MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 34437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015433	TTC	2	6	326159	326164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832164
5502	NC_015433	AGA	2	6	326211	326216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832164
5503	NC_015433	AGT	2	6	326218	326223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
5504	NC_015433	A	7	7	326245	326251	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
5505	NC_015433	A	6	6	326318	326323	100 %	0 %	0 %	0 %	330832164
5506	NC_015433	CAC	2	6	326340	326345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832164
5507	NC_015433	GAT	2	6	326407	326412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832164
5508	NC_015433	A	6	6	326473	326478	100 %	0 %	0 %	0 %	330832165
5509	NC_015433	A	7	7	326482	326488	100 %	0 %	0 %	0 %	330832165
5510	NC_015433	ATC	2	6	326552	326557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832165
5511	NC_015433	GGT	2	6	326776	326781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832165
5512	NC_015433	GCA	2	6	326795	326800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832165
5513	NC_015433	GCCA	2	8	326824	326831	25 %	0 %	25 %	50 %	330832165
5514	NC_015433	GAA	2	6	326971	326976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832165
5515	NC_015433	GTC	2	6	326998	327003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832165
5516	NC_015433	TCA	2	6	327013	327018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832165
5517	NC_015433	CAT	2	6	327027	327032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832165
5518	NC_015433	CAA	2	6	327060	327065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832165
5519	NC_015433	CGA	2	6	327132	327137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832165
5520	NC_015433	TTGG	2	8	327181	327188	0 %	50 %	50 %	0 %	330832165
5521	NC_015433	GAA	2	6	327223	327228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832165
5522	NC_015433	AAGC	2	8	327334	327341	50 %	0 %	25 %	25 %	330832165
5523	NC_015433	AGA	2	6	327375	327380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832165
5524	NC_015433	AGT	2	6	327485	327490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832165
5525	NC_015433	AAAC	2	8	327736	327743	75 %	0 %	0 %	25 %	330832167
5526	NC_015433	CAA	2	6	327806	327811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832167
5527	NC_015433	AAGA	2	8	327816	327823	75 %	0 %	25 %	0 %	330832167
5528	NC_015433	GAA	2	6	327888	327893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5529	NC_015433	TGT	2	6	327908	327913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832167
5530	NC_015433	CAG	2	6	327928	327933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5531	NC_015433	AGC	2	6	327941	327946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5532	NC_015433	AGT	2	6	327968	327973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832167
5533	NC_015433	CTA	2	6	328099	328104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832167
5534	NC_015433	AAG	2	6	328105	328110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5535	NC_015433	GAA	2	6	328119	328124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5536	NC_015433	CAA	2	6	328151	328156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832167
5537	NC_015433	TCA	2	6	328171	328176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832167
5538	NC_015433	AAG	2	6	328177	328182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5539	NC_015433	CAG	2	6	328186	328191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5540	NC_015433	GTT	2	6	328206	328211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832167
5541	NC_015433	CGG	2	6	328250	328255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832167
5542	NC_015433	ACTTGG	2	12	328274	328285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330832167
5543	NC_015433	GAA	2	6	328341	328346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5544	NC_015433	AGA	2	6	328370	328375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5545	NC_015433	AGC	2	6	328382	328387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5546	NC_015433	AAG	2	6	328444	328449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5547	NC_015433	CGA	2	6	328484	328489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5548	NC_015433	TGA	2	6	328505	328510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832167
5549	NC_015433	AGC	2	6	328541	328546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5550	NC_015433	AAG	2	6	328549	328554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5551	NC_015433	CAG	2	6	328579	328584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5552	NC_015433	AGA	2	6	328628	328633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5553	NC_015433	GAA	2	6	328644	328649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5554	NC_015433	CAAT	2	8	328660	328667	50 %	25 %	0 %	25 %	330832167
5555	NC_015433	GGT	2	6	328677	328682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832167
5556	NC_015433	CAA	3	9	328686	328694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832167
5557	NC_015433	GTT	2	6	328797	328802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832167
5558	NC_015433	GAA	3	9	328839	328847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5559	NC_015433	CAA	2	6	328850	328855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832167
5560	NC_015433	GCA	2	6	328872	328877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330832167
5561	NC_015433	GCTT	2	8	328909	328916	0 %	50 %	25 %	25 %	330832167
5562	NC_015433	GAA	2	6	328949	328954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832167
5563	NC_015433	ATT	2	6	328994	328999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832167
5564	NC_015433	CT	3	6	329059	329064	0 %	50 %	0 %	50 %	330832168
5565	NC_015433	GTCC	2	8	329075	329082	0 %	25 %	25 %	50 %	330832168
5566	NC_015433	TGG	2	6	329113	329118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832168
5567	NC_015433	GTC	2	6	329120	329125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832168
5568	NC_015433	GTCA	2	8	329162	329169	25 %	25 %	25 %	25 %	330832168
5569	NC_015433	T	6	6	329227	329232	0 %	100 %	0 %	0 %	330832168
5570	NC_015433	CAATC	2	10	329261	329270	40 %	20 %	0 %	40 %	330832168
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5578	NC_015433	T	6	6	329821	329826	0 %	100 %	0 %	0 %	330832168
5579	NC_015433	AAAG	2	8	330044	330051	75 %	0 %	25 %	0 %	330832169
5580	NC_015433	TTG	2	6	330067	330072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832169
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5589	NC_015433	TGGT	2	8	330487	330494	0 %	50 %	50 %	0 %	330832169
5590	NC_015433	ATT	2	6	330550	330555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330832169
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5593	NC_015433	TAAAA	2	10	330952	330961	80 %	20 %	0 %	0 %	330832169
5594	NC_015433	TGA	2	6	334171	334176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832170
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5601	NC_015433	TGAT	2	8	334426	334433	25 %	50 %	25 %	0 %	330832170
5602	NC_015433	TCAA	2	8	334459	334466	50 %	25 %	0 %	25 %	330832170
5603	NC_015433	CCA	2	6	334569	334574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832170
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5606	NC_015433	A	6	6	334673	334678	100 %	0 %	0 %	0 %	330832170
5607	NC_015433	AG	3	6	334736	334741	50 %	0 %	50 %	0 %	330832170
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5990	NC_015433	AAG	2	6	364730	364735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832195
5991	NC_015433	CGG	2	6	364770	364775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832195
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