MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_015433	TAT	2	6	1245986	1245991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833025
21003	NC_015433	TC	3	6	1246016	1246021	0 %	50 %	0 %	50 %	330833025
21004	NC_015433	TCA	2	6	1246057	1246062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833025
21005	NC_015433	TCA	2	6	1246102	1246107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833025
21006	NC_015433	T	6	6	1246189	1246194	0 %	100 %	0 %	0 %	330833025
21007	NC_015433	T	6	6	1246218	1246223	0 %	100 %	0 %	0 %	330833025
21008	NC_015433	CTA	2	6	1246256	1246261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833025
21009	NC_015433	TCC	2	6	1246288	1246293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833026
21010	NC_015433	CAA	2	6	1246326	1246331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833026
21011	NC_015433	AAG	2	6	1246338	1246343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833026
21012	NC_015433	ATT	2	6	1246344	1246349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833026
21013	NC_015433	TTGG	2	8	1246450	1246457	0 %	50 %	50 %	0 %	330833026
21014	NC_015433	CAAA	2	8	1246472	1246479	75 %	0 %	0 %	25 %	330833026
21015	NC_015433	A	6	6	1246477	1246482	100 %	0 %	0 %	0 %	330833026
21016	NC_015433	AAT	2	6	1246492	1246497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833026
21017	NC_015433	TCC	2	6	1246555	1246560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833026
21018	NC_015433	TTG	2	6	1246618	1246623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833026
21019	NC_015433	ATT	2	6	1246687	1246692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833026
21020	NC_015433	CAC	2	6	1246806	1246811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833026
21021	NC_015433	GCA	2	6	1246831	1246836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833026
21022	NC_015433	ATT	2	6	1246845	1246850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833026
21023	NC_015433	GAA	2	6	1247549	1247554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833027
21024	NC_015433	GAA	2	6	1247607	1247612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833027
21025	NC_015433	TGAA	2	8	1247666	1247673	50 %	25 %	25 %	0 %	330833027
21026	NC_015433	TA	3	6	1247708	1247713	50 %	50 %	0 %	0 %	330833027
21027	NC_015433	TCA	2	6	1247716	1247721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833027
21028	NC_015433	TCCTCA	2	12	1247728	1247739	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330833027
21029	NC_015433	TAA	2	6	1247819	1247824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833027
21030	NC_015433	A	7	7	1247830	1247836	100 %	0 %	0 %	0 %	330833027
21031	NC_015433	AAG	2	6	1247861	1247866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833027
21032	NC_015433	CATC	2	8	1247952	1247959	25 %	25 %	0 %	50 %	330833027
21033	NC_015433	ACC	2	6	1248066	1248071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833028
21034	NC_015433	C	6	6	1248085	1248090	0 %	0 %	0 %	100 %	330833028
21035	NC_015433	T	6	6	1248186	1248191	0 %	100 %	0 %	0 %	330833028
21036	NC_015433	ATG	2	6	1248204	1248209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833028
21037	NC_015433	ATA	2	6	1248302	1248307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833029
21038	NC_015433	GCAT	2	8	1248330	1248337	25 %	25 %	25 %	25 %	330833029
21039	NC_015433	TCA	2	6	1248367	1248372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833029
21040	NC_015433	CAA	2	6	1248412	1248417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833029
21041	NC_015433	A	6	6	1248532	1248537	100 %	0 %	0 %	0 %	330833029
21042	NC_015433	GAA	2	6	1248542	1248547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833029
21043	NC_015433	CAAC	2	8	1248653	1248660	50 %	0 %	0 %	50 %	330833029
21044	NC_015433	GAA	2	6	1248691	1248696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833029
21045	NC_015433	CA	3	6	1248726	1248731	50 %	0 %	0 %	50 %	330833029
21046	NC_015433	CTT	2	6	1248734	1248739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833029
21047	NC_015433	AAT	2	6	1248762	1248767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833029
21048	NC_015433	TA	3	6	1248823	1248828	50 %	50 %	0 %	0 %	330833030
21049	NC_015433	ATAA	2	8	1248858	1248865	75 %	25 %	0 %	0 %	330833030
21050	NC_015433	CTG	2	6	1248896	1248901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833030
21051	NC_015433	T	6	6	1248943	1248948	0 %	100 %	0 %	0 %	330833031
21052	NC_015433	AGT	2	6	1248994	1248999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833031
21053	NC_015433	AAT	2	6	1249058	1249063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833031
21054	NC_015433	GTT	2	6	1249097	1249102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833031
21055	NC_015433	GTT	2	6	1249119	1249124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833031
21056	NC_015433	T	6	6	1249317	1249322	0 %	100 %	0 %	0 %	330833032
21057	NC_015433	AGG	2	6	1249368	1249373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833032
21058	NC_015433	CTC	2	6	1249398	1249403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833032
21059	NC_015433	ATG	2	6	1249450	1249455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833032
21060	NC_015433	GTA	2	6	1249481	1249486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833032
21061	NC_015433	TCT	2	6	1249599	1249604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833032
21062	NC_015433	ACCTT	2	10	1249612	1249621	20 %	40 %	0 %	40 %	330833032
21063	NC_015433	TAG	2	6	1249765	1249770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833033
21064	NC_015433	T	7	7	1249780	1249786	0 %	100 %	0 %	0 %	330833033
21065	NC_015433	CTTGG	2	10	1249919	1249928	0 %	40 %	40 %	20 %	330833033
21066	NC_015433	TGA	2	6	1249943	1249948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833033
21067	NC_015433	GATA	2	8	1249983	1249990	50 %	25 %	25 %	0 %	330833033
21068	NC_015433	T	6	6	1250062	1250067	0 %	100 %	0 %	0 %	330833033
21069	NC_015433	TAT	2	6	1250227	1250232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833034
21070	NC_015433	TTCT	2	8	1250258	1250265	0 %	75 %	0 %	25 %	330833034
21071	NC_015433	CCA	2	6	1250271	1250276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833034
21072	NC_015433	TCTG	2	8	1250335	1250342	0 %	50 %	25 %	25 %	330833034
21073	NC_015433	AAT	2	6	1250436	1250441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833034
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21075	NC_015433	CT	4	8	1250492	1250499	0 %	50 %	0 %	50 %	330833034
21076	NC_015433	CTG	2	6	1250519	1250524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833034
21077	NC_015433	TCT	2	6	1250560	1250565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833034
21078	NC_015433	GCA	2	6	1250575	1250580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833034
21079	NC_015433	ACA	2	6	1250581	1250586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833034
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21081	NC_015433	GGCCAT	2	12	1250816	1250827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21082	NC_015433	ACC	3	9	1250837	1250845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833035
21083	NC_015433	TGA	2	6	1250875	1250880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833035
21084	NC_015433	CTTG	2	8	1250906	1250913	0 %	50 %	25 %	25 %	330833035
21085	NC_015433	CAAC	2	8	1250947	1250954	50 %	0 %	0 %	50 %	330833035
21086	NC_015433	AGT	2	6	1250968	1250973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833035
21087	NC_015433	ACTTGG	2	12	1251024	1251035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330833035
21088	NC_015433	CAG	2	6	1251088	1251093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21089	NC_015433	GCT	2	6	1251102	1251107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21090	NC_015433	TTTC	2	8	1251109	1251116	0 %	75 %	0 %	25 %	330833035
21091	NC_015433	GCG	2	6	1251193	1251198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833035
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21094	NC_015433	AAGG	2	8	1251251	1251258	50 %	0 %	50 %	0 %	330833035
21095	NC_015433	CTT	3	9	1251307	1251315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
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21099	NC_015433	CTT	2	6	1251409	1251414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21100	NC_015433	CTT	3	9	1251520	1251528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21101	NC_015433	ACG	2	6	1251533	1251538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21102	NC_015433	TTC	2	6	1251542	1251547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21103	NC_015433	GGA	2	6	1251583	1251588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833035
21104	NC_015433	ATA	2	6	1251633	1251638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833035
21105	NC_015433	TG	3	6	1251671	1251676	0 %	50 %	50 %	0 %	330833035
21106	NC_015433	TTC	2	6	1251678	1251683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21107	NC_015433	GT	3	6	1251718	1251723	0 %	50 %	50 %	0 %	330833035
21108	NC_015433	TG	3	6	1251761	1251766	0 %	50 %	50 %	0 %	330833035
21109	NC_015433	CAA	2	6	1251811	1251816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833035
21110	NC_015433	ACC	2	6	1251860	1251865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833035
21111	NC_015433	AGG	2	6	1251900	1251905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833035
21112	NC_015433	GCTT	2	8	1251962	1251969	0 %	50 %	25 %	25 %	330833035
21113	NC_015433	AGC	2	6	1252013	1252018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21114	NC_015433	ACC	2	6	1252046	1252051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833035
21115	NC_015433	GCACGG	2	12	1252065	1252076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330833035
21116	NC_015433	TTG	2	6	1252079	1252084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833035
21117	NC_015433	TTC	2	6	1252145	1252150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21118	NC_015433	CTG	2	6	1252225	1252230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833035
21119	NC_015433	CTT	2	6	1252294	1252299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
21120	NC_015433	TCT	2	6	1252312	1252317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
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21129	NC_015433	TCT	2	6	1252800	1252805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833035
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21148	NC_015433	TGT	2	6	1254431	1254436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833037
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21230	NC_015433	GCT	2	6	1258708	1258713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833041
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21349	NC_015433	TCA	2	6	1265413	1265418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833047
21350	NC_015433	TGC	2	6	1265500	1265505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833048
21351	NC_015433	GTT	2	6	1265507	1265512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833048
21352	NC_015433	TTCA	2	8	1265543	1265550	25 %	50 %	0 %	25 %	330833048
21353	NC_015433	GATAT	2	10	1265646	1265655	40 %	40 %	20 %	0 %	330833048
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21380	NC_015433	A	6	6	1267316	1267321	100 %	0 %	0 %	0 %	330833049
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21460	NC_015433	TGTT	2	8	1272359	1272366	0 %	75 %	25 %	0 %	330833054
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21463	NC_015433	CAT	2	6	1272568	1272573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833054
21464	NC_015433	CGA	2	6	1272586	1272591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833054
21465	NC_015433	TCT	2	6	1272603	1272608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833054
21466	NC_015433	CAT	2	6	1272679	1272684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833054
21467	NC_015433	CAT	2	6	1272781	1272786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833054
21468	NC_015433	T	6	6	1272793	1272798	0 %	100 %	0 %	0 %	330833054
21469	NC_015433	TCAA	2	8	1272921	1272928	50 %	25 %	0 %	25 %	330833054
21470	NC_015433	CCA	2	6	1272948	1272953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330833054
21471	NC_015433	CTG	2	6	1272955	1272960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833054
21472	NC_015433	CAG	2	6	1272961	1272966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833054
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21475	NC_015433	CAT	2	6	1273158	1273163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833055
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21480	NC_015433	T	6	6	1273541	1273546	0 %	100 %	0 %	0 %	330833055
21481	NC_015433	AGC	2	6	1273555	1273560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833055
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21485	NC_015433	AAG	2	6	1273862	1273867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833055
21486	NC_015433	CCTGC	2	10	1273908	1273917	0 %	20 %	20 %	60 %	330833055
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21491	NC_015433	ATA	2	6	1274222	1274227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833055
21492	NC_015433	CAA	2	6	1274400	1274405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833056
21493	NC_015433	GTT	2	6	1274419	1274424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833056
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21496	NC_015433	CTT	2	6	1274828	1274833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833057
21497	NC_015433	TA	3	6	1274834	1274839	50 %	50 %	0 %	0 %	330833057
21498	NC_015433	TTA	2	6	1274854	1274859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833057
21499	NC_015433	ATG	2	6	1274932	1274937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833057
21500	NC_015433	TTG	2	6	1274961	1274966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833057

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