MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015152	CGG	2	6	2477625	2477630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972098
43002	NC_015152	TTG	2	6	2477690	2477695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972098
43003	NC_015152	ATC	2	6	2477722	2477727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972098
43004	NC_015152	GGA	2	6	2477826	2477831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972098
43005	NC_015152	AAGA	2	8	2477902	2477909	75 %	0 %	25 %	0 %	325972098
43006	NC_015152	ATT	2	6	2477946	2477951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972098
43007	NC_015152	AGC	2	6	2478190	2478195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972099
43008	NC_015152	TGC	2	6	2478197	2478202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972099
43009	NC_015152	CTG	2	6	2478207	2478212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972099
43010	NC_015152	CAG	2	6	2478225	2478230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972099
43011	NC_015152	GAT	2	6	2478321	2478326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972099
43012	NC_015152	TACA	2	8	2478354	2478361	50 %	25 %	0 %	25 %	325972099
43013	NC_015152	TGC	2	6	2478384	2478389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972099
43014	NC_015152	ATG	2	6	2478403	2478408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972099
43015	NC_015152	CAA	2	6	2478410	2478415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972099
43016	NC_015152	AG	3	6	2478497	2478502	50 %	0 %	50 %	0 %	325972099
43017	NC_015152	TGA	2	6	2478554	2478559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972099
43018	NC_015152	TCTTT	2	10	2478759	2478768	0 %	80 %	0 %	20 %	325972100
43019	NC_015152	GCAG	2	8	2478798	2478805	25 %	0 %	50 %	25 %	325972100
43020	NC_015152	CCT	2	6	2478890	2478895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972100
43021	NC_015152	GGAA	2	8	2478899	2478906	50 %	0 %	50 %	0 %	325972100
43022	NC_015152	ATG	2	6	2478995	2479000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972100
43023	NC_015152	AC	3	6	2479091	2479096	50 %	0 %	0 %	50 %	325972100
43024	NC_015152	T	7	7	2479164	2479170	0 %	100 %	0 %	0 %	325972100
43025	NC_015152	TCA	2	6	2479181	2479186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972100
43026	NC_015152	GAG	2	6	2479189	2479194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972100
43027	NC_015152	TGA	2	6	2479277	2479282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972100
43028	NC_015152	AAC	2	6	2479383	2479388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972100
43029	NC_015152	GAA	2	6	2479408	2479413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972100
43030	NC_015152	GCT	2	6	2479422	2479427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972100
43031	NC_015152	CTT	2	6	2479501	2479506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972101
43032	NC_015152	GGAT	2	8	2479524	2479531	25 %	25 %	50 %	0 %	325972101
43033	NC_015152	ATG	2	6	2479593	2479598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972101
43034	NC_015152	GAA	2	6	2479614	2479619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972101
43035	NC_015152	GCT	2	6	2479637	2479642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972101
43036	NC_015152	GCA	2	6	2479663	2479668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972101
43037	NC_015152	CT	3	6	2479695	2479700	0 %	50 %	0 %	50 %	325972101
43038	NC_015152	TTCACC	2	12	2479712	2479723	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325972101
43039	NC_015152	TG	3	6	2479755	2479760	0 %	50 %	50 %	0 %	325972101
43040	NC_015152	CTG	2	6	2479844	2479849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972101
43041	NC_015152	GCA	2	6	2479858	2479863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972101
43042	NC_015152	GAA	2	6	2479910	2479915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972101
43043	NC_015152	CTG	2	6	2479982	2479987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972101
43044	NC_015152	TGA	2	6	2480065	2480070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972101
43045	NC_015152	TAA	2	6	2480083	2480088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972101
43046	NC_015152	AAC	2	6	2480135	2480140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972101
43047	NC_015152	AGC	2	6	2480149	2480154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972101
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43049	NC_015152	CTG	2	6	2480397	2480402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972102
43050	NC_015152	CAG	2	6	2480442	2480447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972102
43051	NC_015152	CAA	2	6	2480480	2480485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972102
43052	NC_015152	AG	3	6	2480513	2480518	50 %	0 %	50 %	0 %	325972102
43053	NC_015152	TCC	2	6	2480526	2480531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972102
43054	NC_015152	TTG	2	6	2480554	2480559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972102
43055	NC_015152	ACA	2	6	2480575	2480580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972102
43056	NC_015152	CAA	2	6	2480631	2480636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972102
43057	NC_015152	GTA	2	6	2480721	2480726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972102
43058	NC_015152	ACA	2	6	2480783	2480788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972102
43059	NC_015152	CTCC	2	8	2480904	2480911	0 %	25 %	0 %	75 %	325972103
43060	NC_015152	CAG	2	6	2480942	2480947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972103
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43062	NC_015152	TCT	3	9	2480990	2480998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972103
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43073	NC_015152	GCTT	2	8	2481625	2481632	0 %	50 %	25 %	25 %	325972103
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43083	NC_015152	ATGA	2	8	2482143	2482150	50 %	25 %	25 %	0 %	325972104
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43088	NC_015152	CAT	2	6	2482354	2482359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972105
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43090	NC_015152	ATC	2	6	2482462	2482467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972105
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43095	NC_015152	GACA	2	8	2482772	2482779	50 %	0 %	25 %	25 %	325972105
43096	NC_015152	GTCGG	2	10	2482780	2482789	0 %	20 %	60 %	20 %	325972105
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43100	NC_015152	ATGC	2	8	2483046	2483053	25 %	25 %	25 %	25 %	325972105
43101	NC_015152	CAG	2	6	2483073	2483078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972105
43102	NC_015152	CACC	2	8	2483105	2483112	25 %	0 %	0 %	75 %	325972105
43103	NC_015152	A	6	6	2483142	2483147	100 %	0 %	0 %	0 %	325972105
43104	NC_015152	ACC	2	6	2483259	2483264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972106
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43112	NC_015152	CAA	2	6	2483568	2483573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972106
43113	NC_015152	GATAC	2	10	2483627	2483636	40 %	20 %	20 %	20 %	325972106
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43115	NC_015152	CATCC	2	10	2483676	2483685	20 %	20 %	0 %	60 %	325972106
43116	NC_015152	TGT	2	6	2483750	2483755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972106
43117	NC_015152	ACA	2	6	2483756	2483761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972106
43118	NC_015152	GCTT	2	8	2483763	2483770	0 %	50 %	25 %	25 %	325972106
43119	NC_015152	GCGAG	2	10	2483846	2483855	20 %	0 %	60 %	20 %	325972106
43120	NC_015152	GCTGCC	2	12	2483958	2483969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325972106
43121	NC_015152	ACA	2	6	2483972	2483977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972106
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43123	NC_015152	ACTT	2	8	2484375	2484382	25 %	50 %	0 %	25 %	325972106
43124	NC_015152	GAT	2	6	2484392	2484397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972106
43125	NC_015152	GA	3	6	2484409	2484414	50 %	0 %	50 %	0 %	325972106
43126	NC_015152	TCG	2	6	2484437	2484442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972106
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43130	NC_015152	AAT	2	6	2484684	2484689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972106
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43132	NC_015152	CCA	2	6	2484823	2484828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972106
43133	NC_015152	ATACGG	2	12	2484852	2484863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972106
43134	NC_015152	TGC	2	6	2484887	2484892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972106
43135	NC_015152	GAGAA	2	10	2485015	2485024	60 %	0 %	40 %	0 %	325972106
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43137	NC_015152	GAG	2	6	2485200	2485205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972106
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43143	NC_015152	CCCTT	2	10	2485574	2485583	0 %	40 %	0 %	60 %	325972107
43144	NC_015152	TCT	2	6	2485631	2485636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972107
43145	NC_015152	TTTC	2	8	2485743	2485750	0 %	75 %	0 %	25 %	325972107
43146	NC_015152	CTT	2	6	2485815	2485820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972107
43147	NC_015152	GA	3	6	2485904	2485909	50 %	0 %	50 %	0 %	325972107
43148	NC_015152	GCA	2	6	2485932	2485937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972107
43149	NC_015152	GTTG	2	8	2486016	2486023	0 %	50 %	50 %	0 %	325972107
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43151	NC_015152	GA	3	6	2486108	2486113	50 %	0 %	50 %	0 %	325972107
43152	NC_015152	GTCG	2	8	2486202	2486209	0 %	25 %	50 %	25 %	325972107
43153	NC_015152	GCA	2	6	2486214	2486219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972107
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43155	NC_015152	T	6	6	2486444	2486449	0 %	100 %	0 %	0 %	325972108
43156	NC_015152	GGT	2	6	2486495	2486500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972108
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43158	NC_015152	CG	3	6	2486590	2486595	0 %	0 %	50 %	50 %	325972108
43159	NC_015152	TCGA	2	8	2486659	2486666	25 %	25 %	25 %	25 %	325972108
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43169	NC_015152	G	6	6	2487403	2487408	0 %	0 %	100 %	0 %	325972109
43170	NC_015152	CGCCTG	2	12	2487427	2487438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325972109
43171	NC_015152	GA	3	6	2487468	2487473	50 %	0 %	50 %	0 %	325972109
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43184	NC_015152	CTGCTT	2	12	2488483	2488494	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325972110
43185	NC_015152	CTCC	2	8	2488583	2488590	0 %	25 %	0 %	75 %	325972110
43186	NC_015152	AGG	2	6	2488659	2488664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972110
43187	NC_015152	CTG	2	6	2488699	2488704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972110
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43191	NC_015152	TGA	2	6	2488961	2488966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972110
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43204	NC_015152	GGA	2	6	2489654	2489659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972111
43205	NC_015152	GCA	2	6	2489710	2489715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972111
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43208	NC_015152	GGCA	2	8	2489776	2489783	25 %	0 %	50 %	25 %	325972111
43209	NC_015152	TGC	2	6	2489861	2489866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972111
43210	NC_015152	TAC	2	6	2490006	2490011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972111
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43212	NC_015152	TCA	2	6	2490196	2490201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972111
43213	NC_015152	CA	3	6	2490200	2490205	50 %	0 %	0 %	50 %	325972111
43214	NC_015152	CAA	2	6	2490209	2490214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972111
43215	NC_015152	TC	3	6	2490246	2490251	0 %	50 %	0 %	50 %	325972111
43216	NC_015152	TCC	2	6	2490272	2490277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972112
43217	NC_015152	CAT	2	6	2490300	2490305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972112
43218	NC_015152	CAT	2	6	2490424	2490429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972112
43219	NC_015152	AAC	2	6	2490491	2490496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972112
43220	NC_015152	CGC	2	6	2490570	2490575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972112
43221	NC_015152	GTA	2	6	2490587	2490592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972112
43222	NC_015152	TGC	2	6	2490612	2490617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972112
43223	NC_015152	AGGG	2	8	2490641	2490648	25 %	0 %	75 %	0 %	325972112
43224	NC_015152	TAG	3	9	2490710	2490718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972112
43225	NC_015152	CAG	2	6	2490795	2490800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972112
43226	NC_015152	CAA	2	6	2490915	2490920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972112
43227	NC_015152	TCG	2	6	2490932	2490937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972112
43228	NC_015152	AAT	2	6	2490961	2490966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972112
43229	NC_015152	GCCA	2	8	2490999	2491006	25 %	0 %	25 %	50 %	325972112
43230	NC_015152	TTC	2	6	2491044	2491049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972112
43231	NC_015152	AGGTC	2	10	2491073	2491082	20 %	20 %	40 %	20 %	325972112
43232	NC_015152	GAA	3	9	2491117	2491125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972113
43233	NC_015152	AGC	2	6	2491215	2491220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972113
43234	NC_015152	GGC	2	6	2491310	2491315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972113
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43237	NC_015152	AG	3	6	2491370	2491375	50 %	0 %	50 %	0 %	325972113
43238	NC_015152	GTGG	2	8	2491381	2491388	0 %	25 %	75 %	0 %	325972113
43239	NC_015152	AG	3	6	2491412	2491417	50 %	0 %	50 %	0 %	325972113
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43243	NC_015152	TCG	2	6	2491553	2491558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972114
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43248	NC_015152	GGCC	2	8	2491825	2491832	0 %	0 %	50 %	50 %	325972114
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43312	NC_015152	CTGT	2	8	2495250	2495257	0 %	50 %	25 %	25 %	325972119
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43328	NC_015152	TCCGA	2	10	2496652	2496661	20 %	20 %	20 %	40 %	325972120
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43337	NC_015152	GCATC	2	10	2497415	2497424	20 %	20 %	20 %	40 %	325972120
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43342	NC_015152	CAA	2	6	2497611	2497616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972120
43343	NC_015152	G	6	6	2497796	2497801	0 %	0 %	100 %	0 %	325972120
43344	NC_015152	CGTT	2	8	2497831	2497838	0 %	50 %	25 %	25 %	325972120
43345	NC_015152	GCT	2	6	2497850	2497855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972120
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43348	NC_015152	GCT	3	9	2498027	2498035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972120
43349	NC_015152	AGCC	2	8	2498092	2498099	25 %	0 %	25 %	50 %	325972120
43350	NC_015152	CTT	2	6	2498210	2498215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972120
43351	NC_015152	CAGCTT	2	12	2498255	2498266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325972120
43352	NC_015152	CCAA	2	8	2498290	2498297	50 %	0 %	0 %	50 %	325972120
43353	NC_015152	AAT	2	6	2498406	2498411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972120
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43374	NC_015152	GAG	2	6	2499708	2499713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972121
43375	NC_015152	CCG	2	6	2499863	2499868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972121
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43456	NC_015152	ATG	2	6	2504580	2504585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972125
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43459	NC_015152	AGT	2	6	2504834	2504839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972126
43460	NC_015152	ATA	2	6	2504891	2504896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972126
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43462	NC_015152	GCCACC	2	12	2504937	2504948	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325972126
43463	NC_015152	AGA	2	6	2504974	2504979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972126
43464	NC_015152	ACA	2	6	2505003	2505008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972126
43465	NC_015152	CTG	2	6	2505158	2505163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972126
43466	NC_015152	CAA	2	6	2505176	2505181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972126
43467	NC_015152	TTG	2	6	2505203	2505208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972126
43468	NC_015152	GTT	2	6	2505278	2505283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972126
43469	NC_015152	TCT	2	6	2505291	2505296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972126
43470	NC_015152	TCC	3	9	2505333	2505341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972126
43471	NC_015152	TGT	2	6	2505366	2505371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972126
43472	NC_015152	ATC	2	6	2505375	2505380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972126
43473	NC_015152	AAC	2	6	2505396	2505401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972126
43474	NC_015152	TGCTT	2	10	2505419	2505428	0 %	60 %	20 %	20 %	325972126
43475	NC_015152	CCCAA	2	10	2505436	2505445	40 %	0 %	0 %	60 %	325972126
43476	NC_015152	CAG	2	6	2505470	2505475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972126
43477	NC_015152	CAT	2	6	2505482	2505487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972126
43478	NC_015152	GGA	2	6	2505562	2505567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972127
43479	NC_015152	CAA	2	6	2505588	2505593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972127
43480	NC_015152	AGCGA	2	10	2505598	2505607	40 %	0 %	40 %	20 %	325972127
43481	NC_015152	TTC	2	6	2505640	2505645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972127
43482	NC_015152	AAGAAA	2	12	2505748	2505759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972127
43483	NC_015152	GAAA	2	8	2505818	2505825	75 %	0 %	25 %	0 %	325972127
43484	NC_015152	GAA	2	6	2505852	2505857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972127
43485	NC_015152	CGG	2	6	2505890	2505895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972127
43486	NC_015152	CAG	2	6	2506060	2506065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972127
43487	NC_015152	AGT	2	6	2506307	2506312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972128
43488	NC_015152	GCCT	2	8	2506326	2506333	0 %	25 %	25 %	50 %	325972128
43489	NC_015152	GGC	2	6	2506403	2506408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972128
43490	NC_015152	CTGTTC	2	12	2506411	2506422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325972128
43491	NC_015152	TGC	2	6	2506433	2506438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972128
43492	NC_015152	CAA	2	6	2506469	2506474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972128
43493	NC_015152	GTC	2	6	2506581	2506586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972128
43494	NC_015152	TCC	2	6	2506604	2506609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972128
43495	NC_015152	CTG	2	6	2506623	2506628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972128
43496	NC_015152	GCTT	2	8	2506636	2506643	0 %	50 %	25 %	25 %	325972128
43497	NC_015152	CAG	2	6	2506732	2506737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972128
43498	NC_015152	GTA	2	6	2506809	2506814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972128
43499	NC_015152	AAG	2	6	2506834	2506839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972128
43500	NC_015152	ACC	2	6	2506920	2506925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972128

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