MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015433	GTT	2	6	1134825	1134830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832917
19002	NC_015433	ATACC	2	10	1134834	1134843	40 %	20 %	0 %	40 %	330832917
19003	NC_015433	AATC	2	8	1134903	1134910	50 %	25 %	0 %	25 %	330832917
19004	NC_015433	ACCAGA	2	12	1134979	1134990	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330832917
19005	NC_015433	ATT	2	6	1135039	1135044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832917
19006	NC_015433	T	6	6	1135051	1135056	0 %	100 %	0 %	0 %	330832917
19007	NC_015433	TCAA	2	8	1135198	1135205	50 %	25 %	0 %	25 %	330832918
19008	NC_015433	AGA	2	6	1135217	1135222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832918
19009	NC_015433	GCT	2	6	1135246	1135251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832918
19010	NC_015433	CTT	2	6	1135290	1135295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832918
19011	NC_015433	TCT	2	6	1135312	1135317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832918
19012	NC_015433	GCT	2	6	1135480	1135485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832918
19013	NC_015433	CAA	2	6	1135502	1135507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832918
19014	NC_015433	TCAT	2	8	1135711	1135718	25 %	50 %	0 %	25 %	330832918
19015	NC_015433	ATTTT	2	10	1135780	1135789	20 %	80 %	0 %	0 %	330832918
19016	NC_015433	T	7	7	1135786	1135792	0 %	100 %	0 %	0 %	330832918
19017	NC_015433	TTG	2	6	1135853	1135858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832918
19018	NC_015433	T	6	6	1135922	1135927	0 %	100 %	0 %	0 %	330832918
19019	NC_015433	GCT	2	6	1135951	1135956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832919
19020	NC_015433	GCT	2	6	1136035	1136040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832919
19021	NC_015433	CAG	2	6	1136045	1136050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832919
19022	NC_015433	CTGA	2	8	1136189	1136196	25 %	25 %	25 %	25 %	330832919
19023	NC_015433	GCT	2	6	1136215	1136220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832919
19024	NC_015433	AAC	2	6	1136289	1136294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832919
19025	NC_015433	AAC	2	6	1136460	1136465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832919
19026	NC_015433	CAAA	2	8	1136480	1136487	75 %	0 %	0 %	25 %	330832919
19027	NC_015433	ACGG	2	8	1136497	1136504	25 %	0 %	50 %	25 %	330832919
19028	NC_015433	T	6	6	1136556	1136561	0 %	100 %	0 %	0 %	330832919
19029	NC_015433	AAAT	2	8	1136575	1136582	75 %	25 %	0 %	0 %	330832919
19030	NC_015433	GAA	2	6	1136634	1136639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832919
19031	NC_015433	ACC	2	6	1136664	1136669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832919
19032	NC_015433	A	6	6	1136701	1136706	100 %	0 %	0 %	0 %	330832919
19033	NC_015433	T	6	6	1136820	1136825	0 %	100 %	0 %	0 %	330832919
19034	NC_015433	CT	3	6	1136848	1136853	0 %	50 %	0 %	50 %	330832920
19035	NC_015433	TAA	2	6	1136856	1136861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832920
19036	NC_015433	TCA	2	6	1136889	1136894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832920
19037	NC_015433	GTT	2	6	1136926	1136931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832920
19038	NC_015433	GCT	2	6	1136990	1136995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832920
19039	NC_015433	ACT	2	6	1137317	1137322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832920
19040	NC_015433	ACCA	2	8	1137358	1137365	50 %	0 %	0 %	50 %	330832920
19041	NC_015433	CAC	2	6	1137396	1137401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832920
19042	NC_015433	CTG	2	6	1137429	1137434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832920
19043	NC_015433	CAA	2	6	1137456	1137461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832920
19044	NC_015433	CAA	2	6	1137576	1137581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832920
19045	NC_015433	AAAATC	2	12	1137611	1137622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330832920
19046	NC_015433	CAA	2	6	1137627	1137632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832920
19047	NC_015433	CAAT	2	8	1137639	1137646	50 %	25 %	0 %	25 %	330832920
19048	NC_015433	TTACC	2	10	1137666	1137675	20 %	40 %	0 %	40 %	330832920
19049	NC_015433	GTT	2	6	1137726	1137731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832920
19050	NC_015433	CAT	2	6	1137849	1137854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832921
19051	NC_015433	TTC	2	6	1137867	1137872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832921
19052	NC_015433	TTG	2	6	1137935	1137940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832921
19053	NC_015433	CAG	2	6	1137950	1137955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832921
19054	NC_015433	ATC	2	6	1137993	1137998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832921
19055	NC_015433	TAGG	2	8	1138014	1138021	25 %	25 %	50 %	0 %	330832921
19056	NC_015433	CAA	2	6	1138043	1138048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832921
19057	NC_015433	TCCA	2	8	1138101	1138108	25 %	25 %	0 %	50 %	330832921
19058	NC_015433	ACC	2	6	1138182	1138187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832921
19059	NC_015433	TCT	2	6	1138234	1138239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832921
19060	NC_015433	GTA	2	6	1138240	1138245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832921
19061	NC_015433	GCTACT	2	12	1138291	1138302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330832921
19062	NC_015433	CAA	2	6	1138310	1138315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832921
19063	NC_015433	CCA	2	6	1138414	1138419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832921
19064	NC_015433	CTG	3	9	1138466	1138474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832921
19065	NC_015433	CAA	2	6	1138478	1138483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832921
19066	NC_015433	CTC	2	6	1138523	1138528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832921
19067	NC_015433	GATC	2	8	1138529	1138536	25 %	25 %	25 %	25 %	330832921
19068	NC_015433	AAG	2	6	1138538	1138543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832921
19069	NC_015433	AAC	2	6	1138544	1138549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832921
19070	NC_015433	TAC	2	6	1138562	1138567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832921
19071	NC_015433	T	8	8	1138603	1138610	0 %	100 %	0 %	0 %	330832921
19072	NC_015433	ATTT	2	8	1138743	1138750	25 %	75 %	0 %	0 %	330832922
19073	NC_015433	TTC	2	6	1138903	1138908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832922
19074	NC_015433	T	7	7	1138983	1138989	0 %	100 %	0 %	0 %	330832922
19075	NC_015433	GTAG	2	8	1139061	1139068	25 %	25 %	50 %	0 %	330832922
19076	NC_015433	AG	3	6	1139139	1139144	50 %	0 %	50 %	0 %	330832922
19077	NC_015433	T	6	6	1139185	1139190	0 %	100 %	0 %	0 %	330832922
19078	NC_015433	CTGA	2	8	1139191	1139198	25 %	25 %	25 %	25 %	330832922
19079	NC_015433	TGG	2	6	1139249	1139254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832922
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19081	NC_015433	CCATT	2	10	1139295	1139304	20 %	40 %	0 %	40 %	330832922
19082	NC_015433	ACT	2	6	1139357	1139362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832922
19083	NC_015433	ACC	2	6	1139410	1139415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832922
19084	NC_015433	AAGT	2	8	1139722	1139729	50 %	25 %	25 %	0 %	330832922
19085	NC_015433	TCC	2	6	1139740	1139745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832922
19086	NC_015433	CTTT	2	8	1139927	1139934	0 %	75 %	0 %	25 %	330832922
19087	NC_015433	A	6	6	1139983	1139988	100 %	0 %	0 %	0 %	330832922
19088	NC_015433	AT	3	6	1140056	1140061	50 %	50 %	0 %	0 %	330832923
19089	NC_015433	AAT	2	6	1140174	1140179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832923
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19091	NC_015433	AAG	2	6	1140212	1140217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832923
19092	NC_015433	CTTC	2	8	1140232	1140239	0 %	50 %	0 %	50 %	330832923
19093	NC_015433	GAAT	2	8	1140420	1140427	50 %	25 %	25 %	0 %	330832923
19094	NC_015433	CTC	2	6	1140428	1140433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832923
19095	NC_015433	CAT	2	6	1140458	1140463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832923
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19097	NC_015433	GT	3	6	1140687	1140692	0 %	50 %	50 %	0 %	330832923
19098	NC_015433	TTC	2	6	1140717	1140722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832923
19099	NC_015433	ATC	2	6	1140732	1140737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832923
19100	NC_015433	AGC	2	6	1140838	1140843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832924
19101	NC_015433	AAC	2	6	1140847	1140852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832924
19102	NC_015433	AAC	2	6	1140922	1140927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832924
19103	NC_015433	A	6	6	1141004	1141009	100 %	0 %	0 %	0 %	330832924
19104	NC_015433	TCTT	2	8	1141086	1141093	0 %	75 %	0 %	25 %	330832925
19105	NC_015433	T	6	6	1141120	1141125	0 %	100 %	0 %	0 %	330832925
19106	NC_015433	GAA	2	6	1141151	1141156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832925
19107	NC_015433	AAT	2	6	1141209	1141214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832925
19108	NC_015433	GCT	2	6	1141259	1141264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832925
19109	NC_015433	TCA	2	6	1141276	1141281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832925
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19111	NC_015433	ATA	2	6	1141396	1141401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832925
19112	NC_015433	AATCT	2	10	1141565	1141574	40 %	40 %	0 %	20 %	330832926
19113	NC_015433	T	7	7	1141612	1141618	0 %	100 %	0 %	0 %	330832926
19114	NC_015433	TAA	2	6	1141628	1141633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832926
19115	NC_015433	TCA	2	6	1141647	1141652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832926
19116	NC_015433	ACCA	2	8	1141745	1141752	50 %	0 %	0 %	50 %	330832926
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19118	NC_015433	GAA	2	6	1141853	1141858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832926
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19225	NC_015433	GAAC	2	8	1147176	1147183	50 %	0 %	25 %	25 %	330832933
19226	NC_015433	CT	3	6	1147218	1147223	0 %	50 %	0 %	50 %	330832933
19227	NC_015433	TAG	2	6	1147234	1147239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832933
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19230	NC_015433	CTG	2	6	1147406	1147411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832933
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19232	NC_015433	TAA	2	6	1147610	1147615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832933
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19468	NC_015433	TC	3	6	1161463	1161468	0 %	50 %	0 %	50 %	330832948
19469	NC_015433	GCTG	2	8	1161533	1161540	0 %	25 %	50 %	25 %	330832948
19470	NC_015433	TGGA	2	8	1161603	1161610	25 %	25 %	50 %	0 %	330832948
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19474	NC_015433	ATG	2	6	1162005	1162010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832948
19475	NC_015433	CTAG	2	8	1162017	1162024	25 %	25 %	25 %	25 %	330832948
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19498	NC_015433	CAT	2	6	1163487	1163492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832951
19499	NC_015433	TCT	2	6	1163618	1163623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832951
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