %	50 %	330836257
5523	NC_015436	GCT	2	6	320739	320744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836257
5524	NC_015436	CCGC	2	8	320749	320756	0 %	0 %	25 %	75 %	330836257
5525	NC_015436	AGGGA	2	10	320847	320856	40 %	0 %	60 %	0 %	330836257
5526	NC_015436	CAC	2	6	320879	320884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836257
5527	NC_015436	TCG	3	9	320904	320912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836257
5528	NC_015436	CCGGC	2	10	320950	320959	0 %	0 %	40 %	60 %	330836257
5529	NC_015436	GGA	2	6	320966	320971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836257
5530	NC_015436	TGA	2	6	320998	321003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836257
5531	NC_015436	TCA	3	9	321144	321152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836257
5532	NC_015436	CG	3	6	321158	321163	0 %	0 %	50 %	50 %	330836257
5533	NC_015436	CATT	2	8	321292	321299	25 %	50 %	0 %	25 %	330836257
5534	NC_015436	ATG	2	6	321344	321349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
5535	NC_015436	TTGTTC	2	12	321478	321489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330836258
5536	NC_015436	CCTTG	2	10	321729	321738	0 %	40 %	20 %	40 %	330836258
5537	NC_015436	TGA	2	6	321797	321802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
5538	NC_015436	TGC	2	6	321816	321821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836258
5539	NC_015436	CATTTT	2	12	321831	321842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330836258
5540	NC_015436	T	7	7	321839	321845	0 %	100 %	0 %	0 %	330836258
5541	NC_015436	CCT	2	6	321846	321851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836258
5542	NC_015436	GC	3	6	321882	321887	0 %	0 %	50 %	50 %	330836258
5543	NC_015436	TGA	2	6	321917	321922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
5544	NC_015436	TCA	2	6	321977	321982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836258
5545	NC_015436	TG	3	6	322063	322068	0 %	50 %	50 %	0 %	330836258
5546	NC_015436	GTG	2	6	322099	322104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836258
5547	NC_015436	TGA	2	6	322121	322126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
5548	NC_015436	TTC	2	6	322138	322143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836258
5549	NC_015436	TGA	2	6	322178	322183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
5550	NC_015436	CAG	2	6	322392	322397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836258
5551	NC_015436	AGA	2	6	322506	322511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836258
5552	NC_015436	TCT	2	6	322519	322524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836258
5553	NC_015436	AAC	2	6	322603	322608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836259
5554	NC_015436	A	6	6	322613	322618	100 %	0 %	0 %	0 %	330836259
5555	NC_015436	CAG	2	6	322657	322662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
5556	NC_015436	CT	3	6	322703	322708	0 %	50 %	0 %	50 %	330836259
5557	NC_015436	TCGCCA	2	12	322769	322780	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330836259
5558	NC_015436	GCA	2	6	322799	322804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
5559	NC_015436	CAG	2	6	322848	322853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
5560	NC_015436	ACC	3	9	322854	322862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836259
5561	NC_015436	TGCT	2	8	322945	322952	0 %	50 %	25 %	25 %	330836259
5562	NC_015436	ACA	2	6	322972	322977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836259
5563	NC_015436	GCTT	2	8	322985	322992	0 %	50 %	25 %	25 %	330836259
5564	NC_015436	TGA	2	6	323039	323044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
5565	NC_015436	TCT	2	6	323054	323059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
5566	NC_015436	CCTG	2	8	323063	323070	0 %	25 %	25 %	50 %	330836259
5567	NC_015436	GCC	3	9	323088	323096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836259
5568	NC_015436	ATCT	2	8	323127	323134	25 %	50 %	0 %	25 %	330836259
5569	NC_015436	TGA	2	6	323177	323182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
5570	NC_015436	TTC	2	6	323215	323220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
5571	NC_015436	GCC	2	6	323226	323231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836259
5572	NC_015436	GAC	2	6	323241	323246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
5573	NC_015436	GGTT	2	8	323296	323303	0 %	50 %	50 %	0 %	330836259
5574	NC_015436	TTC	2	6	323324	323329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836259
5575	NC_015436	GA	3	6	323365	323370	50 %	0 %	50 %	0 %	330836259
5576	NC_015436	CCA	2	6	323399	323404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836259
5577	NC_015436	GCA	2	6	323443	323448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836259
5578	NC_015436	TGA	2	6	323450	323455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
5579	NC_015436	GCAG	2	8	323486	323493	25 %	0 %	50 %	25 %	330836259
5580	NC_015436	GAA	2	6	323505	323510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836259
5581	NC_015436	GAA	2	6	323555	323560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836259
5582	NC_015436	TGA	3	9	323562	323570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836259
5583	NC_015436	TGA	2	6	323637	323642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5584	NC_015436	GAT	2	6	323653	323658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5585	NC_015436	ATG	2	6	323726	323731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5586	NC_015436	ATG	3	9	323783	323791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5587	NC_015436	TCC	3	9	323824	323832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836260
5588	NC_015436	AG	3	6	323844	323849	50 %	0 %	50 %	0 %	330836260
5589	NC_015436	GGC	2	6	323920	323925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836260
5590	NC_015436	CGC	2	6	323928	323933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836260
5591	NC_015436	TGT	2	6	323988	323993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836260
5592	NC_015436	TCA	2	6	324180	324185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836260
5593	NC_015436	GCCATG	2	12	324209	324220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330836260
5594	NC_015436	TGA	3	9	324252	324260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5595	NC_015436	GAT	2	6	324274	324279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5596	NC_015436	CAT	2	6	324358	324363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836260
5597	NC_015436	GAT	2	6	324463	324468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836260
5598	NC_015436	CCTTGA	2	12	324696	324707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330836261
5599	NC_015436	ATG	2	6	324797	324802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
5600	NC_015436	TGA	2	6	324806	324811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
5601	NC_015436	GAC	2	6	324815	324820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836261
5602	NC_015436	TGA	2	6	324912	324917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
5603	NC_015436	TGA	2	6	324980	324985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836261
5604	NC_015436	CGC	2	6	325029	325034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836261
5605	NC_015436	GCC	2	6	325126	325131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836261
5606	NC_015436	GCG	2	6	325168	325173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836261
5607	NC_015436	CTC	2	6	325193	325198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836261
5608	NC_015436	GTTG	2	8	325260	325267	0 %	50 %	50 %	0 %	330836261
5609	NC_015436	TGA	2	6	325528	325533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836262
5610	NC_015436	GAT	2	6	325673	325678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836262
5611	NC_015436	AGC	2	6	325741	325746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836262
5612	NC_015436	GAA	2	6	325808	325813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836262
5613	NC_015436	GAA	2	6	325865	325870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836262
5614	NC_015436	CCTGA	2	10	325887	325896	20 %	20 %	20 %	40 %	330836262
5615	NC_015436	T	6	6	325938	325943	0 %	100 %	0 %	0 %	330836263
5616	NC_015436	CGTG	2	8	325946	325953	0 %	25 %	50 %	25 %	330836263
5617	NC_015436	GCA	2	6	326018	326023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836263
5618	NC_015436	GCC	2	6	326085	326090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836263
5619	NC_015436	ACAG	2	8	326169	326176	50 %	0 %	25 %	25 %	330836263
5620	NC_015436	CCG	2	6	326192	326197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836263
5621	NC_015436	CGGAGG	2	12	326252	326263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330836263
5622	NC_015436	CCT	2	6	326279	326284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836263
5623	NC_015436	TTCT	2	8	326325	326332	0 %	75 %	0 %	25 %	330836263
5624	NC_015436	GCA	2	6	326411	326416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836263
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5626	NC_015436	CAT	2	6	326546	326551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836263
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5629	NC_015436	GGA	2	6	326990	326995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836264
5630	NC_015436	GAT	2	6	326997	327002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836264
5631	NC_015436	CT	3	6	327011	327016	0 %	50 %	0 %	50 %	330836264
5632	NC_015436	AGG	2	6	327018	327023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836264
5633	NC_015436	GGC	2	6	327122	327127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836264
5634	NC_015436	GCCA	2	8	327143	327150	25 %	0 %	25 %	50 %	330836264
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5642	NC_015436	AATC	2	8	327920	327927	50 %	25 %	0 %	25 %	330836265
5643	NC_015436	GCA	2	6	327936	327941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836265
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5648	NC_015436	GA	3	6	328238	328243	50 %	0 %	50 %	0 %	330836265
5649	NC_015436	GGA	2	6	328250	328255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836265
5650	NC_015436	CGC	2	6	328341	328346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836265
5651	NC_015436	TGCC	2	8	328370	328377	0 %	25 %	25 %	50 %	330836265
5652	NC_015436	GGC	2	6	328418	328423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836265
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5654	NC_015436	GGA	2	6	328473	328478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836265
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5658	NC_015436	TGA	2	6	328656	328661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836265
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5661	NC_015436	GCA	2	6	328728	328733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836266
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5667	NC_015436	A	6	6	328926	328931	100 %	0 %	0 %	0 %	330836266
5668	NC_015436	GGA	2	6	328977	328982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836266
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5712	NC_015436	TA	3	6	330934	330939	50 %	50 %	0 %	0 %	330836267
5713	NC_015436	GAT	2	6	330963	330968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836267
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5983	NC_015436	ATGG	2	8	345333	345340	25 %	25 %	50 %	0 %	330836279
5984	NC_015436	GAC	2	6	345413	345418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836279
5985	NC_015436	TCT	2	6	345436	345441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836279
5986	NC_015436	GGA	2	6	345543	345548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836279
5987	NC_015436	CGAG	2	8	345553	345560	25 %	0 %	50 %	25 %	330836279
5988	NC_015436	TGA	2	6	345604	345609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836279
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5991	NC_015436	AGG	2	6	345672	345677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836279
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5999	NC_015436	CCT	2	6	346130	346135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836279
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