MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_015152	GCAT	2	8	2836488	2836495	25 %	25 %	25 %	25 %	325972426
49002	NC_015152	AGA	2	6	2836616	2836621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972426
49003	NC_015152	TTCT	2	8	2836644	2836651	0 %	75 %	0 %	25 %	325972426
49004	NC_015152	GTT	2	6	2836675	2836680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972426
49005	NC_015152	CAG	2	6	2836751	2836756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972426
49006	NC_015152	CAA	2	6	2836765	2836770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972426
49007	NC_015152	TTTC	2	8	2836814	2836821	0 %	75 %	0 %	25 %	325972426
49008	NC_015152	GGGAGA	2	12	2836840	2836851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972426
49009	NC_015152	TCT	2	6	2836870	2836875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972426
49010	NC_015152	TGC	2	6	2836916	2836921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972426
49011	NC_015152	AGA	2	6	2836972	2836977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972426
49012	NC_015152	TAA	2	6	2837014	2837019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972426
49013	NC_015152	TTC	2	6	2837063	2837068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972426
49014	NC_015152	GTA	2	6	2837120	2837125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972426
49015	NC_015152	AGG	2	6	2837221	2837226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972426
49016	NC_015152	CCT	2	6	2837247	2837252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972426
49017	NC_015152	ATT	2	6	2837355	2837360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972426
49018	NC_015152	TCA	2	6	2837382	2837387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972426
49019	NC_015152	GAA	2	6	2837608	2837613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972426
49020	NC_015152	CTG	2	6	2837615	2837620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972426
49021	NC_015152	CTT	2	6	2837685	2837690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972427
49022	NC_015152	TTC	2	6	2837731	2837736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972427
49023	NC_015152	TATG	2	8	2837747	2837754	25 %	50 %	25 %	0 %	325972427
49024	NC_015152	CTC	2	6	2837820	2837825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972427
49025	NC_015152	AGC	2	6	2837887	2837892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972427
49026	NC_015152	CAG	2	6	2837894	2837899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972427
49027	NC_015152	TGA	2	6	2838037	2838042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972427
49028	NC_015152	ACAGA	2	10	2838055	2838064	60 %	0 %	20 %	20 %	325972427
49029	NC_015152	GTT	2	6	2838065	2838070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972427
49030	NC_015152	AGT	2	6	2838107	2838112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972427
49031	NC_015152	GA	3	6	2838152	2838157	50 %	0 %	50 %	0 %	325972427
49032	NC_015152	GTT	2	6	2838164	2838169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972427
49033	NC_015152	GGT	2	6	2838195	2838200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972427
49034	NC_015152	ATG	2	6	2838374	2838379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972428
49035	NC_015152	G	6	6	2838466	2838471	0 %	0 %	100 %	0 %	325972428
49036	NC_015152	AGG	2	6	2838522	2838527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972428
49037	NC_015152	GAG	2	6	2838544	2838549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972428
49038	NC_015152	TAA	2	6	2838567	2838572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972428
49039	NC_015152	GAA	2	6	2838595	2838600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972428
49040	NC_015152	AGAA	2	8	2838663	2838670	75 %	0 %	25 %	0 %	325972428
49041	NC_015152	TAG	2	6	2838812	2838817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972428
49042	NC_015152	AT	3	6	2838818	2838823	50 %	50 %	0 %	0 %	325972428
49043	NC_015152	AGG	2	6	2838836	2838841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972428
49044	NC_015152	AGGA	2	8	2838856	2838863	50 %	0 %	50 %	0 %	325972428
49045	NC_015152	AT	3	6	2838870	2838875	50 %	50 %	0 %	0 %	325972428
49046	NC_015152	TAA	2	6	2838879	2838884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972428
49047	NC_015152	AGG	2	6	2838890	2838895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972428
49048	NC_015152	CAA	2	6	2838956	2838961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972428
49049	NC_015152	A	6	6	2839071	2839076	100 %	0 %	0 %	0 %	325972428
49050	NC_015152	A	6	6	2839221	2839226	100 %	0 %	0 %	0 %	325972428
49051	NC_015152	GCT	2	6	2839294	2839299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972428
49052	NC_015152	GAG	2	6	2839378	2839383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972428
49053	NC_015152	T	6	6	2839441	2839446	0 %	100 %	0 %	0 %	325972428
49054	NC_015152	AGT	2	6	2839530	2839535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972428
49055	NC_015152	AAAAG	2	10	2839685	2839694	80 %	0 %	20 %	0 %	325972428
49056	NC_015152	CAT	2	6	2839716	2839721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972428
49057	NC_015152	AAT	2	6	2839735	2839740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972428
49058	NC_015152	AAG	2	6	2839944	2839949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972429
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49060	NC_015152	ATC	2	6	2840144	2840149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972429
49061	NC_015152	CTTT	2	8	2840155	2840162	0 %	75 %	0 %	25 %	325972429
49062	NC_015152	A	6	6	2840179	2840184	100 %	0 %	0 %	0 %	325972429
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49064	NC_015152	AT	3	6	2840303	2840308	50 %	50 %	0 %	0 %	325972429
49065	NC_015152	CCCA	2	8	2840309	2840316	25 %	0 %	0 %	75 %	325972429
49066	NC_015152	TGA	2	6	2840356	2840361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972429
49067	NC_015152	AAG	2	6	2840412	2840417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972429
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49071	NC_015152	AT	3	6	2840540	2840545	50 %	50 %	0 %	0 %	325972429
49072	NC_015152	TC	3	6	2840677	2840682	0 %	50 %	0 %	50 %	325972429
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49084	NC_015152	T	6	6	2841300	2841305	0 %	100 %	0 %	0 %	325972430
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49100	NC_015152	TA	3	6	2842141	2842146	50 %	50 %	0 %	0 %	325972430
49101	NC_015152	CGA	2	6	2842249	2842254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972430
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49105	NC_015152	A	6	6	2842497	2842502	100 %	0 %	0 %	0 %	325972430
49106	NC_015152	CAA	2	6	2842535	2842540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972430
49107	NC_015152	AG	3	6	2842562	2842567	50 %	0 %	50 %	0 %	325972430
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49117	NC_015152	TTA	2	6	2843045	2843050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972430
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49227	NC_015152	AAGCA	2	10	2848512	2848521	60 %	0 %	20 %	20 %	325972435
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49232	NC_015152	TCCC	2	8	2848636	2848643	0 %	25 %	0 %	75 %	325972435
49233	NC_015152	AGA	2	6	2848659	2848664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972435
49234	NC_015152	ATC	2	6	2848721	2848726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972435
49235	NC_015152	TCAA	2	8	2848895	2848902	50 %	25 %	0 %	25 %	325972436
49236	NC_015152	GAT	2	6	2848967	2848972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972436
49237	NC_015152	TGGT	2	8	2849017	2849024	0 %	50 %	50 %	0 %	325972436
49238	NC_015152	ACT	2	6	2849063	2849068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972436
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49240	NC_015152	TAC	2	6	2849236	2849241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972436
49241	NC_015152	CT	3	6	2849340	2849345	0 %	50 %	0 %	50 %	325972436
49242	NC_015152	AGA	2	6	2849430	2849435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972436
49243	NC_015152	ATC	2	6	2849466	2849471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972436
49244	NC_015152	TCC	2	6	2849591	2849596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972436
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49249	NC_015152	CTCGA	2	10	2849893	2849902	20 %	20 %	20 %	40 %	325972436
49250	NC_015152	GT	3	6	2849918	2849923	0 %	50 %	50 %	0 %	325972436
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49254	NC_015152	CT	3	6	2850108	2850113	0 %	50 %	0 %	50 %	325972436
49255	NC_015152	CTG	2	6	2850165	2850170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972436
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49259	NC_015152	TGC	2	6	2850371	2850376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972436
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49264	NC_015152	GTATC	2	10	2850950	2850959	20 %	40 %	20 %	20 %	325972436
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49271	NC_015152	AATT	2	8	2851334	2851341	50 %	50 %	0 %	0 %	325972437
49272	NC_015152	TGA	2	6	2851367	2851372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972437
49273	NC_015152	CTTC	2	8	2851456	2851463	0 %	50 %	0 %	50 %	325972437
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49285	NC_015152	AATC	2	8	2851866	2851873	50 %	25 %	0 %	25 %	325972437
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49291	NC_015152	GAC	2	6	2852065	2852070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972437
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49295	NC_015152	AAGA	2	8	2852290	2852297	75 %	0 %	25 %	0 %	325972437
49296	NC_015152	CGCC	2	8	2852304	2852311	0 %	0 %	25 %	75 %	325972437
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49302	NC_015152	GGA	2	6	2852757	2852762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972437
49303	NC_015152	TGT	2	6	2852798	2852803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972437
49304	NC_015152	A	6	6	2852926	2852931	100 %	0 %	0 %	0 %	325972438
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49309	NC_015152	GTC	2	6	2853192	2853197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972438
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49312	NC_015152	CT	3	6	2853240	2853245	0 %	50 %	0 %	50 %	325972438
49313	NC_015152	TTCA	2	8	2853288	2853295	25 %	50 %	0 %	25 %	325972438
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49323	NC_015152	CAT	2	6	2854292	2854297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972439
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49332	NC_015152	AT	3	6	2854811	2854816	50 %	50 %	0 %	0 %	325972440
49333	NC_015152	GAA	2	6	2855020	2855025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972440
49334	NC_015152	TCCCTG	2	12	2855167	2855178	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325972440
49335	NC_015152	TCC	2	6	2855180	2855185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972440
49336	NC_015152	TG	3	6	2855197	2855202	0 %	50 %	50 %	0 %	325972440
49337	NC_015152	ATG	2	6	2855251	2855256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972440
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49339	NC_015152	CTTT	2	8	2855294	2855301	0 %	75 %	0 %	25 %	325972440
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49342	NC_015152	ACCG	2	8	2855540	2855547	25 %	0 %	25 %	50 %	325972441
49343	NC_015152	GTA	2	6	2855555	2855560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972441
49344	NC_015152	CGA	2	6	2855641	2855646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972441
49345	NC_015152	GT	3	6	2855660	2855665	0 %	50 %	50 %	0 %	325972441
49346	NC_015152	GCT	2	6	2855678	2855683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972441
49347	NC_015152	GAAAG	2	10	2855755	2855764	60 %	0 %	40 %	0 %	325972441
49348	NC_015152	GCA	2	6	2855827	2855832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972441
49349	NC_015152	CTG	2	6	2855837	2855842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972441
49350	NC_015152	TGT	2	6	2855940	2855945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972441
49351	NC_015152	TCT	2	6	2856117	2856122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972442
49352	NC_015152	TGCT	2	8	2856156	2856163	0 %	50 %	25 %	25 %	325972442
49353	NC_015152	TC	4	8	2856169	2856176	0 %	50 %	0 %	50 %	325972442
49354	NC_015152	TAC	2	6	2856245	2856250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972442
49355	NC_015152	GGT	2	6	2856262	2856267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972442
49356	NC_015152	TCG	2	6	2856273	2856278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972442
49357	NC_015152	CAT	2	6	2856310	2856315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972442
49358	NC_015152	CTG	2	6	2856359	2856364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972442
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49381	NC_015152	CTG	2	6	2857404	2857409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972443
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49402	NC_015152	AAGCG	2	10	2858825	2858834	40 %	0 %	40 %	20 %	325972444
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49450	NC_015152	TAC	2	6	2862450	2862455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972448
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49452	NC_015152	TGCCGA	2	12	2862566	2862577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972448
49453	NC_015152	GAG	2	6	2862597	2862602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972448
49454	NC_015152	ACC	2	6	2862628	2862633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972448
49455	NC_015152	GAAG	2	8	2862677	2862684	50 %	0 %	50 %	0 %	325972448
49456	NC_015152	TGCAGA	2	12	2862703	2862714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972448
49457	NC_015152	CTG	2	6	2862807	2862812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972448
49458	NC_015152	GCT	2	6	2862821	2862826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972448
49459	NC_015152	GAC	2	6	2862846	2862851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972448
49460	NC_015152	GCG	2	6	2862856	2862861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972448
49461	NC_015152	CTA	2	6	2862893	2862898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972448
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49464	NC_015152	TGA	2	6	2863192	2863197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972448
49465	NC_015152	CAA	2	6	2863202	2863207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972448
49466	NC_015152	TCG	2	6	2863243	2863248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972448
49467	NC_015152	TCC	2	6	2863288	2863293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972448
49468	NC_015152	GAGAA	2	10	2863298	2863307	60 %	0 %	40 %	0 %	325972448
49469	NC_015152	GTG	2	6	2863327	2863332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972449
49470	NC_015152	AGA	2	6	2863367	2863372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972449
49471	NC_015152	CTG	2	6	2863489	2863494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972449
49472	NC_015152	A	6	6	2863513	2863518	100 %	0 %	0 %	0 %	325972449
49473	NC_015152	CAA	2	6	2863581	2863586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972449
49474	NC_015152	GAT	2	6	2863599	2863604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972449
49475	NC_015152	CAT	2	6	2863674	2863679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972449
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49478	NC_015152	GAATAA	2	12	2863775	2863786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325972449
49479	NC_015152	GCA	2	6	2863796	2863801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972449
49480	NC_015152	TCG	2	6	2863805	2863810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972449
49481	NC_015152	ATG	2	6	2863816	2863821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972449
49482	NC_015152	TCT	2	6	2863832	2863837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972449
49483	NC_015152	ATC	2	6	2864062	2864067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972449
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49485	NC_015152	GGA	2	6	2864186	2864191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972450
49486	NC_015152	GAA	2	6	2864210	2864215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972450
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49489	NC_015152	GAA	2	6	2864267	2864272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972450
49490	NC_015152	AGGT	2	8	2864307	2864314	25 %	25 %	50 %	0 %	325972450
49491	NC_015152	ATC	2	6	2864376	2864381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972450
49492	NC_015152	ATG	2	6	2864385	2864390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972450
49493	NC_015152	ATG	2	6	2864403	2864408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972450
49494	NC_015152	GA	3	6	2864410	2864415	50 %	0 %	50 %	0 %	325972450
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49496	NC_015152	AGC	2	6	2864520	2864525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972450
49497	NC_015152	CCAG	2	8	2864590	2864597	25 %	0 %	25 %	50 %	325972450
49498	NC_015152	ATG	2	6	2864625	2864630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972450
49499	NC_015152	CAC	2	6	2864636	2864641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972450
49500	NC_015152	GCC	2	6	2864690	2864695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972450

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