MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015433	ACA	2	6	236118	236123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832078
4002	NC_015433	A	6	6	236235	236240	100 %	0 %	0 %	0 %	330832079
4003	NC_015433	AGG	2	6	236285	236290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832079
4004	NC_015433	TGAG	2	8	236317	236324	25 %	25 %	50 %	0 %	330832079
4005	NC_015433	GAA	2	6	236325	236330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832079
4006	NC_015433	ATA	2	6	236434	236439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832079
4007	NC_015433	GAT	2	6	236511	236516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832079
4008	NC_015433	TGG	2	6	236528	236533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832079
4009	NC_015433	ATG	2	6	236670	236675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832080
4010	NC_015433	ATC	3	9	236741	236749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832080
4011	NC_015433	ACA	2	6	236820	236825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832080
4012	NC_015433	ATG	2	6	236874	236879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832080
4013	NC_015433	TA	3	6	236966	236971	50 %	50 %	0 %	0 %	330832080
4014	NC_015433	CAGAT	2	10	237000	237009	40 %	20 %	20 %	20 %	330832080
4015	NC_015433	ATCACA	2	12	237035	237046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	330832080
4016	NC_015433	AGG	2	6	237058	237063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832080
4017	NC_015433	CT	3	6	237064	237069	0 %	50 %	0 %	50 %	330832080
4018	NC_015433	ATGT	2	8	237074	237081	25 %	50 %	25 %	0 %	330832080
4019	NC_015433	GAA	2	6	237088	237093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832080
4020	NC_015433	AGA	2	6	237145	237150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832080
4021	NC_015433	GCA	3	9	237166	237174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832080
4022	NC_015433	GAA	2	6	237265	237270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832080
4023	NC_015433	TGAT	2	8	237336	237343	25 %	50 %	25 %	0 %	330832080
4024	NC_015433	GGT	2	6	237355	237360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832080
4025	NC_015433	GAG	2	6	237461	237466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832080
4026	NC_015433	T	7	7	237468	237474	0 %	100 %	0 %	0 %	330832080
4027	NC_015433	CAG	2	6	237501	237506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832080
4028	NC_015433	GATT	2	8	237595	237602	25 %	50 %	25 %	0 %	330832080
4029	NC_015433	AG	3	6	237683	237688	50 %	0 %	50 %	0 %	330832080
4030	NC_015433	AT	4	8	237705	237712	50 %	50 %	0 %	0 %	330832080
4031	NC_015433	ATT	2	6	237764	237769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832080
4032	NC_015433	ATT	2	6	237873	237878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832081
4033	NC_015433	GGA	2	6	237885	237890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832081
4034	NC_015433	AAG	2	6	237929	237934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832081
4035	NC_015433	GTC	2	6	238007	238012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832081
4036	NC_015433	ATG	2	6	238025	238030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832081
4037	NC_015433	T	6	6	238042	238047	0 %	100 %	0 %	0 %	330832081
4038	NC_015433	AAG	2	6	238067	238072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832081
4039	NC_015433	AGG	2	6	238118	238123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832081
4040	NC_015433	AGA	2	6	238164	238169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832081
4041	NC_015433	AGG	2	6	238186	238191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832081
4042	NC_015433	CGG	2	6	238259	238264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832082
4043	NC_015433	TTG	2	6	238304	238309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832082
4044	NC_015433	AGAC	2	8	238341	238348	50 %	0 %	25 %	25 %	330832082
4045	NC_015433	AGA	2	6	238353	238358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832082
4046	NC_015433	GTAC	2	8	238427	238434	25 %	25 %	25 %	25 %	330832082
4047	NC_015433	GAA	2	6	238442	238447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832082
4048	NC_015433	CAG	2	6	238462	238467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832082
4049	NC_015433	A	6	6	238873	238878	100 %	0 %	0 %	0 %	330832083
4050	NC_015433	TTAT	2	8	238887	238894	25 %	75 %	0 %	0 %	330832083
4051	NC_015433	GTCT	2	8	238906	238913	0 %	50 %	25 %	25 %	330832083
4052	NC_015433	GAA	2	6	238996	239001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832083
4053	NC_015433	GAA	2	6	239011	239016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832083
4054	NC_015433	AACAGA	2	12	239076	239087	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330832083
4055	NC_015433	ACT	2	6	239101	239106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832083
4056	NC_015433	ATG	2	6	239114	239119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832083
4057	NC_015433	TAG	2	6	239168	239173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832083
4058	NC_015433	TGT	2	6	239205	239210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832083
4059	NC_015433	TGG	2	6	239264	239269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832083
4060	NC_015433	GACC	2	8	239285	239292	25 %	0 %	25 %	50 %	330832083
4061	NC_015433	TTA	2	6	239345	239350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832083
4062	NC_015433	AGT	2	6	239379	239384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832083
4063	NC_015433	GAG	2	6	239436	239441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832083
4064	NC_015433	T	6	6	239460	239465	0 %	100 %	0 %	0 %	330832083
4065	NC_015433	TGGA	2	8	239471	239478	25 %	25 %	50 %	0 %	330832083
4066	NC_015433	AGG	2	6	239499	239504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832083
4067	NC_015433	GATT	2	8	239519	239526	25 %	50 %	25 %	0 %	330832083
4068	NC_015433	TAT	2	6	239557	239562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832083
4069	NC_015433	T	7	7	239603	239609	0 %	100 %	0 %	0 %	330832083
4070	NC_015433	TAG	2	6	239717	239722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832083
4071	NC_015433	CAT	2	6	239742	239747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832083
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4073	NC_015433	GTCT	2	8	239843	239850	0 %	50 %	25 %	25 %	330832083
4074	NC_015433	TGA	2	6	239874	239879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832083
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4077	NC_015433	CAT	2	6	239997	240002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832083
4078	NC_015433	TA	3	6	240055	240060	50 %	50 %	0 %	0 %	330832083
4079	NC_015433	ATT	3	9	240132	240140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832083
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4082	NC_015433	TTA	2	6	240249	240254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832083
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4087	NC_015433	TCT	2	6	240594	240599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832083
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4090	NC_015433	AACA	2	8	240799	240806	75 %	0 %	0 %	25 %	330832083
4091	NC_015433	A	6	6	240821	240826	100 %	0 %	0 %	0 %	330832083
4092	NC_015433	CGA	2	6	240900	240905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832084
4093	NC_015433	TTGG	2	8	240928	240935	0 %	50 %	50 %	0 %	330832084
4094	NC_015433	ATT	2	6	240966	240971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832084
4095	NC_015433	AGTC	2	8	241130	241137	25 %	25 %	25 %	25 %	330832084
4096	NC_015433	GGA	2	6	241156	241161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832084
4097	NC_015433	ATTTT	2	10	241206	241215	20 %	80 %	0 %	0 %	330832084
4098	NC_015433	TCT	2	6	241249	241254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832084
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4101	NC_015433	CAG	2	6	241413	241418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832084
4102	NC_015433	ATTT	2	8	241452	241459	25 %	75 %	0 %	0 %	330832084
4103	NC_015433	CTA	2	6	241460	241465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832084
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4105	NC_015433	CAG	2	6	241521	241526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832084
4106	NC_015433	CTA	2	6	241567	241572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832084
4107	NC_015433	TAG	2	6	241587	241592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832084
4108	NC_015433	CTTG	2	8	241603	241610	0 %	50 %	25 %	25 %	330832084
4109	NC_015433	T	7	7	241623	241629	0 %	100 %	0 %	0 %	330832084
4110	NC_015433	GCT	2	6	241631	241636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832084
4111	NC_015433	TTATGG	2	12	241716	241727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	330832084
4112	NC_015433	TGG	2	6	241746	241751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832084
4113	NC_015433	TAT	2	6	241778	241783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832084
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4115	NC_015433	ACT	2	6	241839	241844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832084
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4117	NC_015433	AAGC	2	8	241919	241926	50 %	0 %	25 %	25 %	330832084
4118	NC_015433	GC	3	6	241941	241946	0 %	0 %	50 %	50 %	330832084
4119	NC_015433	CAG	2	6	242025	242030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832084
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4121	NC_015433	AAG	2	6	242109	242114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832084
4122	NC_015433	CAAG	2	8	242216	242223	50 %	0 %	25 %	25 %	330832084
4123	NC_015433	ATC	2	6	242286	242291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832084
4124	NC_015433	CTG	2	6	242367	242372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832084
4125	NC_015433	TGAA	2	8	242382	242389	50 %	25 %	25 %	0 %	330832084
4126	NC_015433	TATTT	2	10	242401	242410	20 %	80 %	0 %	0 %	330832084
4127	NC_015433	AGT	2	6	242480	242485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832084
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4129	NC_015433	TAT	2	6	242598	242603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832084
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4131	NC_015433	TTG	2	6	242705	242710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832084
4132	NC_015433	AGCA	2	8	242719	242726	50 %	0 %	25 %	25 %	330832084
4133	NC_015433	AGT	2	6	242753	242758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832084
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4136	NC_015433	ATG	2	6	243016	243021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832085
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4140	NC_015433	GTCT	2	8	243226	243233	0 %	50 %	25 %	25 %	330832085
4141	NC_015433	CTAT	2	8	243253	243260	25 %	50 %	0 %	25 %	330832085
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4156	NC_015433	A	6	6	244515	244520	100 %	0 %	0 %	0 %	330832087
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4163	NC_015433	CTTAC	2	10	245065	245074	20 %	40 %	0 %	40 %	330832087
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4230	NC_015433	GGCTT	2	10	248791	248800	0 %	40 %	40 %	20 %	330832091
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4236	NC_015433	ACC	2	6	249060	249065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832091
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4241	NC_015433	TGG	2	6	249303	249308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832091
4242	NC_015433	AAC	2	6	249372	249377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832091
4243	NC_015433	AAGG	2	8	249385	249392	50 %	0 %	50 %	0 %	330832091
4244	NC_015433	CAT	2	6	249432	249437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832091
4245	NC_015433	GA	3	6	249837	249842	50 %	0 %	50 %	0 %	330832092
4246	NC_015433	T	6	6	249900	249905	0 %	100 %	0 %	0 %	330832092
4247	NC_015433	TAT	2	6	249923	249928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832092
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4249	NC_015433	CAT	2	6	250013	250018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832092
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4490	NC_015433	TTG	2	6	263667	263672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832108
4491	NC_015433	TGG	2	6	263680	263685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832108
4492	NC_015433	CTT	2	6	263744	263749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832108
4493	NC_015433	TGG	2	6	263789	263794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832108
4494	NC_015433	ATC	2	6	264076	264081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832109
4495	NC_015433	GTC	2	6	264227	264232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832109
4496	NC_015433	AGA	2	6	264236	264241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832109
4497	NC_015433	AGTTG	2	10	264276	264285	20 %	40 %	40 %	0 %	330832109
4498	NC_015433	TTG	2	6	264361	264366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832109
4499	NC_015433	TTGA	2	8	264436	264443	25 %	50 %	25 %	0 %	330832109
4500	NC_015433	GTT	2	6	264556	264561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832109

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