MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_015433	GAG	2	6	1861642	1861647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833635
31503	NC_015433	TC	3	6	1861680	1861685	0 %	50 %	0 %	50 %	330833635
31504	NC_015433	CTCC	2	8	1861693	1861700	0 %	25 %	0 %	75 %	330833635
31505	NC_015433	C	6	6	1861715	1861720	0 %	0 %	0 %	100 %	330833635
31506	NC_015433	TCA	3	9	1861772	1861780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833635
31507	NC_015433	TAG	2	6	1861781	1861786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833635
31508	NC_015433	CACG	2	8	1861788	1861795	25 %	0 %	25 %	50 %	330833635
31509	NC_015433	TGT	2	6	1861855	1861860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833635
31510	NC_015433	AAG	2	6	1861892	1861897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833635
31511	NC_015433	ATC	2	6	1862089	1862094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833635
31512	NC_015433	CTT	2	6	1862115	1862120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833635
31513	NC_015433	CGAC	2	8	1862191	1862198	25 %	0 %	25 %	50 %	330833636
31514	NC_015433	CCA	2	6	1862224	1862229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833636
31515	NC_015433	T	6	6	1862311	1862316	0 %	100 %	0 %	0 %	330833636
31516	NC_015433	T	6	6	1862357	1862362	0 %	100 %	0 %	0 %	330833636
31517	NC_015433	CAC	2	6	1862369	1862374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833636
31518	NC_015433	CCT	2	6	1862419	1862424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833636
31519	NC_015433	ATG	2	6	1862448	1862453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833636
31520	NC_015433	TGA	2	6	1862482	1862487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833636
31521	NC_015433	CCG	2	6	1862596	1862601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833636
31522	NC_015433	AGT	2	6	1862608	1862613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833636
31523	NC_015433	TC	3	6	1862626	1862631	0 %	50 %	0 %	50 %	330833636
31524	NC_015433	TTC	2	6	1862840	1862845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833636
31525	NC_015433	TGGGTA	2	12	1862880	1862891	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	330833636
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31528	NC_015433	CGA	2	6	1863050	1863055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833637
31529	NC_015433	CG	4	8	1863113	1863120	0 %	0 %	50 %	50 %	330833637
31530	NC_015433	CCAT	2	8	1863394	1863401	25 %	25 %	0 %	50 %	330833638
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31533	NC_015433	AAG	2	6	1863589	1863594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833638
31534	NC_015433	ATTG	2	8	1863678	1863685	25 %	50 %	25 %	0 %	330833638
31535	NC_015433	ATC	2	6	1863729	1863734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833638
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31539	NC_015433	GTA	2	6	1863889	1863894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833638
31540	NC_015433	TCT	2	6	1863904	1863909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833638
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31542	NC_015433	CTT	2	6	1863953	1863958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833638
31543	NC_015433	ATC	3	9	1863987	1863995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833638
31544	NC_015433	CAA	2	6	1864034	1864039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833638
31545	NC_015433	AAC	2	6	1864140	1864145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833638
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31549	NC_015433	T	7	7	1864242	1864248	0 %	100 %	0 %	0 %	330833638
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31551	NC_015433	T	6	6	1864354	1864359	0 %	100 %	0 %	0 %	330833639
31552	NC_015433	TAT	2	6	1864423	1864428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833639
31553	NC_015433	ATT	2	6	1864438	1864443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833639
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31555	NC_015433	ATC	2	6	1864532	1864537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833639
31556	NC_015433	TTC	2	6	1864574	1864579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833639
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31558	NC_015433	GCT	2	6	1864827	1864832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833639
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31566	NC_015433	GGA	2	6	1865670	1865675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833641
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31569	NC_015433	AAT	2	6	1865831	1865836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833641
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31571	NC_015433	CCTT	2	8	1865971	1865978	0 %	50 %	0 %	50 %	330833641
31572	NC_015433	TTA	2	6	1865995	1866000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833641
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31574	NC_015433	TCAGC	2	10	1866077	1866086	20 %	20 %	20 %	40 %	330833641
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31579	NC_015433	CAT	2	6	1866210	1866215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833641
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31584	NC_015433	TGGGC	2	10	1866464	1866473	0 %	20 %	60 %	20 %	330833641
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31588	NC_015433	TTC	2	6	1866894	1866899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833641
31589	NC_015433	TTGG	2	8	1867001	1867008	0 %	50 %	50 %	0 %	330833642
31590	NC_015433	TGA	2	6	1867023	1867028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833642
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31592	NC_015433	AAC	2	6	1867165	1867170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833642
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31594	NC_015433	AGT	2	6	1867552	1867557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833642
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31600	NC_015433	TTC	2	6	1867969	1867974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833642
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31602	NC_015433	TCTT	2	8	1868087	1868094	0 %	75 %	0 %	25 %	330833642
31603	NC_015433	CCA	2	6	1868126	1868131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833642
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31605	NC_015433	CTAAA	2	10	1868406	1868415	60 %	20 %	0 %	20 %	330833643
31606	NC_015433	CCAAG	2	10	1868451	1868460	40 %	0 %	20 %	40 %	330833643
31607	NC_015433	GTAG	2	8	1868473	1868480	25 %	25 %	50 %	0 %	330833643
31608	NC_015433	TTG	2	6	1868488	1868493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833643
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31610	NC_015433	AT	3	6	1868519	1868524	50 %	50 %	0 %	0 %	330833643
31611	NC_015433	TAAGG	2	10	1868620	1868629	40 %	20 %	40 %	0 %	330833643
31612	NC_015433	A	6	6	1868683	1868688	100 %	0 %	0 %	0 %	330833643
31613	NC_015433	CAA	2	6	1868709	1868714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833643
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