MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015152	TACT	2	8	2537072	2537079	25 %	50 %	0 %	25 %	325972155
44002	NC_015152	TTG	2	6	2537138	2537143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972155
44003	NC_015152	AAT	2	6	2537158	2537163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972155
44004	NC_015152	AAC	2	6	2537166	2537171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972155
44005	NC_015152	CT	3	6	2537199	2537204	0 %	50 %	0 %	50 %	325972155
44006	NC_015152	A	7	7	2537272	2537278	100 %	0 %	0 %	0 %	325972155
44007	NC_015152	CTG	2	6	2537291	2537296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972155
44008	NC_015152	GCA	2	6	2537374	2537379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972155
44009	NC_015152	AAG	2	6	2537797	2537802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972156
44010	NC_015152	CA	3	6	2537838	2537843	50 %	0 %	0 %	50 %	325972156
44011	NC_015152	GAT	2	6	2537847	2537852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972156
44012	NC_015152	ATCAA	2	10	2537863	2537872	60 %	20 %	0 %	20 %	325972156
44013	NC_015152	CAG	2	6	2537904	2537909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972156
44014	NC_015152	AGG	2	6	2537936	2537941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972156
44015	NC_015152	AAG	2	6	2537942	2537947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972156
44016	NC_015152	GAC	2	6	2538276	2538281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972158
44017	NC_015152	AGTCA	2	10	2538321	2538330	40 %	20 %	20 %	20 %	325972158
44018	NC_015152	GAA	2	6	2538570	2538575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972159
44019	NC_015152	TTG	2	6	2538583	2538588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972159
44020	NC_015152	CAA	2	6	2538772	2538777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972159
44021	NC_015152	ACG	2	6	2538875	2538880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972160
44022	NC_015152	GA	3	6	2538915	2538920	50 %	0 %	50 %	0 %	325972160
44023	NC_015152	ATC	2	6	2538958	2538963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972160
44024	NC_015152	ATT	2	6	2539083	2539088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972160
44025	NC_015152	ATAG	2	8	2539135	2539142	50 %	25 %	25 %	0 %	325972160
44026	NC_015152	TGC	2	6	2539173	2539178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972160
44027	NC_015152	TCAGA	2	10	2539179	2539188	40 %	20 %	20 %	20 %	325972160
44028	NC_015152	AG	3	6	2539193	2539198	50 %	0 %	50 %	0 %	325972160
44029	NC_015152	CTGCA	2	10	2539274	2539283	20 %	20 %	20 %	40 %	325972160
44030	NC_015152	CTGCA	2	10	2539285	2539294	20 %	20 %	20 %	40 %	325972160
44031	NC_015152	AGATA	2	10	2539317	2539326	60 %	20 %	20 %	0 %	325972160
44032	NC_015152	TAG	2	6	2539338	2539343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972160
44033	NC_015152	GAA	2	6	2539387	2539392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972160
44034	NC_015152	TAC	2	6	2539450	2539455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972160
44035	NC_015152	GAA	2	6	2539479	2539484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972160
44036	NC_015152	A	7	7	2539523	2539529	100 %	0 %	0 %	0 %	325972160
44037	NC_015152	GAG	2	6	2539584	2539589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972160
44038	NC_015152	GCAG	2	8	2539647	2539654	25 %	0 %	50 %	25 %	325972161
44039	NC_015152	TC	3	6	2539679	2539684	0 %	50 %	0 %	50 %	325972161
44040	NC_015152	T	6	6	2539702	2539707	0 %	100 %	0 %	0 %	325972161
44041	NC_015152	TGG	2	6	2539723	2539728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972161
44042	NC_015152	GAA	2	6	2539763	2539768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972161
44043	NC_015152	TCC	2	6	2539792	2539797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972161
44044	NC_015152	CTG	2	6	2539918	2539923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972161
44045	NC_015152	TCA	2	6	2539942	2539947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972161
44046	NC_015152	GAG	2	6	2540031	2540036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972161
44047	NC_015152	GAC	2	6	2540066	2540071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972161
44048	NC_015152	TGG	2	6	2540099	2540104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972161
44049	NC_015152	TGA	2	6	2540167	2540172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972161
44050	NC_015152	CTG	2	6	2540212	2540217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972161
44051	NC_015152	CAG	2	6	2540222	2540227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972161
44052	NC_015152	GAT	2	6	2540246	2540251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972161
44053	NC_015152	CAAG	2	8	2540255	2540262	50 %	0 %	25 %	25 %	325972161
44054	NC_015152	A	6	6	2540263	2540268	100 %	0 %	0 %	0 %	325972161
44055	NC_015152	AGT	2	6	2540321	2540326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972161
44056	NC_015152	ATG	2	6	2540371	2540376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972161
44057	NC_015152	ATG	2	6	2540416	2540421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972161
44058	NC_015152	TAC	2	6	2540430	2540435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972161
44059	NC_015152	GCA	3	9	2540571	2540579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972161
44060	NC_015152	GCAA	2	8	2540602	2540609	50 %	0 %	25 %	25 %	325972161
44061	NC_015152	CAT	2	6	2540666	2540671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972161
44062	NC_015152	CAGA	2	8	2540698	2540705	50 %	0 %	25 %	25 %	325972161
44063	NC_015152	GAG	2	6	2540802	2540807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972161
44064	NC_015152	ATT	2	6	2541197	2541202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972162
44065	NC_015152	CATC	2	8	2541332	2541339	25 %	25 %	0 %	50 %	325972162
44066	NC_015152	A	6	6	2541423	2541428	100 %	0 %	0 %	0 %	325972162
44067	NC_015152	GTCC	2	8	2541443	2541450	0 %	25 %	25 %	50 %	325972162
44068	NC_015152	CAT	2	6	2541500	2541505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972162
44069	NC_015152	GAT	2	6	2541570	2541575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972162
44070	NC_015152	TCT	2	6	2541589	2541594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972162
44071	NC_015152	CAG	2	6	2541608	2541613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972162
44072	NC_015152	TGC	2	6	2541682	2541687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972162
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44075	NC_015152	CATC	2	8	2541980	2541987	25 %	25 %	0 %	50 %	325972163
44076	NC_015152	GAT	2	6	2542003	2542008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972163
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44083	NC_015152	TCC	2	6	2542299	2542304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972164
44084	NC_015152	CGAA	2	8	2542319	2542326	50 %	0 %	25 %	25 %	325972164
44085	NC_015152	CAAC	2	8	2542331	2542338	50 %	0 %	0 %	50 %	325972164
44086	NC_015152	TC	3	6	2542391	2542396	0 %	50 %	0 %	50 %	325972164
44087	NC_015152	CAG	2	6	2542445	2542450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972164
44088	NC_015152	ACA	2	6	2542465	2542470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972164
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44091	NC_015152	TCAA	2	8	2542665	2542672	50 %	25 %	0 %	25 %	325972165
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44099	NC_015152	AAT	2	6	2543260	2543265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972166
44100	NC_015152	TGA	2	6	2543280	2543285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972166
44101	NC_015152	GGA	2	6	2543339	2543344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972166
44102	NC_015152	GTT	2	6	2543345	2543350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972166
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44104	NC_015152	TAC	2	6	2543398	2543403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972166
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44116	NC_015152	CTTG	2	8	2544270	2544277	0 %	50 %	25 %	25 %	325972167
44117	NC_015152	GCC	2	6	2544479	2544484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972167
44118	NC_015152	CTG	2	6	2544586	2544591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972167
44119	NC_015152	TCA	2	6	2544679	2544684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972167
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44121	NC_015152	CCAA	2	8	2544707	2544714	50 %	0 %	0 %	50 %	325972167
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44132	NC_015152	GCTT	2	8	2544941	2544948	0 %	50 %	25 %	25 %	325972168
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44219	NC_015152	ACC	2	6	2553618	2553623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972175
44220	NC_015152	CTGA	2	8	2553670	2553677	25 %	25 %	25 %	25 %	325972175
44221	NC_015152	TC	3	6	2553711	2553716	0 %	50 %	0 %	50 %	325972175
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44223	NC_015152	ATC	2	6	2553753	2553758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972175
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44226	NC_015152	CATA	2	8	2553929	2553936	50 %	25 %	0 %	25 %	325972176
44227	NC_015152	CT	3	6	2553976	2553981	0 %	50 %	0 %	50 %	325972176
44228	NC_015152	CGAT	2	8	2554044	2554051	25 %	25 %	25 %	25 %	325972176
44229	NC_015152	CCTT	2	8	2554165	2554172	0 %	50 %	0 %	50 %	325972176
44230	NC_015152	TC	3	6	2554183	2554188	0 %	50 %	0 %	50 %	325972176
44231	NC_015152	TTG	2	6	2554191	2554196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972176
44232	NC_015152	GTA	2	6	2554299	2554304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972176
44233	NC_015152	CAGA	2	8	2554313	2554320	50 %	0 %	25 %	25 %	325972176
44234	NC_015152	AAT	2	6	2554336	2554341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972176
44235	NC_015152	TGG	2	6	2554364	2554369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972176
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44237	NC_015152	TGA	2	6	2554428	2554433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972176
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44239	NC_015152	AGATG	2	10	2554538	2554547	40 %	20 %	40 %	0 %	325972177
44240	NC_015152	CTGC	2	8	2554577	2554584	0 %	25 %	25 %	50 %	325972177
44241	NC_015152	TGTCCT	2	12	2554601	2554612	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325972177
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44243	NC_015152	TG	3	6	2554646	2554651	0 %	50 %	50 %	0 %	325972177
44244	NC_015152	CAA	2	6	2554754	2554759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972177
44245	NC_015152	GAA	3	9	2554803	2554811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972177
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44251	NC_015152	TCT	2	6	2555053	2555058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972178
44252	NC_015152	TCA	2	6	2555073	2555078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972178
44253	NC_015152	CCA	2	6	2555155	2555160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972178
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44255	NC_015152	AGCCA	2	10	2555198	2555207	40 %	0 %	20 %	40 %	325972178
44256	NC_015152	ATCA	2	8	2555219	2555226	50 %	25 %	0 %	25 %	325972178
44257	NC_015152	ACC	2	6	2555316	2555321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972178
44258	NC_015152	CTT	2	6	2555330	2555335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972178
44259	NC_015152	GTAGCC	2	12	2555360	2555371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972178
44260	NC_015152	ATGA	2	8	2555382	2555389	50 %	25 %	25 %	0 %	325972178
44261	NC_015152	TG	3	6	2555431	2555436	0 %	50 %	50 %	0 %	325972179
44262	NC_015152	TCA	2	6	2555468	2555473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972179
44263	NC_015152	CT	3	6	2555499	2555504	0 %	50 %	0 %	50 %	325972179
44264	NC_015152	TCA	2	6	2555585	2555590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972179
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44266	NC_015152	GCAAT	2	10	2555615	2555624	40 %	20 %	20 %	20 %	325972179
44267	NC_015152	TCA	2	6	2555687	2555692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972179
44268	NC_015152	TC	3	6	2555773	2555778	0 %	50 %	0 %	50 %	325972179
44269	NC_015152	CCT	2	6	2556000	2556005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972180
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44272	NC_015152	GAAT	2	8	2556153	2556160	50 %	25 %	25 %	0 %	325972180
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44294	NC_015152	TC	3	6	2557267	2557272	0 %	50 %	0 %	50 %	325972183
44295	NC_015152	TTG	3	9	2557312	2557320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972183
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44301	NC_015152	GTT	2	6	2557941	2557946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972185
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44320	NC_015152	CGA	2	6	2560820	2560825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972188
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44329	NC_015152	TGAAT	2	10	2562266	2562275	40 %	40 %	20 %	0 %	325972190
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44331	NC_015152	TCG	2	6	2562298	2562303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972190
44332	NC_015152	GGTG	2	8	2562392	2562399	0 %	25 %	75 %	0 %	325972190
44333	NC_015152	AC	3	6	2562409	2562414	50 %	0 %	0 %	50 %	325972190
44334	NC_015152	ATT	2	6	2562498	2562503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972190
44335	NC_015152	TCAT	2	8	2562515	2562522	25 %	50 %	0 %	25 %	325972190
44336	NC_015152	AG	3	6	2562547	2562552	50 %	0 %	50 %	0 %	325972190
44337	NC_015152	GGA	2	6	2562723	2562728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972190
44338	NC_015152	GT	3	6	2562730	2562735	0 %	50 %	50 %	0 %	325972190
44339	NC_015152	TGA	2	6	2562743	2562748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972190
44340	NC_015152	AATC	2	8	2562760	2562767	50 %	25 %	0 %	25 %	325972190
44341	NC_015152	TCT	2	6	2562869	2562874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972190
44342	NC_015152	CAA	2	6	2562878	2562883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972190
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44344	NC_015152	GGCT	2	8	2562925	2562932	0 %	25 %	50 %	25 %	325972190
44345	NC_015152	CTG	2	6	2562933	2562938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972190
44346	NC_015152	AGAA	2	8	2563006	2563013	75 %	0 %	25 %	0 %	325972190
44347	NC_015152	ATA	2	6	2563153	2563158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972190
44348	NC_015152	TA	3	6	2563265	2563270	50 %	50 %	0 %	0 %	325972190
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44469	NC_015152	C	7	7	2569640	2569646	0 %	0 %	0 %	100 %	325972193
44470	NC_015152	CT	3	6	2569708	2569713	0 %	50 %	0 %	50 %	325972193
44471	NC_015152	A	7	7	2570077	2570083	100 %	0 %	0 %	0 %	325972193
44472	NC_015152	GGAG	2	8	2570163	2570170	25 %	0 %	75 %	0 %	325972193
44473	NC_015152	TCA	2	6	2570181	2570186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972193
44474	NC_015152	TTG	2	6	2570228	2570233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972193
44475	NC_015152	ACG	2	6	2570333	2570338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972193
44476	NC_015152	GAT	2	6	2570425	2570430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972193
44477	NC_015152	A	7	7	2570432	2570438	100 %	0 %	0 %	0 %	325972193
44478	NC_015152	TCT	2	6	2571134	2571139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972194
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44480	NC_015152	TCA	2	6	2571233	2571238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972194
44481	NC_015152	TGA	2	6	2571254	2571259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972194
44482	NC_015152	AAGA	2	8	2571297	2571304	75 %	0 %	25 %	0 %	325972194
44483	NC_015152	CTT	2	6	2571366	2571371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972194
44484	NC_015152	CAA	2	6	2571416	2571421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972194
44485	NC_015152	CCTT	2	8	2571436	2571443	0 %	50 %	0 %	50 %	325972194
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44487	NC_015152	CTT	2	6	2571600	2571605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972194
44488	NC_015152	TCCT	2	8	2571606	2571613	0 %	50 %	0 %	50 %	325972194
44489	NC_015152	TCA	2	6	2571652	2571657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972194
44490	NC_015152	TCACC	2	10	2571662	2571671	20 %	20 %	0 %	60 %	325972194
44491	NC_015152	CCT	2	6	2571686	2571691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972194
44492	NC_015152	AGG	2	6	2571706	2571711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972194
44493	NC_015152	TTG	2	6	2571754	2571759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972194
44494	NC_015152	CGCA	2	8	2571771	2571778	25 %	0 %	25 %	50 %	325972194
44495	NC_015152	CTT	2	6	2571930	2571935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972194
44496	NC_015152	ATG	2	6	2572044	2572049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972194
44497	NC_015152	TGA	2	6	2572055	2572060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972194
44498	NC_015152	TGTGC	2	10	2572116	2572125	0 %	40 %	40 %	20 %	325972194
44499	NC_015152	CAA	2	6	2572553	2572558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972195
44500	NC_015152	ACTC	2	8	2572625	2572632	25 %	25 %	0 %	50 %	325972195

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