MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_015433	TCAGG	2	10	1044375	1044384	20 %	20 %	40 %	20 %	330832832
17503	NC_015433	TCT	2	6	1044386	1044391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17504	NC_015433	TGA	2	6	1044402	1044407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832832
17505	NC_015433	CGT	2	6	1044474	1044479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832832
17506	NC_015433	CTT	2	6	1044582	1044587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17507	NC_015433	T	6	6	1044586	1044591	0 %	100 %	0 %	0 %	330832832
17508	NC_015433	CTT	2	6	1044606	1044611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17509	NC_015433	TCG	2	6	1044633	1044638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832832
17510	NC_015433	CAT	2	6	1044652	1044657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832832
17511	NC_015433	ACA	2	6	1044659	1044664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832832
17512	NC_015433	ACC	2	6	1044673	1044678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832832
17513	NC_015433	GCT	2	6	1044680	1044685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832832
17514	NC_015433	TCT	2	6	1044710	1044715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17515	NC_015433	ATCA	2	8	1044790	1044797	50 %	25 %	0 %	25 %	330832832
17516	NC_015433	CTT	2	6	1044798	1044803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17517	NC_015433	TCT	2	6	1044812	1044817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832832
17518	NC_015433	TAA	2	6	1044919	1044924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832832
17519	NC_015433	CTA	2	6	1044964	1044969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832833
17520	NC_015433	CAAT	2	8	1044977	1044984	50 %	25 %	0 %	25 %	330832833
17521	NC_015433	GGTT	2	8	1045104	1045111	0 %	50 %	50 %	0 %	330832833
17522	NC_015433	T	6	6	1045120	1045125	0 %	100 %	0 %	0 %	330832833
17523	NC_015433	ACA	2	6	1045157	1045162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832833
17524	NC_015433	ACC	2	6	1045181	1045186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832833
17525	NC_015433	TAA	2	6	1045188	1045193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832833
17526	NC_015433	CTG	2	6	1045245	1045250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832833
17527	NC_015433	ATC	2	6	1045330	1045335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832833
17528	NC_015433	ACT	2	6	1045451	1045456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832833
17529	NC_015433	GTT	2	6	1045475	1045480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832833
17530	NC_015433	GCA	2	6	1045487	1045492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832833
17531	NC_015433	CCA	2	6	1045523	1045528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832833
17532	NC_015433	TGAT	2	8	1045550	1045557	25 %	50 %	25 %	0 %	330832833
17533	NC_015433	AAT	2	6	1045566	1045571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832833
17534	NC_015433	TTC	2	6	1045670	1045675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832834
17535	NC_015433	TCA	2	6	1045722	1045727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832834
17536	NC_015433	GAT	2	6	1045750	1045755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832834
17537	NC_015433	GCCA	2	8	1045770	1045777	25 %	0 %	25 %	50 %	330832834
17538	NC_015433	GAA	2	6	1045849	1045854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832834
17539	NC_015433	AGG	2	6	1045863	1045868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832834
17540	NC_015433	TGA	2	6	1045896	1045901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832834
17541	NC_015433	GAC	2	6	1046070	1046075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832834
17542	NC_015433	CTA	2	6	1046103	1046108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832834
17543	NC_015433	TCA	2	6	1046130	1046135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832834
17544	NC_015433	AAT	2	6	1046144	1046149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832834
17545	NC_015433	A	6	6	1046155	1046160	100 %	0 %	0 %	0 %	330832834
17546	NC_015433	ACG	2	6	1046194	1046199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832834
17547	NC_015433	TCCA	2	8	1046227	1046234	25 %	25 %	0 %	50 %	330832834
17548	NC_015433	AG	3	6	1046331	1046336	50 %	0 %	50 %	0 %	330832834
17549	NC_015433	CTT	2	6	1046340	1046345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832834
17550	NC_015433	CAT	2	6	1046436	1046441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832834
17551	NC_015433	CTT	2	6	1046520	1046525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832834
17552	NC_015433	AT	3	6	1046732	1046737	50 %	50 %	0 %	0 %	330832835
17553	NC_015433	AAT	2	6	1046769	1046774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832835
17554	NC_015433	GCT	3	9	1046885	1046893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832835
17555	NC_015433	T	6	6	1046946	1046951	0 %	100 %	0 %	0 %	330832835
17556	NC_015433	CTG	2	6	1047069	1047074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832835
17557	NC_015433	ACCTCA	2	12	1047092	1047103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330832835
17558	NC_015433	TTC	3	9	1047109	1047117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832835
17559	NC_015433	TCAA	2	8	1047140	1047147	50 %	25 %	0 %	25 %	330832835
17560	NC_015433	ATA	2	6	1047296	1047301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832835
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17563	NC_015433	CAT	2	6	1047550	1047555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832836
17564	NC_015433	ATG	2	6	1047624	1047629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832836
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17567	NC_015433	CTG	2	6	1047863	1047868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832837
17568	NC_015433	CAC	2	6	1047899	1047904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832837
17569	NC_015433	CA	3	6	1047931	1047936	50 %	0 %	0 %	50 %	330832837
17570	NC_015433	CTT	2	6	1048007	1048012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832837
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17577	NC_015433	ATA	2	6	1048306	1048311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832837
17578	NC_015433	ATA	2	6	1048326	1048331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832837
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17583	NC_015433	AAT	2	6	1048703	1048708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832838
17584	NC_015433	CAT	2	6	1048775	1048780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832838
17585	NC_015433	CCG	2	6	1048795	1048800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832838
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17587	NC_015433	AAT	2	6	1048820	1048825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832838
17588	NC_015433	CTG	2	6	1048882	1048887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832838
17589	NC_015433	TCC	2	6	1048898	1048903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832838
17590	NC_015433	ACCA	2	8	1048952	1048959	50 %	0 %	0 %	50 %	330832838
17591	NC_015433	ATC	2	6	1048968	1048973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832838
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17599	NC_015433	AGC	2	6	1049482	1049487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832838
17600	NC_015433	ATG	2	6	1049499	1049504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832838
17601	NC_015433	TATCA	2	10	1049549	1049558	40 %	40 %	0 %	20 %	330832838
17602	NC_015433	CCT	2	6	1049560	1049565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832839
17603	NC_015433	CCTT	2	8	1049598	1049605	0 %	50 %	0 %	50 %	330832839
17604	NC_015433	ACA	2	6	1049649	1049654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832839
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17609	NC_015433	TGAC	2	8	1049923	1049930	25 %	25 %	25 %	25 %	330832839
17610	NC_015433	CCA	2	6	1049971	1049976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832839
17611	NC_015433	GGA	2	6	1049979	1049984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832839
17612	NC_015433	TCC	2	6	1049993	1049998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832839
17613	NC_015433	ATG	2	6	1050003	1050008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832839
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17615	NC_015433	AAT	2	6	1050134	1050139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832839
17616	NC_015433	ATC	2	6	1050203	1050208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832839
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17618	NC_015433	ATC	2	6	1050333	1050338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832839
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17647	NC_015433	A	6	6	1052059	1052064	100 %	0 %	0 %	0 %	330832841
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17730	NC_015433	TCT	2	6	1057135	1057140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832844
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