MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_015433	CAC	2	6	1623836	1623841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833410
27503	NC_015433	TCT	2	6	1623857	1623862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833410
27504	NC_015433	ATG	2	6	1623868	1623873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833410
27505	NC_015433	ATTT	2	8	1624164	1624171	25 %	75 %	0 %	0 %	330833411
27506	NC_015433	TCCA	2	8	1624211	1624218	25 %	25 %	0 %	50 %	330833411
27507	NC_015433	CTT	2	6	1624307	1624312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833411
27508	NC_015433	A	6	6	1624339	1624344	100 %	0 %	0 %	0 %	330833411
27509	NC_015433	TTC	2	6	1624361	1624366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833411
27510	NC_015433	ATG	2	6	1624410	1624415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833411
27511	NC_015433	GAA	2	6	1624457	1624462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833411
27512	NC_015433	ATCA	2	8	1624580	1624587	50 %	25 %	0 %	25 %	330833411
27513	NC_015433	ACA	2	6	1624619	1624624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833412
27514	NC_015433	TTGG	2	8	1624627	1624634	0 %	50 %	50 %	0 %	330833412
27515	NC_015433	CCA	2	6	1624635	1624640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833412
27516	NC_015433	T	6	6	1624723	1624728	0 %	100 %	0 %	0 %	330833412
27517	NC_015433	CTG	2	6	1624845	1624850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833412
27518	NC_015433	CTCA	2	8	1624858	1624865	25 %	25 %	0 %	50 %	330833412
27519	NC_015433	CTG	2	6	1624872	1624877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833412
27520	NC_015433	GGGCT	2	10	1624884	1624893	0 %	20 %	60 %	20 %	330833412
27521	NC_015433	CTG	2	6	1624951	1624956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833412
27522	NC_015433	TCA	2	6	1625031	1625036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833412
27523	NC_015433	CCA	2	6	1625102	1625107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833413
27524	NC_015433	ATGGC	2	10	1625126	1625135	20 %	20 %	40 %	20 %	330833413
27525	NC_015433	CAA	2	6	1625278	1625283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833413
27526	NC_015433	AGA	2	6	1625305	1625310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833413
27527	NC_015433	TCG	2	6	1625538	1625543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833413
27528	NC_015433	AGT	2	6	1625659	1625664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833413
27529	NC_015433	ACC	2	6	1625689	1625694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833413
27530	NC_015433	GCCA	2	8	1625728	1625735	25 %	0 %	25 %	50 %	330833413
27531	NC_015433	CAT	2	6	1625787	1625792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833413
27532	NC_015433	TGA	2	6	1625794	1625799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833413
27533	NC_015433	TGA	2	6	1625811	1625816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833413
27534	NC_015433	GCC	2	6	1625864	1625869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833413
27535	NC_015433	TCAT	2	8	1625924	1625931	25 %	50 %	0 %	25 %	330833413
27536	NC_015433	ACC	2	6	1625962	1625967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833413
27537	NC_015433	GATAA	2	10	1625978	1625987	60 %	20 %	20 %	0 %	330833413
27538	NC_015433	CTT	2	6	1626042	1626047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833413
27539	NC_015433	CTC	2	6	1626226	1626231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833413
27540	NC_015433	TAC	3	9	1626271	1626279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833413
27541	NC_015433	GCC	2	6	1626705	1626710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833414
27542	NC_015433	CTTG	2	8	1626743	1626750	0 %	50 %	25 %	25 %	330833414
27543	NC_015433	CTT	2	6	1626776	1626781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833414
27544	NC_015433	CTT	2	6	1626824	1626829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833414
27545	NC_015433	ATA	2	6	1627018	1627023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833414
27546	NC_015433	TTG	2	6	1627162	1627167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833414
27547	NC_015433	CCA	2	6	1627208	1627213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833414
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27549	NC_015433	GCCAA	2	10	1627366	1627375	40 %	0 %	20 %	40 %	330833414
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27551	NC_015433	T	6	6	1627647	1627652	0 %	100 %	0 %	0 %	330833415
27552	NC_015433	AG	3	6	1627751	1627756	50 %	0 %	50 %	0 %	330833415
27553	NC_015433	ATC	2	6	1627789	1627794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833415
27554	NC_015433	GT	3	6	1627874	1627879	0 %	50 %	50 %	0 %	330833415
27555	NC_015433	TCAA	2	8	1627930	1627937	50 %	25 %	0 %	25 %	330833415
27556	NC_015433	AT	3	6	1627999	1628004	50 %	50 %	0 %	0 %	330833415
27557	NC_015433	CAC	2	6	1628006	1628011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833415
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27560	NC_015433	TTGT	2	8	1628202	1628209	0 %	75 %	25 %	0 %	330833415
27561	NC_015433	AAAAG	2	10	1628332	1628341	80 %	0 %	20 %	0 %	330833415
27562	NC_015433	GCT	2	6	1628405	1628410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833416
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27578	NC_015433	ACA	2	6	1629102	1629107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833416
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27604	NC_015433	CT	3	6	1630351	1630356	0 %	50 %	0 %	50 %	330833418
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27967	NC_015433	TCA	2	6	1651636	1651641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833437
27968	NC_015433	GAA	2	6	1651878	1651883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833437
27969	NC_015433	CAT	2	6	1651892	1651897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833437
27970	NC_015433	TGA	2	6	1652030	1652035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833437
27971	NC_015433	ACC	2	6	1652064	1652069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833437
27972	NC_015433	CTT	2	6	1652094	1652099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833437
27973	NC_015433	GTAG	2	8	1652166	1652173	25 %	25 %	50 %	0 %	330833437
27974	NC_015433	GTCC	2	8	1652191	1652198	0 %	25 %	25 %	50 %	330833437
27975	NC_015433	GTCAAT	2	12	1652211	1652222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330833437
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27979	NC_015433	T	6	6	1652517	1652522	0 %	100 %	0 %	0 %	330833437
27980	NC_015433	TCAA	2	8	1652596	1652603	50 %	25 %	0 %	25 %	330833437
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27994	NC_015433	TAG	2	6	1653331	1653336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833437
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27998	NC_015433	AGA	2	6	1653542	1653547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833437
27999	NC_015433	GAT	2	6	1653573	1653578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833437
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