MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_015152	TTGG	2	8	2777579	2777586	0 %	50 %	50 %	0 %	325972372
48003	NC_015152	AGC	2	6	2777602	2777607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972372
48004	NC_015152	TTC	2	6	2777646	2777651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972372
48005	NC_015152	CCT	2	6	2777720	2777725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972372
48006	NC_015152	CAT	2	6	2777755	2777760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972372
48007	NC_015152	TGAA	2	8	2777772	2777779	50 %	25 %	25 %	0 %	325972372
48008	NC_015152	TGGT	2	8	2777801	2777808	0 %	50 %	50 %	0 %	325972372
48009	NC_015152	TTCC	2	8	2777840	2777847	0 %	50 %	0 %	50 %	325972372
48010	NC_015152	GAAATT	2	12	2777958	2777969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972373
48011	NC_015152	GTTG	2	8	2777991	2777998	0 %	50 %	50 %	0 %	325972373
48012	NC_015152	G	6	6	2778019	2778024	0 %	0 %	100 %	0 %	325972373
48013	NC_015152	CTT	2	6	2778050	2778055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972373
48014	NC_015152	ATG	2	6	2778065	2778070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972373
48015	NC_015152	A	7	7	2778129	2778135	100 %	0 %	0 %	0 %	325972373
48016	NC_015152	CT	3	6	2778145	2778150	0 %	50 %	0 %	50 %	325972373
48017	NC_015152	TTG	2	6	2778199	2778204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972373
48018	NC_015152	GCA	2	6	2778265	2778270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972373
48019	NC_015152	TGC	2	6	2778313	2778318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972373
48020	NC_015152	GAA	2	6	2778334	2778339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972373
48021	NC_015152	CTT	2	6	2778406	2778411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972373
48022	NC_015152	AAT	2	6	2778436	2778441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972373
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48024	NC_015152	AGT	2	6	2778462	2778467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972373
48025	NC_015152	ATC	2	6	2778472	2778477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972373
48026	NC_015152	A	6	6	2778478	2778483	100 %	0 %	0 %	0 %	325972373
48027	NC_015152	CATGTT	2	12	2778586	2778597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325972373
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48031	NC_015152	TTTG	2	8	2778763	2778770	0 %	75 %	25 %	0 %	325972373
48032	NC_015152	GAAT	2	8	2778888	2778895	50 %	25 %	25 %	0 %	325972374
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48034	NC_015152	CCAC	2	8	2779050	2779057	25 %	0 %	0 %	75 %	325972374
48035	NC_015152	CAC	2	6	2779059	2779064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972374
48036	NC_015152	CCCA	2	8	2779081	2779088	25 %	0 %	0 %	75 %	325972374
48037	NC_015152	CGGCAT	2	12	2779090	2779101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972374
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48041	NC_015152	GCA	2	6	2779269	2779274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972374
48042	NC_015152	CCA	2	6	2779311	2779316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972374
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48049	NC_015152	TCA	2	6	2779607	2779612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972374
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48051	NC_015152	CAA	2	6	2779707	2779712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972374
48052	NC_015152	TCA	2	6	2779793	2779798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972374
48053	NC_015152	CTG	2	6	2779817	2779822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972374
48054	NC_015152	AGC	2	6	2779883	2779888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972374
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48056	NC_015152	GTGA	2	8	2780001	2780008	25 %	25 %	50 %	0 %	325972374
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48083	NC_015152	CAGCAT	2	12	2781363	2781374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325972376
48084	NC_015152	CAC	2	6	2781379	2781384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972376
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48086	NC_015152	GAA	2	6	2781451	2781456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972376
48087	NC_015152	CTT	2	6	2781507	2781512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972376
48088	NC_015152	GAC	2	6	2781546	2781551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972376
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48100	NC_015152	AGCA	2	8	2782070	2782077	50 %	0 %	25 %	25 %	325972376
48101	NC_015152	CAT	2	6	2782196	2782201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972376
48102	NC_015152	TCT	2	6	2782211	2782216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972376
48103	NC_015152	GCCA	2	8	2782313	2782320	25 %	0 %	25 %	50 %	325972376
48104	NC_015152	ATA	2	6	2782342	2782347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972376
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48109	NC_015152	TG	3	6	2782454	2782459	0 %	50 %	50 %	0 %	325972377
48110	NC_015152	CAACG	2	10	2782493	2782502	40 %	0 %	20 %	40 %	325972377
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48113	NC_015152	GCC	2	6	2782670	2782675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972377
48114	NC_015152	GAT	2	6	2782747	2782752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972377
48115	NC_015152	GAT	2	6	2782793	2782798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972377
48116	NC_015152	GTT	2	6	2782799	2782804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972377
48117	NC_015152	GTC	2	6	2782805	2782810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972377
48118	NC_015152	GAG	2	6	2782821	2782826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972377
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48120	NC_015152	AGG	2	6	2783100	2783105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972377
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48122	NC_015152	TTG	2	6	2783145	2783150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972377
48123	NC_015152	CCA	2	6	2783209	2783214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972377
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48148	NC_015152	TGT	2	6	2785133	2785138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972378
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48152	NC_015152	CAA	2	6	2785235	2785240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972378
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48168	NC_015152	CATGC	2	10	2786858	2786867	20 %	20 %	20 %	40 %	325972379
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48200	NC_015152	AG	3	6	2788777	2788782	50 %	0 %	50 %	0 %	325972380
48201	NC_015152	ATCG	2	8	2788930	2788937	25 %	25 %	25 %	25 %	325972380
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48205	NC_015152	AG	4	8	2789215	2789222	50 %	0 %	50 %	0 %	325972381
48206	NC_015152	ATC	2	6	2789242	2789247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972381
48207	NC_015152	GTGC	2	8	2789319	2789326	0 %	25 %	50 %	25 %	325972381
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48214	NC_015152	GCA	2	6	2789872	2789877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972382
48215	NC_015152	TCA	2	6	2789887	2789892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972382
48216	NC_015152	AAC	2	6	2789920	2789925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972382
48217	NC_015152	TGCA	2	8	2789983	2789990	25 %	25 %	25 %	25 %	325972382
48218	NC_015152	T	6	6	2790027	2790032	0 %	100 %	0 %	0 %	325972382
48219	NC_015152	CTTC	2	8	2790116	2790123	0 %	50 %	0 %	50 %	325972383
48220	NC_015152	AGC	2	6	2790141	2790146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972383
48221	NC_015152	TGCT	2	8	2790175	2790182	0 %	50 %	25 %	25 %	325972383
48222	NC_015152	GAA	2	6	2790224	2790229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972383
48223	NC_015152	AGA	2	6	2790240	2790245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972383
48224	NC_015152	ACACC	2	10	2790250	2790259	40 %	0 %	0 %	60 %	325972383
48225	NC_015152	TTGC	2	8	2790288	2790295	0 %	50 %	25 %	25 %	325972383
48226	NC_015152	GGC	2	6	2790328	2790333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972383
48227	NC_015152	TCA	2	6	2790346	2790351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972383
48228	NC_015152	TGA	2	6	2790490	2790495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972383
48229	NC_015152	GCT	2	6	2790498	2790503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972383
48230	NC_015152	GCT	2	6	2790547	2790552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972383
48231	NC_015152	TTC	2	6	2790618	2790623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972383
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48461	NC_015152	GAT	2	6	2803997	2804002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972395
48462	NC_015152	AGT	2	6	2804020	2804025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972395
48463	NC_015152	ACTTAT	2	12	2804032	2804043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325972395
48464	NC_015152	AAG	2	6	2804057	2804062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972395
48465	NC_015152	TTC	2	6	2804178	2804183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972395
48466	NC_015152	CAG	2	6	2804219	2804224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972395
48467	NC_015152	GAG	2	6	2804354	2804359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972395
48468	NC_015152	AT	3	6	2804377	2804382	50 %	50 %	0 %	0 %	325972395
48469	NC_015152	TGA	2	6	2804392	2804397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972395
48470	NC_015152	CG	3	6	2804408	2804413	0 %	0 %	50 %	50 %	325972395
48471	NC_015152	ATA	2	6	2804484	2804489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972395
48472	NC_015152	CAT	3	9	2804531	2804539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972395
48473	NC_015152	AT	3	6	2804571	2804576	50 %	50 %	0 %	0 %	325972395
48474	NC_015152	TCTT	2	8	2804601	2804608	0 %	75 %	0 %	25 %	325972395
48475	NC_015152	GAA	2	6	2804615	2804620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972395
48476	NC_015152	AAT	2	6	2804684	2804689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972395
48477	NC_015152	CTA	2	6	2804773	2804778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972396
48478	NC_015152	TTGC	2	8	2804794	2804801	0 %	50 %	25 %	25 %	325972396
48479	NC_015152	TGT	2	6	2804822	2804827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972396
48480	NC_015152	ATA	2	6	2804828	2804833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972396
48481	NC_015152	TAT	2	6	2804852	2804857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972396
48482	NC_015152	T	7	7	2804865	2804871	0 %	100 %	0 %	0 %	325972396
48483	NC_015152	TCT	2	6	2804891	2804896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972396
48484	NC_015152	TCACC	2	10	2804909	2804918	20 %	20 %	0 %	60 %	325972396
48485	NC_015152	CTG	2	6	2804992	2804997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972396
48486	NC_015152	TTG	2	6	2805091	2805096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972396
48487	NC_015152	CTTG	2	8	2805124	2805131	0 %	50 %	25 %	25 %	325972396
48488	NC_015152	TGC	2	6	2805151	2805156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972396
48489	NC_015152	GGA	2	6	2805177	2805182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972396
48490	NC_015152	GTA	2	6	2805184	2805189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972396
48491	NC_015152	ACT	2	6	2805303	2805308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972397
48492	NC_015152	AAGG	2	8	2805354	2805361	50 %	0 %	50 %	0 %	325972397
48493	NC_015152	AGGA	2	8	2805382	2805389	50 %	0 %	50 %	0 %	325972397
48494	NC_015152	TGC	2	6	2805397	2805402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972397
48495	NC_015152	CTG	2	6	2805405	2805410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972397
48496	NC_015152	GCT	2	6	2805479	2805484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972397
48497	NC_015152	GAT	2	6	2805488	2805493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972397
48498	NC_015152	TTTG	2	8	2805617	2805624	0 %	75 %	25 %	0 %	325972397
48499	NC_015152	TGA	2	6	2805644	2805649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972397
48500	NC_015152	CAA	2	6	2805663	2805668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972397

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