MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015433	GTT	2	6	604706	604711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832426
10003	NC_015433	TCAA	2	8	604747	604754	50 %	25 %	0 %	25 %	330832426
10004	NC_015433	AGA	2	6	604786	604791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832426
10005	NC_015433	GTC	2	6	604836	604841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832426
10006	NC_015433	TTGA	2	8	605006	605013	25 %	50 %	25 %	0 %	330832426
10007	NC_015433	GTC	2	6	605132	605137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832426
10008	NC_015433	CGT	2	6	605306	605311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832426
10009	NC_015433	CTGT	2	8	605570	605577	0 %	50 %	25 %	25 %	330832426
10010	NC_015433	ATTG	2	8	605581	605588	25 %	50 %	25 %	0 %	330832426
10011	NC_015433	A	6	6	605646	605651	100 %	0 %	0 %	0 %	330832427
10012	NC_015433	TCT	2	6	605678	605683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832427
10013	NC_015433	AGA	2	6	605710	605715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832427
10014	NC_015433	CTT	2	6	605731	605736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832427
10015	NC_015433	ACC	2	6	605754	605759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832427
10016	NC_015433	TAC	2	6	605786	605791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832427
10017	NC_015433	ACC	2	6	605846	605851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832427
10018	NC_015433	CGA	2	6	605855	605860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832427
10019	NC_015433	AAT	2	6	605892	605897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832427
10020	NC_015433	TTA	2	6	605945	605950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832427
10021	NC_015433	G	6	6	606029	606034	0 %	0 %	100 %	0 %	330832427
10022	NC_015433	ATA	2	6	606058	606063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832427
10023	NC_015433	GGA	2	6	606113	606118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832427
10024	NC_015433	CAAT	2	8	606175	606182	50 %	25 %	0 %	25 %	330832427
10025	NC_015433	TTA	2	6	606210	606215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832427
10026	NC_015433	GCT	2	6	606264	606269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832427
10027	NC_015433	GAC	2	6	606273	606278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832427
10028	NC_015433	TAT	2	6	606300	606305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832427
10029	NC_015433	A	6	6	606390	606395	100 %	0 %	0 %	0 %	330832427
10030	NC_015433	TTCC	2	8	606526	606533	0 %	50 %	0 %	50 %	330832428
10031	NC_015433	ATT	2	6	606665	606670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832428
10032	NC_015433	GCT	2	6	606686	606691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832428
10033	NC_015433	TAG	2	6	606721	606726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832428
10034	NC_015433	AAG	2	6	606858	606863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832428
10035	NC_015433	CAGG	2	8	606881	606888	25 %	0 %	50 %	25 %	330832428
10036	NC_015433	TGAAA	2	10	606934	606943	60 %	20 %	20 %	0 %	330832428
10037	NC_015433	TAA	2	6	606953	606958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832428
10038	NC_015433	ATC	2	6	607277	607282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832429
10039	NC_015433	TTC	2	6	607289	607294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832429
10040	NC_015433	GCA	2	6	607311	607316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832429
10041	NC_015433	CATA	2	8	607329	607336	50 %	25 %	0 %	25 %	330832429
10042	NC_015433	TAA	2	6	607357	607362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832429
10043	NC_015433	AAG	2	6	607367	607372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832429
10044	NC_015433	AACC	2	8	607374	607381	50 %	0 %	0 %	50 %	330832429
10045	NC_015433	TCA	2	6	607426	607431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832429
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10047	NC_015433	ATC	2	6	607662	607667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832429
10048	NC_015433	AGT	2	6	607707	607712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832429
10049	NC_015433	ATG	2	6	607804	607809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832429
10050	NC_015433	TGA	2	6	607828	607833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832429
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10052	NC_015433	TAG	2	6	607874	607879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832429
10053	NC_015433	GA	3	6	607969	607974	50 %	0 %	50 %	0 %	330832429
10054	NC_015433	GATA	2	8	608026	608033	50 %	25 %	25 %	0 %	330832429
10055	NC_015433	AAGA	2	8	608579	608586	75 %	0 %	25 %	0 %	330832430
10056	NC_015433	CA	3	6	608591	608596	50 %	0 %	0 %	50 %	330832430
10057	NC_015433	GAA	2	6	608696	608701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832430
10058	NC_015433	TGG	2	6	608772	608777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832430
10059	NC_015433	CTGA	2	8	608825	608832	25 %	25 %	25 %	25 %	330832430
10060	NC_015433	GGT	2	6	608837	608842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832430
10061	NC_015433	AGA	2	6	608881	608886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832430
10062	NC_015433	GTA	2	6	608916	608921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832430
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10064	NC_015433	TGA	2	6	608992	608997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832430
10065	NC_015433	A	7	7	609031	609037	100 %	0 %	0 %	0 %	330832430
10066	NC_015433	CCG	2	6	609085	609090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832430
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10070	NC_015433	ATGAA	2	10	609228	609237	60 %	20 %	20 %	0 %	330832430
10071	NC_015433	TTGA	2	8	609317	609324	25 %	50 %	25 %	0 %	330832430
10072	NC_015433	CGA	2	6	609526	609531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832430
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10077	NC_015433	GCAGAT	2	12	609760	609771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330832431
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10085	NC_015433	AGCG	2	8	610281	610288	25 %	0 %	50 %	25 %	330832432
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10088	NC_015433	CGACAG	2	12	610398	610409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832432
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10091	NC_015433	AAT	2	6	610597	610602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330832432
10092	NC_015433	TCAGTT	2	12	610604	610615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330832432
10093	NC_015433	AACC	2	8	610638	610645	50 %	0 %	0 %	50 %	330832432
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10095	NC_015433	TCA	2	6	610694	610699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832432
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10102	NC_015433	CG	3	6	611390	611395	0 %	0 %	50 %	50 %	330832433
10103	NC_015433	A	6	6	611434	611439	100 %	0 %	0 %	0 %	330832433
10104	NC_015433	AAG	2	6	611503	611508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832433
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10107	NC_015433	ATG	2	6	611633	611638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832433
10108	NC_015433	AGAA	2	8	611639	611646	75 %	0 %	25 %	0 %	330832433
10109	NC_015433	GACA	2	8	611712	611719	50 %	0 %	25 %	25 %	330832433
10110	NC_015433	AAC	2	6	611854	611859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832433
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10112	NC_015433	AGA	2	6	612060	612065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832433
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10115	NC_015433	TGA	2	6	612144	612149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832433
10116	NC_015433	ATCA	2	8	612190	612197	50 %	25 %	0 %	25 %	330832433
10117	NC_015433	TTTACG	2	12	612759	612770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330832434
10118	NC_015433	AAC	2	6	612775	612780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832434
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10120	NC_015433	T	6	6	612899	612904	0 %	100 %	0 %	0 %	330832434
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10242	NC_015433	ACC	2	6	619690	619695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832440
10243	NC_015433	AAG	2	6	619735	619740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832440
10244	NC_015433	CGT	2	6	619785	619790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
10245	NC_015433	CCA	2	6	619851	619856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832440
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10260	NC_015433	TTGG	2	8	620588	620595	0 %	50 %	50 %	0 %	330832440
10261	NC_015433	TCG	2	6	620770	620775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832440
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10482	NC_015433	TCC	2	6	636979	636984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832457
10483	NC_015433	CCA	2	6	637006	637011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832457
10484	NC_015433	GT	3	6	637048	637053	0 %	50 %	50 %	0 %	330832457
10485	NC_015433	GAA	2	6	637115	637120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832457
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