MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_015152	TGC	3	9	2630307	2630315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972240
45502	NC_015152	TTC	2	6	2630340	2630345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972240
45503	NC_015152	ATT	2	6	2630353	2630358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972240
45504	NC_015152	ATC	2	6	2630403	2630408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972240
45505	NC_015152	ATT	2	6	2630410	2630415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972240
45506	NC_015152	GGC	2	6	2630422	2630427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972240
45507	NC_015152	AT	3	6	2630428	2630433	50 %	50 %	0 %	0 %	325972240
45508	NC_015152	ATCA	2	8	2630530	2630537	50 %	25 %	0 %	25 %	325972240
45509	NC_015152	ATT	2	6	2630614	2630619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972240
45510	NC_015152	CAAG	2	8	2630624	2630631	50 %	0 %	25 %	25 %	325972240
45511	NC_015152	TGA	2	6	2630691	2630696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972240
45512	NC_015152	TA	3	6	2630747	2630752	50 %	50 %	0 %	0 %	325972240
45513	NC_015152	ATT	2	6	2631031	2631036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972241
45514	NC_015152	CATA	2	8	2631150	2631157	50 %	25 %	0 %	25 %	325972241
45515	NC_015152	GTA	2	6	2631220	2631225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972241
45516	NC_015152	AT	3	6	2631274	2631279	50 %	50 %	0 %	0 %	325972241
45517	NC_015152	T	6	6	2631354	2631359	0 %	100 %	0 %	0 %	325972241
45518	NC_015152	CGG	2	6	2631388	2631393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972241
45519	NC_015152	CATC	2	8	2631441	2631448	25 %	25 %	0 %	50 %	325972241
45520	NC_015152	CTC	2	6	2631473	2631478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972241
45521	NC_015152	ATATC	2	10	2631532	2631541	40 %	40 %	0 %	20 %	325972241
45522	NC_015152	TCA	2	6	2631561	2631566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972242
45523	NC_015152	ATTG	2	8	2631680	2631687	25 %	50 %	25 %	0 %	325972242
45524	NC_015152	ATCC	2	8	2631688	2631695	25 %	25 %	0 %	50 %	325972242
45525	NC_015152	C	6	6	2631694	2631699	0 %	0 %	0 %	100 %	325972242
45526	NC_015152	AAT	2	6	2631715	2631720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972242
45527	NC_015152	CTC	2	6	2631723	2631728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972242
45528	NC_015152	GAT	2	6	2631744	2631749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972242
45529	NC_015152	CAT	2	6	2631765	2631770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972242
45530	NC_015152	AT	4	8	2631919	2631926	50 %	50 %	0 %	0 %	325972242
45531	NC_015152	CAAA	2	8	2631981	2631988	75 %	0 %	0 %	25 %	325972242
45532	NC_015152	TCT	2	6	2631993	2631998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972242
45533	NC_015152	GCA	2	6	2632014	2632019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972242
45534	NC_015152	CAT	2	6	2632443	2632448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972242
45535	NC_015152	CT	3	6	2632484	2632489	0 %	50 %	0 %	50 %	325972242
45536	NC_015152	CTT	2	6	2632594	2632599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972242
45537	NC_015152	TCC	2	6	2632691	2632696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972242
45538	NC_015152	CTG	3	9	2632720	2632728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972242
45539	NC_015152	TTGA	2	8	2632805	2632812	25 %	50 %	25 %	0 %	325972242
45540	NC_015152	AGA	2	6	2632825	2632830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972242
45541	NC_015152	TCT	2	6	2632892	2632897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972242
45542	NC_015152	CCTT	2	8	2632904	2632911	0 %	50 %	0 %	50 %	325972242
45543	NC_015152	TGAG	2	8	2632928	2632935	25 %	25 %	50 %	0 %	325972242
45544	NC_015152	CAT	2	6	2632959	2632964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972242
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45546	NC_015152	CTT	2	6	2633021	2633026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972242
45547	NC_015152	ATAA	2	8	2633126	2633133	75 %	25 %	0 %	0 %	325972243
45548	NC_015152	GATGG	2	10	2633189	2633198	20 %	20 %	60 %	0 %	325972243
45549	NC_015152	TCT	2	6	2633256	2633261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972243
45550	NC_015152	GAA	2	6	2633262	2633267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972243
45551	NC_015152	TGGTA	2	10	2633410	2633419	20 %	40 %	40 %	0 %	325972243
45552	NC_015152	AGG	2	6	2633476	2633481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972243
45553	NC_015152	TGA	2	6	2633564	2633569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972243
45554	NC_015152	CAA	2	6	2633598	2633603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972243
45555	NC_015152	GA	3	6	2633606	2633611	50 %	0 %	50 %	0 %	325972243
45556	NC_015152	TC	3	6	2633667	2633672	0 %	50 %	0 %	50 %	325972243
45557	NC_015152	TTC	2	6	2633719	2633724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972244
45558	NC_015152	TC	3	6	2633728	2633733	0 %	50 %	0 %	50 %	325972244
45559	NC_015152	TTCC	2	8	2633737	2633744	0 %	50 %	0 %	50 %	325972244
45560	NC_015152	TCA	2	6	2633775	2633780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972244
45561	NC_015152	ACCA	2	8	2633791	2633798	50 %	0 %	0 %	50 %	325972244
45562	NC_015152	ACCC	2	8	2633870	2633877	25 %	0 %	0 %	75 %	325972244
45563	NC_015152	CTATC	2	10	2633934	2633943	20 %	40 %	0 %	40 %	325972244
45564	NC_015152	GCA	2	6	2633963	2633968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972244
45565	NC_015152	CAA	2	6	2633985	2633990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972244
45566	NC_015152	CTTC	2	8	2633991	2633998	0 %	50 %	0 %	50 %	325972244
45567	NC_015152	AAG	2	6	2634106	2634111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972244
45568	NC_015152	GCA	2	6	2634152	2634157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972244
45569	NC_015152	AGT	2	6	2634330	2634335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972244
45570	NC_015152	CTC	2	6	2634418	2634423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972244
45571	NC_015152	TGT	2	6	2634426	2634431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972244
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45573	NC_015152	TCCAA	2	10	2634451	2634460	40 %	20 %	0 %	40 %	325972244
45574	NC_015152	ATTG	2	8	2634486	2634493	25 %	50 %	25 %	0 %	325972244
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45576	NC_015152	ATC	2	6	2634656	2634661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972244
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45578	NC_015152	TGA	2	6	2634735	2634740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972244
45579	NC_015152	CATC	2	8	2634744	2634751	25 %	25 %	0 %	50 %	325972244
45580	NC_015152	TAAA	2	8	2634753	2634760	75 %	25 %	0 %	0 %	325972244
45581	NC_015152	CA	3	6	2634771	2634776	50 %	0 %	0 %	50 %	325972244
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45584	NC_015152	CAA	2	6	2634918	2634923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972244
45585	NC_015152	TTTCA	2	10	2634997	2635006	20 %	60 %	0 %	20 %	325972244
45586	NC_015152	TGT	2	6	2635025	2635030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972245
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45588	NC_015152	GGC	2	6	2635183	2635188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972245
45589	NC_015152	AAG	2	6	2635190	2635195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972245
45590	NC_015152	AGC	2	6	2635225	2635230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972245
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45592	NC_015152	CCGA	2	8	2635289	2635296	25 %	0 %	25 %	50 %	325972245
45593	NC_015152	T	7	7	2635357	2635363	0 %	100 %	0 %	0 %	325972245
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45596	NC_015152	CAT	2	6	2635441	2635446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972245
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45598	NC_015152	CCTG	2	8	2635589	2635596	0 %	25 %	25 %	50 %	325972245
45599	NC_015152	ATGGCA	2	12	2635649	2635660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972245
45600	NC_015152	AGA	2	6	2635704	2635709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972245
45601	NC_015152	AGG	2	6	2635785	2635790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972245
45602	NC_015152	AAGT	2	8	2635805	2635812	50 %	25 %	25 %	0 %	325972245
45603	NC_015152	TTA	2	6	2635880	2635885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972245
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45605	NC_015152	TGA	2	6	2635944	2635949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972245
45606	NC_015152	A	6	6	2635961	2635966	100 %	0 %	0 %	0 %	325972245
45607	NC_015152	CCT	2	6	2635990	2635995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972246
45608	NC_015152	T	6	6	2636005	2636010	0 %	100 %	0 %	0 %	325972246
45609	NC_015152	CCA	2	6	2636118	2636123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972246
45610	NC_015152	GGAGA	2	10	2636183	2636192	40 %	0 %	60 %	0 %	325972246
45611	NC_015152	GAC	2	6	2636204	2636209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972246
45612	NC_015152	CAAG	2	8	2636230	2636237	50 %	0 %	25 %	25 %	325972246
45613	NC_015152	GGA	2	6	2636267	2636272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972246
45614	NC_015152	GAT	2	6	2636290	2636295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972246
45615	NC_015152	TGGCC	2	10	2636407	2636416	0 %	20 %	40 %	40 %	325972246
45616	NC_015152	ACGA	2	8	2636493	2636500	50 %	0 %	25 %	25 %	325972246
45617	NC_015152	CCA	2	6	2636602	2636607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972246
45618	NC_015152	ATG	2	6	2636643	2636648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972246
45619	NC_015152	GAG	2	6	2636649	2636654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972246
45620	NC_015152	TA	3	6	2636706	2636711	50 %	50 %	0 %	0 %	325972246
45621	NC_015152	CCG	2	6	2636712	2636717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972246
45622	NC_015152	AGC	2	6	2636729	2636734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972246
45623	NC_015152	AGG	2	6	2636759	2636764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972246
45624	NC_015152	GGC	2	6	2636789	2636794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972246
45625	NC_015152	CTT	2	6	2636821	2636826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972246
45626	NC_015152	AGA	2	6	2636836	2636841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972246
45627	NC_015152	GCA	2	6	2636865	2636870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972246
45628	NC_015152	CAA	2	6	2636912	2636917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972246
45629	NC_015152	A	7	7	2637002	2637008	100 %	0 %	0 %	0 %	325972246
45630	NC_015152	ACC	2	6	2637015	2637020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972246
45631	NC_015152	CA	3	6	2637037	2637042	50 %	0 %	0 %	50 %	325972246
45632	NC_015152	CTCC	2	8	2637094	2637101	0 %	25 %	0 %	75 %	325972247
45633	NC_015152	TC	3	6	2637123	2637128	0 %	50 %	0 %	50 %	325972247
45634	NC_015152	CAA	2	6	2637144	2637149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972247
45635	NC_015152	CAACT	2	10	2637213	2637222	40 %	20 %	0 %	40 %	325972247
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45637	NC_015152	ATCCA	2	10	2637297	2637306	40 %	20 %	0 %	40 %	325972247
45638	NC_015152	GGTT	2	8	2637313	2637320	0 %	50 %	50 %	0 %	325972247
45639	NC_015152	TCC	2	6	2637381	2637386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972247
45640	NC_015152	GAT	2	6	2637441	2637446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972247
45641	NC_015152	CA	3	6	2637464	2637469	50 %	0 %	0 %	50 %	325972247
45642	NC_015152	GAA	2	6	2637483	2637488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972247
45643	NC_015152	TGA	2	6	2637614	2637619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972247
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45645	NC_015152	CCT	2	6	2637704	2637709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972247
45646	NC_015152	AT	3	6	2637738	2637743	50 %	50 %	0 %	0 %	325972247
45647	NC_015152	TAC	2	6	2637801	2637806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972247
45648	NC_015152	CTTCC	2	10	2637875	2637884	0 %	40 %	0 %	60 %	325972247
45649	NC_015152	CAT	3	9	2637888	2637896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972247
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45652	NC_015152	GCCT	2	8	2638026	2638033	0 %	25 %	25 %	50 %	325972247
45653	NC_015152	AAGG	2	8	2638056	2638063	50 %	0 %	50 %	0 %	325972247
45654	NC_015152	GAGAAT	2	12	2638104	2638115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972247
45655	NC_015152	GCT	2	6	2638226	2638231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972247
45656	NC_015152	TGA	2	6	2638259	2638264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972247
45657	NC_015152	TGG	2	6	2638339	2638344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972247
45658	NC_015152	TCA	2	6	2638454	2638459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972247
45659	NC_015152	TTG	2	6	2638534	2638539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972247
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45662	NC_015152	CAT	2	6	2638707	2638712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972248
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45665	NC_015152	TGA	2	6	2638956	2638961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972248
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45672	NC_015152	TTG	2	6	2639309	2639314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972248
45673	NC_015152	GTCTG	2	10	2639384	2639393	0 %	40 %	40 %	20 %	325972248
45674	NC_015152	TCT	2	6	2639399	2639404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972248
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45680	NC_015152	ACT	2	6	2639639	2639644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972248
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45707	NC_015152	T	7	7	2641217	2641223	0 %	100 %	0 %	0 %	325972250
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45714	NC_015152	AG	3	6	2642489	2642494	50 %	0 %	50 %	0 %	325972251
45715	NC_015152	CCT	2	6	2642503	2642508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972251
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45718	NC_015152	ATTG	2	8	2642774	2642781	25 %	50 %	25 %	0 %	325972251
45719	NC_015152	T	6	6	2642783	2642788	0 %	100 %	0 %	0 %	325972251
45720	NC_015152	TCA	2	6	2642796	2642801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972251
45721	NC_015152	TCA	2	6	2642847	2642852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972251
45722	NC_015152	ATT	2	6	2642892	2642897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972251
45723	NC_015152	GTA	2	6	2643931	2643936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972252
45724	NC_015152	GTT	2	6	2643985	2643990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972252
45725	NC_015152	CAC	2	6	2644049	2644054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972253
45726	NC_015152	TGG	2	6	2644124	2644129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972253
45727	NC_015152	CCAT	2	8	2644204	2644211	25 %	25 %	0 %	50 %	325972253
45728	NC_015152	ATTGG	2	10	2644919	2644928	20 %	40 %	40 %	0 %	325972254
45729	NC_015152	GCA	2	6	2645027	2645032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972254
45730	NC_015152	GAT	2	6	2645036	2645041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972254
45731	NC_015152	ACCA	2	8	2645124	2645131	50 %	0 %	0 %	50 %	325972255
45732	NC_015152	AAGA	2	8	2645136	2645143	75 %	0 %	25 %	0 %	325972255
45733	NC_015152	CTTG	2	8	2645177	2645184	0 %	50 %	25 %	25 %	325972255
45734	NC_015152	CTG	2	6	2645199	2645204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972255
45735	NC_015152	CTT	2	6	2645757	2645762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972256
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45842	NC_015152	TTA	2	6	2652568	2652573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972262
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45846	NC_015152	TTG	2	6	2652940	2652945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972262
45847	NC_015152	A	6	6	2652958	2652963	100 %	0 %	0 %	0 %	325972262
45848	NC_015152	TCT	2	6	2653009	2653014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972262
45849	NC_015152	TATCG	2	10	2653026	2653035	20 %	40 %	20 %	20 %	325972262
45850	NC_015152	ATG	2	6	2653153	2653158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972262
45851	NC_015152	ATT	2	6	2653269	2653274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972262
45852	NC_015152	A	6	6	2653323	2653328	100 %	0 %	0 %	0 %	325972262
45853	NC_015152	ATG	2	6	2653374	2653379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972262
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45857	NC_015152	ATG	2	6	2653642	2653647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972262
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45959	NC_015152	CATCG	2	10	2659948	2659957	20 %	20 %	20 %	40 %	325972265
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45962	NC_015152	CCA	2	6	2660000	2660005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972265
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45964	NC_015152	CACT	2	8	2660064	2660071	25 %	25 %	0 %	50 %	325972265
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45966	NC_015152	AGC	2	6	2660248	2660253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972265
45967	NC_015152	GTT	2	6	2660302	2660307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972265
45968	NC_015152	GAAT	2	8	2660446	2660453	50 %	25 %	25 %	0 %	325972265
45969	NC_015152	AGC	2	6	2660470	2660475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972265
45970	NC_015152	AGT	2	6	2660488	2660493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972265
45971	NC_015152	GTT	2	6	2660524	2660529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972265
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45973	NC_015152	TGCA	2	8	2660581	2660588	25 %	25 %	25 %	25 %	325972265
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45975	NC_015152	GTC	3	9	2660615	2660623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972265
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45984	NC_015152	AG	4	8	2661092	2661099	50 %	0 %	50 %	0 %	325972265
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46000	NC_015152	A	6	6	2662844	2662849	100 %	0 %	0 %	0 %	325972267

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