MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophobotulus glycolicus DSM 8271 chromosome

Total Repeats: 58573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015172	CAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288202
2	NC_015172	CAA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288202
3	NC_015172	TTAA	2	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	325288202
4	NC_015172	TGT	2	6	301	306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288202
5	NC_015172	CGGAAA	2	12	415	426	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325288202
6	NC_015172	GGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325288202
7	NC_015172	CATG	2	8	529	536	25 %	25 %	25 %	25 %	325288202
8	NC_015172	CTT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288202
9	NC_015172	AAG	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288202
10	NC_015172	GAA	2	6	728	733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288202
11	NC_015172	ATT	2	6	776	781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288202
12	NC_015172	TCC	2	6	796	801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288202
13	NC_015172	GAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288202
14	NC_015172	CCG	2	6	872	877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325288202
15	NC_015172	A	7	7	907	913	100 %	0 %	0 %	0 %	325288202
16	NC_015172	TGA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288202
17	NC_015172	ATC	2	6	947	952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288202
18	NC_015172	ATCCA	2	10	971	980	40 %	20 %	0 %	40 %	325288202
19	NC_015172	AATC	2	8	1037	1044	50 %	25 %	0 %	25 %	325288202
20	NC_015172	GAA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288202
21	NC_015172	AATT	2	8	1119	1126	50 %	50 %	0 %	0 %	325288202
22	NC_015172	A	6	6	1128	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	325288202
23	NC_015172	A	7	7	1176	1182	100 %	0 %	0 %	0 %	325288202
24	NC_015172	GAACCA	2	12	1185	1196	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325288202
25	NC_015172	GGC	2	6	1277	1282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288202
26	NC_015172	ACG	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288202
27	NC_015172	A	6	6	1353	1358	100 %	0 %	0 %	0 %	325288202
28	NC_015172	ATT	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288202
29	NC_015172	TGA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288203
30	NC_015172	GCA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288203
31	NC_015172	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288203
32	NC_015172	GAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288203
33	NC_015172	ATTA	2	8	1842	1849	50 %	50 %	0 %	0 %	325288203
34	NC_015172	GAA	2	6	1887	1892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288203
35	NC_015172	CTGC	2	8	1935	1942	0 %	25 %	25 %	50 %	325288203
36	NC_015172	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325288203
37	NC_015172	GAA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288203
38	NC_015172	TTGG	2	8	2052	2059	0 %	50 %	50 %	0 %	325288203
39	NC_015172	ATT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288203
40	NC_015172	GAT	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288203
41	NC_015172	AT	3	6	2190	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	325288203
42	NC_015172	T	6	6	2214	2219	0 %	100 %	0 %	0 %	325288203
43	NC_015172	TAATT	2	10	2372	2381	40 %	60 %	0 %	0 %	325288203
44	NC_015172	ATCA	2	8	2427	2434	50 %	25 %	0 %	25 %	325288203
45	NC_015172	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288203
46	NC_015172	ATCA	2	8	2472	2479	50 %	25 %	0 %	25 %	325288203
47	NC_015172	ATT	2	6	2617	2622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288203
48	NC_015172	TAG	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288204
49	NC_015172	TAT	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288204
50	NC_015172	TTAT	2	8	2834	2841	25 %	75 %	0 %	0 %	325288204
51	NC_015172	A	6	6	2925	2930	100 %	0 %	0 %	0 %	325288204
52	NC_015172	T	8	8	2996	3003	0 %	100 %	0 %	0 %	325288204
53	NC_015172	TGA	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288204
54	NC_015172	CAT	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288204
55	NC_015172	TCT	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288204
56	NC_015172	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	325288204
57	NC_015172	AAG	2	6	3150	3155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288204
58	NC_015172	GCG	2	6	3169	3174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288204
59	NC_015172	TCTGG	2	10	3186	3195	0 %	40 %	40 %	20 %	325288204
60	NC_015172	TGA	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288204
61	NC_015172	CGG	2	6	3412	3417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288204
62	NC_015172	TTG	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288204
63	NC_015172	CA	3	6	3434	3439	50 %	0 %	0 %	50 %	325288204
64	NC_015172	GAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288204
65	NC_015172	ATA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288204
66	NC_015172	TAT	2	6	3481	3486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288204
67	NC_015172	GCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288204
68	NC_015172	TTTG	2	8	3518	3525	0 %	75 %	25 %	0 %	325288204
69	NC_015172	ATA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288204
70	NC_015172	AGAA	2	8	3557	3564	75 %	0 %	25 %	0 %	325288204
71	NC_015172	TGC	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325288204
72	NC_015172	AAAC	2	8	3655	3662	75 %	0 %	0 %	25 %	325288204
73	NC_015172	AGG	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325288204
74	NC_015172	A	6	6	3789	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	325288205
75	NC_015172	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288205
76	NC_015172	A	7	7	3871	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	325288205
77	NC_015172	G	6	6	3902	3907	0 %	0 %	100 %	0 %	325288205
78	NC_015172	CAA	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288206
79	NC_015172	CAG	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288206
80	NC_015172	TCA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288206
81	NC_015172	TTG	2	6	4302	4307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288206
82	NC_015172	ACA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288206
83	NC_015172	GAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
84	NC_015172	TTC	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288206
85	NC_015172	CGG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288206
86	NC_015172	CAG	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288206
87	NC_015172	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
88	NC_015172	TTATGA	2	12	4717	4728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325288206
89	NC_015172	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	325288206
90	NC_015172	CCGGTG	2	12	4803	4814	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325288206
91	NC_015172	GCG	2	6	4830	4835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288206
92	NC_015172	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288206
93	NC_015172	CAA	2	6	4867	4872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288206
94	NC_015172	ATG	2	6	4950	4955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288206
95	NC_015172	ACA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288206
96	NC_015172	TAAT	2	8	5049	5056	50 %	50 %	0 %	0 %	325288206
97	NC_015172	ATA	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288206
98	NC_015172	GTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325288206
99	NC_015172	GAA	2	6	5258	5263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
100	NC_015172	A	7	7	5279	5285	100 %	0 %	0 %	0 %	325288206
101	NC_015172	GA	3	6	5338	5343	50 %	0 %	50 %	0 %	325288206
102	NC_015172	CCTC	2	8	5376	5383	0 %	25 %	0 %	75 %	325288206
103	NC_015172	AAG	2	6	5412	5417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
104	NC_015172	GAA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
105	NC_015172	TGA	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288206
106	NC_015172	TAA	2	6	5641	5646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288206
107	NC_015172	CTT	2	6	5696	5701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288206
108	NC_015172	CTT	2	6	5707	5712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288206
109	NC_015172	CCT	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288206
110	NC_015172	A	6	6	5783	5788	100 %	0 %	0 %	0 %	325288206
111	NC_015172	TGA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288206
112	NC_015172	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288206
113	NC_015172	GAA	2	6	5981	5986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325288206
114	NC_015172	AT	3	6	6031	6036	50 %	50 %	0 %	0 %	325288206
115	NC_015172	A	6	6	6058	6063	100 %	0 %	0 %	0 %	325288206
116	NC_015172	CGAT	2	8	6129	6136	25 %	25 %	25 %	25 %	325288207
117	NC_015172	A	6	6	6151	6156	100 %	0 %	0 %	0 %	325288207
118	NC_015172	CCTG	2	8	6199	6206	0 %	25 %	25 %	50 %	325288207
119	NC_015172	TA	3	6	6246	6251	50 %	50 %	0 %	0 %	325288207
120	NC_015172	CATG	2	8	6253	6260	25 %	25 %	25 %	25 %	325288207
121	NC_015172	TCC	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288207
122	NC_015172	ATG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
123	NC_015172	ATG	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
124	NC_015172	TCT	2	6	6595	6600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288207
125	NC_015172	TCA	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288207
126	NC_015172	C	7	7	6647	6653	0 %	0 %	0 %	100 %	325288207
127	NC_015172	TGAT	2	8	6690	6697	25 %	50 %	25 %	0 %	325288207
128	NC_015172	CAG	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288207
129	NC_015172	TTA	2	6	6788	6793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288207
130	NC_015172	ACA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325288207
131	NC_015172	TAT	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288207
132	NC_015172	A	6	6	6870	6875	100 %	0 %	0 %	0 %	325288207
133	NC_015172	A	7	7	6879	6885	100 %	0 %	0 %	0 %	325288207
134	NC_015172	ATC	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288207
135	NC_015172	A	6	6	6948	6953	100 %	0 %	0 %	0 %	325288207
136	NC_015172	GAAAA	2	10	6971	6980	80 %	0 %	20 %	0 %	325288207
137	NC_015172	TGA	2	6	7003	7008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
138	NC_015172	ATC	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288207
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140	NC_015172	TCA	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288207
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143	NC_015172	TGA	2	6	7294	7299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
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145	NC_015172	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
146	NC_015172	TGA	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288207
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157	NC_015172	CGA	2	6	7920	7925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288207
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162	NC_015172	TGT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288207
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165	NC_015172	GTT	2	6	8393	8398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288207
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169	NC_015172	TAA	2	6	8683	8688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288208
170	NC_015172	GAC	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288208
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172	NC_015172	TTG	2	6	8881	8886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288208
173	NC_015172	CGG	2	6	8947	8952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325288208
174	NC_015172	TAA	2	6	8969	8974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288208
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233	NC_015172	TAGG	2	8	13849	13856	25 %	25 %	50 %	0 %	325288212
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247	NC_015172	TCGC	2	8	14916	14923	0 %	25 %	25 %	50 %	325288213
248	NC_015172	ATTC	2	8	14956	14963	25 %	50 %	0 %	25 %	325288213
249	NC_015172	TTC	2	6	14966	14971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288213
250	NC_015172	AAAT	2	8	15039	15046	75 %	25 %	0 %	0 %	325288213
251	NC_015172	TTTC	2	8	16993	17000	0 %	75 %	0 %	25 %	325288214
252	NC_015172	CATCC	2	10	17004	17013	20 %	20 %	0 %	60 %	325288214
253	NC_015172	TGTGC	2	10	17082	17091	0 %	40 %	40 %	20 %	325288214
254	NC_015172	T	7	7	17177	17183	0 %	100 %	0 %	0 %	325288214
255	NC_015172	CTTTTC	2	12	17325	17336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288214
256	NC_015172	T	6	6	17474	17479	0 %	100 %	0 %	0 %	325288214
257	NC_015172	ACTTC	2	10	17515	17524	20 %	40 %	0 %	40 %	325288214
258	NC_015172	CA	3	6	17553	17558	50 %	0 %	0 %	50 %	325288214
259	NC_015172	ATC	2	6	17571	17576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288214
260	NC_015172	CAT	2	6	17598	17603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288214
261	NC_015172	TTC	2	6	17638	17643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288214
262	NC_015172	GAT	2	6	17679	17684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288214
263	NC_015172	GGA	2	6	17717	17722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325288214
264	NC_015172	GT	3	6	17750	17755	0 %	50 %	50 %	0 %	325288214
265	NC_015172	TCA	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288214
266	NC_015172	ATTG	2	8	17770	17777	25 %	50 %	25 %	0 %	325288214
267	NC_015172	TGT	2	6	17883	17888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325288214
268	NC_015172	CT	3	6	17982	17987	0 %	50 %	0 %	50 %	325288214
269	NC_015172	TTC	2	6	18018	18023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288214
270	NC_015172	T	6	6	18063	18068	0 %	100 %	0 %	0 %	325288214
271	NC_015172	TTTTTC	2	12	18122	18133	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325288214
272	NC_015172	T	7	7	18172	18178	0 %	100 %	0 %	0 %	325288214
273	NC_015172	TTC	2	6	18373	18378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288215
274	NC_015172	GTCC	2	8	18422	18429	0 %	25 %	25 %	50 %	325288215
275	NC_015172	TTGTT	2	10	18552	18561	0 %	80 %	20 %	0 %	325288215
276	NC_015172	A	7	7	18586	18592	100 %	0 %	0 %	0 %	325288216
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278	NC_015172	CT	3	6	18726	18731	0 %	50 %	0 %	50 %	325288216
279	NC_015172	GCCC	2	8	18741	18748	0 %	0 %	25 %	75 %	325288216
280	NC_015172	TGGG	2	8	18763	18770	0 %	25 %	75 %	0 %	325288216
281	NC_015172	TGG	3	9	18809	18817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325288216
282	NC_015172	GTA	2	6	18906	18911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325288216
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284	NC_015172	T	7	7	19602	19608	0 %	100 %	0 %	0 %	325288217
285	NC_015172	A	6	6	19698	19703	100 %	0 %	0 %	0 %	325288217
286	NC_015172	GTTCCT	2	12	19718	19729	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325288217
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288	NC_015172	AG	3	6	19809	19814	50 %	0 %	50 %	0 %	325288217
289	NC_015172	TCC	2	6	19843	19848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288217
290	NC_015172	TAA	2	6	19864	19869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288217
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293	NC_015172	TCC	2	6	19894	19899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288217
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298	NC_015172	TTC	2	6	20931	20936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288218
299	NC_015172	T	6	6	20965	20970	0 %	100 %	0 %	0 %	325288218
300	NC_015172	CA	3	6	21001	21006	50 %	0 %	0 %	50 %	325288218
301	NC_015172	ATC	3	9	21069	21077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288218
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304	NC_015172	CTTC	2	8	21251	21258	0 %	50 %	0 %	50 %	325288218
305	NC_015172	AT	3	6	21290	21295	50 %	50 %	0 %	0 %	325288218
306	NC_015172	TA	3	6	21314	21319	50 %	50 %	0 %	0 %	325288218
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314	NC_015172	ATT	2	6	22083	22088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325288218
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377	NC_015172	TAA	2	6	25700	25705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325288222
378	NC_015172	CAAG	2	8	25791	25798	50 %	0 %	25 %	25 %	325288222
379	NC_015172	AC	3	6	25814	25819	50 %	0 %	0 %	50 %	325288222
380	NC_015172	ATC	2	6	25906	25911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288222
381	NC_015172	TTC	2	6	25945	25950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325288222
382	NC_015172	GACA	2	8	25984	25991	50 %	0 %	25 %	25 %	325288222
383	NC_015172	TAC	2	6	26376	26381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288223
384	NC_015172	T	6	6	26400	26405	0 %	100 %	0 %	0 %	325288223
385	NC_015172	T	6	6	26416	26421	0 %	100 %	0 %	0 %	325288223
386	NC_015172	TCG	2	6	26454	26459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325288223
387	NC_015172	ATC	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288223
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390	NC_015172	TCA	2	6	26623	26628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288223
391	NC_015172	TGAT	2	8	26643	26650	25 %	50 %	25 %	0 %	325288223
392	NC_015172	CCG	2	6	26671	26676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325288223
393	NC_015172	AAAT	2	8	26755	26762	75 %	25 %	0 %	0 %	325288223
394	NC_015172	CCT	2	6	26782	26787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325288224
395	NC_015172	CAG	2	6	26796	26801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325288224
396	NC_015172	TCG	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325288224
397	NC_015172	GCC	2	6	26896	26901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325288224
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482	NC_015172	TCA	2	6	32075	32080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325288229
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